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利用抑制差减杂交技术分离马铃薯晚疫病抗性相关基因(英文) 被引量:22
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作者 田振东 柳俊 谢从华 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第7期597-605,共9页
以晚疫病病原菌混合小种接种处理 4 8h的马铃薯水平抗性材料 (R gene free)叶片为目的材料 ,以未处理材料作为对照 ,用抑制差减杂交技术构建了一个富集晚疫病抗性相关基因的差减文库。应用反向Northern技术对84 0个克隆进行斑点杂交筛... 以晚疫病病原菌混合小种接种处理 4 8h的马铃薯水平抗性材料 (R gene free)叶片为目的材料 ,以未处理材料作为对照 ,用抑制差减杂交技术构建了一个富集晚疫病抗性相关基因的差减文库。应用反向Northern技术对84 0个克隆进行斑点杂交筛选 ,筛选出 15 0个病原诱导后信号明显增强的克隆。 2 6个片段测序结果表明 :部分片段基因功能与抗病性明显相关。 7个差异表达片段与GenBankEST数据库中已有晚疫病原诱导马铃薯叶片得到的EST有很高同源性 (达 95 %~ 10 0 % ) ;部分片段核苷酸或氨基酸序列分别与番茄、烟草、拟南芥等的EST序列或氨基酸序列有较高同源性 ;另有 4个基因片段在GenBankEST数据库中未找到明显的同源序列 ,可能为新发现的基因片段。 展开更多
关键词 马铃薯 晚疫病 抗病相关基因 抑制差减杂交(SSH) 反向northern斑点杂交
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黑胫病菌诱导的烟草SSH文库构建及其分析 被引量:11
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作者 苏振刚 杨爱国 +7 位作者 孙玉合 罗成刚 刘贯山 周佳 李元元 杨帆 赵百英 王元英 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1763-1770,共8页
黑胫病是危害严重的世界性烟草主要病害之一,探究烟草对黑胫病的抗病机制,可以为该病的综合防治提供理论依据。本研究以烟草黑胫病抗性品种革新3号为材料,利用黑胫病0号生理小种诱导其水平抗性,分别在接种后0.5、1、3、6、10和16d取样,... 黑胫病是危害严重的世界性烟草主要病害之一,探究烟草对黑胫病的抗病机制,可以为该病的综合防治提供理论依据。本研究以烟草黑胫病抗性品种革新3号为材料,利用黑胫病0号生理小种诱导其水平抗性,分别在接种后0.5、1、3、6、10和16d取样,通过抑制差减杂交技术(SSH)构建cDNA文库,获得了960个阳性克隆。利用反向Northern斑点杂交技术对其中240个阳性克隆进行杂交筛选,筛选出57个表达差异明显的基因,序列拼接后获得33条高质量EST,测序及其比对分析表明,革新3号对烟草黑胫病抗性相关基因主要涉及抗病防卫、光合作用、信号传导和能量代谢等方面。进一步基因功能分析显示,病程相关PR1b蛋白、半胱氨酸蛋白、延伸因子1-α、α-微管蛋白、细胞色素P450、精胺合成酶、水通道蛋白、过氧化物酶体膜蛋白、甘氨酸延伸因子等可能参与了烟草与黑胫病菌非亲和互作过程。 展开更多
关键词 烟草 黑胫病病菌 抑制差减杂交 反向northern斑点杂交 非亲和互作
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奶牛乳房炎抗性基因的反向Northern斑点杂交差异筛选 被引量:6
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作者 曹随忠 李宏滨 +3 位作者 姚学萍 王爱华 赵兴绪 杜立新 《家畜生态学报》 2007年第3期57-61,共5页
分别用地高辛标记患乳房炎奶牛和健康奶牛外周血白细胞cDNA探针,对已构建的奶牛乳房炎抗性相关cDNA文库应用反向Northern斑点杂交技术进行差异筛选,筛选出的50个差异表达克隆测序后获得48个EST序列。根据在GenBank非冗余核酸数据库(nr)... 分别用地高辛标记患乳房炎奶牛和健康奶牛外周血白细胞cDNA探针,对已构建的奶牛乳房炎抗性相关cDNA文库应用反向Northern斑点杂交技术进行差异筛选,筛选出的50个差异表达克隆测序后获得48个EST序列。根据在GenBank非冗余核酸数据库(nr)和EST数据库中Blastn序列比对结果,将这些EST分为3类:第一类代表已知基因,共35个;第二类代表已知EST,共5个;第三类为新EST,共3个。35个代表已知基因的ESTs按照基因功能分为八类:信号转导与细胞间通信(8.57%)、细胞结构与运动(11.43%)、细胞凋亡(5.72%)、细胞与机体防御(20.00%)、物质转运(8.57%)、翻译与表达调控(20.00%)、代谢(14.20%)及其它(11.43%)。结合相关文献初步探讨了部分患乳房炎奶牛外周血白细胞差异表达基因的功能和意义,其中BNBD5、IgJ、MIP-3、MnSOD、AHCY、WIP等基因可能在奶牛乳房炎抗性中发挥重要作用。 展开更多
关键词 反向northern斑点杂交 CDNA文库 乳房炎抗性相关基因 差异筛选
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滞育七星瓢虫抑制性消减杂交文库的构建及分析 被引量:1
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作者 蒋莎 黄凤霞 +4 位作者 齐晓阳 任小云 陈红印 黄建 张礼生 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2016年第1期33-39,共7页
七星瓢虫是优良的天敌昆虫,可凭滞育特性抵御逆境胁迫,提高种群生存能力。为研究七星瓢虫的滞育分子机制,构建抑制性消减杂交文库,经反向Northern斑点杂交技术进一步筛选,得到231个差异点。blastx/n比对后,正、反向文库分别得到差异表... 七星瓢虫是优良的天敌昆虫,可凭滞育特性抵御逆境胁迫,提高种群生存能力。为研究七星瓢虫的滞育分子机制,构建抑制性消减杂交文库,经反向Northern斑点杂交技术进一步筛选,得到231个差异点。blastx/n比对后,正、反向文库分别得到差异表达基因64和54个,GO分类和PATHWAY分析表明,差异表达基因参与的生物过程涉及滞育的信号传导、生物合成、初级代谢和次级代谢等。文库中发现多种基因,为进一步筛选、克隆、分析滞育相关基因提供线索。着重讨论了与抗寒性相关的28 k D抗干燥应激蛋白、卵巢发育相关的Cullin 3蛋白,能量代谢相关的异柠檬酸脱氢酶的生物学功能,进而推测其与七星瓢虫滞育的相关性。 展开更多
关键词 七星瓢虫 抑制性消减杂交 差异表达基因 反向northern斑点杂交 滞育
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