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1株同时携带tet(X6)和tet(X3)的禽源印地不动杆菌比较基因组学分析 被引量：1
1
作者 李垠树 赵冰 +5 位作者 孙华润 何坤 许慧 梁玉蕾 胡功政 苑丽 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1620-1625,共6页
为了研究动物园禽类散养场分离菌对替加环素敏感性及其耐药机制,2019年从某市动物园禽类散养场采集的1只健康珍珠鸡粪便样品中分离获得分离菌,通过常规细菌分离纯化、革兰染色镜检和全自动细菌鉴定仪鉴定,以及序列比对确定该菌株为印地... 为了研究动物园禽类散养场分离菌对替加环素敏感性及其耐药机制,2019年从某市动物园禽类散养场采集的1只健康珍珠鸡粪便样品中分离获得分离菌,通过常规细菌分离纯化、革兰染色镜检和全自动细菌鉴定仪鉴定,以及序列比对确定该菌株为印地不动杆菌(LYS68A)。采用微量肉汤稀释法测定菌株对8种抗菌药物的敏感性,并通过全基因组测序和比较基因组学分析该菌株的耐药特征。药敏试验及PCR检测发现,尽管该菌株对多西环素和替加环素高度敏感,但却携带对替加环素耐药的tet(X3)基因。进一步全基因组测序发现菌株LYS68A未携带耐药质粒,其染色体上共携带tet(X3)、tet(X6)、floR、sul1、aadA2、dfrA12、aph(3’)-I、mphE和sul2等9个耐药基因,构成了一个29252 bp的多重耐药区并以一个整体插入到基因组tRNA-Gly的上游。耐药基因tet(X6)的基因环境(hp-tet(X6)-α/βhydrolase-GMP synthase)与2020年在1株奇异变形杆菌中发现的tet(X6)的基因环境同源性高达99%,推测其是通过ISVsa3和假定蛋白(hp)之间的热点区域(TCTTCC)经同源重组获得。耐药基因tet(X3)的基因环境与质粒p34AB(MK134375)中tet(X3)的上、下游序列高度相似,主要区别是前者仅一侧含有ISVsa3,而另一侧的插入序列在同源重组后缺失,结果导致tet(X3)失去独立在菌属间水平传播能力。本试验首次在1株替加环素敏感的禽源印地不动杆菌菌株LYS68A的染色体上同时检出tet(X6)和tet(X3)基因,且两种tet(X)的变异体主要通过菌属间的同源重组获得。 展开更多
关键词 印地不动杆菌 比较基因组学 tet(X6) tet(X3)
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