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宁都黄鸡GH基因SNP与鸡冠性状的关联分析 被引量：1
1
作者 马荆鄂 曾成瑶 +4 位作者 周敏 谭玉文 朱学农 饶友生 许继国 《广东农业科学》 CAS 2023年第7期137-145,共9页
【目的】研究宁都黄鸡GH基因(Growth hormone,GH)5’-侧翼和内含子1区域单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与鸡冠性状的关联性,以期筛选地方鸡种鸡冠性状的早期选育分子标记。【方法】以499只宁都黄鸡公鸡为研究对象... 【目的】研究宁都黄鸡GH基因(Growth hormone,GH)5’-侧翼和内含子1区域单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)与鸡冠性状的关联性,以期筛选地方鸡种鸡冠性状的早期选育分子标记。【方法】以499只宁都黄鸡公鸡为研究对象,测定7个不同周龄的冠高、冠长、冠厚、肉垂长、肉垂厚以及冠齿数指标,利用SAS(Statistical analysis system)分析GH基因部分序列SNP与鸡冠性状的关联性。【结果】有13个SNP与冠高性状指标显著关联(P<0.05),即C1272225T、G1272611A、C1271211T、C1270902T、A1270769G、G1270640C、T1270578C、G1270503C、T1270451C、C1270032T,其中A1270769G与7个周龄冠高指标均显著关联;G1272611A与5个周龄冠高指标显著关联;有10个SNP与冠长性状显著关联(P<0.05),即C1272225T、G1272611A、C1271211T、C1270902T、A1270769G、G1270640C、T1270578C、G1270503C、T1270451C、C1270032T,其中C1271211T与6个周龄冠长指标显著关联,G1272611A与5个周龄冠长指标显著关联。G1272611A位点与5个连续周龄冠长或冠高性状指标均显著关联,该位点在该群体中对应GG和GA 2种基因型,GG基因型个体的5个连续周龄冠高或冠长均显著高于GA基因型个体。【结论】G1272611A位点可作为宁都黄鸡冠高和冠长性状选育重要候选分子标记。 展开更多
关键词 宁都黄鸡 生长激素基因 单核苷酸多态位点(SNP) 鸡冠 冠高 冠长
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家兔MyoD1基因多态性与生长和屠宰性能的相关性 被引量：4
2
作者 何桦 张文秀 赖松家 《畜牧与兽医》 北大核心 2013年第6期32-35,共4页
采用DNA直接测序法筛选生肌决定基因(MyoD1)5'-UTR及编码区的遗传多态性,采用高分辨率溶解曲线分型技术(HRM)对候选单核苷酸多态性位点(SNP)进行基因分型,并分析其与生长和屠宰性能的相关性(n=190)。结果显示:仅在外显子4上发现一... 采用DNA直接测序法筛选生肌决定基因(MyoD1)5'-UTR及编码区的遗传多态性,采用高分辨率溶解曲线分型技术(HRM)对候选单核苷酸多态性位点(SNP)进行基因分型,并分析其与生长和屠宰性能的相关性(n=190)。结果显示:仅在外显子4上发现一个同义突变SNP(c.783 G>A)。等位基因A和G在3品种中的平均频率为0.216和0.784,基因型GG、GA和AA的平均频率分别为0.674、0.221和0.105。相关性分析表明,无论公母兔,其AA基因型个体的全净膛重和半净膛重都显著高于GA基因型个体(P<0.05),而该SNP位点与生长性状间无显著相关。研究结果支持MyoD1基因可作为家兔屠宰性能的候选基因。 展开更多
关键词 家兔 生肌决定基因(MyoD1) 单核苷酸多态性位点(SNP) 高分辨率溶解曲线(HRM) 屠宰性状
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中国人热性惊厥与MASS1基因的分子生物学研究 被引量：2
3
作者 胡具雄 金庆民 +4 位作者 吕文娟 张艳红 张明 傅克勇 叶盛 《中国农村卫生事业管理》 2012年第1期102-104,共3页
目的:研究中国人热性惊厥患者MASS1单核苷酸多态性位点(SNP)与基因突变情况。方法:抽取44位热性惊厥患者外周血,提取DNA,设计MASS1基因全部35个编码外显子引物,经PCR扩增,采用Sanger双脱氧链终止法测序。结果:共发现3个单核苷酸多态性位... 目的:研究中国人热性惊厥患者MASS1单核苷酸多态性位点(SNP)与基因突变情况。方法:抽取44位热性惊厥患者外周血,提取DNA,设计MASS1基因全部35个编码外显子引物,经PCR扩增,采用Sanger双脱氧链终止法测序。结果:共发现3个单核苷酸多态性位点,其中1个为位于第13外显子尚未有文献报道的新单核苷酸多态性位点2625A>C,致使原来的密码子CGA变成CGC,均编码精氨酸。另有2个单核苷酸多态性位点与已有文献报道相符,分别为第29外显子6666G>A及第33外显子7798T>G单核苷酸多态性位点。未发现新的基因突变。结论:MASS1基因存在多个单核苷酸多态性位点,对进一步研究中国人热性惊厥分子遗传学机制具有理论积累意义。 展开更多
关键词 热性惊厥 MASS1基因 单核苷酸多态性位点(SNP)
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抗孕激素药物敏感性与孕激素受体基因多态性关系的研究 被引量：1
4
作者 冯文华 韩维田 +5 位作者 姜淼 李学付 关长吉 王迎春 冯文霄 李建新 《生殖与避孕》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期404-408,共5页
目的:研究孕激素受体基因多态性与抗孕激素药物敏感性的关系。方法:辽宁省部分地区因非意愿妊娠要求药物流产孕妇185例,根据对药物的临床反应情况将其分成正常完全流产组、敏感组、不全流产组及失败组并进行血清激素水平测定;采用PCR-S... 目的:研究孕激素受体基因多态性与抗孕激素药物敏感性的关系。方法:辽宁省部分地区因非意愿妊娠要求药物流产孕妇185例,根据对药物的临床反应情况将其分成正常完全流产组、敏感组、不全流产组及失败组并进行血清激素水平测定;采用PCR-SSCP方法筛查孕激素受体基因上具有遗传学意义的3个单核苷酸多态性位点(G1031C Ser344Thr;G1978T Leu660Val;C2310T His770His)在各组中的分布情况。结果:PCR扩增的DNA片段经变性成单链,并进行电泳后,各组显示的条带完全一致,说明3个SNP位点在各组中的分布不存在差异。结论:这3个孕激素受体基因的SNP位点在所调查的辽宁省女性中对于抗孕激素药物反应敏感性的影响没有统计学意义。 展开更多
关键词 抗孕激素制剂 孕激素受体基因 单核苷酸多态性位点(SNP) 单链构象多态性(SSCP)
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南江黄羊ARHGAP11A基因SNPs筛选及其与生长性状的关联分析 被引量：1
5
作者 王嘉欣 张德鹏 +5 位作者 谭永乾 冯静 宋天增 陈愉 张红平 李利 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期91-99,共9页
【目的】探讨ARHGAP11A基因与南江黄羊生长性状的关联。【方法】以南江黄羊(母羊,n=243)为试验材料,采用PCR产物直接测序筛选ARHGAP11A基因的SNP位点并分析其与性状之间的关联。【结果】在南江黄羊群体中共发现ARHGAP11A基因16个SNPs位... 【目的】探讨ARHGAP11A基因与南江黄羊生长性状的关联。【方法】以南江黄羊(母羊,n=243)为试验材料,采用PCR产物直接测序筛选ARHGAP11A基因的SNP位点并分析其与性状之间的关联。【结果】在南江黄羊群体中共发现ARHGAP11A基因16个SNPs位点。g.3483A>G和g.3621G>A的纯合突变具有增加南江黄羊体重(2月龄、6月龄和12月龄)以及胸围(6月龄)指标的趋势(P>0.05),而在g.3525A>G位点AG型羊初生重、12月龄体重和12月龄胸围显著高于GG型个体(P<0.05)。AAGT单倍型山羊体重体尺均高于AGGT和GGAT个体(P>0.05)。【结论】南江黄羊母羊群体中ARHGAP11A基因突变与生长发育密切相关,进一步验证其功能后在选育中可考虑其作为辅助选择标记。 展开更多
关键词 南江黄羊 ARHGAP11A基因 单核苷酸多态性位点(SNP) 生长性能 关联分析
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Jak2基因多态性与儿童急性淋巴细胞白血病遗传易感性的研究
6
作者 张海艳 翟晓文 +8 位作者 王宏胜 范翠青 钱晓文 苗慧 俞懿 朱晓华 李军 陆凤娟 吴玥 《世界临床药物》 CAS 2015年第9期631-635,644,共6页
目的探讨jak2基因多态性与中国汉族儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)遗传易感性的相关性以及儿童ALL的发病因素。方法采用SNa Pshot SNP分型技术检测141例ALL患儿(病例组)和239例健康儿童(对照组)的10个单核苷酸多态性位点(SNP),包括rs10974... 目的探讨jak2基因多态性与中国汉族儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)遗传易感性的相关性以及儿童ALL的发病因素。方法采用SNa Pshot SNP分型技术检测141例ALL患儿(病例组)和239例健康儿童(对照组)的10个单核苷酸多态性位点(SNP),包括rs10974944、rs10974947、rs12343867、rs2230722、rs2230724、rs2274472、rs4495487、rs56118985、rs6476933和rs7046736,比较两组儿童基因型特征。结果病例组rs10974947位点G/A+A/A的分布明显低于对照组,G/G基因型分布显著高于对照组(χ2=5.042,P=0.025)。结论 jak2基因rs10974947位点G/G基因型与中国汉族儿童急性淋巴细胞白血病易感性相关。 展开更多
关键词 JAK2基因 急性淋巴细胞白血病(ALL) 儿童 易感性 单核苷酸多态性位点(SNP)
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南江黄羊肉髯相关的候选基因单核苷酸多态性及其与体重、体尺和繁殖性能的相关分析
7
作者 聂露 谭永乾 +7 位作者 李利 张红平 陈瑜 陈勇 苗斌 王定国 刘金鑫 周立新 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2018年第3期428-436,共9页
【目的】寻找与山羊肉髯相关的基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,分析肉髯性状与体重、体尺和繁殖性能的相关性。【方法】以南江黄羊为试验材料,对肉髯性状候选基因区域(Chr10:25 Mb^28 Mb)的15个SNP位点进... 【目的】寻找与山羊肉髯相关的基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,分析肉髯性状与体重、体尺和繁殖性能的相关性。【方法】以南江黄羊为试验材料,对肉髯性状候选基因区域(Chr10:25 Mb^28 Mb)的15个SNP位点进行检测分析;测量肉髯长度和周长,观察肉髯切片的组织形态;进一步比较分析有肉髯个体和无肉髯个体之间的体重体尺性状(包括体重、体长、体高和胸围)和繁殖性状(包括初产和经产母羊产羔率)的差异。【结果】南江黄羊Chr 10:25 Mb^28 Mb区域内,仍未发现与肉髯性状显著相关的SNP位点。两侧肉髯的长度之间、周长之间均呈显著正相关(P<0.01),但单侧肉髯长度与周长并无显著性相关(P>0.05)。在生长发育早期,肉髯个体的体长和体高较小(P<0.01),到成年后差异不显著(P>0.05);同时,肉髯个体的体重和胸围也更小(P<0.01),尤其是在6月龄至成年后。而有肉髯和无肉髯初产和经产母羊的产羔率差异均不显著(P>0.05)。【结论】在山羊肉髯性状候选基因区域内未发现与肉髯性状显著相关的SNP位点;有肉髯山羊的体重和体尺均小于无肉髯山羊,但肉髯对母羊产羔率无显著影响。 展开更多
关键词 山羊肉髯 单核苷酸多态性位点(SNP) 生长性状 产羔率
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