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尿嘧啶、水合尿嘧啶的结构和振动性质研究 被引量:1
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作者 王志萍 张丰收 +4 位作者 周宏余 曾祥华 顾斌 张伟 程伟 《原子核物理评论》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期438-443,共6页
基于从头计算方法和半经验势分子动力学,通过计算尿嘧啶分子及其水合尿嘧啶分子运动轨迹的速度自关联函数的傅立叶变换,给出了这些分子的振动频率。通过求解Hessian矩阵,鉴别出这些分子每一个振动频率的振动模式。对孤立的尿嘧啶分子,... 基于从头计算方法和半经验势分子动力学,通过计算尿嘧啶分子及其水合尿嘧啶分子运动轨迹的速度自关联函数的傅立叶变换,给出了这些分子的振动频率。通过求解Hessian矩阵,鉴别出这些分子每一个振动频率的振动模式。对孤立的尿嘧啶分子,计算结果能够和实验数据符合。对水合尿嘧啶分子中,尿嘧啶分子的结构和振动频率的改变做了讨论。 展开更多
关键词 尿嘧啶 水合尿嘧啶 结构 振动 经验分子动力学
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尿嘧啶分子振动性质研究 被引量:2
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作者 王志萍 张丰收 +3 位作者 曾祥华 周宏余 顾斌 程伟 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第10期1145-1150,共6页
发展了研究生物分子的半经验势分子动力学方法.通过计算尿嘧啶分子动力学运动轨迹的速度自关联函数的傅立叶变换,获得了其振动频率.通过求解Hessian矩阵方法,鉴别出每一个振动频率的振动模式.计算结果能够和现有实验数据符合,对目前研... 发展了研究生物分子的半经验势分子动力学方法.通过计算尿嘧啶分子动力学运动轨迹的速度自关联函数的傅立叶变换,获得了其振动频率.通过求解Hessian矩阵方法,鉴别出每一个振动频率的振动模式.计算结果能够和现有实验数据符合,对目前研究还未能给出的振动模式和频率做了自洽补充,完整给出尿嘧啶分子振动的30个模式和频率. 展开更多
关键词 尿嘧啶 振动性质 经验分子动力学
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Vibrational properties of uracil
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作者 WANG Zhiping ZHANG Fengshou +3 位作者 ZENG Xianghua ZHOU Hongyu GU Bin CHENG Wei 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2006年第15期1804-1810,共7页
A semiempirical molecular dynamics model is developed to study the vibrational frequen cies of uracil at very low kinetic temperature by using the Fourier transform of velocity autocorrelation func tion of trajectorie... A semiempirical molecular dynamics model is developed to study the vibrational frequen cies of uracil at very low kinetic temperature by using the Fourier transform of velocity autocorrelation func tion of trajectories of molecular dynamics simulations The finite difference harmonic method is used to as sign the vibrational frequency of each mode. The calculated frequencies are found to be in good agreement with experimental measurements. More over, we make up for the lost vibrational modes in experiments self-consistently. A total of 30 vibrationa modes and their corresponding frequencies are re ported. 展开更多
关键词 尿嘧啶 振动性能 经验分子动力学 模型
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