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基于荧光重组酶聚合酶扩增技术快速检测美洲钩虫方法研究
被引量:
1
1
作者
梁家瑞
徐斌
+3 位作者
胡薇
李梦茹
杨硕
郑彬
《中国热带医学》
CAS
2023年第7期681-685,共5页
目的 建立基于荧光重组酶聚合酶核酸扩增(recombinase polymerase amplification, RPA)技术快速检测粪样中美洲钩虫卵的方法,并评价其效能,为快速检测粪样中美洲钩虫卵提供技术支撑。方法 根据美洲钩虫的cox1基因序列设计荧光RPA引物及...
目的 建立基于荧光重组酶聚合酶核酸扩增(recombinase polymerase amplification, RPA)技术快速检测粪样中美洲钩虫卵的方法,并评价其效能,为快速检测粪样中美洲钩虫卵提供技术支撑。方法 根据美洲钩虫的cox1基因序列设计荧光RPA引物及探针并进行筛选,建立荧光RPA检测方法。将美洲钩虫卵基因组DNA稀释至100 pg/μL、10 pg/μL、1 pg/μL、100 fg/μL、10 fg/μL、1 fg/μL、0.1 fg/μL等7个浓度梯度以测定荧光RPA法的最低检出值,利用荧光RPA法检测日本血吸虫、蛔虫、华支睾吸虫、肝片形吸虫DNA样本进行交叉反应实验。采集44例人粪样并进行DNA提取,运用改良加藤厚涂片法(Kato-Katz)、半巢式PCR法、荧光RPA法同时检测,评价荧光RPA法的灵敏度和特异度。结果 建立的荧光RPA法可在20 min内特异性扩增出美洲钩虫cox1基因长度为194 bp的片段,最低检出值为10 fg/μL,与日本血吸虫、蛔虫、华支睾吸虫、肝片形吸虫均无交叉反应。通过对44份人粪便样本进行检测,Kato-Katz法和半巢式PCR法均检出26例阳性样本,荧光RPA法检出27例阳性样本,其中1号样本荧光曲线在反应后期略高于阴性对照,但未出现与阳性对照相似反应趋势,因此判定为疑似阴性样本。荧光RPA法与Kato-Katz法和半巢式PCR法相比,其灵敏度均为100.00%,特异度均为94.44%,检测结果一致性较好(Kappa=0.953>0.75)。结论 荧光RPA法可在短时间内实现对美洲钩虫高效、敏感、特异的检测,有望应用于美洲钩虫感染的监测及预警。
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关键词
美洲钩虫
重组酶聚合酶扩增技术
cox1基因
改良加藤厚涂片
法
半巢式pcr
法
原文传递
外套细胞淋巴瘤bcl-1基因重排的分析
被引量:
2
2
作者
孙文佶
林茂芳
Reza Parwaresch
《中华血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第4期200-202,共3页
关键词
外套细胞淋巴瘤
bcl-1基因
基因重排
主要易位簇
半巢式pcr
法
原文传递
题名
基于荧光重组酶聚合酶扩增技术快速检测美洲钩虫方法研究
被引量:
1
1
作者
梁家瑞
徐斌
胡薇
李梦茹
杨硕
郑彬
机构
中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所(国家热带病研究中心)
上海交通大学医学院-国家热带病研究中心全球健康学院
出处
《中国热带医学》
CAS
2023年第7期681-685,共5页
基金
国家科技重大专项(No.2018ZX10734404)。
文摘
目的 建立基于荧光重组酶聚合酶核酸扩增(recombinase polymerase amplification, RPA)技术快速检测粪样中美洲钩虫卵的方法,并评价其效能,为快速检测粪样中美洲钩虫卵提供技术支撑。方法 根据美洲钩虫的cox1基因序列设计荧光RPA引物及探针并进行筛选,建立荧光RPA检测方法。将美洲钩虫卵基因组DNA稀释至100 pg/μL、10 pg/μL、1 pg/μL、100 fg/μL、10 fg/μL、1 fg/μL、0.1 fg/μL等7个浓度梯度以测定荧光RPA法的最低检出值,利用荧光RPA法检测日本血吸虫、蛔虫、华支睾吸虫、肝片形吸虫DNA样本进行交叉反应实验。采集44例人粪样并进行DNA提取,运用改良加藤厚涂片法(Kato-Katz)、半巢式PCR法、荧光RPA法同时检测,评价荧光RPA法的灵敏度和特异度。结果 建立的荧光RPA法可在20 min内特异性扩增出美洲钩虫cox1基因长度为194 bp的片段,最低检出值为10 fg/μL,与日本血吸虫、蛔虫、华支睾吸虫、肝片形吸虫均无交叉反应。通过对44份人粪便样本进行检测,Kato-Katz法和半巢式PCR法均检出26例阳性样本,荧光RPA法检出27例阳性样本,其中1号样本荧光曲线在反应后期略高于阴性对照,但未出现与阳性对照相似反应趋势,因此判定为疑似阴性样本。荧光RPA法与Kato-Katz法和半巢式PCR法相比,其灵敏度均为100.00%,特异度均为94.44%,检测结果一致性较好(Kappa=0.953>0.75)。结论 荧光RPA法可在短时间内实现对美洲钩虫高效、敏感、特异的检测,有望应用于美洲钩虫感染的监测及预警。
关键词
美洲钩虫
重组酶聚合酶扩增技术
cox1基因
改良加藤厚涂片
法
半巢式pcr
法
Keywords
Necator americanus
RPA
cox1 gene
Kato-Katz
semi-nested
pcr
分类号
R383.13 [医药卫生—医学寄生虫学]
原文传递
题名
外套细胞淋巴瘤bcl-1基因重排的分析
被引量:
2
2
作者
孙文佶
林茂芳
Reza Parwaresch
机构
浙江大学医学院附属第一医院血液病研究所
Institute
出处
《中华血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第4期200-202,共3页
关键词
外套细胞淋巴瘤
bcl-1基因
基因重排
主要易位簇
半巢式pcr
法
分类号
R733.1 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于荧光重组酶聚合酶扩增技术快速检测美洲钩虫方法研究
梁家瑞
徐斌
胡薇
李梦茹
杨硕
郑彬
《中国热带医学》
CAS
2023
1
原文传递
2
外套细胞淋巴瘤bcl-1基因重排的分析
孙文佶
林茂芳
Reza Parwaresch
《中华血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2003
2
原文传递
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