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RD105缺失基因检测法用于青海省北京/W系结核分枝杆菌鉴定 被引量：3
1
作者 李斌 文飞 +6 位作者 刘寿 杜文琪 汪海静 文国颖 苏效东 瞿述根 王兆芬 《广州医药》 2015年第5期11-14,共4页
目的了解青海省北京/W系结核分枝杆菌分布特征。方法收集青海地区结核分支杆菌临床分离株,采用RD105缺失基因检测鉴定北京/W系结核分枝杆菌。结果共收集237株结核分枝杆菌临床分离株,采用RD105缺失基因检测鉴定北京/W系结核分枝杆菌220... 目的了解青海省北京/W系结核分枝杆菌分布特征。方法收集青海地区结核分支杆菌临床分离株,采用RD105缺失基因检测鉴定北京/W系结核分枝杆菌。结果共收集237株结核分枝杆菌临床分离株,采用RD105缺失基因检测鉴定北京/W系结核分枝杆菌220株,占92.8%,非北京/W结核分枝杆菌,共17株,占7.2%。北京/W系结核分枝杆菌在青海地区性别与民族分布差异没有统计学意义(P>0.05)。结论北京/W结核分枝杆菌为青海地区流行菌株,在人群易于发生感染和传播。 展开更多
关键词 结核分支杆菌 RD105 北京/w系结核分枝杆菌
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北京基因型结核分枝杆菌的研究 被引量：7
2
作者 孙蕾 杨立军 +2 位作者 郑锦辉 杨文涛 王莉 《中国防痨杂志》 CAS 2008年第3期223-226,共4页
关键词 北京基因型结核分枝杆菌 毒性 毒力 结核分枝杆菌 分枝杆菌属 结核杆菌
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潜伏期结核分枝杆菌HLA-A~*0201限制性CD8^+CTL表位的高通量筛选 被引量：4
3
作者 孙燕妮 王一松 +3 位作者 王海霞 平国玲 王甦民 张力平 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2013年第1期26-29,共4页
目的采用生物信息学软件预测并筛选结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。方法以标准株H37Rv和北京基因型结核分枝杆菌为研究对象,利用结核分枝杆菌全基因组芯片技术筛选缺氧培养后表达上调的基因... 目的采用生物信息学软件预测并筛选结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。方法以标准株H37Rv和北京基因型结核分枝杆菌为研究对象,利用结核分枝杆菌全基因组芯片技术筛选缺氧培养后表达上调的基因,应用SYFPEITHI生物信息学软件分析相关基因编码的多肽序列中可能存在的HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位;利用T2细胞进行HLA-A2结合试验,检测候选表位肽的结合亲和性,以HLA-A2解离试验检测其结合稳定性,从而筛选出HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。结果从SYFPEITHI数据库预测到的表位肽中筛选出4条能够结合HLA-A*0201分子的表位肽,通过HLA-A2结合试验得到Rv0440-1(KLQER-LAKL)、Rv0440-9(TLLKGAKEV)、RV0350-6(VLKGEVKDV)与HLA-A*0201分子之间均有较高的亲和性(FR>1.5),通过HLA-A2解离试验得到候选表位肽Rv0440-1和Rv0440-9与HLA-A*0201分子的结合具有较高的稳定性(DC50>4h)。结论经生物信息学技术预测以及HLA-A2结合与解离试验初步筛选出的Rv0440-1(KLAGGVAVI)和Rv0440-9(TLLKGAKEV)是潜伏期结核分枝杆菌HLA-A*0201限制性CD8+CTL的优势表位,但有待进一步实验验证。 展开更多
关键词 H37RV 北京基因型结核分枝杆菌 潜伏感染 基因芯片技术 生物信息学软件 CTL表位 预测
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北京和非北京基因型结核分枝杆菌生长曲线及mazEF系统的研究
4
作者 谢婉莹 赵继利 +2 位作者 杨赛丽 刘微 袁俐 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期502-508,共7页
目的研究北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达有无差异。方法测绘上述菌株及其mazEF3,6,9基因缺失和过表达菌株在标准、低氧和营养饥饿培养条件下的生长曲线。使用qRT-PCR技术检测各菌株的mazEF3, 6, 9、mazF... 目的研究北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达有无差异。方法测绘上述菌株及其mazEF3,6,9基因缺失和过表达菌株在标准、低氧和营养饥饿培养条件下的生长曲线。使用qRT-PCR技术检测各菌株的mazEF3, 6, 9、mazF3, 6,9和mazE3, 6,9基因mRNA表达水平;利用Western Blot技术检测MazF9蛋白表达水平。结果在标准和低氧条件下培养的第4、6、8、10 d,营养饥饿条件下培养的第2、4、6、8 d,北京基因型菌株的OD值(细菌数量)均高于非北京基因型菌株,差异有统计学意义(P<0.05);在上述3种培养条件下,北京和非北京基因型mazEF3,6,9缺失突变株和过表达株菌数均低于其亲本株。在mRNA、蛋白水平上,与非北京基因型菌株相比,北京基因型菌株mazEF3高表达9.55倍、mazF3高表达4.86倍、mazF6高表达2.64倍、mazF9高表达5.27倍和mazE9低表达0.16倍;mazF9蛋白高表达1.62倍,差异均具有统计学意义(P<0.05)。结论北京与非北京基因型结核分枝杆菌的生长曲线、mazEF3,6,9系统表达存在差异,mazEF系统与北京基因型菌株流行相关。 展开更多
关键词 北京基因型结核分枝杆菌 非北京基因型结核分枝杆菌 毒素-抗毒素mazEF系统 生长曲线
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mazEF系统及生物膜对北京基因型结核分枝杆菌生存能力的影响
5
作者 谢婉莹 赵继利 +2 位作者 刘微 杨赛丽 袁俐 《石河子大学学报（自然科学版）》 CAS 北大核心 2018年第6期661-668,共8页
目的探索生物膜形成能力、mazEF3,6,9系统的表达与北京基因型结核分枝杆菌生存力的相关性。方法检测北京、非北京基因型菌株与标准毒力株H37Rv在不同培养条件下的生存力、生物膜形成能力。采用PCR技术扩增上述菌株的mazE3,6,9系统,并进... 目的探索生物膜形成能力、mazEF3,6,9系统的表达与北京基因型结核分枝杆菌生存力的相关性。方法检测北京、非北京基因型菌株与标准毒力株H37Rv在不同培养条件下的生存力、生物膜形成能力。采用PCR技术扩增上述菌株的mazE3,6,9系统,并进行基因测序;使用荧光定量PCR检测所有菌株的mazEF3,6,9基因、mazF3,6,9毒素基因和mazEF3,6,9抗毒素基因的mRNA表达水平;利用WesternBlot技术检测MazF9蛋白表达水平。结果北京基因型菌株在不同培养条件下的生存力、生物膜形成能力高于非北京基因型菌株。北京、非北京基因型菌株mazF3基因193bp处发生碱基突变,由C突变为T。在mRNA表达水平上,与H37Rv相比,北京、非北京基因型菌株中mazE3低表达;非北京菌株中mazE6低表达,mazE9高表达(P<0.05)。与非北京基因型菌株相比,北京基因型菌株中mazEF3高表达、mazE9低表达、mazF3、mazF6、mazF9高表达,mazF9蛋白高表达(P<0.05)。结论北京基因型菌株具有较强的生存力和生物膜形成能力。mazEF系统的差异表达、生物膜成膜能力强可能与北京基因型菌株生存能力强相关。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 北京基因型结核分枝杆菌 毒素-抗毒素系统 生存力 生物膜
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