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VRML在分子模型中的应用 被引量:17
1
作者 何敏 谢桂荣 周家驹 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 2000年第1期133-134,共2页
介绍了虚拟现实模型语言 (VRML ,VirtualRealityModelingLanguage)及其在全球信息网 (WWW ,WorldWideWeb)上分子模型中的应用 ,并介绍了我们开发的把表征分子三维结构的MOL2或ML2格式文件转换为 4种显示模式 (线型、棍型、球棍型和空间... 介绍了虚拟现实模型语言 (VRML ,VirtualRealityModelingLanguage)及其在全球信息网 (WWW ,WorldWideWeb)上分子模型中的应用 ,并介绍了我们开发的把表征分子三维结构的MOL2或ML2格式文件转换为 4种显示模式 (线型、棍型、球棍型和空间充满型 )VRML格式文件的软件。最后 ,给出了一个应用实例。结果表明 ,VRML适合于WWW上分子模型的传输和显示。 展开更多
关键词 VRML 分子模型 化学结构 网络化学 化学数据库
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XML技术在化学深层网数据提取中的应用 被引量:9
2
作者 卓流艺 李晓霞 郭力 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1137-1141,共5页
Internet上的化学数据库是宝贵的化学信息资源,如何有效地利用这些数据是化学深层网所要解决的问题。本文总结了化学深层网的特点,基于XML技术实现从数据库检索返回的半结构化HTML页面中提取数据的目标,使之成为可供程序直接调用做进一... Internet上的化学数据库是宝贵的化学信息资源,如何有效地利用这些数据是化学深层网所要解决的问题。本文总结了化学深层网的特点,基于XML技术实现从数据库检索返回的半结构化HTML页面中提取数据的目标,使之成为可供程序直接调用做进一步计算的数据。在数据提取过程中,先采用JTidy规范化HTML,得到格式上完整、内容无误的XHTML文档,利用包含着XPath路径语言的XSLT数据转换模板实现数据转换和提取。其中XPath表达式的优劣决定了XSLT数据转换模板能否长久有效地提取化学数据,文中着重介绍了如何编辑健壮的XPath表达式,强调了XPath表达式应利用内容和属性特征实现对源树中数据的定位,并尽可能地降低表达式之间的耦合度,前瞻性地预测化学站点可能出现的变化并在XSLT数据转换模板中采取相应的措施以提高表达式的长期有效性。为创建化学深层网数据提取的XSLT数据提取模板提供方法指导。 展开更多
关键词 Web数据提取 化学深层网 XML XSLT XPATH 化学数据库
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大规模化合物子结构检索的并行实现与优化 被引量:7
3
作者 井银玲 李晓霞 +1 位作者 袁小龙 郭力 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期728-734,共7页
化合物的子结构检索在计算机辅助药物设计、波普学、化学数据库等领域是不可或缺的工具。然而由于子结构检索是一个NP完备性的问题,获得用户可接受的平均检索时间一直是研究人员十分关注的问题,其方法主要有改进算法和提升硬件条件2个... 化合物的子结构检索在计算机辅助药物设计、波普学、化学数据库等领域是不可或缺的工具。然而由于子结构检索是一个NP完备性的问题,获得用户可接受的平均检索时间一直是研究人员十分关注的问题,其方法主要有改进算法和提升硬件条件2个方面。当化学结构数据库的规模达到百万乃至千万级别时,尽管改进算法的方式能够获得一定的检索效率提升,但其提升的空间有限,因而,集群并行方式是大规模化合物子结构检索应用的必然选择。本文以ChemDB Portal的化学子结构检索系统为基础,实现了基于集群并行的化学子结构检索系统,并进行了任务均分、多线程并行等优化。在包含800万个化合物结构的化学结构数据库中,利用5个节点的小型集群,选取10个较为典型的提问结构进行子结构检索测试。测试结果为基于集群的化学子结构检索的平均检索时间由初始单节点时的34.1 min降低为2.75 min,检索效率平均提高12.4倍,表明在大规模乃至超大规模的数据条件下,集群并行化方式能够显著地提高子结构检索系统的执行效率。 展开更多
关键词 化学子结构检索 大规模化学结构检索 集群并行 化学数据库 化学信息学
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Internet上的化学化工信息资源 被引量:6
4
作者 刘淑琼 《胶体与聚合物》 2003年第1期43-44,共2页
关键词 INTERNET 化学化工信息资源 互联网 化学化工信息资源导航系统 化学软件 专利资源 化学品供应商 化学数据库
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开源软件在化学数据库分子结构检索中的应用 被引量:7
5
作者 袁小龙 李晓霞 +1 位作者 郭力 聂峰光 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1143-1146,共4页
分子结构检索是化学数据库必备的检索手段,利用开源化学软件是实现分子结构检索的有效途径。不同于商业软件的解决方案,开源本身就体现了经济性和可重复开发的特点。本文利用Java开源化学软件开发工具包如Chemistry Development Kit(CDK... 分子结构检索是化学数据库必备的检索手段,利用开源化学软件是实现分子结构检索的有效途径。不同于商业软件的解决方案,开源本身就体现了经济性和可重复开发的特点。本文利用Java开源化学软件开发工具包如Chemistry Development Kit(CDK)、JOELib的基本构件,基于JSP+Servlet+Bean+MySQL技术搭建了一个网络化学数据库结构检索平台。其中包括分子全结构和子结构检索,并实现了在线提交分子和化合物结构的三维显示等。对包含12万化合物结构信息的数据库的测试表明,该系统在经过预处理和一系列优化措施下,实现了较好的检索性能。 展开更多
关键词 分子结构检索 开源 CDK JOELib 化合物子结构检索 化学数据库 化学信息学
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SIOC化学数据库的网络化进展 被引量:5
6
作者 陈维明 王源 +2 位作者 朱谷 朱翠娣 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 1999年第5期355-356,共2页
介绍了 S I O C 上网的4 个化学数据库, 包括两个化工企业和厂商数据库,
关键词 WEB 化学数据库 红外光谱数据库 文献数据库
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DARC系统——计算机化学的一个缩影 被引量:2
7
作者 袁身刚 《有机化学》 SCIE CAS 1988年第4期289-299,共11页
本文从化学结构的 DARC 码表述方法,结构-性质相关研究的 DARC-PELCO 方法,化学数据库和计算机辅助有机合成四个方面介绍了著名的法国计算机化学研究系统,即 DARC 系统。由于这四个方面包括了计算机化学最主要的研究领域,因此本文也就... 本文从化学结构的 DARC 码表述方法,结构-性质相关研究的 DARC-PELCO 方法,化学数据库和计算机辅助有机合成四个方面介绍了著名的法国计算机化学研究系统,即 DARC 系统。由于这四个方面包括了计算机化学最主要的研究领域,因此本文也就概要地介绍了计算机化学。 展开更多
关键词 DARC 系统 DARC 化学数据库 计算机辅助有机合成
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基于Web的网络计算机技术在高校化学科研与教学中的应用 被引量:3
8
作者 闫生忠 陈亚芍 尹世伟 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1451-1454,1464,共5页
现代计算机网络使我们的生活和工作发生了革命性的变化。互联网日渐渗透到我们工作和生活的每一个角落,互联网、数据库、多媒体、分子模拟等技术的发展,使化学家的工作变得更加方便快捷。作者等就计算机网络技术在陕西师范大学化学与材... 现代计算机网络使我们的生活和工作发生了革命性的变化。互联网日渐渗透到我们工作和生活的每一个角落,互联网、数据库、多媒体、分子模拟等技术的发展,使化学家的工作变得更加方便快捷。作者等就计算机网络技术在陕西师范大学化学与材料科学学院的应用,及笔者的体会对以下两方面的内容做简要介绍和展望:(1)现代网络计算机技术的发展状况;(2)网络计算机技术在高校化学科研和教学中的应用,及其未来的发展方向。 展开更多
关键词 网络计算机技术 网格计算 化学数据库 化学科研和教学
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分析化学数据管理专家系统的实现 被引量:1
9
作者 唐全 《药学教育》 1996年第1期16-17,15,共3页
本文的目的是要介绍如何建立和使用分析数据管理专家系统,使科学工作者方便地实现知识和数据共享。 一、专家系统为实现化学数据库提供了途径 科研中的两个重要因素是专业研究领域的知识及数据管理能力。
关键词 管理专家系统 化学数据库 数据库管理系统 有毒金属离子 知识库 分配系数 掩蔽剂 系统框架 数据管理 分析化学
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网上logP数据库的实现
10
作者 荔建锋 杨铄 +1 位作者 袁身刚 郑崇直 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 2000年第1期159-160,共2页
介绍了网上数据库查询接口的实现方法以及上网的logP数据库的库结构和查询方法。
关键词 数据库 LOGP 网上查询 库结构 化学数据库
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基于化学数据库和神经网络的中学化学教学与项目化学习
11
作者 唐元杰 《化学教育(中英文)》 CAS 北大核心 2022年第1期110-114,共5页
以碳热还原和化学材料智能搜索为素材,将化学数据库和机器学习方法与讲授式教学模式有机结合。木炭燃烧和还原CuO的案例致力于增强学生对化学反应能量变化和平衡移动的认知。基于神经网络的科研实践对发展问题导向式的研学课堂具有重要... 以碳热还原和化学材料智能搜索为素材,将化学数据库和机器学习方法与讲授式教学模式有机结合。木炭燃烧和还原CuO的案例致力于增强学生对化学反应能量变化和平衡移动的认知。基于神经网络的科研实践对发展问题导向式的研学课堂具有重要启示。 展开更多
关键词 化学数据库 机器学习 化学平衡 热力学 新材料搜索
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STN国际联机检索系统中化学文献检索方法的比较与研究 被引量:1
12
作者 简南红 《图书情报工作》 CSSCI 北大核心 2001年第8期62-63,共2页
由于检索费用较高,尤其是化学结构式的检索比较复杂,因此国际联机检索在化学文献检索方面的应用受到极大的限制。本文在对STN国际联机检索系统中几个主要的化学数据库进行比较与分析的基础上,结合实际问题对化学文献的检索方法进行了比... 由于检索费用较高,尤其是化学结构式的检索比较复杂,因此国际联机检索在化学文献检索方面的应用受到极大的限制。本文在对STN国际联机检索系统中几个主要的化学数据库进行比较与分析的基础上,结合实际问题对化学文献的检索方法进行了比较与研究。 展开更多
关键词 化学文献 情报检索 检索费用 检索方法 STN 国际联机检索系统 化学数据库
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现代信息技术在化学领域的应用
13
作者 林伟忠 《肇庆学院学报》 2002年第2期85-87,89,共4页
现代信息技术被广泛应用在绿色化学、化学数据库、解决化学问题、化学教育等化学领域中,加快了化学学科的发展。未来化学将朝逻辑化、智能化方向发展。
关键词 化学领域 应用 现代信息技术 绿色化学 化学数据库 化学教育 学科发展 INTERNET
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一个开展有效服务的情报中心——介绍法国全国化学情报中心
14
作者 秦薮 《情报理论与实践》 1985年第6期37-38,共2页
当今世界每年要产生三百万篇化学文献,包括各种专著、期刊、会议论文、科技报告、专利、文摘等等,共中还包含不少有价值的数据,都发表在各种化学出版物上,存贮在300个化学数据库内。法国全国化学情报中心(Centre Nati-onal de l’Inform... 当今世界每年要产生三百万篇化学文献,包括各种专著、期刊、会议论文、科技报告、专利、文摘等等,共中还包含不少有价值的数据,都发表在各种化学出版物上,存贮在300个化学数据库内。法国全国化学情报中心(Centre Nati-onal de l’Information Chimiclue 简称 CNI-C)面临着数以百万计的化学情报源,仅有十五名工作人员,四名管理干部,依靠国家拨给的设备。 展开更多
关键词 情报中心 化学数据库 化学工业 法国 化学文献 工作人员 当今世界 美国化学文摘社 出版物 化学信息
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第三讲 专用化学数据库的设计与建立
15
作者 姚建华 李玉玲 +4 位作者 王海燕 徐雯丽 蒋舒仰 胡静 李靖靖 《上海化工》 CAS 2019年第5期7-10,共4页
在第二讲“化学数据库系统的设计策略”中,介绍了化学数据库系统的设计策略。在本期讲座中,将介绍如何利用化学数据库管理系统ISIS/BASE(MDL信息系统有限公司的产品,目前该公司已并入其他公司。)[1]和CISOC-ChIMS[2]分别建立专用的数据... 在第二讲“化学数据库系统的设计策略”中,介绍了化学数据库系统的设计策略。在本期讲座中,将介绍如何利用化学数据库管理系统ISIS/BASE(MDL信息系统有限公司的产品,目前该公司已并入其他公司。)[1]和CISOC-ChIMS[2]分别建立专用的数据库系统——防腐剂数据库和农药代谢数据库。 展开更多
关键词 化学数据库 设计策略 数据库系统 数据库管理系统 信息系统 MDL 防腐剂
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韦氏线型化学代码的应用及其发展趋势
16
作者 李伟明 《图书情报工作》 1986年第1期18-24,共7页
关于韦氏线型化学代码(Wiswesser Line-formula Chemical Notation,简称 WLN)的具体规则和应用,国内已有多篇文章介绍。目前,世界各国已有150多个机构和组织采用 WLN 法标引化合物文献,并有30—40个教育机构教授使用 WLN 的方法,WLN 规... 关于韦氏线型化学代码(Wiswesser Line-formula Chemical Notation,简称 WLN)的具体规则和应用,国内已有多篇文章介绍。目前,世界各国已有150多个机构和组织采用 WLN 法标引化合物文献,并有30—40个教育机构教授使用 WLN 的方法,WLN 规则已有英文版、法文版、德文版以及日文的翻译版。 展开更多
关键词 韦氏线 新化合物 发展趋势 化学数据库 结构检索 代码 化学工作者 亚结构 连接表 化学结构
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第三次全国机器检索交流会议论文文摘(上)
17
《情报理论与实践》 1984年第5期49-56,43,共9页
〔0348〕科学技术数据库的建设和现状第三次全国机器检索交流会论文李大年(中国科技情报所)译 1983年12月 16页本文是法国热化学数据库主任Y·DENIEL在北京所做报告的部分内容.数据库是一种情报手段,把来自各情报源的数据收集起来,... 〔0348〕科学技术数据库的建设和现状第三次全国机器检索交流会论文李大年(中国科技情报所)译 1983年12月 16页本文是法国热化学数据库主任Y·DENIEL在北京所做报告的部分内容.数据库是一种情报手段,把来自各情报源的数据收集起来,并保证这些数据的机器可存取性,这样就使社会经济统计数据或科学上的经验数据可被直接利用.数据库分为两类,一类是观测的数据,如气象数据,这种数据只能被观测到一次,是不能再现的,也无法进行校验.另一类数据库的数据是可以再现的,经校验后把基本数据存储起来.一般说,数据来自一次文献。 展开更多
关键词 机器检索 化学数据库 检索策略 微型机 文献数据库 计算机情报检索 检索结果 自动标引 查准率 标引工作
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科技情报工作现代化的重要基础——数据库
18
作者 甘道初 《图书情报工作》 1981年第4期32-33,共2页
随着现代科学技术的迅速发展,科学技术的信息量也日益剧增。据统计,现在世界上已有一千多个学科,每年发表的论文达四百多万篇。由于人工查找情报资料的速度太慢。
关键词 化学数据库 计算机 结构数据库 图书情报工作 未知物 科技情报工作 重要基础 分子结构 计算型 情报资料
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化学品信息及进展
19
作者 徐丽娟 霍本兴 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 1994年第S2期43-48,共6页
介绍了国内外化学品信息数据库的发展简况.
关键词 化学品信息 化学数据库
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结构性化学数据库的国外动态
20
作者 梁曦云 《现代图书情报技术》 1983年第4期41-43,40,共4页
关键词 化学数据库 谱图 国外动态 化学信息系统 结构性 检索系统 登录号 SANS DARC 化合物
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