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基于SNP推测中国汉族人群身高的遗传学研究
被引量:
3
1
作者
支越胜
孙亚男
+5 位作者
高行健
刘凡
李彩霞
叶健
赵雯婷
黄艳梅
《中国法医学杂志》
CSCD
2019年第2期113-119,共7页
目的选取已知与身高关联的31个SNP位点,在1220例中国汉族健康成年人群样本中验证其身高遗传关联性,并构建身高预测模型及评估该模型的推断能力。方法基于多元线性回归及logistic回归分析,在31个SNP位点中验证与中国汉族人群身高相关联的...
目的选取已知与身高关联的31个SNP位点,在1220例中国汉族健康成年人群样本中验证其身高遗传关联性,并构建身高预测模型及评估该模型的推断能力。方法基于多元线性回归及logistic回归分析,在31个SNP位点中验证与中国汉族人群身高相关联的SNP位点;利用质控后的22个SNP位点,采用加权等位基因求和法(weight allele sums,WAS)针对不同身高分类方法建立推断模型。并通过受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic, ROC)及曲线下面积(area under curve,AUC)分别计算推断准确性。结果 7个SNP位点与身高的关联得到验证,其中rs3823418、rs2166898、rs4821083及rs6030712来自东亚人群研究,rs11021504来自中国汉族人群研究,rs3816804、rs3751599在欧洲和中国汉族人群研究中均有报道。四川男性群体二元分类身高预测模型的AUC值为0.67(95%CI:0.55-0.79),稍高于Aulchenko等研究(AUC=0.65),但低于Liu等研究(AUC=0.75,95%CI:0.72-0.79)。结论本研究揭示了身高遗传位点具有人群差异性,筛选与某一群体身高遗传显著相关的SNP位点,结合适当的特征分类方法,有望构建出对该群体推断效果较好的身高模型。
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关键词
法医遗传学
身高
加权
等位基因
求和
中国汉族人群
身高预测
原文传递
题名
基于SNP推测中国汉族人群身高的遗传学研究
被引量:
3
1
作者
支越胜
孙亚男
高行健
刘凡
李彩霞
叶健
赵雯婷
黄艳梅
机构
新乡医学院法医学院
公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心现场物证溯源技术国家工程实验室法医遗传学公安部重点实验室
济宁医学院法医学与医学检验学院
中国科学院北京基因组研究所
出处
《中国法医学杂志》
CSCD
2019年第2期113-119,共7页
基金
国家自然科学基金(编号:81471828)
国家重点研发计划(编号:2017YFC0803501)
法医遗传学公安部重点实验室开放课题(2017FGKFKT06)
文摘
目的选取已知与身高关联的31个SNP位点,在1220例中国汉族健康成年人群样本中验证其身高遗传关联性,并构建身高预测模型及评估该模型的推断能力。方法基于多元线性回归及logistic回归分析,在31个SNP位点中验证与中国汉族人群身高相关联的SNP位点;利用质控后的22个SNP位点,采用加权等位基因求和法(weight allele sums,WAS)针对不同身高分类方法建立推断模型。并通过受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic, ROC)及曲线下面积(area under curve,AUC)分别计算推断准确性。结果 7个SNP位点与身高的关联得到验证,其中rs3823418、rs2166898、rs4821083及rs6030712来自东亚人群研究,rs11021504来自中国汉族人群研究,rs3816804、rs3751599在欧洲和中国汉族人群研究中均有报道。四川男性群体二元分类身高预测模型的AUC值为0.67(95%CI:0.55-0.79),稍高于Aulchenko等研究(AUC=0.65),但低于Liu等研究(AUC=0.75,95%CI:0.72-0.79)。结论本研究揭示了身高遗传位点具有人群差异性,筛选与某一群体身高遗传显著相关的SNP位点,结合适当的特征分类方法,有望构建出对该群体推断效果较好的身高模型。
关键词
法医遗传学
身高
加权
等位基因
求和
中国汉族人群
身高预测
Keywords
Forensic genetics
Height weighted allele sums(WAS)
Area under ROC curve(AUC)
Height prediction
分类号
D919.1 [医药卫生—法医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SNP推测中国汉族人群身高的遗传学研究
支越胜
孙亚男
高行健
刘凡
李彩霞
叶健
赵雯婷
黄艳梅
《中国法医学杂志》
CSCD
2019
3
原文传递
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