期刊导航
期刊开放获取
cqvip
退出
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
3
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
应用序列特征分析基因剪接信号
被引量：
2
1
作者
马猛
汪洋
《计算机工程与应用》
CSCD
2012年第27期180-185,共6页
在基因选择性剪接调控过程中,有各种剪接信号参与其中,如剪接位点、剪接调控元件等。如何识别这些剪接信号、研究其在基因组中的分布规律是一个有趣的问题。设计了一个基于序列特征的剪接信号打分算法,该算法可赋予每个信号一个分值,表...
在基因选择性剪接调控过程中,有各种剪接信号参与其中,如剪接位点、剪接调控元件等。如何识别这些剪接信号、研究其在基因组中的分布规律是一个有趣的问题。设计了一个基于序列特征的剪接信号打分算法,该算法可赋予每个信号一个分值,表示其信号强度。基于该打分算法所构建的分类器可用于预测识别新的剪接信号。应用该打分算法研究剪接位点和剪接调控元件在基因组中的分布,发现这两类信号具有互补特性。该研究提供了一种可用于分析生物序列数据的新方法,给出了一个从生物信息学角度来研究基因调控问题的新途径。
展开更多
关键词
序列特征
基因
剪接
剪接
位点
剪接
调控
元件
下载PDF
职称材料
一个RNA剪接调控元件分类方法的研究
2
作者
马猛
汪洋
+1 位作者
汝颖
王泽锋
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期45-52,共8页
序列分类方法被广泛应用于各种生物信息学问题,例如转录调控元件识别和蛋白结构预测。本研究设计了一个新的基于序列特征的分类方法,并将其用于RNA剪接调控元件的研究。该方法从已知剪接元件中抽取序列特征,构建一个打分算法,由此预测...
序列分类方法被广泛应用于各种生物信息学问题,例如转录调控元件识别和蛋白结构预测。本研究设计了一个新的基于序列特征的分类方法,并将其用于RNA剪接调控元件的研究。该方法从已知剪接元件中抽取序列特征,构建一个打分算法,由此预测未知元件RNA剪接调控功能。作为应用实例,采用已知外显子剪接增强子和沉默子(ESE和ESS)八联体作为实验数据,对本方法和若干已知常用方法的预测结果进行比较,3类计算验证实验中的平均预测精度为93%,表现出良好预测精度,且其透明的预测结构可帮助进行生物解释。该研究提供了一种可用于分析生物序列数据的新方法,给出了一个从生物信息学角度来研究基因调控问题的新途径。
展开更多
关键词
数据挖掘
序列特征
选择性
剪接
剪接
调控
元件
下载PDF
职称材料
基于移动序列模式分析人基因组调控短序列
3
作者
施梦军
赵海峰
+1 位作者
陈虹
马猛
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期4253-4259,共7页
基因表达过程主要包括转录、剪接和翻译,多种调控元件参与其中,是个高度调控的过程。建模识别分析这些调控元件,对理解基因表达具有重要意义。本研究提出了一个基于移动序列模式的短序列建模模型,并对转录启动子和剪接调控元件进行了建...
基因表达过程主要包括转录、剪接和翻译,多种调控元件参与其中,是个高度调控的过程。建模识别分析这些调控元件,对理解基因表达具有重要意义。本研究提出了一个基于移动序列模式的短序列建模模型,并对转录启动子和剪接调控元件进行了建模分析。启动子是基因转录的核心调控元件,剪接调控元件参与调控剪接位点的识别。分类实验结果表明,该模型可有效识别转录启动子序列和剪接调控元件序列。并进一步利用该模型,建模分析已为生物实验验证的、会导致剪接影响的基因组变异,实验结果表明,该模型可有效预测基因组变异的剪接影响,进一步验证了该模型的有效性。
展开更多
关键词
序列特征
基因表达
剪接
调控
元件
启动子
原文传递
题名
应用序列特征分析基因剪接信号
被引量：
2
1
作者
马猛
汪洋
机构
安徽大学计算机科学技术学院
美国北卡罗来纳大学教堂山分校药理学系
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
2012年第27期180-185,共6页
基金
安徽省自然科学基金(No.1208085QF120)
安徽大学博士科研启动基金(No.33190013)
文摘
在基因选择性剪接调控过程中,有各种剪接信号参与其中,如剪接位点、剪接调控元件等。如何识别这些剪接信号、研究其在基因组中的分布规律是一个有趣的问题。设计了一个基于序列特征的剪接信号打分算法,该算法可赋予每个信号一个分值,表示其信号强度。基于该打分算法所构建的分类器可用于预测识别新的剪接信号。应用该打分算法研究剪接位点和剪接调控元件在基因组中的分布,发现这两类信号具有互补特性。该研究提供了一种可用于分析生物序列数据的新方法,给出了一个从生物信息学角度来研究基因调控问题的新途径。
关键词
序列特征
基因
剪接
剪接
位点
剪接
调控
元件
Keywords
sequential feature
gene splicing
splice sites
splicing regulatory elements
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
一个RNA剪接调控元件分类方法的研究
2
作者
马猛
汪洋
汝颖
王泽锋
机构
北卡罗来纳大学教堂山分校药理学系
安徽大学计算机科学技术学院
安徽省立医院内分泌科
出处
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期45-52,共8页
基金
American Heart Association for Z.W(0865329E)
国家青年自然科学基金(81000321)
+1 种基金
安徽省高校省自然科学基金(KJ2010B385)
安徽大学博士科研启动基金(02303319)
文摘
序列分类方法被广泛应用于各种生物信息学问题,例如转录调控元件识别和蛋白结构预测。本研究设计了一个新的基于序列特征的分类方法,并将其用于RNA剪接调控元件的研究。该方法从已知剪接元件中抽取序列特征,构建一个打分算法,由此预测未知元件RNA剪接调控功能。作为应用实例,采用已知外显子剪接增强子和沉默子(ESE和ESS)八联体作为实验数据,对本方法和若干已知常用方法的预测结果进行比较,3类计算验证实验中的平均预测精度为93%,表现出良好预测精度,且其透明的预测结构可帮助进行生物解释。该研究提供了一种可用于分析生物序列数据的新方法,给出了一个从生物信息学角度来研究基因调控问题的新途径。
关键词
数据挖掘
序列特征
选择性
剪接
剪接
调控
元件
Keywords
data mining
sequential features
alternative splicing
splicing regulatory elements
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
下载PDF
职称材料
题名
基于移动序列模式分析人基因组调控短序列
3
作者
施梦军
赵海峰
陈虹
马猛
机构
安徽大学、计算机科学与技术学院
西奈山伊坎医学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第10期4253-4259,共7页
基金
国家自然基金(No.61300057
No.81000321)
+1 种基金
安徽省教育厅重点项目(KJ2016A040
KJ2013A007)共同资助
文摘
基因表达过程主要包括转录、剪接和翻译,多种调控元件参与其中,是个高度调控的过程。建模识别分析这些调控元件,对理解基因表达具有重要意义。本研究提出了一个基于移动序列模式的短序列建模模型,并对转录启动子和剪接调控元件进行了建模分析。启动子是基因转录的核心调控元件,剪接调控元件参与调控剪接位点的识别。分类实验结果表明,该模型可有效识别转录启动子序列和剪接调控元件序列。并进一步利用该模型,建模分析已为生物实验验证的、会导致剪接影响的基因组变异,实验结果表明,该模型可有效预测基因组变异的剪接影响,进一步验证了该模型的有效性。
关键词
序列特征
基因表达
剪接
调控
元件
启动子
Keywords
Sequential pattern
Gene expression
Splicing regulatory elements
Promoter
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用序列特征分析基因剪接信号
马猛
汪洋
《计算机工程与应用》
CSCD
2012
2
下载PDF
职称材料
2
一个RNA剪接调控元件分类方法的研究
马猛
汪洋
汝颖
王泽锋
《中国生物医学工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
0
下载PDF
职称材料
3
基于移动序列模式分析人基因组调控短序列
施梦军
赵海峰
陈虹
马猛
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部
