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长松萝中非核糖体肽合成酶NRPS基因克隆与鉴定
被引量：
3
1
作者
原晓龙
陈剑
+3 位作者
张传光
毕玮
王娟
王毅
《西部林业科学》
CAS
2016年第1期14-20,24,共8页
非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、...
非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、分子系统进化分析及基因表达分析。结果表明:在地衣型真菌中,非核糖体肽在长松萝中为首次发现,BLAST比对表明其为NRPS基因的A结构域,生物信息学分析显示Us NRPS蛋白是一种非分泌蛋白,位于细胞质基质中;分子进化分析显示Us NRPS与埃默森蓝状菌(Rasamsonia emersonii)的NRPS基因的A结构域蛋白聚为一类;RT-PCR分析表明:2%肌醇、10%甘露醇、2%山梨醇、2%葡萄糖、10%葡萄糖、0.2%谷氨酰胺、1%甘氨酸、0.2%丙氨酸能够诱导NRPS基因的轻微表达,2%、10%蔗糖和果糖均能诱导NRPS基因的强烈表达;0.2%、1%的天冬氨酸均抑制NRPS基因的诱导表达。
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关键词
长松萝
NRPS
基因克隆
生物信息学
分析
分
子系统
进化
分析
诱导表达
下载PDF
职称材料
地衣型真菌皮革肾岛衣中1个Ⅲ型聚酮合酶基因的克隆与鉴定
2
作者
原晓龙
华梅
+2 位作者
陈剑
王娟
王毅
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期2146-2152,共7页
该研究通过对皮革肾岛衣地衣型真菌转录组数据的分析,利用RT-PCR技术,首次克隆得到1个Ⅲ型聚酮合酶基因(NpPKS3),并分析该基因在不同培养基上的表达,以选择皮革肾岛衣地衣型真菌的最佳培养基,为研究NpPKS3基因功能奠定基础,并为异源表...
该研究通过对皮革肾岛衣地衣型真菌转录组数据的分析,利用RT-PCR技术,首次克隆得到1个Ⅲ型聚酮合酶基因(NpPKS3),并分析该基因在不同培养基上的表达,以选择皮革肾岛衣地衣型真菌的最佳培养基,为研究NpPKS3基因功能奠定基础,并为异源表达皮革肾岛衣地衣型真菌的聚酮类化合物提供研究材料。结果表明:(1)NpPKS3基因(GenBank登录号MF351559)全长1 335bp,编码444个氨基酸,其产物为NpPKS3蛋白,在细胞质基质中发挥功能。(2)系统进化分析显示,NpPKS3基因编码的氨基酸序列与Ⅲ型聚酮合酶的csyB亚组聚为一支,推测该基因编码csyB类酶蛋白。(3)采用"一菌多产物"策略研究发现,NpPKS3基因在BMG培养基中表达能力最强,在BD培养基上表达能力最弱。
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关键词
皮革肾岛衣
Ⅲ型聚酮合酶
分
子系统
进化
分析
一菌多产物
下载PDF
职称材料
题名
长松萝中非核糖体肽合成酶NRPS基因克隆与鉴定
被引量：
3
1
作者
原晓龙
陈剑
张传光
毕玮
王娟
王毅
机构
云南省林业科学院
云南省森林植物培育与开发利用重点实验室
云南农业大学
出处
《西部林业科学》
CAS
2016年第1期14-20,24,共8页
基金
国家自然科学青年科学基金项目(31400488)
云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目(2010CI016)
文摘
非核糖体肽具抗生素、抗病毒、抗癌及免疫抑制剂等重要的药用价值。以长松萝的地衣型真菌为研究材料,通过同源克隆和Gene walking的方法获取长松萝地衣型真菌全长非核糖体肽合成酶基因(Us NRPS),并对得到的Us NRPS进行生物信息学分析、分子系统进化分析及基因表达分析。结果表明:在地衣型真菌中,非核糖体肽在长松萝中为首次发现,BLAST比对表明其为NRPS基因的A结构域,生物信息学分析显示Us NRPS蛋白是一种非分泌蛋白,位于细胞质基质中;分子进化分析显示Us NRPS与埃默森蓝状菌(Rasamsonia emersonii)的NRPS基因的A结构域蛋白聚为一类;RT-PCR分析表明:2%肌醇、10%甘露醇、2%山梨醇、2%葡萄糖、10%葡萄糖、0.2%谷氨酰胺、1%甘氨酸、0.2%丙氨酸能够诱导NRPS基因的轻微表达,2%、10%蔗糖和果糖均能诱导NRPS基因的强烈表达;0.2%、1%的天冬氨酸均抑制NRPS基因的诱导表达。
关键词
长松萝
NRPS
基因克隆
生物信息学
分析
分
子系统
进化
分析
诱导表达
Keywords
Usnea longissimi
NRPS
gene clone
bioinformatics analysis
molecular phylogeny evolution
inducible expression
分类号
R284 [医药卫生—中药学]
R285 [医药卫生—中医学]
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职称材料
题名
地衣型真菌皮革肾岛衣中1个Ⅲ型聚酮合酶基因的克隆与鉴定
2
作者
原晓龙
华梅
陈剑
王娟
王毅
机构
云南省林业科学院
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期2146-2152,共7页
基金
国家自然科学青年科学基金(31400488)
云南省应用基础研究计划面上项目(2016FB055)
对外科技合作计划(2015IA004)
文摘
该研究通过对皮革肾岛衣地衣型真菌转录组数据的分析,利用RT-PCR技术,首次克隆得到1个Ⅲ型聚酮合酶基因(NpPKS3),并分析该基因在不同培养基上的表达,以选择皮革肾岛衣地衣型真菌的最佳培养基,为研究NpPKS3基因功能奠定基础,并为异源表达皮革肾岛衣地衣型真菌的聚酮类化合物提供研究材料。结果表明:(1)NpPKS3基因(GenBank登录号MF351559)全长1 335bp,编码444个氨基酸,其产物为NpPKS3蛋白,在细胞质基质中发挥功能。(2)系统进化分析显示,NpPKS3基因编码的氨基酸序列与Ⅲ型聚酮合酶的csyB亚组聚为一支,推测该基因编码csyB类酶蛋白。(3)采用"一菌多产物"策略研究发现,NpPKS3基因在BMG培养基中表达能力最强,在BD培养基上表达能力最弱。
关键词
皮革肾岛衣
Ⅲ型聚酮合酶
分
子系统
进化
分析
一菌多产物
Keywords
Nephrmopsis pallescens
polyketide synthase Ⅲ
phylogentic analysis
OSMAC
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q786
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长松萝中非核糖体肽合成酶NRPS基因克隆与鉴定
原晓龙
陈剑
张传光
毕玮
王娟
王毅
《西部林业科学》
CAS
2016
3
下载PDF
职称材料
2
地衣型真菌皮革肾岛衣中1个Ⅲ型聚酮合酶基因的克隆与鉴定
原晓龙
华梅
陈剑
王娟
王毅
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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