二代测序技术动态监测循环肿瘤DNA在淋巴瘤中的研究进展

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作者 谢炜基 王娟 张翼鷟 《白血病．淋巴瘤》 CAS 2024年第4期253-256,共4页

传统淋巴瘤的疾病诊断和复发监测依赖于病理活组织检查和影像学检查,但各有其局限性,难以满足淋巴瘤患者个体化管理的需求。循环肿瘤DNA(ctDNA)是来源于肿瘤细胞的片段DNA。基于ctDNA的液体活组织检查是一种创新性技术,具有灵敏度高、... 传统淋巴瘤的疾病诊断和复发监测依赖于病理活组织检查和影像学检查,但各有其局限性,难以满足淋巴瘤患者个体化管理的需求。循环肿瘤DNA(ctDNA)是来源于肿瘤细胞的片段DNA。基于ctDNA的液体活组织检查是一种创新性技术,具有灵敏度高、特异度强、创伤性小、实时性和可重复性等优点,在淋巴瘤患者的诊断、基因分型、预后判断、疗效评估、指导治疗、复发监测和耐药机制探索等方面具有应用潜力。现就基于二代测序技术动态监测ctDNA在淋巴瘤患者中的研究进展进行综述。 展开更多

关键词 二代测序 循环肿瘤DNA 分子监测 血液肿瘤

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新型数字PCR对慢性粒细胞白血病BCR-ABL融合基因的检测效果研究 被引量：1

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作者 阮敏 张丽丽 +4 位作者 李野墨 李岱阳 袁志阳 郑仲征 曾庆曙 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1647-1656,共10页

目的:针对慢性粒细胞白血病建立用于BCR-ABL融合基因检测的新型d PCR体系,探讨其在BCR-ABL^(p190/210/230)检测中的分析性能和临床适用性。方法:开发检测BCR-ABL^(p190/210/230)的新型d PCR体系,比较其与q PCR的灵敏度差异,及在慢性粒... 目的:针对慢性粒细胞白血病建立用于BCR-ABL融合基因检测的新型d PCR体系,探讨其在BCR-ABL^(p190/210/230)检测中的分析性能和临床适用性。方法:开发检测BCR-ABL^(p190/210/230)的新型d PCR体系,比较其与q PCR的灵敏度差异,及在慢性粒细胞白血病患者减药或停药期间药物副作用改善的差异。结果:在176份样本中,q PCR和d PCR在检测BCR-ABL的灵敏度方面表现出较高的一致性(82.39%),d PCR的阳性率约为q PCR的5倍(20.45%vs 3.98%)。随访期间,减药或停药的初始d PCR阴性患者较减药或停药前血常规(25%vs 10%)、肾/肝/胃(25%vs20%)及心脏功能(10%vs 0)均有明显改善。结论:d PCR检测体系可应用于BCR-ABL^(p190/210/230)检测,较q PCR一致性佳,阳性检出率高,基于d PCR指导的停药或减少剂量在改善药物副作用上有一定效果。 展开更多

关键词 慢性粒细胞白血病 BCR-ABL 数字聚合酶链反应 分子监测 副作用

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欧洲疾病预防控制中心《百日咳鲍特菌的实验室诊断和分子监测》解读

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作者 胡亚红 姚开虎 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期755-759,共5页

百日咳是一种极具传染性的急性呼吸道感染性疾病,尽管已广泛开展了儿童疫苗接种,但并不能由此获得终身免疫。为应对百日咳在世界流行的挑战,2022年12月21日欧洲疾病预防控制中心发布了《百日咳鲍特菌的实验室诊断和分子监测》,详细描述... 百日咳是一种极具传染性的急性呼吸道感染性疾病,尽管已广泛开展了儿童疫苗接种,但并不能由此获得终身免疫。为应对百日咳在世界流行的挑战,2022年12月21日欧洲疾病预防控制中心发布了《百日咳鲍特菌的实验室诊断和分子监测》,详细描述了百日咳实验室诊断和分子监测的方案,值得我国从事百日咳诊疗的医护人员和技术人员研究学习,现介绍并解读该文件的主要内容。 展开更多

关键词 百日咳鲍特菌 实验室诊断 分子监测

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弓形虫529重复序列检测方法的比较

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作者 殷位刚 朱银银 +1 位作者 杨佩才 张洪英 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2023年第12期111-116,共6页

旨在通过比较针对弓形虫529 bp重复序列片段(Rep-529)的环介导等温扩增(LAMP)和荧光定量PCR(qPCR),筛选出较优的弓形虫DNA检测方法,并初步应用于宠物猫弓形虫感染检测。试验以含有弓形虫Rep-529的质粒作为模板,比较文献报道和自主设计... 旨在通过比较针对弓形虫529 bp重复序列片段(Rep-529)的环介导等温扩增(LAMP)和荧光定量PCR(qPCR),筛选出较优的弓形虫DNA检测方法,并初步应用于宠物猫弓形虫感染检测。试验以含有弓形虫Rep-529的质粒作为模板,比较文献报道和自主设计的引物组的最低检测限,并用其他病原DNA进行交叉反应性测试,用筛选出的最优引物组对宠物猫粪中弓形虫DNA进行检测。结果表明:以包含Rep-529的质粒为模板比较检出限,LAMP 529-11引物组检测限最低,为10^(3) copies/μL;其次为文献报道的LAMP RE引物组和qPCR引物组,检测限均为10^(4) copies/μL;LAMP 529-3和2021引物组的检测限最高,均为10^(5) copies/μL;各引物组对隐孢子虫、贾第鞭毛虫、旋毛虫、大肠杆菌、鼠伤寒沙门菌、细小病毒DNA均无扩增;用LAMP 529-11引物组,对39只宠物猫弓形虫总检出率为33.33%(13/39),其中29份粪便中检出11份阳性(37.93%,11/29),10份肛拭子中检出2份阳性(20.00%,2/10)。总之,以弓形虫Rep-529重复序列为靶基因,本研究筛选获得的LAMP 529-11引物组快速、敏感且特异,在30 min内对弓形虫DNA进行有效扩增;用该法检测发现,33.33%的宠物猫正在排出卵囊,对环境和人类具有较大的潜在污染和传染风险。 展开更多

关键词 弓形虫 感染 分子监测 LAMP qPCR

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慢性粒细胞白血病患者酪氨酸激酶抑制剂的耐药管理 被引量：3

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作者 扈臣媛 闫志凌 徐开林 《国际输血及血液学杂志》 CAS 2017年第1期-,共6页

酪氨酸激酶抑制剂(TKI)的应用使慢性粒细胞白血病(CML)的治疗发生了革命性的变化,但是随着其在临床中的广泛应用,耐药成为临床治疗中面临的巨大挑战.二代、三代TKI.及某些新型药物的研发给一代TKI伊马替尼(IM)耐药的患者带来了新的治疗... 酪氨酸激酶抑制剂(TKI)的应用使慢性粒细胞白血病(CML)的治疗发生了革命性的变化,但是随着其在临床中的广泛应用,耐药成为临床治疗中面临的巨大挑战.二代、三代TKI.及某些新型药物的研发给一代TKI伊马替尼(IM)耐药的患者带来了新的治疗选择和希望.不断完善的疗效监测体系和ABL激酶区突变检测的应用为TKI的选择、疗效评价,以及药物转换提供了客观且敏感的指标.因此,只有将治疗药物与相应的监测体系相结合,才能使CML患者得到更为合理和规范的治疗.本文拟就CML患者使用TKI耐药后,治疗方案选择及疗效监测体系的研究进展进行阐述. 展开更多

关键词 白血病 髓系 慢性 BCR-ABL阳性 蛋白酪氨酸激酶类 蛋白激酶抑制剂 分子监测

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二代测序技术在骨髓增生异常综合征诊治中的临床应用 被引量：3

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作者 宋陆茜 常春康 《诊断学理论与实践》 2016年第6期556-560,共5页

骨髓增生异常综合征（myelodysplastic syndromes,MDS）是常见的髓系恶性肿瘤,由于其临床预后异质性很大,因此逐渐形成了基于不同预后风险组的分层治疗,而对于MDS预后风险的评估,目前很大部分是基于细胞遗传学特征进行的。临床发现,大部... 骨髓增生异常综合征（myelodysplastic syndromes,MDS）是常见的髓系恶性肿瘤,由于其临床预后异质性很大,因此逐渐形成了基于不同预后风险组的分层治疗,而对于MDS预后风险的评估,目前很大部分是基于细胞遗传学特征进行的。临床发现,大部分MDS患者核型由于缺乏特征性结构改变和易位而显示正常,但实际上通过分子遗传学研究可以进一步检测到其存在如SF3B1、DNMT3A、U2AF1/2、ASXL1、TP53等基因突变, 展开更多

关键词 骨髓增生异常综合征 二代测序 分子监测

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循环肿瘤DNA在B细胞非霍奇金淋巴瘤中的研究进展 被引量：2

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作者 宋妮妮 盛立霞 欧阳桂芳 《白血病．淋巴瘤》 CAS 2019年第5期305-308,共4页

从分子水平监测非霍奇金淋巴瘤(NHL)患者的疾病状态对精准的个体化管理具有重要意义。基于新型二代测序的方法能够以极高的灵敏度从外周血中定量检测循环肿瘤DNA(ctDNA),其可克服活组织检查和成像扫描的弊端,作为NHL的新型生物标志物,... 从分子水平监测非霍奇金淋巴瘤(NHL)患者的疾病状态对精准的个体化管理具有重要意义。基于新型二代测序的方法能够以极高的灵敏度从外周血中定量检测循环肿瘤DNA(ctDNA),其可克服活组织检查和成像扫描的弊端,作为NHL的新型生物标志物,为治疗前、治疗期间和治疗后的疾病精准分型、预后评估、疗效判断以及复发监测带来新的机遇,并可能最终改善患者预后。 展开更多

关键词 淋巴瘤 非霍奇金 循环肿瘤DNA 分子监测

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石河子地区棉花黄萎病菌致病型的分子监测

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作者 康东岭 秦建新 +2 位作者 王亦辉 肖林清 张莉 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第17期7141-7142,7154,共3页

[目的]查明落叶型黄萎病菌在石河子地区的存在情况。[方法]采用了PCR技术对石河子地区棉花黄萎菌系进行检测,监测石河子地区棉花黄萎病菌致病类型。[结果]利用非落叶型棉花黄萎病菌的的特异引物ND1、ND2对石河子棉区采来的114个棉花黄... [目的]查明落叶型黄萎病菌在石河子地区的存在情况。[方法]采用了PCR技术对石河子地区棉花黄萎菌系进行检测,监测石河子地区棉花黄萎病菌致病类型。[结果]利用非落叶型棉花黄萎病菌的的特异引物ND1、ND2对石河子棉区采来的114个棉花黄萎病菌菌系进行PCR扩增,108个菌系扩增出1500bp的片段,与文献中报道的非落叶型棉花黄萎菌系扩增出的片段大小一致,说明这些菌系为非落叶型棉花黄萎菌系;而剩余的6个菌系未扩增出任何片段;利用落叶型黄萎病菌的特异性引物D1、D2对这6个菌系进行扩增,也未扩增出任何片段。[结论]非落叶型黄萎病菌占供试菌系的99.5%,表明目前石河子地区棉花黄萎病菌依旧以非落叶型黄萎病菌为主。 展开更多

关键词 致病型 黄萎病菌 分子监测

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代谢组学技术在精准医疗中的运用 被引量：9

9

作者 陈朴 陈斌 《航天医学与医学工程》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期144-149,共6页

个体差异的存在对复杂的代谢综合征(如糖尿病、肥胖、心血管疾病)和癌症治疗及预防带来了巨大的挑战。精准医疗策略利用高通量的分子监测技术筛选与疾病相关的生物标志物,为疾病发生的病理学机理研究及动态监测提供了新的思路。在精准... 个体差异的存在对复杂的代谢综合征(如糖尿病、肥胖、心血管疾病)和癌症治疗及预防带来了巨大的挑战。精准医疗策略利用高通量的分子监测技术筛选与疾病相关的生物标志物,为疾病发生的病理学机理研究及动态监测提供了新的思路。在精准医疗的分子监测技术中,代谢组学技术分析的结果与疾病发生的相关性最高。本文对代谢组学技术在精准医疗中的运用进行阐述,主要包括代谢组学技术的优点,代谢表型的影响因素和代谢组学在疾病监测中的运用,旨在促进精准医疗策略在人体健康管理中的运用。 展开更多

关键词 精准医疗 代谢组学 疾病监测 分子监测技术 高通量

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单分子科学前沿—监测、操纵与表征

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作者 李希明 《实验室科学》 2012年第1期91-95,共5页

单分子监测与操纵(Single-Molecule Observation and Manipulation)综合利用光学工具、荧光标记和扫描探针显微技术对单分子进行成像和监测。过去在观测大分子行为时,必须设法使样本中反应同步进行,以获取相对准确的分布信息。而单分子... 单分子监测与操纵(Single-Molecule Observation and Manipulation)综合利用光学工具、荧光标记和扫描探针显微技术对单分子进行成像和监测。过去在观测大分子行为时,必须设法使样本中反应同步进行,以获取相对准确的分布信息。而单分子监测与操纵技术的出现,使得研究生理环境下的实时反应中大分子的构型、分布和反应进程成为可能,并为进一步解释DNA转录、RNA聚合、动力蛋白和蛋白质折叠机理等一系列过程提供了有力的研究手段。使用扫描隧道显微镜(Scanning Tunneling Microscope,STM),可以更为深刻地观察分子的量子电动力学行为,理解分子水平上力学作用、电磁作用及化学作用的相互影响,并以此为基础设计极其高效的纳米器件。对上述三个领域(光学工具、荧光标记、扫描探针显微技术)做了简要介绍,并重点阐述其在生物大分子研究中的具体应用。 展开更多

关键词 单分子监测与操纵 荧光标记 扫描探针显微技术 光学镊子

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非洲猪瘟病毒p72和CD2v双基因实时荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用 被引量：7

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作者 蔡晓丽 区贤斌 李雪平 《动物医学进展》 北大核心 2021年第11期41-47,共7页

为了建立一种快速、准确、敏感的非洲猪瘟病毒p72和CD2v基因双重荧光定量PCR方法,根据GenBank公布的ASFV基因序列,针对p72基因保守区域和CD2v基因保守区域分别设计特异性引物和探针,并且对反应条件进行了优化。结果显示,该方法对ASFV p7... 为了建立一种快速、准确、敏感的非洲猪瘟病毒p72和CD2v基因双重荧光定量PCR方法,根据GenBank公布的ASFV基因序列,针对p72基因保守区域和CD2v基因保守区域分别设计特异性引物和探针,并且对反应条件进行了优化。结果显示,该方法对ASFV p72、CD2v基因呈现特异性扩增,对猪瘟病毒(CSFV)、口蹄疫病毒(FMDV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪肺炎支原体均无扩增。建立的方法可检出低至7.3 copies/μL~24.5 copies/μL的ASFV核酸。用建立的方法检测2017年以前保存的105份来自国内猪场的血清和组织样本,105份样品均无ASFV核酸扩增。用该方法检测5份ASFV灭活参考样品,符合率为100%。说明建立的方法快速、敏感、准确,可用于ASFV的分子诊断和监测。 展开更多

关键词 非洲猪瘟病毒 双重荧光定量PCR 分子诊断和监测

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一种荧光单分子高精度快速跟踪方法的研究 被引量：2

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作者 鄢志丹 孙立东 +2 位作者 李艳宁 胡小唐 P.Zeppenfeld 《光学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第7期1994-2000,共7页

论述了一种高精度快速的单分子实时跟踪方法,包括图像去噪处理与高斯掩模质心法相结合的定位算法和同时考虑等效光强和帧间最大运动位移的同分子概率链接算法。对不同信噪比（SNR）下的单分子荧光图像的仿真结果表明,该定位算法与被认... 论述了一种高精度快速的单分子实时跟踪方法,包括图像去噪处理与高斯掩模质心法相结合的定位算法和同时考虑等效光强和帧间最大运动位移的同分子概率链接算法。对不同信噪比（SNR）下的单分子荧光图像的仿真结果表明,该定位算法与被认为表现最好的二维直接高斯拟合相比,不仅运算时间缩短为原来的1/10,而且在整个测试信噪比范围内具有更低的偏差和更好的精度,甚至在低信噪比时也能得到可信的小偏差、高精度中心位置值。在普通个人计算机上利用该方法对单分子的百万像素级序列帧进行实时跟踪时,跟踪速率能达到4~5 frame/s。 展开更多

关键词 图像处理 荧光成像处理 单分子跟踪 图像去噪高斯掩模(IDGM)法 实时分子运动监测

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基于JQuery+SSH的水禽动态监测平台研究

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作者 吴小香 王永红 陆惠轩 《现代农业科技》 2017年第23期285-286,共2页

国家水禽示范基地需要对保存的多个水禽品种开展分子遗传监测研究,分析水禽分子遗传监测的各种参数和内在联系。本文研究了基于JQuery+SSH的水禽动态监测平台的开发和应用,实现了水禽良种数据的录入及查询功能,大大提高了数据监测效率。

关键词 JQuery+SSH 水禽动态监测 分子遗传监测 国家水禽示范基地

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