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玉米耐冷基因ZmCOLD1的结构和表达模式分析
1
作者 吕庆雪 李穆 +3 位作者 周迎鑫 周德龙 张建新 宋广树 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期59-65,共7页
低温冷害是影响玉米生产的重要环境因素之一。基于水稻中调控耐低温的OsCOLD1基因编码序列,通过Blast比对获得高度同源的玉米ZmCOLD1基因编码序列,进而对ZmCOLD1基因的分子特征和编码蛋白的亚细胞定位进行分析,并进行ZmCOLD1基因过表达... 低温冷害是影响玉米生产的重要环境因素之一。基于水稻中调控耐低温的OsCOLD1基因编码序列,通过Blast比对获得高度同源的玉米ZmCOLD1基因编码序列,进而对ZmCOLD1基因的分子特征和编码蛋白的亚细胞定位进行分析,并进行ZmCOLD1基因过表达遗传转化载体的构建。结果表明,ZmCOLD1基因编码区长度为1647 bp,编码548个氨基酸,理论等电点(pI)4.95,估计分子量为137457.13 Da,属疏水蛋白。利用ClustalX进行蛋白质序列的比对,进行ZmCOLD1基因系统进化树分析,ZmCOLD1氨基酸序列与水稻的亲缘关系较近。通过构建目的蛋白与GFP融合的表达载体pCAMBIA1302-GFP-ZmCOLD1并注射烟草,发现ZmCOLD1蛋白主要集中在细胞质膜中。 展开更多
关键词 玉米 ZmCOLD1 分子特性分析 亚细胞定位 载体构建
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鸡新城疫病毒分离株F基因的分子特性分析 被引量：2
2
作者 王学艳 王晶钰 +4 位作者 刘红彦 邓小敏 温肖会 姜向阳 罗艳 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2008年第10期1-6,共6页
【目的】对新城疫病毒（NDV）分离毒株进行分子特征分析,了解免疫鸡群发生新城疫的原因。【方法】用非免疫鸡胚从病鸡肺脏中分离新城疫病毒;参考GenBank上发表的NDV的F基因序列设计引物,应用RT-PCR方法对新城疫病毒分离株进行扩增,并构... 【目的】对新城疫病毒（NDV）分离毒株进行分子特征分析,了解免疫鸡群发生新城疫的原因。【方法】用非免疫鸡胚从病鸡肺脏中分离新城疫病毒;参考GenBank上发表的NDV的F基因序列设计引物,应用RT-PCR方法对新城疫病毒分离株进行扩增,并构建克隆载体,对阳性质粒测序后进行F基因核苷酸及推导氨基酸序列分析。【结果】从发病鸡群中分离到6株NDV,分离毒株间的F基因核苷酸和F蛋白氨基酸同源性分别在99.6%-99.9%和99.1%-99.8%;分离毒株与参考毒株的F基因核苷酸和F蛋白氨基酸序列同源性分别在83.2%-87.3%和90.2%-93.8%;分离毒株F蛋白裂解位点的氨基酸顺序为^112R-R-Q-K-R-F^117,符合强毒株的分子特征;6个分离株均属NDV基因Ⅶ型。【结论】NDV分离株的F基因已经发生明显变异,与La Sota、Clone-30、V4等常用疫苗株在遗传进化上的亲缘关系较远,这可能是免疫鸡群发生新城疫的重要原因之一。 展开更多
关键词 新城疫病毒 分离鉴定 F基因 RT-PCR 分子特性分析
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猪瘟病毒E2基因的克隆及分子特性分析 被引量：3
3
作者 罗丹丹 廖党金 叶勇刚 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第8期2095-2103,共9页
为研究四川地区猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)及E_2基因的遗传变异情况,试验对CSFV阳性病料抽提RNA,通过RT-PCR扩增CSFVE_2基因并将其克隆到pMD18-T载体,经菌落PCR、双酶切、序列测定后利用生物信息学软件分析了E_2基因... 为研究四川地区猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)及E_2基因的遗传变异情况,试验对CSFV阳性病料抽提RNA,通过RT-PCR扩增CSFVE_2基因并将其克隆到pMD18-T载体,经菌落PCR、双酶切、序列测定后利用生物信息学软件分析了E_2基因的分子特性。结果显示,扩增的E_2基因大小为1 125bp,编码375个氨基酸,与GenBank中CSFV GXWZ02、CSFV/2.1、HEBZ、YC11WB、SXYL2006、0406/CH/01/TWN亲缘关系较近,核苷酸同源性分别为98.3%、96.5%、94.7%、92.4%、92.1%和90.9%,而与疫苗株HCLV E_2的同源性较低,为87.6%。密码子偏向性分析显示,E_2基因的ENc值为53.161,密码子使用频率与大肠杆菌、酵母菌和人差异较大的分别有33、25和25个;此外,E_2基因共有34个稀有密码子,且有多个稀有密码子多次串联成簇的情况出现。结果表明,E_2基因在密码子使用中整体上不存在较明显的偏向性,且密码子使用模式更接近真核生物,本试验克隆的E_2基因与疫苗株相比,部分核苷酸出现了变异,但主要抗原域氨基酸未发生改变,该结果为进一步开展CSFV E_2功能研究及后期基因工程苗的研制提供了基础数据。 展开更多
关键词 猪瘟病毒(CSFV) E2基因 克隆 分子特性分析
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玉米ZmGS5基因克隆、分子特性分析及对拟南芥的遗传转化 被引量：2
4
作者 刘晓丽 韩利涛 +2 位作者 魏楠 申飞 蔡一林 《作物杂志》 北大核心 2021年第1期16-25,共10页
高产是玉米育种的重要目标,籽粒大小是决定籽粒产量的重要因子。基于水稻中控制籽粒大小的OsGS5基因编码序列,利用同源克隆方法,获得了玉米ZmGS5基因,其cDNA全长为1695bp,开放阅读框1491bp,编码496个氨基酸,含有Peptidase-S10结构域、1... 高产是玉米育种的重要目标,籽粒大小是决定籽粒产量的重要因子。基于水稻中控制籽粒大小的OsGS5基因编码序列,利用同源克隆方法,获得了玉米ZmGS5基因,其cDNA全长为1695bp,开放阅读框1491bp,编码496个氨基酸,含有Peptidase-S10结构域、1个信号肽和1个丝氨酸羧肽酶(serine carboxypeptidases,SCP)类蛋白所特有的催化活性中心,这些都与SCP家族结构特点相符,也与OsGS5相关研究结果相同;磷酸化位点分析结果表明,ZmGS5含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸等蛋白激酶识别位点。qRTPCR分析显示ZmGS5在雄穗和叶片中的表达量较高,而在胚及胚乳中的表达量相对较低。除此之外,采用农杆菌介导法,建立了拟南芥的遗传转化体系,得到纯合转基因株系,T3代转基因拟南芥种子千粒重为0.0169g,较野生型千粒重(0.0139g)高。 展开更多
关键词 ZmGS5 基因克隆 丝氨酸羧肽酶 分子特性分析 遗传转化
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编码巴西利什曼原虫组蛋白H1 cDNA的克隆及分子特性分析
5
作者 朱云娟 《国外医学（寄生虫病分册）》 2003年第1期46-46,共1页
关键词 巴西利什曼原虫 克隆 分子特性分析 HI蛋白
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