本试验以蓖麻叶片为材料,克隆K+吸收蛋白基因Rc KUP 7,并对其进行生物信息学分析.结果显示,Rc KUP 7基因开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)为2583 bp,编码860个氨基酸,蛋白分子量为95.149k D,p I值5.15.通过氨基酸组分分析得到含量最...本试验以蓖麻叶片为材料,克隆K+吸收蛋白基因Rc KUP 7,并对其进行生物信息学分析.结果显示,Rc KUP 7基因开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)为2583 bp,编码860个氨基酸,蛋白分子量为95.149k D,p I值5.15.通过氨基酸组分分析得到含量最高的是亮氨酸(Leu),占该蛋白总摩尔质量的11.74%和分子质量的11.96%;含量最低的氨基酸为色氨酸(Trp),其摩尔质量与分子质量分别占总蛋白的1.16%和1.84%.进行多重序列比对和系统发育树分析可得出与麻枫树、木薯、橡胶树亲缘性较近.通过保守区蛋白分析可以得出该蛋白为钾离子转运蛋白家族的一员.通过亲水疏水性分析,可知该蛋白为疏水性蛋白.跨膜结构分析显示该蛋白具有10个蛋白跨膜结构,是典型的跨膜蛋白,并预测了该蛋白的三级结构.展开更多
以兔抗鸭疫里默氏杆菌(RA)阳性血清对 RA 血清1型 CH-1株表达型 DNA 文库中已通过蓝白斑筛选的一个阳性克隆进行了原位杂交筛选。经过5次免疫筛选后,阳性斑经过体内删除,噬菌粒经酶切分析和序列测定,得到一段4434bp 的插入 DNA 片段。运...以兔抗鸭疫里默氏杆菌(RA)阳性血清对 RA 血清1型 CH-1株表达型 DNA 文库中已通过蓝白斑筛选的一个阳性克隆进行了原位杂交筛选。经过5次免疫筛选后,阳性斑经过体内删除,噬菌粒经酶切分析和序列测定,得到一段4434bp 的插入 DNA 片段。运用 NCBI 的 BLASTN、BLASTP、ORF Finder、Conserved Domains、EMBL 的 FASTA 等程序对该片段中的一个命名为 ORF1689的开放阅读框架进行了全面的生物信息学分析。结果显示ORF1689起始密码子上游存在核糖体结合位点,完整 ORF 含1689bp,编码562个氨基酸,其编码蛋白的理论分子量为59.5kD,等电点为5.82。ORF1689具有 phosphodiest 蛋白家族的保守区域,与丙杆菌属的 Caulobacter sp.K31、鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas sp.)、Sphin-gopyxis alaskensis 和 Novosphingobium aromaticivorans 的Ⅰ型磷酸二酯酶基因的氨基酸序列同源性分别为49.283%、38.716%、38.693%和38.313%,表明该基因是一种新的Ⅰ型磷酸二酯酶基因。该研究结果对阐明Ⅰ型磷酸二酯酶的生物学功能和 RA 的生理特性与致病机理提供了理论基础和实验数据。展开更多
文摘本试验以蓖麻叶片为材料,克隆K+吸收蛋白基因Rc KUP 7,并对其进行生物信息学分析.结果显示,Rc KUP 7基因开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)为2583 bp,编码860个氨基酸,蛋白分子量为95.149k D,p I值5.15.通过氨基酸组分分析得到含量最高的是亮氨酸(Leu),占该蛋白总摩尔质量的11.74%和分子质量的11.96%;含量最低的氨基酸为色氨酸(Trp),其摩尔质量与分子质量分别占总蛋白的1.16%和1.84%.进行多重序列比对和系统发育树分析可得出与麻枫树、木薯、橡胶树亲缘性较近.通过保守区蛋白分析可以得出该蛋白为钾离子转运蛋白家族的一员.通过亲水疏水性分析,可知该蛋白为疏水性蛋白.跨膜结构分析显示该蛋白具有10个蛋白跨膜结构,是典型的跨膜蛋白,并预测了该蛋白的三级结构.
