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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及其分子流行病学分析 被引量：387
1
作者 童光志 周艳君 +4 位作者 郝晓芳 田志军 仇华吉 彭金美 安同庆 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期323-327,共5页
为了弄清2006年在我国南方一些猪场暴发的一种以高热、高发病率和高死亡率为特征的传染病的病因,我们从12个省市48个发病猪场采集临床样品进行了猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的... 为了弄清2006年在我国南方一些猪场暴发的一种以高热、高发病率和高死亡率为特征的传染病的病因,我们从12个省市48个发病猪场采集临床样品进行了猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的分离鉴定和分子流行病学分析。结果显示从48个猪场样品中均检测出了PRRSV,通过完整的ORF5和部分Nsp2基因序列比较分析发现来自12个省市不同猪场的PRRSV高度同源,而且在Nsp2基因上都有两个相同位点的缺失;从分离的15株PRRSV中选择湖南分离株HuN4人工感染5头60日龄的健康猪,结果5头猪分别在7 d～21 d内全部死亡,感染猪的临床症状和现地所见十分相似。本次试验结果表明新出现的以Nsp2基因部分缺失为特征的PRRSV对猪是高致病性的,可能是2006年大部分猪场暴发"高热综合症"的主要病因。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 高热综合症 分子流行病学
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分子流行病学研究 被引量：163
2
作者 李春辉 吴安华 +4 位作者 黄昕 李洁 李宪 黄勋 文细毛 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1032-1035,共4页
目的研究湖南省4所综合医院分离耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）分子流行病学特点，为临床预防、监测MRSA的流行，并制定合理的防治方案提供确实可靠的依据。方法采用质粒图谱分析4所医院MRSA是否存在质粒流行，并分析其型别；采用RAP... 目的研究湖南省4所综合医院分离耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）分子流行病学特点，为临床预防、监测MRSA的流行，并制定合理的防治方案提供确实可靠的依据。方法采用质粒图谱分析4所医院MRSA是否存在质粒流行，并分析其型别；采用RAPD分析对住院患者、环境、医务人员分离的MRSA进行同源性分析。结果对89株MRSA进行质粒图谱分析，有7株未检测到质粒，82株携带有质粒，可分为17型，4所医院MRSA均存在1～2种主要质粒的流行；经RAPD分型89株MRSA可分为A、B、C、D、E5型，其中A型85株占所有菌株的95．50％，B型1株、C型1株、D型1株、E型1株。结论质粒图谱分析及RAPD分型方法可很好用于MRSA分子流行病学分析，医院MRSA临床株与环境株及湖南省4所综合医院之间MRSA菌株具有同源性，呈暴发流行。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 分子流行病学 质粒图谱 RAPD分型
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呼吸机相关肺炎内源性感染途径的分子流行病学研究 被引量：153
3
作者 李华茵 何礼贤 +3 位作者 胡必杰 王葆青 陈雪华 马伟 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 2004年第2期121-125,共5页
目的　用分子流行病学方法研究呼吸机相关肺炎 (VAP)内源性感染途径在VAP发病机制中的作用 ,为探索和发展全新的VAP预防措施提供理论依据。方法　通过前瞻性队列研究 ,动态采集重症监护病房 (ICU)人工气道 (artificialairway ,AA)包括... 目的　用分子流行病学方法研究呼吸机相关肺炎 (VAP)内源性感染途径在VAP发病机制中的作用 ,为探索和发展全新的VAP预防措施提供理论依据。方法　通过前瞻性队列研究 ,动态采集重症监护病房 (ICU)人工气道 (artificialairway ,AA)包括气管插管或气管切开患者胃腔、口咽部、下呼吸道标本行病原菌培养和药敏试验 ;筛选VAP患者中下呼吸道、胃液和 (或 )咽拭子标本中所分病原菌生化反应结果相同并有先后定植次序者 ;通过PFGE方法分析这些病原菌是否具有同源性。结果　 98例人工气道机械通气患者中 5 2例发生VAP ;表型分析 5 2例VAP患者有 13例下呼吸道病原菌呈现胃腔→口咽部→下呼吸道的逆向定植次序 ;3例出现胃腔→下呼吸道的定植次序 ;病原菌的PFGE同源性分析表明ICU中 5 2例VAP患者有 15例 (其中 14例为晚发性VAP)存在胃腔→下呼吸道逆向内源性感染途径 ,占VAP发病总数的 2 8 8% ;PFGE技术方法为分析病原菌同源性的有效方法。结论　病原菌的PFGE同源性分析表明ICU中VAP患者存在胃腔→下呼吸道逆向内源性感染途径。 展开更多
关键词 呼吸机 肺炎 分子流行病学 脉冲场凝胶电泳
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肠道病毒71型的RT-PCR诊断及基因特征 被引量：133
4
作者 崔爱利 许文波 +7 位作者 李秀珠 胡家瑜 凌华 唐伟 杨智宏 张燕 陈立 Hiroyuki Shimizu 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期160-165,共6页
2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,... 2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别。RT PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71。10株病毒的RT PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法。对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26和CHN 87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89 3%～94 6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81 3%～84 0%,差异较大。在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26)的同源性较高,在94 5%～100%范围内。在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支。与CHN 87株的同源性在92 1%～93 6%之间。与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源? 展开更多
关键词 肠道病毒71型 RT-PCR 诊断 基因 分子流行病学
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我国部分地区NDV的分子流行病学研究 被引量：101
5
作者 曹殿军 郭鑫 +4 位作者 梁荣 闫丽辉 刘培欣 闵平 陈杰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期29-32,共4页
本研究根据新城疫病毒 (NDV)F基因编码区 1_374位核苷酸序列计算其遗传距离并绘制了NDV的系统发育进化树 ,将 6 8株NDV分为 9个基因型 (30株为国内分离株 ) ,其中Ⅰ～Ⅵ是早已存在的老基因型 ,Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ为新发现的基因型 ,特别是Ⅸ为... 本研究根据新城疫病毒 (NDV)F基因编码区 1_374位核苷酸序列计算其遗传距离并绘制了NDV的系统发育进化树 ,将 6 8株NDV分为 9个基因型 (30株为国内分离株 ) ,其中Ⅰ～Ⅵ是早已存在的老基因型 ,Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ为新发现的基因型 ,特别是Ⅸ为我国特有的基因型 (F48E9、M3、HLJ_3、HeB_1P和NM_5 )。 1997～ 1999年在我国云南、广西、甘肃、陕西、新疆等地分离的YN_1P、GX_3、H1、H2、P1、GX_1、GX_2、GS_2、GS_3、SHX_2、SHX_3、SHX_6、SHX_7、XJ_2和 1991年分离的HuB_1均属于Ⅶ基因型 ,该基因型的病毒是 90年代以来引起新城疫发生的主要病原。根据遗传距离和分离年代可将此基因型进一步划分为 5个基因亚型 ,分别是Ⅶa、Ⅶb、Ⅶc、Ⅶd和Ⅶe。此外HuN_1/ 98、HLJ_4/ 95和HeH_1P属一个老的基因Ⅵ ,1979～ 1985年分离自青海的QH_1、QH_2、QH_4属于一个新的基因型—Ⅷ型。可见在我国新城疫的流行是极其复杂的 ,既有老基因型的危险 (Ⅰ～Ⅵ ) ,又有新基因型 (Ⅶ )的流行 ,更有我国独特Ⅷ和Ⅸ基因型潜伏。 展开更多
关键词 新城疫病毒 F基因 系统发育进化树 分子流行病学 中国
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产ESBL肺炎克雷伯菌医院感染分子流行病学研究 被引量：133
6
作者 周清德 缪竞智 张秀珍 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 2000年第1期10-12,共3页
目的　明确产 ESBL 肺炎克雷伯菌医院感染发生率及其流行病学特征。方法　收集、鉴定分离菌株 ,进行药敏实验和 ESBL 检测 ;PCR扩增 bla TEM和 bla SHV基因 ;等电聚焦测定 β-内酰胺酶的等电点 ( p I)、染色体 DNA的PFGE分型以及进行病... 目的　明确产 ESBL 肺炎克雷伯菌医院感染发生率及其流行病学特征。方法　收集、鉴定分离菌株 ,进行药敏实验和 ESBL 检测 ;PCR扩增 bla TEM和 bla SHV基因 ;等电聚焦测定 β-内酰胺酶的等电点 ( p I)、染色体 DNA的PFGE分型以及进行病例资料分析。结果　共分离到 10 4株非重复肺炎克雷伯菌 ,产 ESBL 株占 13 .5 %。医院感染株 ESBL 阳性率 ( 2 8.3 % )明显高于院外感染株 ( 3 .6% ) ;ESBL 阳性菌对 CPD、CTX、CAZ、CTR、ATM、FOX、CIP和 GEN的中敏或耐药率分别为 92 .9%、92 .9%、3 5 .7%、92 .8%、78.6%、7.1%、2 8.6%和 4 2 .9% ,但对IMP10 0 %敏感 ;β-内酰胺酶等电聚焦分析及 bla TEM和 bla SHV基因检测结果 ,提示该院流行的 ESBL 主要为 SHV类 ;PFGE分析证实在干部 1病区、SICU和 RICU存在产 ESBL 菌株流行。结论　该医院存在产 ESBL 肺炎克雷伯菌医院感染流行 ;合理使用抗生素 ,加强消毒隔离措施 ,严格遵守无菌操作规程和屏障护理 ,是控制医院感染流行的重要措施。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 医院内感染 分子流行病学 肺炎
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麻疹病毒的分子流行病学 被引量：107
7
作者 许文波 《中国计划免疫》 2001年第1期54-59,共6页
关键词 麻疹 病疹病毒 分子流行病学
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北京地区肺炎链球菌的耐药性及其分子流行病学调查 被引量：97
8
作者 王辉 陈民钧 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期253-256,共4页
目的了解北京地区肺炎链球菌的耐药性以及青霉素耐药株的分子流行病学特征。方法１９９７年９～１１月采集北京市８所幼儿园９８５名儿童鼻咽拭子标本，分离培养肺炎链球菌，用Ｅｔｅｓｔ法和琼脂稀释法测定菌株对１２种抗生素的最低抑... 目的了解北京地区肺炎链球菌的耐药性以及青霉素耐药株的分子流行病学特征。方法１９９７年９～１１月采集北京市８所幼儿园９８５名儿童鼻咽拭子标本，分离培养肺炎链球菌，用Ｅｔｅｓｔ法和琼脂稀释法测定菌株对１２种抗生素的最低抑菌浓度（ＭＩＣｓ），用“荚膜肿胀”技术测血清分型，并用盒式聚合酶链反应（ＢＯＸＰＣＲ）分析青霉素耐药株的亲缘关系。结果儿童鼻咽部肺炎链球菌携带率为２４８％（２４４／９８５）。Ｅｔｅｓｔ法和琼脂稀释法的一致性＞９３７％。（１３１％）（３２／２４４）的菌株低耐青霉素ＭＩＣｓ（００９～０．２５）ｍｇ／Ｌ，３株（１２％）为高耐ＭＩＣｓ，３ｍｇ／Ｌ。青霉素敏感株对其它４种β内酰胺类都敏感。青霉素不敏感组中，１１４％（４／３５）的菌耐其它β内酰胺类。红霉素、四环素、氯环素、甲氧苄啶、磺胺异唑的耐药率分别为７４０％、８７６％、４７８％、６３３％。同时耐氯霉素、红霉素、四环素、甲氧苄啶、磺胺异恶唑的菌株占４８７％。所有菌株对万古霉素、利福平敏感。最常见的血清型为６Ａ（３３６％）、１９Ｆ（１６８％）、２３Ｆ（１５１％）、１５（１１２％）、６Ｂ（４３％）。３５株青霉素不敏感株? 展开更多
关键词 链球菌 肺炎 流行病学 分子流行病学 调查
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中国食管癌分子流行病学研究 被引量：75
9
作者 林东昕 谭文 +1 位作者 陆士新 邢德印 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第10期939-943,共5页
关键词 中国 食管癌 分子流行病学 叶酸代谢 基因多态性
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全球手足口病流行现状及分子流行病学研究进展 被引量：107
10
作者 占华剑 柯昌文 《华南预防医学》 2011年第5期34-38,41,共6页
手足口病(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)是全球性传染病,世界上很多国家均有报道,特别在亚太地区广泛流行,已成为重要的公共卫生问题,引起了世界各国的关注和警惕。目前手足口病的病原体已达20余种,以肠道病毒71型(Enterovirus 71,... 手足口病(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)是全球性传染病,世界上很多国家均有报道,特别在亚太地区广泛流行,已成为重要的公共卫生问题,引起了世界各国的关注和警惕。目前手足口病的病原体已达20余种,以肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CoxA16)为主,两者常相伴引起手足口病的暴发和流行。本文就全球手足口病流行现状及分子流行病学研究进展进行了综述。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 分子流行病学
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我国部分地区不同动物来源新城疫病毒的分子流行病学研究 被引量：72
11
作者 吴艳涛 倪雪霞 +2 位作者 万洪全 刘文博 刘秀梵 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期264-269,共6页
对从我国部分地区 1985～ 2 0 0 1年间分离的 2 6株新城疫病毒毒株进行研究 ,克隆其融合蛋白 (F)基因 ,分析相应的核苷酸 (nt)序列。根据绘制的系统进化发生树和F基因上三种限制性内切酶 (RE)位点分布 ,确定了这些毒株的基因型分类地位... 对从我国部分地区 1985～ 2 0 0 1年间分离的 2 6株新城疫病毒毒株进行研究 ,克隆其融合蛋白 (F)基因 ,分析相应的核苷酸 (nt)序列。根据绘制的系统进化发生树和F基因上三种限制性内切酶 (RE)位点分布 ,确定了这些毒株的基因型分类地位。除 2个毒株属于已知的VIb亚型外 ,其余 2 4个毒株分别属于新发现的基因Ⅸ型、Ⅵf亚型、Ⅵg亚型和VⅡc亚型。基因Ⅸ型毒株的F基因 5 4 0nt存在RsaⅠ位点 ,同时缺乏 1198ntHinfⅠ位点、14 78ntBstOⅠ位点和 16 2 5ntRsaⅠ位点 ;Ⅵf和Ⅵg亚型毒株不具有国外其它Ⅵ型毒株的 872ntRsaⅠ位点 ;Ⅶc亚型的RE位点分布和Ⅶa亚型、Ⅶb亚型、Ⅷ型毒株不同 ,鹅源毒株均出现 973ntRsaⅠ位点 ,7个鹅源毒株还出现了特有的 12 4 9ntRsaⅠ位点。在F基因编码的氨基酸中 ,基因Ⅸ型毒株出现Ile9→Val9和Val10 6→Ala10 6的替换 。 展开更多
关键词 部分地区 中国 动物来源 新城疫病毒 分子流行病学
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肠道病毒71型分子流行病学研究进展 被引量：90
12
作者 田波 段海生 +1 位作者 荣一兵 周世力 《中国病毒学》 CSCD 2004年第4期426-429,共4页
关键词 肠道病毒71型 分子流行病学 基因组 分型 检测
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2011～2013年福建省手足口病相关病原柯萨奇病毒A组6型的分子流行病学研究 被引量：90
13
作者 陈炜 翁育伟 +7 位作者 何文祥 张拥军 杨秀惠 黄萌 谢剑锋 王金章 郑奎城 严延生 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期624-629,共6页
为揭示2011~2013年福建省手足口病相关病原其它肠道病毒中优势血清型柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）的分子流行病学特征,我们收集2011~2013年福建省确诊为其它肠道病毒个人的1340例手足口病的病例标本,进行病毒培养和鉴定... 为揭示2011~2013年福建省手足口病相关病原其它肠道病毒中优势血清型柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）的分子流行病学特征,我们收集2011~2013年福建省确诊为其它肠道病毒个人的1340例手足口病的病例标本,进行病毒培养和鉴定分型,对其中优势血清型CVA6进行完整VP1区基因片段的扩增测序和分析。共分型鉴定出其它肠道病毒病例375例,其中CVA6病例182例（占48.5%）。CVA6病例在2011~2013年福建省手足口病病原谱的年度构成比分别为7.9%、16.2%和39.6%。与手足口病总体疫情相比,CVA6病例在地区、性别、年龄组分布没有特异性,致重症率较低。VP1区基因序列分析显示,CVA6福建分离株与原型株的核苷酸序列差异较大（16.2%~18.6%）,氨基酸序列差异为4.3%~6.2%。进化分析显示,CVA6福建分离株与原型株及国外地区分离株的亲缘关系远,与国内地区分离株的亲缘关系近。CVA6福建分离株在进化树的分布呈多个分支。结果表明,2011~2013年福建省手足口病病原谱发生较大变化,CVA6成为手足口病主要的病原之一。CVA6福建分离株与国内地区相应分离株共进化共循环,在福建至各个地区呈多条亲缘关系接近传播链同时流行。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A6 分子流行病学
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猪瘟国际流行态势、我国现状及防制对策 被引量：73
14
作者 涂长春 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第8期955-960,共6页
猪瘟 (classicalswinefever,CSF)仍然是严重危害全球养猪业的重要传染病 ,是我国主要的畜禽疫病之一。目前该病流行于除北美和大洋洲外的世界上各大洲和地区。笔者分析了当前国际上猪瘟的流行态势与流行原因 ,并在此基础上结合我国养猪... 猪瘟 (classicalswinefever,CSF)仍然是严重危害全球养猪业的重要传染病 ,是我国主要的畜禽疫病之一。目前该病流行于除北美和大洋洲外的世界上各大洲和地区。笔者分析了当前国际上猪瘟的流行态势与流行原因 ,并在此基础上结合我国养猪业的发展现状 ,根据自身多年的研究结果 ,用可靠的试验数据 ,着重阐述了我国猪瘟的流行现状与分子流行病学本底 ,就此提出了一些新的防制对策 ,供同行商榷。 展开更多
关键词 猪瘟 国际流行态势 中国 现状 防制对策 传染病 畜禽疫病 试验数据 分子流行病学
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中国部分地区新型肝炎病毒TTV感染的分子流行病学 被引量：81
15
作者 周育森 董京芳 +3 位作者 周乙华 黄呈辉 何忠平 王海涛 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第6期352-355,共4页
目的了解我国部分地区新型肝炎病毒ＴＴＶ感染的分子流行病学、ＴＴＶ在人群中的感染分布状况，探讨ＴＴＶ在肝炎发病中的作用和地位。方法采用ＰＣＲ方法检测血清标本中ＴＴＶＤＮＡ，克隆测定不同地理株ＴＴＶ的部分基因序列，分析其... 目的了解我国部分地区新型肝炎病毒ＴＴＶ感染的分子流行病学、ＴＴＶ在人群中的感染分布状况，探讨ＴＴＶ在肝炎发病中的作用和地位。方法采用ＰＣＲ方法检测血清标本中ＴＴＶＤＮＡ，克隆测定不同地理株ＴＴＶ的部分基因序列，分析其基因变异情况。结果检测了南方（广东深圳和江苏南京）和北方（北京和辽宁沈阳）的１１２例非甲～非庚型肝炎病人，其中ＴＴＶＤＮＡ阳性者４８例，阳性率４２．９％，而１０２例甲～庚型肝炎病人中阳性率为２．９％（χ２＝４２．８，Ｐ＜０．０１）。ＡＬＴ异常而无甲～庚型肝炎病毒感染标志的献血员中，ＴＴＶＤＮＡ阳性率（３４６％）明显高于ＡＬＴ正常献血员的阳性率（１６．８％，χ２＝４．５，Ｐ＜０．０１）。南方株（广东深圳ＴＴＶＣＨＮ００２、南京ＴＴＶＮＡＮ００１）和北方株（北京ＴＴＶＳＨＢ０１５）病毒间同源性在９８％以上，日本发表的序列同源性也高于９７％。结论我国北方和南方地区均存在ＴＴＶ感染。ＴＴＶ感染与ＡＬＴ异常有极为密切的关系，可能是导致非甲～非庚型肝炎的重要病原。正常人群中存在ＴＴＶ感染者，类似于ＨＢｓＡｇ的所谓“慢性携带状态”。 展开更多
关键词 TT病毒 病毒性肝炎 分子流行病学 聚合酶链反应
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一种新的可经输血传播病毒(TTV)的分子流行病学研究 被引量：78
16
作者 马为民 周伯平 +4 位作者 王火生 徐六妹 袁静 付涌水 孙彤 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 1998年第3期167-169,共3页
目的分析深圳地区不同人群中 TTV(transfusion transmitted virus,TTV)感染情况及其基因型。方法在 TTV ORF1 设计引物,建立巢式聚合酶链反应,检测深圳地区不同人群血清中 TTV DNA。对 PCR 产物进行分子克隆,以荧光法(Applied Biosystem... 目的分析深圳地区不同人群中 TTV(transfusion transmitted virus,TTV)感染情况及其基因型。方法在 TTV ORF1 设计引物,建立巢式聚合酶链反应,检测深圳地区不同人群血清中 TTV DNA。对 PCR 产物进行分子克隆,以荧光法(Applied Biosystems,373A)测序。结果 90例一般人群、88例有偿献血员、79例静脉毒瘾者、52例非甲～非庚型肝炎、67例乙型肝炎及72例丙型肝炎患者中,TTV DNA 阳性率分别为7.8%、9.0%、41.8%、48.0%、22.3%与27.8%。5株深圳 TTV(SZ1～SZ5)ORF1部分基因核苷酸序列同源性为66.2%～96.7%。基因分型5株中2株属Gl型(Gla亚型),3株属 G2型,其中2株为 G2b 型。结论深圳地区一般人群与职业献血员中 TTV 健康携带者较常见:静脉毒瘾者与非甲～非庚型肝炎患者是 TTV 感染的高危人群;乙型及丙型肝炎常重叠 TTV 感染;不同 TTV 分离株 ORF1部分基因序列变异可达33%,基因分型以 G1a 与 G2b 为主。 展开更多
关键词 非甲非庚型肝炎 输血传播病毒 分子流行病学
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铜绿假单胞菌耐药基因的分子流行病学研究 被引量：75
17
作者 金辉 糜祖煌 +2 位作者 钱小毛 李智山 黄支密 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期134-136,共3页
目的了解不同地区临床分离铜绿假单胞菌耐药基因的流行现状。方法对临床分离的104株铜绿假单胞菌采用ATB细菌鉴定仪鉴定菌种和K—B法测定抗菌药物的敏感性，利用聚合酶链反应（PCR）检测耐药基因（16种）和多分子标志法聚类分析菌株的... 目的了解不同地区临床分离铜绿假单胞菌耐药基因的流行现状。方法对临床分离的104株铜绿假单胞菌采用ATB细菌鉴定仪鉴定菌种和K—B法测定抗菌药物的敏感性，利用聚合酶链反应（PCR）检测耐药基因（16种）和多分子标志法聚类分析菌株的亲缘性。结果3个地区铜绿假单胞菌对亚胺培南的耐药率依次为51．3％、80．0％和100．0％，对第三代头孢菌素的耐药率为48．2％～100．0％，耐药基因oprD2缺失率为90％～100％；多重耐药基因标志的菌株显示存在克隆传播现象，但绍兴地区流行耐药株以oprD2的缺失为主，湖州地区则以TEM、oprD2缺失、aac（3）-Ⅱ、ant（3”）-Ⅰ、qacEΔ1为主。结论3个地区临床分离的铜绿假单胞菌呈多重耐药，并由克隆传播导致医院感染，但耐药的机制并不相同。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 多重耐药基因 分子流行病学
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2012―2013年猪繁殖与呼吸综合征病毒河南流行株的分离鉴定及分子流行病学调查 被引量：78
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作者 周峰 常洪涛 +6 位作者 赵军 陈陆 王新卫 刘红英 姚慧霞 王川庆 杨霞 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1398-1404,1410,共8页
为了解河南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)流行毒株的遗传变异情况和发展趋势。通过RT-PCR方法,对2012―2013年采自河南省各地疑似病料进行PRRSV检测,并对阳性病料进行病毒分... 为了解河南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)流行毒株的遗传变异情况和发展趋势。通过RT-PCR方法,对2012―2013年采自河南省各地疑似病料进行PRRSV检测,并对阳性病料进行病毒分离鉴定及分子流行病学分析。结果显示:54份疑似病料中17份检测为阳性,阳性率为31.5%,并分离出3株PRRSV;通过完整的ORF5基因和部分NSP2基因序列遗传进化分析表明,河南地区流行毒株主要为美洲型PRRSV,且17份阳性样品中10份与高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)高度同源、2份与经典PRRSV高度同源、另外5份与美洲流行毒株NADC30高度同源,该类毒株的NSP2基因在不同部位存在393个核苷酸缺失,国内尚未见相关报道。结果表明,2012―2013年河南地区PRRSV主要流行毒株为HP-PRRSV,同时出现了新的变异毒株,使河南地区乃至我国PRRSV变异种类更加多样化,提示加强PRRSV流行及变异的监测十分必要。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 分离 分子流行病学 系统进化分析
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福建省籍各地市人群地中海贫血的分子流行病学研究 被引量：74
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作者 徐两蒲 黄海龙 +5 位作者 王燕 郑琳 王林铄 许金榜 黄欣欣 林元 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期403-406,共4页
目的了解福建省籍各地市人群地中海贫血（简称地贫）的基因携带率、基因突变类型及其分布特征。方法采用分层整群方法随机抽取福建省9地市籍贯体检人群的静脉血，测定红细胞参数和用高效液相色谱法分析血红蛋白，表型阳性的标本用单管多... 目的了解福建省籍各地市人群地中海贫血（简称地贫）的基因携带率、基因突变类型及其分布特征。方法采用分层整群方法随机抽取福建省9地市籍贯体检人群的静脉血，测定红细胞参数和用高效液相色谱法分析血红蛋白，表型阳性的标本用单管多重PCR方法检测中国人常见的3种α缺失型突变和PCR-寡核苷酸探针反相斑点杂交法检测非缺失α地贫基因突变及β-地贫基因突变。未知突变采用DNA直接测序法进行分析。结果11 234人中，共检出α和β地贫504例，地贫总携带率为4.41％。其中356例样本为α地贫，-^SEA／αα236例、-α^3.7／αα67例、-α4.2／αα24例、血红蛋白H病4例（-α3.7／-^SEA3例，-α4.2／-^SEA1例）、-α3.7／-α3.7 1例、-α3.7／-α4.2 1例、非缺失型α地贫中，αα^QS／αα7例、αα^CS／αα3例、αα^WS／αα2例，最常见的为-^SEA／αα占全部基因突变的66．29％；148例为p地贫，共检出12种基因突变类型，IVS-2-654（C→T）65例、CD41-42（-TCTT）40例、CD17（A—T）12例、一28（A→G）10例、CD27→28（＋C）7例、起始密码子ATG→AGG5例、cD26（G→A）2例、CD71-72（＋A）1例、IVS-1-1（G→T）1例、CD43（G→T）1例、-29（A→G）2例、Codon36（-C）2例，其中最常见的是IVS-2-654（C→T）和CD41-42（-TCTT），占全部基因突变的70．95％，并再次在中国人群中发现了Codon36（-C）的新的突变类型。α地贫复合β地贫双重杂合子9例。结论阐明福建省籍各地市人群α和β地贫的基因突变类型和频率，在国内具有较高的地贫发生率和遗传异质性，该研究为在本地区开展遗传咨询和产前诊断提供了参考借鉴资料。 展开更多
关键词 Α-地中海贫血 Β地中海贫血 基因突变类型 分子流行病学
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与氨基糖甙类抗生素耳毒性相关的线粒体12S rRNA突变的流行病学特征 被引量：72
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作者 管敏鑫 赵立东 《中华耳科学杂志》 CSCD 2006年第2期98-105,共8页
线粒体DNA(mtDNA)12SrRNA是氨基糖甙类抗生素导致的非综合征型听力损失的一个突变热点区域。在这些突变位点中,位于12SrRNA高度保守的解码区的同质性的A1555G和C1494T突变与耳聋相关,这两个突变导致很多患者的氨基糖甙类抗生素中毒性耳... 线粒体DNA(mtDNA)12SrRNA是氨基糖甙类抗生素导致的非综合征型听力损失的一个突变热点区域。在这些突变位点中,位于12SrRNA高度保守的解码区的同质性的A1555G和C1494T突变与耳聋相关,这两个突变导致很多患者的氨基糖甙类抗生素中毒性耳聋。A1555G突变和C1494T突变会在12SrRNA的高度保守的A位形成新的1494C-G1555或1494U-A1555碱基对。这些改变使得12SrRNA在二级结构上与细菌的16SrRNA的相应区域的二级结构更加相似,因此,由于C1494T和A1555G突变在12SrRNA形成U-A和G-C配对使得氨基糖甙类抗生素的结合更加容易,这就是为何携带这些突变的人在接触了氨基糖甙类抗生素时会出现或加重耳聋的原因。携带C1494T和A1555G突变的细胞的生化特征是线粒体蛋白质合成的异常并随之引起细胞的呼吸功能异常。而且,当用含高浓度的巴龙霉素或新霉素的DMEM培养基来培养携带这两个突变的细胞系时,可以观察到这些细胞与对照细胞系相比会出现生长缺陷和线粒体内蛋白的翻译异常。这些观察为以下结论提供了直接的遗传和生化方面的证据,即A1555G和C1494T突变是导致氨基糖甙类抗生素诱导的非综合征型耳聋的致病性的mtDNA突变。而且,这些研究数据还为我们进行以下预测提供了有价值的信息和方法:(1)哪些患者有耳毒性风险;(2)提高使用氨基糖甙类抗生素治疗时的安全性;(3)逐渐减少耳聋的发生率。 展开更多
关键词 氨基糖甙类抗生素 非综合征性聋 线粒体DNA 分子流行病学
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