3-吡啶基醚类化合物的分子全息QSAR研究 被引量：6

1

作者 李华 张华北 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1018-1022,i003,共6页

采用分子全息定量构效关系(HQSAR,hologramquantitativestructure-activityrelationship)方法,研究了28个3-吡啶基醚类化合物对乙酰胆碱α4β2受体的亲和性与它们的分子结构之间的关系,讨论了分子碎片大小、分子碎片亚结构类型以及分子... 采用分子全息定量构效关系(HQSAR,hologramquantitativestructure-activityrelationship)方法,研究了28个3-吡啶基醚类化合物对乙酰胆碱α4β2受体的亲和性与它们的分子结构之间的关系,讨论了分子碎片大小、分子碎片亚结构类型以及分子全息长度对QSAR的影响,得到了较好的HQSAR模型,模型的交叉验证系数平方q2=0.670,非交叉相关系数平方r2=0.965,偏差S=0.093.利用HQSAR的颜色编码,对化合物中不同基团对亲和活性的影响进行了讨论,对新配体的合成具有一定的指导作用. 展开更多

关键词 3-吡啶基醚类化合物 分子全息定量构效关系 QSAR 亲和性 分子结构 乙酰胆碱α4β2 药物 神经退化性疾病

下载PDF 职称材料

S-DABO类非核苷类HIV-1逆转录抑制剂HQSAR 被引量：6

2

作者 王月平 闫婉露 +1 位作者 郭琼 何严萍 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第10期916-921,共6页

采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究了34个HIV-1逆转录酶抑制剂S-DABOs类化合物的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数以及分子全息长度对模型的影响.以26个化合物构成的训练集所建最优模型的交叉验证相关系... 采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究了34个HIV-1逆转录酶抑制剂S-DABOs类化合物的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数以及分子全息长度对模型的影响.以26个化合物构成的训练集所建最优模型的交叉验证相关系数q2为0.755,相关系数r2为0.949.对8个化合物构成的测试集进行了预测,其预测相关系数r2pred为0.95,表明所建模型不仅有较高的拟合能力,还有良好的预测能力.最后,利用HQSAR模型的色码表示,探讨了对S-DABOs类似物的活性起重要作用的结构与片段,为此类化合物的进一步结构改造与优化提供理论指导. 展开更多

关键词 S-DABO类似物 HIV-1逆转录酶抑制剂 分子全息定量构效关系 色码

原文传递

苯并咪唑-5-羧酸酰胺HCV NS5B聚合酶抑制剂的分子全息QSAR研究及设计 被引量：3

3

作者 陈娴 张廉高 +2 位作者 王子恒 王月平 何严萍 《云南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1040-1050,共11页

采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究54个苯并咪唑-5-羧酸酰胺类HCV NS5B聚合酶抑制剂的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数以及分子全息长度对模型的影响.以39个化合物构成的训练集所建最优模型的交叉验证... 采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究54个苯并咪唑-5-羧酸酰胺类HCV NS5B聚合酶抑制剂的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数以及分子全息长度对模型的影响.以39个化合物构成的训练集所建最优模型的交叉验证相关系数q2为0.779,非交叉验证相关系数r2为0.922,标准偏差SEE为0.251.同时,利用HQSAR模型的色码图探讨了对该类抑制剂的活性起重要作用的结构片段,并根据HQSAR最佳模型图设计了17个新型2-硫乙酰芳胺-苯并咪唑-5-羧酸酰胺类衍生物,经HQSAR模型预测,这些分子理论上对HCV NS5B聚合酶均具有良好的抑制活性. 展开更多

关键词 苯并咪唑-5-羧酸酰胺 HCV NS5B聚合酶抑制剂 分子全息定量构效关系 色码 分子设计

原文传递

5-羧基苯并咪唑类HCV NS5B聚合酶抑制剂的HQSAR研究及分子设计 被引量：3

4

作者 王子恒 陈娴 +2 位作者 张玉芳 王月平 何严萍 《中国科学：化学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期350-360,共11页

利用分子全息技术研究了129个5-羧基苯并咪唑类HCV NS5B聚合酶抑制剂的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数及全息长度对模型质量的影响.利用偏最小二乘法(partial least square,PLS)建立了一组以99个化合物为训练... 利用分子全息技术研究了129个5-羧基苯并咪唑类HCV NS5B聚合酶抑制剂的结构与活性之间的关系.讨论了分子碎片大小、碎片区分参数及全息长度对模型质量的影响.利用偏最小二乘法(partial least square,PLS)建立了一组以99个化合物为训练集的最优模型,该模型的交叉验证相关系数q^2=0.820,非交叉验证相关系数r^2=0.963,标准偏差SEE=0.213;用最优模型对由30个化合物组成的测试集进行预测,得到其相关系数r_(pred)~2=0.98,表明了该模型具有良好的预测能力及拟合能力.利用色码图对模型中不同原子及不同结构的贡献进行了解释,在此基础上根据最优HQSAR模型设计了几种具有良好抗HCV活性的苯并咪唑类HCV NS5B聚合酶抑制剂分子,为新型HCV NS5B聚合酶抑制剂的设计和优化提供了参考. 展开更多

关键词 5-羧基苯并咪唑类衍生物 HCV NS5B聚合酶抑制剂 分子全息定量构效关系 色码 分子设计

原文传递

丝氨酸及苯基异丝氨酸类SARS病毒3CL蛋白酶抑制剂HQSAR研究及分子设计 被引量：3

5

作者 何安朕 张继川 +1 位作者 何严萍 王月平 《云南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1202-1211,共10页

采用分子全息定量构效关系(Holographic Quentitative Structure-Activity Ralationship,HQSAR)方法,研究了40个丝氨酸及苯基异丝氨酸类SARS-CoV 3CL蛋白酶抑制剂的构效关系,探讨了分子碎片大小、碎片区分参数及全息长度对模型质量的影... 采用分子全息定量构效关系(Holographic Quentitative Structure-Activity Ralationship,HQSAR)方法,研究了40个丝氨酸及苯基异丝氨酸类SARS-CoV 3CL蛋白酶抑制剂的构效关系,探讨了分子碎片大小、碎片区分参数及全息长度对模型质量的影响.利用偏最小二乘法建立了一个以30个化合物为训练集的最优模型,其交叉验证相关系数q^(2)为0.604,非交叉验证相关系数r^(2)为0.904,标准偏差SEE为0.125;使用该模型对由9个化合物组成的测试集进行预测,其预测相关系数r^(2) pred为0.723,表明该模型具有良好的预测能力及拟合能力.利用HQSAR色码图探讨了分子中不同结构片段对活性的贡献,在此基础上根据最优HQSAR模型设计了一组具有良好预测活性的苯基异丝氨酸类3CL蛋白酶抑制剂,为新型SARS-CoV 3CL蛋白酶抑制剂的设计和优化提供了参考,也为研发治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的3CL蛋白酶抑制剂提供借鉴. 展开更多

关键词 冠状病毒 3CL蛋白酶抑制剂 分子全息定量构效关系 色码 分子设计

下载PDF 职称材料

烷烃色谱保留指数的3D-QSAR和HQSAR研究 被引量：2

6

作者 焦龙 刘焕焕 +4 位作者 邰文亮 薛志伟 王媛 韩硕 张镇 《计算机与应用化学》 CAS 北大核心 2019年第6期603-608,共6页

基于比较分子力场分析(CoMFA)、比较分子相似性指数分析(CoMSIA)和分子全息定量构效关系(HQSAR)三种方法,研究并建立了64种烷烃的色谱保留指数定量结构性质关系(QSPR)模型。所建立CoMFA模型的交叉验证系数q^2为0.974,非交叉验证系数r^2... 基于比较分子力场分析(CoMFA)、比较分子相似性指数分析(CoMSIA)和分子全息定量构效关系(HQSAR)三种方法,研究并建立了64种烷烃的色谱保留指数定量结构性质关系(QSPR)模型。所建立CoMFA模型的交叉验证系数q^2为0.974,非交叉验证系数r^2为0.999;CoMSIA模型交叉验证系数q^2为0.928,非交叉验证系数r^2为0.995;HQSAR模型交叉验证系数q^2为0.998,非交叉验证系数r^2为0.999。用留一交叉验证法和外部测试集验证法对所建立模型进行了检验,结果表明所建立的三种模型都具有良好的预测能力,可以对烷烃的色谱保留指数进行较准确的预测。 展开更多

关键词 烷烃 色谱保留指数 比较分子力场分析 比较分子相似性指数分析 分子全息定量构效关系

原文传递

苯基氨基吡啶派生物类非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂HQSAR研究及分子设计 被引量：1

7

作者 杨军锋 赵智东 +2 位作者 鲁静 王月平 何严萍 《计算机与应用化学》 CAS 2016年第1期75-79,共5页

采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究了21个HIV-1逆转录酶抑制剂苯基氨基吡啶派生物(Phenylaminopyridine,PAP)类化合物的构效关系;探讨了碎片区分参数、分子碎片大小和分子全息长度对模型质量的影响;建立了一组以16个化合物为训... 采用分子全息定量构效关系(HQSAR)方法,研究了21个HIV-1逆转录酶抑制剂苯基氨基吡啶派生物(Phenylaminopyridine,PAP)类化合物的构效关系;探讨了碎片区分参数、分子碎片大小和分子全息长度对模型质量的影响;建立了一组以16个化合物为训练集的最优模型,其交叉验证相关系数q^2为0.801,非交叉验证相关系数r^2为0.963,标准偏差为0.363;对5个化合物构成的测试集进行了预测,其相关系数r_(pred)~2为0.92,表明该模型具有良好的预测能力。最后,通过HQSAR模型色码图对PAP类化合物的活性起重要作用的片段与结构进行了讨论,并根据HQASR最佳模型图设计出了20种PAP派生物类化合物,这些化合物理论上均具有较好的抗HIV-1活性,为PAP派生物类化合物的进一步合成提供理论指导。 展开更多

关键词 苯基氨基吡啶派生物 HIV-1逆转录酶抑制剂 分子全息定量构效关系 色码 分子设计

原文传递

芳香族化合物与硝基自由基速率常数的HQSAR研究

8

作者 晋润萍 焦龙 马羚 《云南化工》 CAS 2022年第4期41-44,共4页

研究了硝基自由基与芳香族化合物的反应速率常数(pk(NO_(3)))的全息定量构效关系(HQSAR)模型。为了构建最优的HQSAR模型,将片段区分和片段大小的参数设置为A/B/C/CH/DA和1~4。通过采用外部测试集验证和留一交叉验证,来评估所开发模型的... 研究了硝基自由基与芳香族化合物的反应速率常数(pk(NO_(3)))的全息定量构效关系(HQSAR)模型。为了构建最优的HQSAR模型,将片段区分和片段大小的参数设置为A/B/C/CH/DA和1~4。通过采用外部测试集验证和留一交叉验证,来评估所开发模型的预测能力。两次验证表明,所开发的模型对于研究芳香族化合物与pk(NO_(3))之间的定量关系是可行的。 展开更多

关键词 分子全息定量构效关系 芳香族化合物 硝基自由基 速率常数

下载PDF 职称材料

部分取代芳烃发光菌毒性的HQSAR分析 被引量：5

9

作者 吕玉银 郭伟民 +2 位作者 刘树深 印春生 王连生 《桂林工学院学报》 北大核心 2007年第3期397-401,共5页

采用分子全息定量构效关系(Holographic QSAR)对47个取代芳烃的发光菌生物毒性与化学分子结构之间的关系进行了研究和分析.分子全息表征方法所构建的结构活性模型比传统的理化表征和其他基于碎片的低连接性表征方法优越,由模型所得到的... 采用分子全息定量构效关系(Holographic QSAR)对47个取代芳烃的发光菌生物毒性与化学分子结构之间的关系进行了研究和分析.分子全息表征方法所构建的结构活性模型比传统的理化表征和其他基于碎片的低连接性表征方法优越,由模型所得到的交互检验预测结果拟合相关系数为Q2=0.904.模型的质量随碎片大小而改变,碎片范围变化较大.因为分子全息方法表征的是有机污染物与配体之间相互作用的内在信息,所以这种相对简单的分子碎片表征方法能够反映出分子结构的细微性质. 展开更多

关键词 分子全息定量构效关系(HQSAR)分析 取代芳烃 发光菌毒性

下载PDF 职称材料

硝基苯类化合物对斜生栅藻毒性的HQSAR分析 被引量：7

10

作者 罗坤 高士祥 王连生 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第7期751-755,共5页

利用分子全息定量结构-活性相关关系(HQSAR)技术研究了25种硝基苯类化合物对斜生栅藻的急性毒性与其结构之间的相关关系.应用偏最小二乘回归技术(PLS)建立了定量模型.在碎片长度为1～7、碎片区分参数为原子类型、化学键类型和连接性条件... 利用分子全息定量结构-活性相关关系(HQSAR)技术研究了25种硝基苯类化合物对斜生栅藻的急性毒性与其结构之间的相关关系.应用偏最小二乘回归技术(PLS)建立了定量模型.在碎片长度为1～7、碎片区分参数为原子类型、化学键类型和连接性条件下,得到最佳模型(Q2=0.921,R2=0.992).为检验模型的预测能力,将数据集分成训练集和预测集.模型对预测集的预测结果与实测值吻合较好,表明模型的预测能力良好.最后利用色码图对模型中不同原子的贡献进行了解释. 展开更多

关键词 取代硝基苯类化合物 急性毒性 分子全息定量结构-活性相关关系(HQSAR) 色码

下载PDF 职称材料

基于分子对接技术及CoMSIA/HQSAR辅助的二羟基多氯联苯衍生物分子修饰 被引量：5

11

作者 辛美玲 褚振华 李鱼 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第2期299-309,共11页

利用类二噁英类多氯联苯(PCBs)大气氧化降解产物二羟基多氯联苯与2,3-二羟基联苯双加氧酶(Bphc,PDB ID:1KW6)进行分子对接,构建以分子结构参数为自变量,对接打分函数(K_d,代表对接活性)为因变量的分子相似性指数分析(Co MSIA)与分子全... 利用类二噁英类多氯联苯(PCBs)大气氧化降解产物二羟基多氯联苯与2,3-二羟基联苯双加氧酶(Bphc,PDB ID:1KW6)进行分子对接,构建以分子结构参数为自变量,对接打分函数(K_d,代表对接活性)为因变量的分子相似性指数分析(Co MSIA)与分子全息定量结构-活性相关关系(HQSAR)模型,并对二羟基多氯联苯进行分子修饰,研究结果表明,Bphc酶对二羟基多氯联苯均有不同程度的降解能力,影响Bphc酶对接活性的氨基酸残基为His145,Val147,Ile174,His194,His208,His209,His240,Asn242,Tyr249及Thr280,且二羟基多氯联苯与氨基酸残基对接形成的氢键越多对接活性越高.建立了CoMSIA和HQSAR模型耦合的二羟基多氯联苯分子取代活性精确定位方法,以打分函数较低的二羟基多氯联苯5,6-2OH-CB60为目标分子,设计出8种打分函数显著提升的新型分子,其对接活性提高65%~185%,分子毒性(IC_(50))下降10%~83%,生物富集性(BCF)下降4%~27%,迁移性(K_(OA))与半衰期(t_(1/2))增降幅基本不变.所设计新型分子反应路径的推断可以验证二羟基多氯联苯5,6-2OH-CB60在环境中与活性自由基或与活性分子反应生成所设计的新型5,6-2OH-CB60分子,即类二噁英类PCBs可通过大气氧化降解最终生成酶降解性显著提高的新型二羟基多氯联苯,达到进一步控制类二噁英类PCBs环境行为的目的. 展开更多

关键词 类二噁英类多氯联苯 二羟基多氯联苯 Bphc酶 分子对接 分子相似性指数分数 分子全息定量结构-活性相关关系

下载PDF 职称材料