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乙型肝炎病毒基因组准种与变异特点的研究 被引量:40
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作者 董菁 李进 +5 位作者 施双双 皇甫竞坤 成军 王勤环 洪源 李莉 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期116-118,共3页
探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因组异质性及其生物学意义。以已知HBV基因序列为依据 ,设计特异性多聚酶链反应 (PCR)引物 ,自 2例慢性HBV感染患者外周血血清中扩增HBV基因组序列 ,克隆入pGEMTeasy质粒 ,随机挑选克隆进行DNA测序并加以比较。... 探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因组异质性及其生物学意义。以已知HBV基因序列为依据 ,设计特异性多聚酶链反应 (PCR)引物 ,自 2例慢性HBV感染患者外周血血清中扩增HBV基因组序列 ,克隆入pGEMTeasy质粒 ,随机挑选克隆进行DNA测序并加以比较。测序结果发现 ,来源不同的 5株HBV全基因组核苷酸序列的一致率为 93 6 % ,不同克隆的 4个开放读码框架长度有明显区别 ,氨基酸序列中存有移框、缺失、替换等多种变异类型。说明来源于同一患者的HBV基因组序列之间存在有较明显的变异现象 ,在患者体内构成了准种群。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基因组 准种 遗传变异 HBV
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乙型肝炎病毒X基因准种特点的研究 被引量:39
2
作者 董菁 施双双 +4 位作者 皇甫竞坤 成军 王勤环 李莉 斯崇文 《中国病毒学》 CSCD 2002年第1期22-25,共4页
以乙型肝炎病毒(HBV)X基因序列的异质性表现来探讨HBV准种在 慢性感染者中的存在状态。以中国株HBV基因序列为依据,设计特异性多聚酶链反应引物, 自9例慢性HBV感染患者血清中扩增HBV X基因,克隆入pGEM ... 以乙型肝炎病毒(HBV)X基因序列的异质性表现来探讨HBV准种在 慢性感染者中的存在状态。以中国株HBV基因序列为依据,设计特异性多聚酶链反应引物, 自9例慢性HBV感染患者血清中扩增HBV X基因,克隆入pGEM Teasy质粒,随机挑选克隆进行D NA测序以确定病毒的变异程度。37例测序结果提示来源于不同患者HBV X基因序列高度保守 ,但每个序列均不一致。X区除了存在广泛的碱基点替换突变外,序列的缺失突变占测序克 隆总数的51.4%(19/37);氨基酸缺失及移框突变多发生于123位氨基酸残基之后,可导致X蛋 白多种羧基端形式。结果提示HBV长期携带者体内有HBV准种共存,X区内存在热点缺失突变区,该区突变结果可能影响X蛋白反式激活功能。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 反式激活 X基因
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慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒DNA序列异质性及准种特点的研究 被引量:37
3
作者 董菁 成军 +6 位作者 王勤环 皇甫竞坤 施双双 张国庆 洪源 李莉 斯崇文 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期81-85,共5页
目的 以乙型肝炎病毒 (HBV)基因异质性来探讨HBV准种群在慢性感染者中的存在状态。方法 应用聚合酶链反应 (PCR)法 ,自 18例慢性患者血清中分别扩增前C/C基因、P基因逆转录酶区 (RT)、HBV全S区、X基因和全基因组序列 ,克隆入pGEMTeas... 目的 以乙型肝炎病毒 (HBV)基因异质性来探讨HBV准种群在慢性感染者中的存在状态。方法 应用聚合酶链反应 (PCR)法 ,自 18例慢性患者血清中分别扩增前C/C基因、P基因逆转录酶区 (RT)、HBV全S区、X基因和全基因组序列 ,克隆入pGEMTeasy质粒 ,挑选 81克隆进行DNA测序以确定病毒的变异程度。结果 除外大段缺失突变的克隆 ,来源于同一患者前C/C区、RT区、全S区、X区和全基因组不同克隆之间的碱基序列同源性分别为 98 0 %~ 99 1%、98 7%~ 99 3%、97 5 %~ 10 0 %、93 0 %~ 98 2 %和 96 6 %~ 97 5 %。前C区A83点突变、C抗原内部缺失较为常见 ,缺失突变、终止替换突变、短序列的插入或缺失突变造成的移框突变在各个区域中均可检出 ,X基因 (核心蛋白启动子区 ,CP)内部缺失突变不仅导致X蛋白羧基端的多样性 ,而且调控HBeAg的表达。编码截短型表面抗原中蛋白和缺陷病毒基因亦在患者外周血中。结论 多区域测序结果提示HBV慢性患者体内HBV呈现准种群共存 ,X区 (CP区 )内存在热点缺失突变区 ,CP区的变异可能影响前C蛋白的表达 ,这些变异可能与患者不良预后有关。 展开更多
关键词 患者 缺失突变 体内 准种 HBV CP 乙型肝炎病毒DNA 变异 种群 全基因组序列
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慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒准种特点的初步研究 被引量:36
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作者 董菁 成军 +6 位作者 王勤环 刘友昭 王刚 施双双 夏小兵 邵清 斯崇文 《中华内科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第12期838-839,共2页
关键词 慢性乙型肝炎 HBV 准种
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慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒准种特点的初步研究(英文) 被引量:33
5
作者 董菁 成军 +6 位作者 王勤环 王刚 施双双 刘友昭 夏小兵 邵清 斯崇文 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期199-203,共5页
目的 探讨乙型肝炎病毒 (HBV )准种在慢性乙型肝炎患者中的存在状态。方法 以已知中国株HBV基因序列为依据 ,设计特异性聚合酶链反应 (PCR)引物 ,自 3例慢性乙型肝炎患者体内扩增HBV全S基因片段 ,克隆入 pGEMTeasy质粒 ,用限制性片段... 目的 探讨乙型肝炎病毒 (HBV )准种在慢性乙型肝炎患者中的存在状态。方法 以已知中国株HBV基因序列为依据 ,设计特异性聚合酶链反应 (PCR)引物 ,自 3例慢性乙型肝炎患者体内扩增HBV全S基因片段 ,克隆入 pGEMTeasy质粒 ,用限制性片段长度多态性(RFLP)法确定HBV的变异现象 ,DNA测序确定病毒的变异程度。结果 分别自 3例患者血清中克隆出 2 9、2 8和 8个阳性克隆 ,以EcoRI酶切患者 1和 2的RFLP结果提示各有 5种不同的长度带型 ,PCR产物XhoI酶切RFLP结果表现为高度保守 ,测序结果发现HBV体内毒株DNA序列高度一致 ,同一患者两株全S区序列测序结果表明DNA序列的同源性大于 97%。结论 慢性乙型肝炎患者体内有HBV准种共存 ,且呈现出一定的优势克隆现象 ,可能与患者预后有关。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 变异 限制性片段长度多态性 HBV
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外周血中乙型肝炎病毒截短型囊膜蛋白基因的克隆化与序列分析 被引量:33
6
作者 董菁 成军 +5 位作者 王勤环 王刚 施双双 刘妍 夏小兵 斯崇文 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 2001年第3期163-165,共3页
目的研究乙型肝炎病毒(HBV)在慢性感染者体内存在的特殊状态。方法采用特异性引物设计,以多聚酶链反应(PCR)自患者血清中扩增全S基因片段,测序以明确变异的部位,并与既往已发表的HBV adr亚型进行序列比较。结果经... 目的研究乙型肝炎病毒(HBV)在慢性感染者体内存在的特殊状态。方法采用特异性引物设计,以多聚酶链反应(PCR)自患者血清中扩增全S基因片段,测序以明确变异的部位,并与既往已发表的HBV adr亚型进行序列比较。结果经测序发现慢性HBV感染者体内存有变异病毒株编码的截短型表面抗原中蛋白基因,并存有HBsAs和多聚酶区缺陷型病毒基因。结论在外周血中存在HBV截短型囊膜蛋白编码基因,可能与患者不良预后有关。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 截短型囊膜蛋白 聚合酶链反应 突变 准种 克隆 序列分析
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乙型肝炎病毒准种研究的意义 被引量:26
7
作者 成军 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期197-198,共2页
关键词 乙型肝炎 HBV 准种 DNA
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乙型肝炎病毒逆转录酶区基因序列准种与变异研究 被引量:28
8
作者 董菁成军 王勤环 +5 位作者 施双双 洪源 皇甫竞坤 王刚 李莉 斯崇文 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第11期823-825,共3页
以乙型肝炎病毒 (HBV)多聚酶 (P)逆转录酶 (RT)区及表面抗原主蛋白 (HBsAg)序列异质性来探讨HBV准种群状态。用多聚酶链反应 (PCR)方法 ,自 3例慢性HBV患者血清中扩增靶基因 ,克隆入T载体。随机挑选 13株克隆测序 ,发现 2株克隆出现大... 以乙型肝炎病毒 (HBV)多聚酶 (P)逆转录酶 (RT)区及表面抗原主蛋白 (HBsAg)序列异质性来探讨HBV准种群状态。用多聚酶链反应 (PCR)方法 ,自 3例慢性HBV患者血清中扩增靶基因 ,克隆入T载体。随机挑选 13株克隆测序 ,发现 2株克隆出现大段缺失 ,另 11株序列之间总差异率为 5 1% ;RT和HBsAg氨基酸序列差异率分别为 4 9%和 7 5 % ;并发现缺失突变、终止突变等多种突变类型。结果提示 ,HBV慢性患者体内有HBV准种群 。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 逆转录酶 基因序列异质性
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乙型肝炎病毒基因异质性及准种特点研究的临床意义 被引量:20
9
作者 成军 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期112-115,共4页
乙型肝炎病毒 (HBV)基因组在慢性HBV感染的个体中存在不同的基因型 (genotype)、血清型 (serotype)和准种 (quasispecies)等基因序列异质性 (heterogeneity)的特点。HBV基因序列异质性是普遍存在的 ,在HBV基因组的各结构基因区、调节基... 乙型肝炎病毒 (HBV)基因组在慢性HBV感染的个体中存在不同的基因型 (genotype)、血清型 (serotype)和准种 (quasispecies)等基因序列异质性 (heterogeneity)的特点。HBV基因序列异质性是普遍存在的 ,在HBV基因组的各结构基因区、调节基因区都有异质性的特点 ,而且始终处在持续变化之中。HBV基因序列的异质性具有十分重要的生物医学意义。HBV准种等异质性特点的研究 ,使我们对于HBV全基因序列、HBV基因突变的规律、HBV抗药性的遗传学基础 ,甚至导致肝细胞恶性转化的分子生物学机制等都有了全新的认识。准种概念的引入 ,使我们对于HBV基因序列异质性的认识 ,从单一病毒株水平提升到HBV种群的水平 ,是对于HBV基因遗传与变异认识的一次革命性的飞跃。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 基因型 血清分型 异质性 准种 基因突变 反式激活 HBV
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乙型肝炎病毒表面抗原一级结构多态性的初步研究 被引量:21
10
作者 董菁 刘妍 +7 位作者 皇甫竞坤 施双双 王刚 洪源 陈国凤 李莉 陈菊梅 成军 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2002年第2期130-135,共6页
目的 研究慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒 (HBV)表面抗原一级结构的多态性。方法 设计特异性引物 ,自 7例慢性乙型肝炎患者血清中扩增S基因全长或全基因组片段 ,TA克隆法克隆到T载体中 ,随机选择克隆测序。结果 共 2 0个克隆被测... 目的 研究慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒 (HBV)表面抗原一级结构的多态性。方法 设计特异性引物 ,自 7例慢性乙型肝炎患者血清中扩增S基因全长或全基因组片段 ,TA克隆法克隆到T载体中 ,随机选择克隆测序。结果 共 2 0个克隆被测序。 2 0个克隆全S蛋白的总一致率仅为 3 2 .0 % ,13株全长为 40 1氨基酸残基的克隆氨基酸一致率为 82 .5 %。患者血清中发现2株克隆编码截短型表面抗原中蛋白 ,在前S1或前S2的免疫决定区或可能的肝细胞结合部位均发现缺失突变。结论 慢性乙肝患者体内存有HBV准种群 ,病毒编码的截短型表面抗原中蛋白可为HBV诱导原发性肝癌提供一种途径 ,应加强对HBsAg一级结构多态性的研究。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 表面抗原 准种 缺陷型病毒
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乙型肝炎病毒C基因启动子区准种与变异特点的研究 被引量:18
11
作者 董菁 成军 +7 位作者 王勤环 王刚 施双双 刘妍 夏小兵 李莉 张国庆 斯崇文 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期264-266,共3页
目的 研究乙型肝炎病毒 (HBV)C基因启动子区准种与变异的特点。方法 以中国株HBV基因序列为依据 ,设计特异性聚合酶链反应 (PCR)引物 ,自 3例慢性HBV感染患者外周血血清中扩增HBVCP序列 ,克隆入pGEMTeasy质粒 ,随机挑选克隆进行DNA测... 目的 研究乙型肝炎病毒 (HBV)C基因启动子区准种与变异的特点。方法 以中国株HBV基因序列为依据 ,设计特异性聚合酶链反应 (PCR)引物 ,自 3例慢性HBV感染患者外周血血清中扩增HBVCP序列 ,克隆入pGEMTeasy质粒 ,随机挑选克隆进行DNA测序以确定病毒的变异程度。结果 测序结果发现HBVCP序列高度保守 ,但在TATA样盒 (1~ 3)可发生多种突变 ,其中 184nt(T→C)位替换突变最为常见 ;在直接重复序列 (DR)Ⅰ上游存有一缺失突变高发区 33 3% (5 15 )。结论 CP区内有一缺失高变区 ,TATA样盒 3的变异可能影响前C蛋白的表达。结果提示HBV长期携带者体内有HBV准种共存。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 C基因启动子区 准种 变异 研究
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乙型肝炎病毒C基因启动子区异质性检测初步研究 被引量:17
12
作者 董菁 施双双 +6 位作者 张国庆 皇甫竞坤 洪源 成军 王勤环 李莉 斯崇文 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期72-74,共3页
目的 以乙型肝炎病毒 (HBV)C基因启动子 (CP)变异来探讨HBV准种的存在意义。方法 设计特异性多聚酶链反应 (PCR)引物 ,自 9例慢性HBV感染患者外周血血清中扩增HBVCP序列 ,克隆入pGEMTeasy质粒 ,随机挑选 37个克隆进行DNA测序以确定病... 目的 以乙型肝炎病毒 (HBV)C基因启动子 (CP)变异来探讨HBV准种的存在意义。方法 设计特异性多聚酶链反应 (PCR)引物 ,自 9例慢性HBV感染患者外周血血清中扩增HBVCP序列 ,克隆入pGEMTeasy质粒 ,随机挑选 37个克隆进行DNA测序以确定病毒的变异程度。结果 测序发现HBVCP序列是变异的高发区 ,在直接重复序列 (DR)I上游存有一缺失突变高发 (48 7% ,18/37)区 ,缺失突变与替换突变在TATA样盒TA2、TA3区发生率较高 ,而TA4极为保守。结论 CP区内有一缺失高变区 ,TA2、TA3的变异影响前C蛋白的表达 ,但该区的变异不影响前基因组RNA的转录。结果提示 。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 变异 启动子 C基因
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慢性乙型肝炎患者体内乙型肝炎病毒准种特点的初步研究 被引量:17
13
作者 董菁 成军 +6 位作者 王勤环 刘友昭 王刚 施双双 夏小兵 邵清 斯崇文 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2002年第1期17-19,共3页
探讨乙型肝炎病毒(HBV)在慢性患者中存在状态. 以 HBV基因序列为依据,设计特异性多聚酶链反应(PCR)引物.自2例慢性患者体内扩增HBV全S基因片段,克隆入T载体.限制片段长度多态性(RFLP)法确定HBV的变异... 探讨乙型肝炎病毒(HBV)在慢性患者中存在状态. 以 HBV基因序列为依据,设计特异性多聚酶链反应(PCR)引物.自2例慢性患者体内扩增HBV全S基因片段,克隆入T载体.限制片段长度多态性(RFLP)法确定HBV的变异现象,DNA测序确定病毒的变异程度。质粒EcoRI酶切RFLP结果提示自2例患者血清中克隆出的29和28个阳性克隆中各有5种不同的长度带型,PCR产物XhoI酶切RFLP结果则表现为高度保守,测序结果发现HBV体内毒株碱基序高度一致,同一患者两株全S区序列测序结果表明DNA序列的同源性大于97%。本结果提示HBV慢性患者体内有HBV准种共存,且呈现出一定的优势克隆现象。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 限制片段长度多态性 慢性乙型肝炎 病毒变异 克隆
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乙型肝炎病毒S区准种与疾病活动性的关系 被引量:14
14
作者 刘映霞 胡国龄 谭德明 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期282-286,共5页
目的 通过对慢性乙型肝炎不同病型患者S区准种复杂性差异的分析 ,探讨S区准种与疾病活动性的关系。方法 选择HBVDNA阳性患者共 112例 ,其中慢性重型肝炎 (FHF) 6 0例 (同时有肝硬化者 38例 ) ,慢性轻、中型肝炎 (CH) 30例 ,病毒携带者... 目的 通过对慢性乙型肝炎不同病型患者S区准种复杂性差异的分析 ,探讨S区准种与疾病活动性的关系。方法 选择HBVDNA阳性患者共 112例 ,其中慢性重型肝炎 (FHF) 6 0例 (同时有肝硬化者 38例 ) ,慢性轻、中型肝炎 (CH) 30例 ,病毒携带者 (ASC) 2 2例 ,采用单链构像多态性(SSCP)和DNA序列分析方法检测HBVS区准种。结果 不同疾病期SSCP条带数不同 ,分别为ASC( 1.4 5± 0 .13) ,CH( 3.70± 0 .2 2 ) ,FHF( 5 .93± 0 .2 4 )。准种复杂性随疾病进展而增加 ,组间比较差异有显著性 ,F =72 .73,P <0 .0 1。HBeAg阳性与HBeAg阴性患者SSCP条带数分别为 3.4 1± 0 .2 7和 5 .2 7± 0 .30 ,两组差异有显著性 (t =4 .5 3,P <0 .0 1)。HBV基因型B、C患者SSCP条带数分别为 4 .71± 2 .36和 3.0 6± 1.76 ,差异有显著性 (t =2 .6 6 ,P <0 .0 1)。 2例重型肝炎患者随访 1年后丙氨酸转氨酶 (ALT)分别由 5 6 7.2U/L、4 6 2 .3U/L降至正常和接近正常 ( 4 2 .8U/L) ,SSCP条带数分别由 9、7条减至 5、2条 ;1例ASC随访 1年SSCP方式仍维持 1条带不变 ,ALT水平高低与SS CP条带数多少相一致。经DNA序列分析 ,证实了SSCP显示的HBV准种性。结论 HBVS基因准种随疾病病情加重而复杂性增加 ,其增加程度与HBeAg阴性。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 乙型肝炎 S基因 准种
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乙型肝炎病毒序列准种个体化特征的研究 被引量:16
15
作者 董菁 成军 +6 位作者 皇甫竞坤 洪源 王刚 陈国凤 李莉 张玲霞 陈菊梅 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期119-121,共3页
以乙型肝炎病毒(HBV)多聚酶 (P)逆转录酶 (RT)区及表面抗原 (HBsAg)主蛋白、e抗原 (HBeAg)氨基酸序列异质性来探讨HBV准种群在感染个体中的变异特点。应用多聚酶链反应 (PCR)方法自 8例慢性HBV患者血清中扩增靶基因 ,克隆入T载体 ,随机... 以乙型肝炎病毒(HBV)多聚酶 (P)逆转录酶 (RT)区及表面抗原 (HBsAg)主蛋白、e抗原 (HBeAg)氨基酸序列异质性来探讨HBV准种群在感染个体中的变异特点。应用多聚酶链反应 (PCR)方法自 8例慢性HBV患者血清中扩增靶基因 ,克隆入T载体 ,随机挑选 2 7株克隆测序 ,将获得基因的推断氨基酸序列进行比较后发现 :病毒结构/非结构蛋白氨基酸序列存在广泛的变异现象 ,替换突变表现出一定的个体特异性 ,其结果是导致HBV在特定的患者体内可能存在特征性的变异。本研究提示HBV在患者体内的蛋白序列多样性是乙型肝炎慢性化的一个重要原因。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 表面抗原主蛋白 E抗原 个体化特征 HBV 序列多样性
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乙型肝炎病毒前C/C基因准种与变异特点的研究 被引量:14
16
作者 董菁 施双双 +6 位作者 皇甫竞坤 成军 王勤环 王刚 洪源 李莉 斯崇文 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期122-124,共3页
以乙型肝炎病毒 (HBV)前C/C基因异质性来探讨在慢性感染者体内是否存在HBV准种。以中国株HBV基因序列为依据 ,设计特异性多聚酶链反应 (PCR)引物 ,自 4例慢性HBV感染患者血清中扩增HBV前C/C基因序列 ,克隆入pGEMTeasy载体 ,每例患者挑... 以乙型肝炎病毒 (HBV)前C/C基因异质性来探讨在慢性感染者体内是否存在HBV准种。以中国株HBV基因序列为依据 ,设计特异性多聚酶链反应 (PCR)引物 ,自 4例慢性HBV感染患者血清中扩增HBV前C/C基因序列 ,克隆入pGEMTeasy载体 ,每例患者挑选 5个克隆测序以比较病毒的变异程度。测序结果发现同一患者前C/C基因碱基序列之间的同源性大于 98% ,但存有G83→A替换、C抗原内部缺失、移框突变等多种变异类型。结果提示 ,HBV长期携带者体内有HBV准种共存 ,推测前C/C区的多种变异可能与感染慢性化有关。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 前C/C基因 遗传变异 HBV
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熔点曲线法研究乙型肝炎病毒准种和临床表现的关系 被引量:14
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作者 温志立 谭德明 +2 位作者 彭仕芳 侯周华 成军 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期19-22,共4页
目的研究乙型肝炎病毒(HBV)准种与临床的关系,从HBV准种这个角度阐述相同基因型 HBV导致不同病情的机制。方法选取B基因型HBV感染的慢性携带者血清32份和慢性乙型肝炎重度患者血清28份作为检测对象,采用熔点曲线法比较两组血清波峰数量... 目的研究乙型肝炎病毒(HBV)准种与临床的关系,从HBV准种这个角度阐述相同基因型 HBV导致不同病情的机制。方法选取B基因型HBV感染的慢性携带者血清32份和慢性乙型肝炎重度患者血清28份作为检测对象,采用熔点曲线法比较两组血清波峰数量的差异。结果慢性乙型肝炎重度患者血清的波峰数量明显多于慢性携带者血清(P<0.05),提示前者所携带HBV的准种数量多于后者。结论 HBV准种与乙型肝炎临床表现存在一定关系,在HBV基因型相同时,病情较重的乙型肝炎与HBV准种数量多有关,可在一定程度上解释同一基因型的不同患者出现不同临床表现的现象。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 准种 临床表现 熔点曲线
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乙型肝炎病毒逆转录酶区基因序列准种与变异特点 被引量:15
18
作者 董菁 成军 +6 位作者 王勤环 施双双 洪源 皇甫竞坤 王刚 李莉 斯崇文 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期270-272,共3页
To investigate the HBV quasispecies population in the patients with chronic HBV infection,a set of specific primers was synthesized according to DNA sequence of HBV found in China The reverse transcriptase(RT) region ... To investigate the HBV quasispecies population in the patients with chronic HBV infection,a set of specific primers was synthesized according to DNA sequence of HBV found in China The reverse transcriptase(RT) region in polymerase gene was amplified by PCR method from the sera of 3 patients with chronic HBV infection,and then the PCR products were subcloned into pGEM Teasy vectors 13 clones were sequenced Sequence comparison of the selected clones was made to find out the differences After being compared,11 sequences of RT were found different The different rates of RT coding nucletide sequences, RT and HBsAg amino acid sequences of the 11 clones were 5 1%,4 9% and 7 5% respectively Many mutation types,including point substitution and deletion mutation,were found in this region There are quasispecies population and defective HBV genome in patients with chronic HBV infection. 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 准种 变异 多聚酶 逆转录酶区
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拉米夫定与恩替卡韦序贯治疗中的乙型肝炎病毒准种动力学 被引量:13
19
作者 刘霖 汤影子 +3 位作者 李俊刚 周吉军 王小红 王宇明 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期423-427,共5页
目的 研究HBV准种群体在拉米夫定(LAM)与恩替卡韦(ETV)序贯治疗过程中的动态演变及其临床意义. 方法 对2例采用LAM-ETV序贯治疗出现不同临床结果的患者进行了近4年的随访,用多聚酶链反应-克隆-测序的方法研究HBV准种组成的长程动态... 目的 研究HBV准种群体在拉米夫定(LAM)与恩替卡韦(ETV)序贯治疗过程中的动态演变及其临床意义. 方法 对2例采用LAM-ETV序贯治疗出现不同临床结果的患者进行了近4年的随访,用多聚酶链反应-克隆-测序的方法研究HBV准种组成的长程动态演变,用最大似然法建立遗传进化树分析代表序列的遗传进化关系,结合血清学和病毒学指标分析HBV准种演变与临床过程的关系. 结果 2例患者均出现了LAM耐药病毒学突破,采用ETV治疗后,1例患者获得了持续病毒学应答,另一例患者在ETV治疗72周时又出现病毒学突破.病毒学突破均发生在原有对药物敏感的优势准种被耐药株替代时,ETV耐药与rtL180M+S202G+M204V三联突变株成为优势准种密切相关,准种动力学和遗传进化分析结果提示LAM治疗筛选出的rtL180M合并M204V联合突变株在HBV种群中的累积与此三联突变株的出现有直接关系.结论 HBV准种组成与核苷类药物敏感性密切相关,LAM耐药株可进一步演化为ETV耐药株,对使用核苷类药物治疗的患者进行HBV准种监测具有重要临床意义. 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 拉米夫定 恩替卡韦 治疗 抗病毒 准种
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丙型肝炎病毒感染自然过程中的准种变化 被引量:12
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作者 王齐欣 魏来 +5 位作者 高燕 孙德贵 蒋栋 徐小元 陈红松 王宇 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期323-326,共4页
目的观察丙型肝炎病毒(HCV)持续感染者与自然阴转者外周血HCV准种构成的变化规律。方法应用基因扩增、分子克隆和测序的方法,对未接受过治疗的4例HCV持续感染者与4例自然阴转者前后间隔10年血清中HCV高变区1(HVR1)基因片段进行了序列分... 目的观察丙型肝炎病毒(HCV)持续感染者与自然阴转者外周血HCV准种构成的变化规律。方法应用基因扩增、分子克隆和测序的方法,对未接受过治疗的4例HCV持续感染者与4例自然阴转者前后间隔10年血清中HCV高变区1(HVR1)基因片段进行了序列分析及遗传进化关系比较。结果与持续感染者相比,自然阴转者外周血HCVHVR1区准种群体组内平均遗传距离、熵值较小。4例持续感染者中有3例10年前后血清HCVHVR1准种群体组内与组间遗传距离有明显差异。8例感染者中有7例血清HCV准种KA/KS值大于1。结论在丙型肝炎的自然病程中HCV准种遗传复杂度、变异度大小可能与丙型肝炎的转归相关;HCV准种构成可能发生改变。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒感染 准种 遗传距离
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