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黑木耳栽培菌株亲缘关系的ISSR分析 被引量：12
1
作者 任广明 李滇华 +1 位作者 郭兴 高云虹 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期99-101,共3页
采用ISSR分析标记技术对黑龙江省伊春地区23个黑木耳主栽品种进行DNA指纹图谱分析,在选用的10个引物中,有6个引物扩增得到较清晰、稳定、多态性强的指纹图谱。运用NTSYS软件进行聚类分析,相似水平为0.70时,可将23个黑木耳菌株分为3个组... 采用ISSR分析标记技术对黑龙江省伊春地区23个黑木耳主栽品种进行DNA指纹图谱分析,在选用的10个引物中,有6个引物扩增得到较清晰、稳定、多态性强的指纹图谱。运用NTSYS软件进行聚类分析,相似水平为0.70时,可将23个黑木耳菌株分为3个组群。结果表明,伊春地区黑木耳栽培菌株遗传背景差异不大,存在同物异名现象,ISSR标记可用于黑木耳栽培菌株鉴定、遗传作图、遗传多样性等研究。 展开更多
关键词 内部简单重复序列 黑木耳 聚类分析
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ISSR标记技术辅助形态学的红曲菌株分类鉴定 被引量：4
2
作者 朱丽萍 陈福生 +2 位作者 杨强 陈申习 邵彦春 《中国酿造》 CAS 北大核心 2020年第8期175-181,共7页
以市售红曲产品中分离的17株红曲菌株和8株标准菌株为主要材料,根据它们的菌落形态和显微形态特征进行分类,25株菌株归为6类。同时,运用内部简单重复序列(ISSR)标记分类法进行聚类分析,在相似性水平为0.9时,25株菌株聚为5类。综合形态... 以市售红曲产品中分离的17株红曲菌株和8株标准菌株为主要材料,根据它们的菌落形态和显微形态特征进行分类,25株菌株归为6类。同时,运用内部简单重复序列(ISSR)标记分类法进行聚类分析,在相似性水平为0.9时,25株菌株聚为5类。综合形态学分类鉴定法和ISSR标记分类法结果,25株红曲菌株被聚为3大类,分别是红色红曲菌(Monascus ruber)、紫色红曲菌(Monascus purpureus)和血红红曲菌(Monascus sanguineus)。结果表明,传统形态学分类方法结合ISSR标记分类法能为红曲菌株的分类鉴定提供综合参考信息。也可为了解市售红曲相关发酵产品生产菌株的分类与特征、进一步发掘和保护红曲菌株资源提供参考。 展开更多
关键词 红曲菌 形态 内部简单重复序列 分类鉴定
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皱边石杉内生真菌ISSR-PCR反应条件的优化 被引量：3
3
作者 史云峰 禹利君 +3 位作者 刘仲华 黄璜 胥锦桦 朱楠楠 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期398-403,共6页
以从皱边石杉中分离纯化出的99株内生真菌DNA为材料,优选出10条ISSR引物(UBC842、UBC848、UBC850、UBC856、UBC861、UBC864、UBC868、UBC873、UBC880、UBC887)的最适退火温度,并对其进行ISSR–PCR反应体系单因素试验及正交试验优化,建... 以从皱边石杉中分离纯化出的99株内生真菌DNA为材料,优选出10条ISSR引物(UBC842、UBC848、UBC850、UBC856、UBC861、UBC864、UBC868、UBC873、UBC880、UBC887)的最适退火温度,并对其进行ISSR–PCR反应体系单因素试验及正交试验优化,建立皱边石杉内生真菌ISSR–PCR的优化反应体系,即25μL反应体系中,10×PCR Buffer(Mg2+浓度为2.0 mmol/L)2.5μL,dNTPs(10 mmol/L)0.6μL,引物(10 pmol/μL)2.0μL,Taq E(1 U/μL)1.5μL,DNA模板(10 ng/μL)3μL,无菌ddH2O 15.4μL。以UBC873引物对99株内生真菌基因组DNA进行PCR扩增,初步获知皱边石杉内生真菌资源的遗传多样性非常丰富。 展开更多
关键词 皱边石杉 内生真菌 内部简单重复序列 正交试验
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13个居群唐松草内部简单重复序列遗传多样性分析
4
作者 李勇慧 金明现 +1 位作者 陈凤玲 周晓君 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期4908-4912,共5页
目的:对13个居群唐松草进行遗传多样性分析。方法:通过改良的CTAB法提取DNA,并通过ISSRPCR扩增目的产物。结果:220条引物筛选出9条多态性较高的引物,共扩增125个位点,多态性比率100%。Popgene 1.32分析得出13个居群的Nei’s基因多样性指... 目的:对13个居群唐松草进行遗传多样性分析。方法:通过改良的CTAB法提取DNA,并通过ISSRPCR扩增目的产物。结果:220条引物筛选出9条多态性较高的引物,共扩增125个位点,多态性比率100%。Popgene 1.32分析得出13个居群的Nei’s基因多样性指数(H)=(0.2523±0.1555),Shannon信息指数(I)=(0.3981±0.2033),遗传分化系数(Gst)=0.4282,基因流(Nm)=0.6676,可知群体间、群体内的遗传变异占总遗传变异的42.84%、57.16%,居群内的遗传变异高于居群间。与AMOVA分析相一致。Mantel检验表明种群间的遗传距离与地理距离较弱性正相关。表明13个居群唐松草有着较为丰富的遗传多样性且群体之间存在着一定的遗传分化。进行聚类分析和主坐标分析,表明每个居群的个体基本上会聚在一起,居群间基本不按地理位置的远近进行聚类。结论:13个居群唐松草的遗传距离和地理位置相关性不高。 展开更多
关键词 唐松草 居群 内部简单重复序列 遗传多样性 聚类分析 地理距离 主坐标分析 遗传距离
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福建不同水域水葫芦遗传多态性的ISSR分析 被引量：6
5
作者 林瑞余 孙红艳 +4 位作者 赵瑞宗 陈祥旭 苗利国 黄磊 林文雄 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2008年第2期175-179,共5页
在建立内部简单重复序列(ISSR)分析方法的基础上,以采自福建省主要河流和福州内河的12份水葫芦样本为材料,筛选出20个可扩增出清晰且具多态性片段的ISSR随机引物,通过PCR扩增,探讨其遗传多态性和亲缘关系.ISSR分析结果表明,从12份水葫... 在建立内部简单重复序列(ISSR)分析方法的基础上,以采自福建省主要河流和福州内河的12份水葫芦样本为材料,筛选出20个可扩增出清晰且具多态性片段的ISSR随机引物,通过PCR扩增,探讨其遗传多态性和亲缘关系.ISSR分析结果表明,从12份水葫芦样本中获得了150个DNA片段,其中75个片段呈现多态性,占总扩增片段的50.0%;Shannon信息指数均值(0.2739)和Nei′s基因多样性指数均值(0.1894)相对较小,但种群内的遗传多样性仍有一定的差异.聚类分析表明,当遗传距离为0.40时,供试的12份水葫芦样本分为3大类,第Ⅰ大类来自福建农林大学校内池塘,第Ⅱ类来自福州金山社区内河,而闽江、九龙江、木兰溪和晋江流域的聚为一类. 展开更多
关键词 水葫芦 内部简单重复序列(ISSR) 遗传多态性
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不同产地北柴胡ISSR遗传多样性分析 被引量：6
6
作者 李勇慧 于相丽 欧小洁 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1728-1731,共4页
目的为了对不同产地的北柴胡进行遗传多样性研究,本文利用ISSR(inter-simple sequence repeat)技术对我国北柴胡的6个居群11个样品进行了遗传多样性的分析。方法共挑选出了9条扩增条带清晰的引物,共检测到2088条明显的条带,多态性条带为... 目的为了对不同产地的北柴胡进行遗传多样性研究,本文利用ISSR(inter-simple sequence repeat)技术对我国北柴胡的6个居群11个样品进行了遗传多样性的分析。方法共挑选出了9条扩增条带清晰的引物,共检测到2088条明显的条带,多态性条带为2084条,多态性的比值占99.8%。结果利用popgene32对6个居群进行聚类分析,结果显示信息指数Shannon I=0.1996,Nei's基因多样性指数H=0.1299。显示了6个北柴胡居群有着较为丰富的遗传多样性。进行遗传变异研究显示,遗传分化系数Gst=0.7826,表明在北柴胡群体之间存在一定遗传分化,居群间基因流Nm=0.1388,表明居群间遗传交换较少。结论聚类分析结果表明6个居群北柴胡存在比较丰富的遗传变异,且与地理分布有一定相关性。 展开更多
关键词 北柴胡 PCR扩增 内部简单重复序列分子标记技术 亲缘关系 遗传多样性
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黑木耳总DNA提取及PCR-ISSR引物筛选 被引量：4
7
作者 曾晓丽 汪思迪 程水明 《湖北农业科学》 北大核心 2009年第12期2926-2928,共3页
以14个黑木耳[Auricularia auricula(L.ex Hook)Underw]菌株为试材,对黑木耳总DNA提取方法和ISSR-PCR扩增反应条件及引物进行了筛选。结果表明,改进的SDS抽提法可以在较短时间内提取到高纯度的DNA产物;并筛选出了可产生遗传多样性的15... 以14个黑木耳[Auricularia auricula(L.ex Hook)Underw]菌株为试材,对黑木耳总DNA提取方法和ISSR-PCR扩增反应条件及引物进行了筛选。结果表明,改进的SDS抽提法可以在较短时间内提取到高纯度的DNA产物;并筛选出了可产生遗传多样性的15条引物,其中引物ISSR11、ISSR12、ISSR14扩增结果的稳定性好、多态性强。经凝胶电泳比较,引物ISSR14可作为黑木耳PCR–ISSR反应的适宜引物。 展开更多
关键词 黑木耳 内部简单重复序列分子标记 DNA提取 引物筛选
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应用内部简单重复序列(ISSR)扩增的大麻DNA指纹图谱
8
作者 鲍雷 《国外医学（中医中药分册）》 2004年第1期62-62,共1页
利用HPLC方法可将3种不同的大麻样品分成四氢大麻酚类(THC)和大麻二酚类(CBD)2种化学类型，但有2种样品不能区分同属CBD型。本次利用ISSR指纹图谱进行鉴别。
关键词 内部简单重复序列 WSSR 扩增 大麻 DNA指纹图谱
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