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弱后酸化保加利亚乳杆菌KLDS1.1011的筛选及其全基因组注释研究
被引量:
5
1
作者
王成凤
李柏良
+4 位作者
岳莹雪
陈紫育
闫芬芬
霍贵成
李艾黎
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2021年第6期103-110,共8页
为了研究影响保加利亚乳杆菌后酸化的关键基因,为酸奶发酵剂的开发提供分子水平的理论基础。本实验以实验室现有的8株保加利亚乳杆菌作为出发菌株,通过对其生长性能以及对酸敏感性筛选出KLDS1.0207、KLDS1.0205、KLDS1.1001、KLDS1.101...
为了研究影响保加利亚乳杆菌后酸化的关键基因,为酸奶发酵剂的开发提供分子水平的理论基础。本实验以实验室现有的8株保加利亚乳杆菌作为出发菌株,通过对其生长性能以及对酸敏感性筛选出KLDS1.0207、KLDS1.0205、KLDS1.1001、KLDS1.1011产酸差异性明显的4株保加利亚乳杆菌,通过对4株保加利亚乳杆菌单菌株发酵乳的凝乳时间、滴定酸度、乳糖消耗进行检测,分析得到菌株KLDS1.1011后酸化能力最弱。通过Illumina HiSeq与Illumina MiSeq测序平台对菌株菌株KLDS1.1011进行基因组测序,得到KLDS1.1011基因组全长1887491 bp,平均G+C含量为39.83%,基因组中共预测出2098个CDS,其总长度为1622760 bp,编码区域总长度占全基因组比例85.97%,编码基因的平均长度为773 bp;利用同源聚类分析方式比较保加利亚乳杆菌KLDS1.1011和KLDS1.0207基因组,发现两者有1631个共有基因,KLDS1.1011有353个特有基因,KLDS1.0207有320个特有基因,进而通过对特有基因进行KEGG通路的注释以及后酸化相关通路的分析得到6个与后酸化相关的基因,1.1011_GM000805、1.1011_GM002068、1.1011_GM000803、1.1011_GM000804四个基因是关于生物膜的形成,菌株的物质转运、1.1011_GM000260基因属于丙酮酸代谢通路,是乳酸生成过程的重要通路、1.1011_GM000194基因是蛋白水解的关键酶基因。在基因水平上为菌株KLDS1.1011较弱的后酸化特性提供了重要的理论依据。
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关键词
保加利亚乳杆菌
筛选
后酸化
全
基因组
注释
特有
基因
下载PDF
职称材料
单细胞微生物基因组学研究
被引量:
3
2
作者
陆光涛
何勇强
唐纪良
《广西农业生物科学》
CAS
CSCD
2001年第2期129-132,153,共5页
本文介绍了单细胞微生物基因组测序 ,全基因组序列的注释 。
关键词
单细胞微生物
基因组
学
全
基因组
测序
全
基因组
序列
注释
下载PDF
职称材料
题名
弱后酸化保加利亚乳杆菌KLDS1.1011的筛选及其全基因组注释研究
被引量:
5
1
作者
王成凤
李柏良
岳莹雪
陈紫育
闫芬芬
霍贵成
李艾黎
机构
东北农业大学
出处
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2021年第6期103-110,共8页
基金
“十三五”国家重点研发计划项目(2017YFD0400303)。
文摘
为了研究影响保加利亚乳杆菌后酸化的关键基因,为酸奶发酵剂的开发提供分子水平的理论基础。本实验以实验室现有的8株保加利亚乳杆菌作为出发菌株,通过对其生长性能以及对酸敏感性筛选出KLDS1.0207、KLDS1.0205、KLDS1.1001、KLDS1.1011产酸差异性明显的4株保加利亚乳杆菌,通过对4株保加利亚乳杆菌单菌株发酵乳的凝乳时间、滴定酸度、乳糖消耗进行检测,分析得到菌株KLDS1.1011后酸化能力最弱。通过Illumina HiSeq与Illumina MiSeq测序平台对菌株菌株KLDS1.1011进行基因组测序,得到KLDS1.1011基因组全长1887491 bp,平均G+C含量为39.83%,基因组中共预测出2098个CDS,其总长度为1622760 bp,编码区域总长度占全基因组比例85.97%,编码基因的平均长度为773 bp;利用同源聚类分析方式比较保加利亚乳杆菌KLDS1.1011和KLDS1.0207基因组,发现两者有1631个共有基因,KLDS1.1011有353个特有基因,KLDS1.0207有320个特有基因,进而通过对特有基因进行KEGG通路的注释以及后酸化相关通路的分析得到6个与后酸化相关的基因,1.1011_GM000805、1.1011_GM002068、1.1011_GM000803、1.1011_GM000804四个基因是关于生物膜的形成,菌株的物质转运、1.1011_GM000260基因属于丙酮酸代谢通路,是乳酸生成过程的重要通路、1.1011_GM000194基因是蛋白水解的关键酶基因。在基因水平上为菌株KLDS1.1011较弱的后酸化特性提供了重要的理论依据。
关键词
保加利亚乳杆菌
筛选
后酸化
全
基因组
注释
特有
基因
Keywords
Lactobacillus bulgaricus
screening
post-acidification
genome-wide annotation
unique genes
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
单细胞微生物基因组学研究
被引量:
3
2
作者
陆光涛
何勇强
唐纪良
机构
广西大学农业部农业分子遗传重点开放实验室
出处
《广西农业生物科学》
CAS
CSCD
2001年第2期129-132,153,共5页
基金
国家高技术"863"计划资助项目!( 863 1 0 1 0 2 0 70 1 )
文摘
本文介绍了单细胞微生物基因组测序 ,全基因组序列的注释 。
关键词
单细胞微生物
基因组
学
全
基因组
测序
全
基因组
序列
注释
Keywords
single cell microbes
genomics
sequencing
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
弱后酸化保加利亚乳杆菌KLDS1.1011的筛选及其全基因组注释研究
王成凤
李柏良
岳莹雪
陈紫育
闫芬芬
霍贵成
李艾黎
《食品工业科技》
CAS
北大核心
2021
5
下载PDF
职称材料
2
单细胞微生物基因组学研究
陆光涛
何勇强
唐纪良
《广西农业生物科学》
CAS
CSCD
2001
3
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
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