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赤狐EDNRB基因编码区序列分析及启动子预测
被引量：
1
1
作者
胡露露
赵子雅
+5 位作者
王瑞宁
王亚琪
刘铮铸
巩元芳
李祥龙
彭永东
《畜牧与兽医》
北大核心
2019年第8期16-20,共5页
为了研究赤狐内皮素受体B基因(EDNRB)编码蛋白的结构、功能及预测其5′端上游2 000 bp的候选启动子区的核心启动子区与转录因子的结合位点,从NCBI数据库中获得赤狐EDNRB基因的数据,利用生物信息学方法分析其编码区及候选启动子区。结果...
为了研究赤狐内皮素受体B基因(EDNRB)编码蛋白的结构、功能及预测其5′端上游2 000 bp的候选启动子区的核心启动子区与转录因子的结合位点,从NCBI数据库中获得赤狐EDNRB基因的数据,利用生物信息学方法分析其编码区及候选启动子区。结果表明:赤狐EDNRB基因编码氨基酸的总数为443个,编码产物为不稳定的疏水蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,存在信号肽和二硫键。该编码蛋白存在于内质网、细胞质膜和线粒体中。该编码蛋白含有7次跨膜G蛋白偶联受体超家族结构域。赤狐与乌苏里貉的亲缘关系最近,与犬关系较近。该基因的5′端上游存在潜在的启动子区域,同时发现存在转录调控元件和转录因子结合位点,不存在CpG岛。通过对赤狐EDNRB基因进行生物信息学分析,能够初步预测其编码区的结构、功能以及该基因的核心启动子区与转录因子结合位点,为其遗传特性及调控机制的研究提供基本信息。
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关键词
赤狐
内皮素受体B基因
编码
区
候选
启动子
区
生物信息学
原文传递
题名
赤狐EDNRB基因编码区序列分析及启动子预测
被引量：
1
1
作者
胡露露
赵子雅
王瑞宁
王亚琪
刘铮铸
巩元芳
李祥龙
彭永东
机构
河北科技师范学院动物科技学院
出处
《畜牧与兽医》
北大核心
2019年第8期16-20,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31501940)
河北省自然科学基金项目(C2016407114
+3 种基金
C2017407037
C2017407040)
河北省高等学校青年拔尖人才计划项目(BJ2016026)
河北省高校创新团队领军人才培育计划项目(LJRC004)
文摘
为了研究赤狐内皮素受体B基因(EDNRB)编码蛋白的结构、功能及预测其5′端上游2 000 bp的候选启动子区的核心启动子区与转录因子的结合位点,从NCBI数据库中获得赤狐EDNRB基因的数据,利用生物信息学方法分析其编码区及候选启动子区。结果表明:赤狐EDNRB基因编码氨基酸的总数为443个,编码产物为不稳定的疏水蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,存在信号肽和二硫键。该编码蛋白存在于内质网、细胞质膜和线粒体中。该编码蛋白含有7次跨膜G蛋白偶联受体超家族结构域。赤狐与乌苏里貉的亲缘关系最近,与犬关系较近。该基因的5′端上游存在潜在的启动子区域,同时发现存在转录调控元件和转录因子结合位点,不存在CpG岛。通过对赤狐EDNRB基因进行生物信息学分析,能够初步预测其编码区的结构、功能以及该基因的核心启动子区与转录因子结合位点,为其遗传特性及调控机制的研究提供基本信息。
关键词
赤狐
内皮素受体B基因
编码
区
候选
启动子
区
生物信息学
Keywords
Red fox
endothelin receptor B gene
coding region
candidate promoter region
bioinformatics
分类号
S865.23 [农业科学—野生动物驯养]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
赤狐EDNRB基因编码区序列分析及启动子预测
胡露露
赵子雅
王瑞宁
王亚琪
刘铮铸
巩元芳
李祥龙
彭永东
《畜牧与兽医》
北大核心
2019
1
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