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大鼠肝癌细胞照射后非实质细胞影响肝癌细胞基因的变化
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作者 周乐源 张勇 +3 位作者 姚苏芮 殷媛 李杰 黄朝晖 《中华实验外科杂志》 CSCD 北大核心 2017年第7期1095-1098,共4页
目的探讨照射后微环境对残存的肝癌细胞转移能力影响及分子机制。方法分离大鼠肝脏非实质细胞（NPCs），贴壁后进行照射，然后收集培养上清液与照射过的大鼠肝癌细胞McA-RH7777-6 Gy共培养。经不同培液上清共培养McA-RH7777-6 Gy细胞得... 目的探讨照射后微环境对残存的肝癌细胞转移能力影响及分子机制。方法分离大鼠肝脏非实质细胞（NPCs），贴壁后进行照射，然后收集培养上清液与照射过的大鼠肝癌细胞McA-RH7777-6 Gy共培养。经不同培液上清共培养McA-RH7777-6 Gy细胞得到RH 6 Gy（与未照射NPCs上清液共培养）和RH 6 Gy-R（与照射后NPCs上清液共培养）细胞株。采用基因芯片技术检测RH 6 Gy和RH 6 Gy-R细胞中基因的表达。通过生物信息学对显著变化的基因进行分析，并利用DAVID数据库对这些变化的基因进行功能富集分析（GO-analysis）和信号转导通路富集分析（KEGG-analysis，BIOCARTA-analysis）。进行细胞划痕实验，比较RH 6 Gy细胞和RH 6 Gy-R细胞的运动迁移能力。结果基因芯片检测结果显示，RH 6 Gy-R与RH 6 Gy细胞比较，周期蛋白依赖性激酶2（CDK2）、丝裂原活化蛋白激酶9（MAPK9）、细胞周期蛋白（Cyclin） A、Toll/白细胞介素-1受体相关蛋白（TIRAP）、3-磷酸肌醇依赖性蛋白激酶1/2（PDK1/2）、磷酸肌醇3激酶（PI3K）等15个肿瘤发生发展相关基因的表达都显著高于未照射上清共培养组，且这些表达差异显著的基因多数富集在肿瘤转移相关通路，如腺苷酸活化蛋白激酶（AMPK）信号通路、磷脂酰肌醇信号通路、Ras信号转导通路等。体外划痕实验显示，细胞划痕培养48 h后，RH 6 Gy细胞面积愈合率为（9.00±1.35）%，RH 6 Gy-R细胞面积愈合率为（41.30±6.32）%。结论经照射后的残存的肝癌表现出更强的转移能力，可能与其微环境中的NPCs相关，我们推测照射后的NPCs释放的某些细胞因子促进了肝癌残存细胞转移相关mRNA的表达，从而激活相关癌转移通路。 展开更多
关键词 肝非实质细胞 肝癌细胞 转移 功能富集分析 信号转导通路富集分析
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亚致死照射后大鼠肝癌细胞基因表达谱的变化及其生物信息学分析
2
作者 姚苏芮 周乐源 +1 位作者 殷媛 黄朝晖 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期681-689,共9页
目的 :初步探讨亚致死照射后残存的肝癌细胞中基因表达谱和细胞转移能力的变化,以及其可能的分子作用机制。方法:对肝癌Mc A-RH7777细胞进行一次性照射(6 Gy),筛选残存细胞即为McA-RH7777-6Gy细胞系。采用基因芯片技术检测Mc A-RH7777和... 目的 :初步探讨亚致死照射后残存的肝癌细胞中基因表达谱和细胞转移能力的变化,以及其可能的分子作用机制。方法:对肝癌Mc A-RH7777细胞进行一次性照射(6 Gy),筛选残存细胞即为McA-RH7777-6Gy细胞系。采用基因芯片技术检测Mc A-RH7777和McA-RH7777-6Gy细胞中mRNA表达的变化。然后,利用DAVID数据库对表达水平有明显差异的基因进行生物信息学分析,包括GO生物功能富集分析和KEGG信号通路富集分析。采用实时荧光定量PCR法验证2组细胞中上述分析差异较大的3个基因基质金属蛋白酶组织抑制因子2(tissue inhibitor of metalloproteinase 2,TIMP2)、SMAD家族成员2(SMAD family member 2,SMAD2)和MET原癌基因m RNA表达差异。进一步采用划痕愈合实验和Transwell小室法检测2组细胞的迁移和侵袭能力的差异。结果:基因芯片检测结果显示,照射后残存Mc A-RH7777-6Gy细胞与野生型Mc A-RH7777细胞相比,一系列与肿瘤相关的基因表达都发生了明显变化。实时荧光定量PCR检测结果显示,与McA-RH7777细胞相比,Mc A-RH7777-6Gy细胞中TIMP2、SMAD2和MET mRNA的表达水平分别上调13.000、14.516和6.384倍。GO生物信息学分析发现,这些基因多富集于肿瘤转移相关的生物学过程,如Ras蛋白信号转导、细胞周期阻滞、细胞迁移、细胞黏附、凋亡负调控、细胞增殖正调控、上皮-间质转化正调控和MAP激酶活性正调控等。KEGG信号通路分析发现,这些基因多富集在蛋白多糖信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶(phosphoinositide-3 kinase,PI3K)-蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又称Akt)信号通路、病毒致瘤信号通路、FoxO信号通路、Rap1信号通路、Hippo信号通路和Ras信号通路等。划痕愈合实验结果表明,McA-RH7777-6Gy组划痕愈合率明显高于McA-RH7777组划痕愈合率(P<0.001)。Transwell小室法检测结果显示,McA-RH7777-6Gy组细胞侵袭至小室滤膜下的平均细胞数明显多于Mc A-RH7777组(P<0.001)。� 展开更多
关键词 肝肿瘤 放射疗法 亚致死照射 基因功能富集分析 信号转导通路富集分析
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