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水熊虫耐干燥机制的关键分子筛选
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作者 郑坤 沈磐 +3 位作者 侯雨杉 王斐 王虎强 杨冬 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2024年第5期936-950,共15页
水熊虫,学名缓步动物,是一种能耐受多种极端环境的微小水陆两栖动物,但其耐干燥的具体分子机制仍不明.本研究收集3种水熊虫和其他11种后生动物的基因组数据,使用OrthoFinder判定得到4个基因家族在水熊虫中特异扩张;接着用eggNOG-Mapper... 水熊虫,学名缓步动物,是一种能耐受多种极端环境的微小水陆两栖动物,但其耐干燥的具体分子机制仍不明.本研究收集3种水熊虫和其他11种后生动物的基因组数据,使用OrthoFinder判定得到4个基因家族在水熊虫中特异扩张;接着用eggNOG-Mapper注释变形拉式熊虫的基因的功能信息,并分析其在正常、低湿隐生、补水80 min、补水3 h四种状态的基因表达谱,筛选出5032个差异基因,用Fuzzy C-Means算法分为9类,对干燥状态下高表达的基因做功能富集分析,得到耐干燥关键分子尿苷二磷酸糖基转移酶UGT72E1(UDP-glycosyltransferase72E1).此外,UGT72E1在典型高生熊虫低湿隐生状态同样存在高表达,推测其通过调节苯丙烷代谢增强水熊虫耐干燥能力. 展开更多
关键词 水熊虫 缓步动物 耐干燥 低湿 尿苷二磷酸糖基转移酶 苯丙烷代谢
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