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题名水熊虫耐干燥机制的关键分子筛选
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作者
郑坤
沈磐
侯雨杉
王斐
王虎强
杨冬
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机构
军事科学院军事医学研究院生命组学研究所
中国人民解放军南部战区总医院骨科
军事科学院军事医学研究院辐射医学研究所
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出处
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2024年第5期936-950,共15页
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基金
国家自然科学基金(批准号:32270711)
北京市科技新星计划(批准号:20220484230)
蛋白质组学国家重点实验室自主研究课题基金(批准号:SKLP-K202004)资助。
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文摘
水熊虫,学名缓步动物,是一种能耐受多种极端环境的微小水陆两栖动物,但其耐干燥的具体分子机制仍不明.本研究收集3种水熊虫和其他11种后生动物的基因组数据,使用OrthoFinder判定得到4个基因家族在水熊虫中特异扩张;接着用eggNOG-Mapper注释变形拉式熊虫的基因的功能信息,并分析其在正常、低湿隐生、补水80 min、补水3 h四种状态的基因表达谱,筛选出5032个差异基因,用Fuzzy C-Means算法分为9类,对干燥状态下高表达的基因做功能富集分析,得到耐干燥关键分子尿苷二磷酸糖基转移酶UGT72E1(UDP-glycosyltransferase72E1).此外,UGT72E1在典型高生熊虫低湿隐生状态同样存在高表达,推测其通过调节苯丙烷代谢增强水熊虫耐干燥能力.
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关键词
水熊虫
缓步动物
耐干燥
低湿隐生
尿苷二磷酸糖基转移酶
苯丙烷代谢
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Keywords
water bear
tardigrade
desiccation tolerance
anhydrobiosis
UDP-glucuronosyltransferase
phenylpropanes metabolism
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分类号
Q953
[生物学—动物学]
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