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基于偏最小二乘法的近红外光谱STR基因分型
1
作者
陈泽琴
汪雪娇
谢洪平
《常熟理工学院学报》
2011年第8期51-55,共5页
基于近红外光谱结合化学模式识别中的偏最小二乘法研究了一种快速、简单和低成本检测STR基因型的方法.选择STR基因座D5S818中的总串数相差较大的10-10、11-11与13-13基因型作为研究对象,将这三个基因型样本进行标准的PCR扩增并采集PCR...
基于近红外光谱结合化学模式识别中的偏最小二乘法研究了一种快速、简单和低成本检测STR基因型的方法.选择STR基因座D5S818中的总串数相差较大的10-10、11-11与13-13基因型作为研究对象,将这三个基因型样本进行标准的PCR扩增并采集PCR产物的近红外光谱,以每一基因型的任意三分之二样本作为校正集,剩余三分之一作为预测集样本,探索了基于近红外光谱进行基因分型的可能性,结果发现该三类模型能够得到正确的判别,没有误判,预测集预测率达到100%.成功实现了基于近红外光谱对STR基因型的快速、简单和低成本检测.
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关键词
短串联重复序列
近红外光谱
伪
偏
最小
二
乘法
基因分型
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职称材料
题名
基于偏最小二乘法的近红外光谱STR基因分型
1
作者
陈泽琴
汪雪娇
谢洪平
机构
苏州大学医学部药学院
西华师范大学化学化工学院
出处
《常熟理工学院学报》
2011年第8期51-55,共5页
文摘
基于近红外光谱结合化学模式识别中的偏最小二乘法研究了一种快速、简单和低成本检测STR基因型的方法.选择STR基因座D5S818中的总串数相差较大的10-10、11-11与13-13基因型作为研究对象,将这三个基因型样本进行标准的PCR扩增并采集PCR产物的近红外光谱,以每一基因型的任意三分之二样本作为校正集,剩余三分之一作为预测集样本,探索了基于近红外光谱进行基因分型的可能性,结果发现该三类模型能够得到正确的判别,没有误判,预测集预测率达到100%.成功实现了基于近红外光谱对STR基因型的快速、简单和低成本检测.
关键词
短串联重复序列
近红外光谱
伪
偏
最小
二
乘法
基因分型
Keywords
short tandem repeat
near infrared spectroscopy
discriminant partial least squares regression
genotyping
分类号
O657.33 [理学—分析化学]
TP183 [理学—化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于偏最小二乘法的近红外光谱STR基因分型
陈泽琴
汪雪娇
谢洪平
《常熟理工学院学报》
2011
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