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中药黄酮类化合物抗衰老作用及其机制研究进展 被引量:90
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作者 李萌茹 周玉枝 +1 位作者 杜冠华 秦雪梅 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期1382-1391,共10页
衰老是生命过程中的一种自然现象,是机体内外多种因素共同作用的结果。现阶段,国内外科研工作者对抗衰老和具有抗衰老活性的天然产物的研究还远远不够,仍需积极探索和开发。近年来,许多科研工作者发现中药中含有的黄酮类活性成分能够延... 衰老是生命过程中的一种自然现象,是机体内外多种因素共同作用的结果。现阶段,国内外科研工作者对抗衰老和具有抗衰老活性的天然产物的研究还远远不够,仍需积极探索和开发。近年来,许多科研工作者发现中药中含有的黄酮类活性成分能够延缓神经系统、免疫器官、生殖系统、肝脏和皮肤等组织的衰老。因此,积极探索和开发中药黄酮类抗衰老药物,对提高老年人的生命质量、减缓社会人口老龄化具有重要意义。目前,对于这类物质抗衰老的作用机制尚未完全清楚,因此本文将以现代衰老学说为基础,从细胞信号转导通路和代谢通路两方面探讨中药黄酮类化合物的抗衰老作用及其涉及的作用机制。 展开更多
关键词 黄酮类化合物 抗氧化 抗衰老 自由基理论 细胞信号转导通路 代谢通路
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高同型半胱氨酸血症诊疗专家共识 被引量:81
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作者 孔娟 《肿瘤代谢与营养电子杂志》 2020年第3期283-288,共6页
高同型半胱氨酸血症与多种疾病的发生发展,如心脑血管疾病、高血压、糖尿病、肾脏疾病、妊娠等疾病密切相关,几乎影响全身的各个器官,通过氧化损伤、DNA甲基化和含硫化合物代谢异常等多种机制影响细胞的功能、蛋白质的合成与调控,进而... 高同型半胱氨酸血症与多种疾病的发生发展,如心脑血管疾病、高血压、糖尿病、肾脏疾病、妊娠等疾病密切相关,几乎影响全身的各个器官,通过氧化损伤、DNA甲基化和含硫化合物代谢异常等多种机制影响细胞的功能、蛋白质的合成与调控,进而导致组织和器官的病理变化。总同型半胱氨酸代谢异常的诱因与基因、营养、疾病等关系密切,因此,本专家共识基于回顾分析近30年的国内外研究文献和循证医学的证据,结合我国人群特点,本专家共识建议将总同型半胱氨酸≥10μmol/L定义为高同型半胱氨酸血症;根据同型半胱氨酸相关基因的检测结果和总同型半胱氨酸的水平,通过调整饮食结构和/或使用膳食补充剂包括甜菜碱和B族维生素以及相关辅助因子的营养素补充剂等方法降低总同型半胱氨酸水平,以期显著减缓相关疾病的发展进程。推荐开展与同型半胱氨酸相关的检测指标,以明确同型半胱氨酸升高的原因,进而指导临床的精准干预措施,有效改善同型半胱氨酸水平,实现预防疾病发生或延缓疾病进展的目的。 展开更多
关键词 高同型半胱氨酸血症 代谢通路 专家共识
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基于网络药理学的香附抗抑郁作用机制研究 被引量:41
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作者 贾红梅 唐策 +3 位作者 刘欢 于猛 张宏武 邹忠梅 《药物评价研究》 CAS 2019年第1期49-55,共7页
目的基于网络药理学方法研究香附多成分-多靶点-多途径的抗抑郁潜在作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库、文献挖掘和本实验室已有研究收集香附化学成分,并依据类药原则进行筛选。使用PhamMapper和DrugBank数据库进... 目的基于网络药理学方法研究香附多成分-多靶点-多途径的抗抑郁潜在作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库、文献挖掘和本实验室已有研究收集香附化学成分,并依据类药原则进行筛选。使用PhamMapper和DrugBank数据库进行靶点预测和筛选,通过MAS 3.0及KEGG通路注释分析香附抗抑郁效应化学成分的作用通路,采用Cytoscape 3.6.1软件构建"化合物-核心靶点-通路"网络,预测其抗抑郁药效成分及相关作用靶点。结果香附中的69个化合物作用于103个靶点,29个核心靶点。构建的"化合物-核心靶点-代谢通路"网络预测发现,香附中48个化学成分直接或间接作用于15个核心靶点,8条抑郁相关代谢通路,主要涉及细胞过程、对应激的应答等生物过程,通过调节黏附斑、神经营养因子、血管内皮生长因子(VEGF)、促性腺激素释放激素(GnRH)、NOD样受体、胰岛素、趋化因子、ErbB信号通路发挥抗抑郁作用。结论网络药理学分析结果初步揭示了香附以多成分、多靶点、多通路的协同作用方式发挥抗抑郁效应机制。 展开更多
关键词 香附 网络药理学 抗抑郁 作用靶点 代谢通路 黏附斑 神经营养因子
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基于血清代谢组学和网络药理学研究酸枣仁提取物治疗失眠的效应物质及作用机制 被引量:36
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作者 卞振华 张文明 +10 位作者 唐静月 费倩倩 胡敏敏 陈晓伟 苏联麟 费程浩 季德 毛春芹 童黄锦 陆兔林 袁晓航 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期188-202,共15页
基于血清代谢组学和网络药理学研究酸枣仁提取物治疗失眠的效应物质及作用机制。建立对氯苯丙氨酸(p-chlorophenylalanine,PCPA)诱导大鼠失眠模型,酸枣仁提取物灌胃给药后,进行一般形态观察、戊巴比妥钠诱导失眠实验和病理组织学等药效... 基于血清代谢组学和网络药理学研究酸枣仁提取物治疗失眠的效应物质及作用机制。建立对氯苯丙氨酸(p-chlorophenylalanine,PCPA)诱导大鼠失眠模型,酸枣仁提取物灌胃给药后,进行一般形态观察、戊巴比妥钠诱导失眠实验和病理组织学等药效学评价。采用UHPLC-MS代谢组学技术,结合多元数据统计筛选酸枣仁提取物治疗失眠的潜在生物标志物,进一步分析相关代谢通路。采用UHPLC-Q-Exactive-MS/MS技术结合网络药理学,构建酸枣仁治疗失眠的"成分-靶点-通路"网络,探讨酸枣仁治疗失眠的效应物质及作用机制。戊巴比妥钠诱导睡眠实验和组织病理学HE(hematoxylin and eosin)染色结果表明酸枣仁提取物具有较好的治疗失眠作用。血清代谢组学共筛选出21个酸枣仁提取物治疗失眠的内源性生物标志物,获取了苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成,苯丙氨酸代谢,烟酸和烟酰胺代谢等代谢通路。UHPLC-Q-Exactive-MS/MS鉴定了酸枣仁提取物中34个化学成分,包括24个黄酮类成分、2个三萜皂苷类成分、4个生物碱成分、2个三萜酸成分以及2个脂肪酸成分。网络药理学分析表明酸枣仁治疗失眠主要作用于DRD2(dopamine D2 receptor)、HTR1A(5-hydroxytryptamine receptor 1A)及ADRA2A(alpha-2A adrenergic receptor)等靶蛋白;与神经活性配体受体相互作用、5-羟色胺能突触、钙信号等通路密切相关;酸枣仁中木兰花碱、N-去甲荷叶碱、山矾碱、油酸、棕榈酸、乌药碱、白桦脂酸以及美洲茶酸为其治疗失眠的潜在效应物质。该研究揭示了酸枣仁提取物治疗失眠通过多个代谢途径,整体上纠正紊乱的代谢轮廓,阐释了酸枣仁治疗失眠的多成分、多靶点、多途径整合机制,为深入研究酸枣仁治疗失眠的作用机制奠定基础,也为开发治疗失眠的创新中药提供支撑。 展开更多
关键词 酸枣仁 失眠 内源性代谢 生物标志物 代谢通路 效应物质 代谢组学 网络药理学
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基于网络药理学的僵蚕主要药效作用研究 被引量:34
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作者 权浩浩 张晓凤 +1 位作者 高凯 杜霞 《西部中医药》 2021年第3期92-96,共5页
目的:通过网络药理学方法探讨僵蚕的主要药效作用机制。方法:利用化学专业数据库及文献收集僵蚕的化学成分,借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及Swiss Target Prediction数据库获得僵蚕化合物潜在作用靶点,结合TTD、DisGeNE... 目的:通过网络药理学方法探讨僵蚕的主要药效作用机制。方法:利用化学专业数据库及文献收集僵蚕的化学成分,借助中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及Swiss Target Prediction数据库获得僵蚕化合物潜在作用靶点,结合TTD、DisGeNET等生物信息库及僵蚕现代药理作用将靶标映射在相关疾病上。运用Cytoscape构建药材-成分-靶点-疾病网络模型,并应用DAVID数据库基于KEGG通路分析僵蚕作用机制。结果:僵蚕39个化学成分共作用451个靶点,主要富集在糖尿病、哮喘、肿瘤、疼痛类疾病方面,其中27个化合物和20个靶点是网络中的关键节点。僵蚕以代谢通路、神经活性配体-受体相互作用、PI3KAkt信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路、癌症通路等为主要作用通路。结论:僵蚕可通过多成分、多靶点、多通路治疗糖尿病、哮喘、肿瘤、疼痛类疾病。 展开更多
关键词 网络药理学 僵蚕 代谢通路 神经活性配体-受体相互作用 PI3K-AKT信号通路 钙信号通路 cAMP信号通路 癌症通路 药效作用
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基于代谢组学技术的白芍养血柔肝作用机制研究 被引量:22
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作者 赵丹萍 张建军 +4 位作者 贺成 王莎 汤如莹 侯燕 王林元 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第16期3412-3418,共7页
目的通过分析血虚肝郁模型大鼠血清内源性代谢物的变化,利用代谢组学技术研究白芍对异常代谢物的调节作用,探讨白芍养血柔肝功效的作用机制。方法采用辐照复合慢性束缚应激方法建立大鼠血虚肝郁模型,以液质联用为核心技术,以主成分分析(... 目的通过分析血虚肝郁模型大鼠血清内源性代谢物的变化,利用代谢组学技术研究白芍对异常代谢物的调节作用,探讨白芍养血柔肝功效的作用机制。方法采用辐照复合慢性束缚应激方法建立大鼠血虚肝郁模型,以液质联用为核心技术,以主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(PLS-DA)方法为数据分析的主要手段,筛选出可能的生物标志物,并分析白芍的干预机制。结果白芍通过影响磷脂酰胆碱、溶血磷脂酰胆碱、神经酰胺、脱氧胞苷、甜菜碱等21种小分子代谢物,对体内代谢轨迹的扰动起到一定的回调作用,能够改善大鼠因外界刺激因素(如辐照、束缚、孤养)诱发的血虚肝郁状态。结论白芍养血柔肝功效的作用机制可能与鞘脂代谢、甘油磷脂代谢、亚油酸代谢、α-亚油酸代谢等相关代谢通路有关。 展开更多
关键词 代谢组学 白芍 养血柔肝 血虚肝郁模型 内源性代谢 辐照复合慢性束缚应激法 液质联用 主成分分析 偏最小二乘判别分析 生物标志物 干预机制 鞘脂代谢 甘油磷脂代谢 亚油酸代谢 α-亚油酸代谢 代谢通路
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冠心病心血瘀阻证患者血浆代谢组学的通路分析 被引量:23
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作者 郑景辉 陈建军 +5 位作者 简维雄 蒋祖玲 刘华盛 付蕾 李云航 王铁华 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期485-487,共3页
目的探讨冠心病心血瘀阻证患者血浆代谢组学的通路。方法信号通路分析采用KEGG,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析采用HMDB,代谢产物路径可视化采用met PA网络软件。结果用Met PA分析的生物代谢通路显示,9个代谢产... 目的探讨冠心病心血瘀阻证患者血浆代谢组学的通路。方法信号通路分析采用KEGG,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析采用HMDB,代谢产物路径可视化采用met PA网络软件。结果用Met PA分析的生物代谢通路显示,9个代谢产物参与了15条代谢路径。其中糖酵解和糖异生(Glycolysis or Gluconeogenesis)、丙酸代谢(Propanoate metabolism)、脂肪酸生物合成(Fatty acid biosynthesis)通路影响值P<0.05。结论心血瘀阻证患者糖酵解和糖异生、丙酸代谢、脂肪酸生物合成通路参与其病理过程。 展开更多
关键词 代谢组学 心血瘀阻证 代谢通路 糖酵解和糖异生 丙酸代谢 脂肪酸生物合成
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基于网络药理学的杜仲-山茱萸配伍治疗糖尿病的作用机制 被引量:24
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作者 韩立柱 胡坤霞 +3 位作者 巨红叶 段玺 唐志书 宋逍 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期1130-1137,1182,共9页
为探讨杜仲-山茱萸治疗糖尿病的作用机制。研究利用网络药理学的方法,首先通过中药系统药理学数据库筛选出杜仲和山茱萸的活性成分和相关靶点,再利用DisGeNET、DrugBank等数据库筛选出糖尿病的潜在靶点。以STRING数据库对活性靶点构建... 为探讨杜仲-山茱萸治疗糖尿病的作用机制。研究利用网络药理学的方法,首先通过中药系统药理学数据库筛选出杜仲和山茱萸的活性成分和相关靶点,再利用DisGeNET、DrugBank等数据库筛选出糖尿病的潜在靶点。以STRING数据库对活性靶点构建蛋白互作网络(PPI)分析,采用Cytoscape3.7.0软件绘制其“成分-靶点-通路”的相互作用网络,通过CludterProfiler对靶蛋白进行生物过程、细胞组分及分子功能分析;京都基因与基因组(KEGG)的代谢通路分析。实验结果筛选得到杜仲-山茱萸有效成分30个,其中槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇等成分对PTGS2、DPP4、ADRB2、PPARG等相关靶点通过IL-17信号通路、钙信号通路、脂肪细胞脂解的调控等参与氮化合物代谢过程、血液循环、脂肪细胞分化和血压调节等过程。综上,杜仲-山茱萸配伍治疗糖尿病存在多成分和多重药理作用机制,为进一步研究其治疗糖尿病药理实验提供了参考,也为其他中药的相关研究提供借鉴和参考。 展开更多
关键词 网络药理学 杜仲 山茱萸 活性成分 代谢通路
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低海拔和高海拔产区气象因子对‘美乐’葡萄浆果品质和代谢组的影响 被引量:22
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作者 毛如志 张国涛 +6 位作者 邵建辉 杜飞 邓维萍 赵新节 朱书生 朱有勇 何霞红 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期506-516,共11页
为明确低海拔(41 m)和高海拔(2 343 m)‘美乐’葡萄产区浆果代谢组和品质的差异和成因,试验采用GPRS-Base系统气象站监测低海拔和高海拔‘美乐’葡萄产区的气象因子,采用气相色谱/飞行时间质谱(GC/TOF-MS)技术解析低海拔和高海拔产区‘... 为明确低海拔(41 m)和高海拔(2 343 m)‘美乐’葡萄产区浆果代谢组和品质的差异和成因,试验采用GPRS-Base系统气象站监测低海拔和高海拔‘美乐’葡萄产区的气象因子,采用气相色谱/飞行时间质谱(GC/TOF-MS)技术解析低海拔和高海拔产区‘美乐’浆果代谢组的差异,并测定了不同海拔‘美乐’葡萄浆果的可溶性固形物含量、p H、总酸含量、还原糖、花青素、总酚、单宁、黄酮、类黄酮和蛋白质的含量。结果表明,高海拔‘美乐’葡萄产区平均日照时数、生育期总辐射、日均辐射、日均温差、日均温度、生长时期有效积温等气象因子均高于低海拔‘美乐’葡萄产区;与低海拔产区相比,高海拔产区的‘美乐’葡萄浆果的可溶性固形物、单宁和还原糖含量增加,总酚和花青素含量减少。代谢通路分析表明:高海拔产区的葡萄浆果积累更多的氨基酸、有机酸、醇、多酚、糖类等物质。代谢通路富集表明:高海拔产区改变了葡萄浆果8条氨基酸代谢、4条碳水化合物、3条脂质代谢和3条氮代谢通路。去趋势化对应分析表明:‘美乐’葡萄园中的气象因子如日均日照时数、生长时期总辐射、日均辐射、温差、日均温度、生长时期有效积温是驱动‘美乐’浆果代谢物积累的主要因子。高海拔和低海拔区域气象因子的差异是‘美乐’葡萄浆果代谢物差异的重要驱动力,高海拔区‘美乐’葡萄浆果通过代谢物和代谢通路的多样性策略来适应高海拔环境,提高浆果的品质。 展开更多
关键词 '美乐’葡萄浆果 海拔梯度 代谢 代谢组学 气象因子 代谢通路 通路富集
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冠心病心血瘀阻证患者尿液代谢组学的通路分析 被引量:22
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作者 陈夏 郑景辉 +8 位作者 梁健 简维雄 秦伟夫 刘华盛 王伟 吴发胜 付蕾 赵晓芳 吴诚 《中国中医基础医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期69-71,共3页
目的:探讨冠心病心血瘀阻证患者尿液代谢组学的通路。方法:通路的生物学分析使用KEGG数据库进行检索和构建,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析使用HMDB代谢组学数据库进行检索,代谢产物路径可视化采用Met PA网络软... 目的:探讨冠心病心血瘀阻证患者尿液代谢组学的通路。方法:通路的生物学分析使用KEGG数据库进行检索和构建,代谢产物分子注释、相关的酶或转运蛋白及其相关性质分析使用HMDB代谢组学数据库进行检索,代谢产物路径可视化采用Met PA网络软件构建。结果:冠心病心血瘀阻证患者代谢通路显示,6个差异性代谢产物共参与了10条代谢路径,其中"半乳糖代谢"、"酮体的合成和降解通路"影响值分别为0.00276和0.0000。结论:冠心病心血瘀阻证患者中"半乳糖代谢"、"酮体的合成和降解通路"发生变化参与其病理过程。 展开更多
关键词 代谢组学 心血瘀阻证 代谢通路 半乳糖代谢 酮体的合成和降解
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利用转录组测序挖掘掌叶大黄蒽醌类生物合成相关基因 被引量:22
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作者 李欢 张娜 +6 位作者 李依民 黑小斌 李元敏 邓翀 颜永刚 刘蒙蒙 张岗 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1908-1917,共10页
蒽醌为中药大黄的主要活性成分,也是大黄质量控制的指标成分。为研究大黄蒽醌类生物合成通路,用Illumina HiSeq^(TM) 2000 150PE对掌叶大黄幼苗转录组文库进行高通量测序,得到11.04G数据,736 309 74条高质量reads (SRA数据库注册号SRP16... 蒽醌为中药大黄的主要活性成分,也是大黄质量控制的指标成分。为研究大黄蒽醌类生物合成通路,用Illumina HiSeq^(TM) 2000 150PE对掌叶大黄幼苗转录组文库进行高通量测序,得到11.04G数据,736 309 74条高质量reads (SRA数据库注册号SRP160030)。Trinity do novo组装产生93 646个unigenes,平均长度1 108 nt。功能注释表明所有unigenes在NR、NT、Swiss-port、PFAM、KOG等数据库得到注释,可归为GO分类的生物过程、细胞组分和分子功能3大类57分支, KEGG分析发现1 107条unigenes参与19个次生代谢标准通路。172条unigenes编码蒽醌类生物合成相关的MVA、MEP、莽草酸及聚酮途径28个关键酶。125条CYP450基因可能参与次生代谢物的修饰,73条与糖基转移酶相关。RT-PCR和测序成功验证7个蒽醌及黄酮类候选全长unigenes。MISA还发现18885个SSRs。该研究首次获得掌叶大黄幼苗转录组基因表达特征及蒽醌类生物合成通路基因,为后续基因功能鉴定、次生代谢途径解析及蒽醌类生物合成与调控分子机制研究提供基础资料。 展开更多
关键词 掌叶大黄 转录组 蒽醌 基因 代谢通路
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基于宏基因组技术分析传统红茶菌中菌群组成及其主要代谢通路 被引量:21
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作者 徐伟 葛阳阳 +1 位作者 陈翠婷 马婷婷 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期119-123,129,共6页
由于传统红茶菌发酵过程中,微生物的种类及数量随时间延长而不断变化,导致红茶菌发酵液代谢产物难以控制。采用高通量测序技术对发酵7 d的传统红茶菌进行宏基因组测序,获得65771178个clean reads数据,经拼接组装,获得93449个Unigene片... 由于传统红茶菌发酵过程中,微生物的种类及数量随时间延长而不断变化,导致红茶菌发酵液代谢产物难以控制。采用高通量测序技术对发酵7 d的传统红茶菌进行宏基因组测序,获得65771178个clean reads数据,经拼接组装,获得93449个Unigene片段。以BLAST(E-value<1.0e-5)将Unigene对NR、KEGG数据库进行比对,与NR库比对共65515个Unigene得到注释信息,再将得到的注释信息根据GI(Gen Info Identifier)与物种分类的关系得到物种分类信息,分为细菌、真菌2个界,细菌界占96.57%,真菌界占3.40%,细菌的主要优势菌种是Gluconacetobacter sp.SXCC-1(29.17%)、Komagataeibacter medellinensis(7.84%)、Komagataeibacter xylinus(7.58%),真菌的优势菌种是Brettanomyces bruxellensis(1.86%);与KEGG数据库比对,共47234个Unigene注释到KEGG的代谢通路中,分属338类代谢通路,其中有2475个Unigene参与氨基酸代谢过程,307个属于次生代谢途径。序列已提交至Gen Bank数据库,登录号SRP103682。利用宏基因组技术将传统红茶菌中的微生物鉴定到"种"的水平,同时了解红茶菌微生物群落的代谢机理,可以更有效地控制红茶菌的发酵进程。 展开更多
关键词 红茶菌 菌群组成 代谢通路 宏基因组
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一株木质纤维素降解菌的筛选及其全基因组分析 被引量:20
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作者 鲍文英 江经纬 +2 位作者 周云 吴玉峰 梁志清 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期765-777,共13页
【目的】筛选和鉴定有木质纤维素降解能力的1株细菌,测定其相关酶活力并进行全基因组分析,为构建木质纤维素降解工程菌提供依据。【方法】采用3种木质素类似物(天青-B;酚红;愈创木酚)的脱色/染色法,从腐木和被枝叶覆盖的土壤中分离和筛... 【目的】筛选和鉴定有木质纤维素降解能力的1株细菌,测定其相关酶活力并进行全基因组分析,为构建木质纤维素降解工程菌提供依据。【方法】采用3种木质素类似物(天青-B;酚红;愈创木酚)的脱色/染色法,从腐木和被枝叶覆盖的土壤中分离和筛选出1株具有较强木质纤维素降解能力的细菌。通过16S r RNA基因和全基因组序列分析对该菌进行种属鉴定。使用紫外分光光度法测定其锰过氧化物酶(Mn P)、漆酶(Lac)、羧甲基纤维素酶(CMCase)以及滤纸酶(FPA)活力,了解该菌相关酶活力大小在一定时间内的变化趋势。使用Illumina Miseq和454 GS Junior测序平台获取该菌的全基因组序列,将其全基因组序列经过注释的基因蛋白质序列提交COG和KEGG数据库进行BLASTp比对分析,确定该菌潜在的重要酶类和代谢途径,并对部分注释基因进行定量RT-PCR验证。【结果】筛选得到1株优势菌株S12,该菌经鉴定后命名为解鸟氨酸拉乌尔菌(Raoultella ornithinolytica)。在液体CMC-Na培养基中发酵28 h,菌体生长达到稳定期,纤维素降解相关酶活力也在此时达到峰值。生物信息学分析结果表明,菌株S12具有木质素降解通路中重要酶类的编码基因,如过氧化物酶、Fe-Mn型超氧化物歧化酶、邻苯二酚1,2-双加氧酶和原儿茶酸-3,4-双加氧酶等,这些基因在以碱性木质素为碳源的培养条件下表达量不同程度地高于以葡萄糖为碳源的培养条件。另外,菌株S12具备完整的纤维素降解和乙醇生成通路。【结论】本研究首次揭示了Raoultella ornithinolytica S12具备有效的木质纤维素降解性能,这对于推动木质纤维素应用产业的发展具有重要意义。 展开更多
关键词 木质纤维素降解菌 筛选 拉乌尔属 全基因组 代谢通路
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利用网络药理学方法研究交泰丸治疗糖尿病的作用机制 被引量:20
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作者 杨释岑 刘志强 +1 位作者 刘和波 王博龙 《中国药房》 CAS 北大核心 2018年第19期2656-2661,共6页
目的:利用网络药理学研究交泰丸治疗糖尿病的作用机制。方法:以化合物的口服药物生物利用度(OB)和类药性(DL)为标准,依据中药系统药理学技术平台(TCMSP)等数据库、反向分子对接服务器(DRAR-CPI)、人类基因组注释数据库(Genecards)预测... 目的:利用网络药理学研究交泰丸治疗糖尿病的作用机制。方法:以化合物的口服药物生物利用度(OB)和类药性(DL)为标准,依据中药系统药理学技术平台(TCMSP)等数据库、反向分子对接服务器(DRAR-CPI)、人类基因组注释数据库(Genecards)预测和筛选交泰丸的活性成分及治疗糖尿病的作用靶点。借助Cytoscape 3.5.1软件构建交泰丸活性成分-作用靶点网络,借助STRING平台构建靶蛋白相互作用网络,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因本体(GO)生物过程及京都基因与基因组百科全书(KEGG)中代谢通路进行分析。结果:从交泰丸中筛选得到16个活性成分,其作用于61个糖尿病靶点,关键靶点包括白细胞介素(IL)-4、IL-10、胰岛素受体等,调节包括磷酸肌醇-3-激酶/丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶信号通路、谷胱甘肽代谢通路、Janus激酶/信号转导子和转录激活因子信号通路、细胞色素P450酶药物代谢、丙酮酸代谢通路和肾素-血管紧张素系统等在内的25条代谢通路,参与蛋白质磷酸化、氧化还原、信号转导、谷胱甘肽代谢、炎症反应、免疫反应等多种生物过程。结论:交泰丸及其活性成分能通过多个靶点、多条通路发挥治疗糖尿病的作用;本研究结果为进一步研究交泰丸药理药效机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 交泰丸 糖尿病 网络药理学 活性成分 作用靶点 代谢通路 生物过程
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基于代谢组学的百合知母汤治疗抑郁症的作用研究 被引量:19
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作者 刘职瑞 杨波 +2 位作者 刘芳 郭延磊 夏培元 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第20期1917-1925,共9页
目的观察抑郁大鼠模型血清中内源性代谢物的变化,分析百合知母汤对异常代谢物的调节作用。方法 40只雄性SD大鼠(SPF级)按随机数字表法分为4组,每组10只,分别是正常对照组、模型组、氟西汀+模型组和百合知母汤+模型组。采用慢性不可预见... 目的观察抑郁大鼠模型血清中内源性代谢物的变化,分析百合知母汤对异常代谢物的调节作用。方法 40只雄性SD大鼠(SPF级)按随机数字表法分为4组,每组10只,分别是正常对照组、模型组、氟西汀+模型组和百合知母汤+模型组。采用慢性不可预见性轻度应激联合孤养的方法建立抑郁大鼠模型,利用代谢组学方法寻找抑郁模型大鼠血清中改变的内源性代谢物及其相关代谢通路,从内源性代谢物的角度评价百合知母汤的抗抑郁作用。结果百合知母汤可显著增加抑郁模型大鼠的体质量、糖水偏好度以及行为学得分(P<0.05),并使模型大鼠血清中水平异常的23个差异代谢物回调至正常水平,主要涉及脂肪酸酰胺代谢、苯丙氨酸代谢、甘氨酸代谢和脂质代谢;而氟西汀仅能纠正甘氨酸代谢和脂质代谢2条代谢通路中17个代谢物的水平异常。结论与氟西汀相比,百合知母汤可影响更多的代谢通路而发挥抗抑郁作用。 展开更多
关键词 百合知母汤 抑郁症 代谢组学 代谢通路
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原发性肾病综合征患者血清异常代谢通路的代谢组学分析 被引量:18
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作者 李鞠 唐凤英 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第30期1-4,I0001,共5页
目的通过液相色谱质谱联用的代谢组学方法,分析与原发性肾病综合征(PNS)相关的异常代谢通路,探讨PNS的发病机制。方法应用超高效液相色谱-高分辨质谱法方法对40例PNS患者(观察组)和40例健康体检者(对照组)血清样本中的代谢物进行检测,... 目的通过液相色谱质谱联用的代谢组学方法,分析与原发性肾病综合征(PNS)相关的异常代谢通路,探讨PNS的发病机制。方法应用超高效液相色谱-高分辨质谱法方法对40例PNS患者(观察组)和40例健康体检者(对照组)血清样本中的代谢物进行检测,采用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)法进行模式识别,构建PNS诊断模型,采用Met PA数据库进行代谢通路分析。结果 OPLS-DA模型的质量参数R2X=71.4%,Q2Y=0.517,观察组、对照组间的区分非常明显。代谢通路分析共筛选出有差异的代谢物相关通路9个,其中硫胺素代谢、嘧啶代谢、苯基丙氨酸代谢、柠檬酸循环4个代谢通路影响值均大于0.1。结论 PNS患者存在硫胺素代谢、嘧啶代谢、苯基丙氨酸代谢、柠檬酸循环代谢紊乱,可能与PNS的发生发展密切相关。 展开更多
关键词 代谢组学 液相色谱质谱联用 原发性肾病综合征 代谢通路 通路分析
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当归不同炮制品挥发油给药大鼠的尿液代谢组学研究 被引量:17
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作者 薛子钰 华永丽 +4 位作者 李锦霞 姚万玲 纪鹏 王涛 魏彦明 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期928-939,共12页
分析当归(Angelica sinensis,AS)不同炮制品挥发油对正常大鼠尿液代谢产物的影响,揭示其影响大鼠体内可能的代谢途径。该实验将50只雄性Wister大鼠随机分成空白对照组和当归炭挥发油(volatile oils from charred AS,C-ASVO)、酒当归挥发... 分析当归(Angelica sinensis,AS)不同炮制品挥发油对正常大鼠尿液代谢产物的影响,揭示其影响大鼠体内可能的代谢途径。该实验将50只雄性Wister大鼠随机分成空白对照组和当归炭挥发油(volatile oils from charred AS,C-ASVO)、酒当归挥发油(volatile oils from parched AS with alcohol,J-ASVO)、土当归挥发油(volatile oils from parched AS with soil,T-ASVO)、油当归挥发油(volatile oils from parched AS with oil,Y-ASVO)组,每组10只,正常对照组灌胃等体积的0.5%的聚氧乙烯脱水山梨醇单油酸酯(吐温-80),各当归炮制品挥发油组每次灌胃挥发油剂量为0.176 m L·kg-1,连续给药3 d,利用大鼠代谢笼收集各组大鼠48 h的尿液。采用气相色谱质谱联用技术(gas chromatography-mass spectrometer,GC-MS)对大鼠尿液代谢物进行检测,并采用主成分分析方法(principal component analysis,PCA),正交偏最小二乘分析方法(orthogonal partial least-squares discriminant analysis,OPLS-DA)进行多元统计分析,通过变量重要性投影(variable importance in the projection,VIP)和t检验来选择差异代谢物。利用metabolic pathway analysis(Met PA)数据库构建差异代谢物的代谢通路。结果显示,与空白对照组相比,当归不同炮制品挥发油给药组大鼠尿液中31种代谢物有显著变化(P<0.05),并且当归不同炮制品挥发油对正常大鼠尿液代谢产物的影响存在差异,其中以J-ASVO的影响程度略强于C-ASVO,T-ASVO和Y-ASVO。它们对体内代谢的影响可能主要集中于能量代谢、氨基酸代谢、脂质代谢以及糖代谢。该研究补充了当归不同炮制品挥发油药物代谢和作用机制,为其中药药理作用深层次的研究提供思路。 展开更多
关键词 代谢组学 当归挥发油 不同炮制品 GC-MS 代谢通路
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药物代谢组学研究进展 被引量:17
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作者 黄寅 许风国 +2 位作者 张伟 王俊南 张尊建 《中国药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期105-112,共8页
药物代谢组学是在系统生物学背景下,代谢组学与药学紧密交叉、有机结合促生的一门新兴学科。它依托现代分析技术、化学计量学和生物信息学技术,通过分析比较给药前后生物体液中小分子代谢物轮廓的改变来进行药物疗效和毒性的评价、预测... 药物代谢组学是在系统生物学背景下,代谢组学与药学紧密交叉、有机结合促生的一门新兴学科。它依托现代分析技术、化学计量学和生物信息学技术,通过分析比较给药前后生物体液中小分子代谢物轮廓的改变来进行药物疗效和毒性的评价、预测。本文对药物代谢组学的研究流程和应用等方面的最新进展进行了系统概括,并对相关技术要点和存在的问题进行了讨论。 展开更多
关键词 药物代谢组学 系统生物学 代谢通路 生物标记物
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基于UPLC-ESI-QE-Orbitrap-MS技术的首荟通便胶囊干预慢传输型便秘的代谢组学研究 被引量:17
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作者 孙成宏 李翔子 +4 位作者 肖贺 张丽 赵云 姚景春 张贵民 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期532-538,共7页
用代谢组学方法分析首荟通便胶囊(SHTB)对慢传输型便秘小鼠结肠组织内源性代谢产物的影响,探讨SHTB治疗便秘的机制。ICR小鼠按体质量随机分为正常组、模型组、SHTB组。灌胃复方地芬诺酯建立慢传输型便秘模型,观察碳墨汁推进率、首次排... 用代谢组学方法分析首荟通便胶囊(SHTB)对慢传输型便秘小鼠结肠组织内源性代谢产物的影响,探讨SHTB治疗便秘的机制。ICR小鼠按体质量随机分为正常组、模型组、SHTB组。灌胃复方地芬诺酯建立慢传输型便秘模型,观察碳墨汁推进率、首次排便时间和12 h排便粒数。取结肠,阿利新蓝和过碘酸雪夫(AB-PAS)染色观察黏液细胞。超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱联用仪(UHPLC-ESI-QE-Orbitrap-MS)检测结肠组织差异代谢物,分析可能的代谢通路。结果表明,SHTB明显缩短便秘小鼠首次排便时间和排便数量,增加肠蠕动和结肠黏膜层黏液细胞数量。代谢组学研究显示,与正常组相比,模型组结肠共发现左旋尿嘧啶、N6,N6,N6-三甲基-L-赖氨酸、L-甲酰基鸟氨酸、N6-乙酰基-L-赖氨酸、L-苯丙氨酸、苯乙醛、黄嘌呤、胸苷、甘氨酰-L-亮氨酸、L-半胱氨酸、(R)-1-氨基丙烷-2-醇、脱氧胞苷、γ-谷氨酰-γ-氨基丁醛、D-半乳糖、L-精氨酸、L-脯氨酸、丙酮酸等17个代谢差异物。SHTB组这些代谢差异物有向正常水平回调的趋势。因此推测SHTB治疗慢性传输性便秘可能与调节苯丙氨酸代谢,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成,精氨酸和脯氨酸代谢,半胱氨酸和蛋氨酸代谢,酪氨酸代谢,丙酮酸代谢,糖酵解,嘧啶代谢,精氨酸生物合成,三羧酸循环和半乳糖代谢等代谢通路有关。 展开更多
关键词 首荟通便胶囊 便秘 结肠组织 代谢差异物 代谢通路
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基于代谢组学分析不同颜色花生红衣的组成差异 被引量:16
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作者 贾聪 芦鑫 +4 位作者 高锦鸿 孙强 朱笑鹏 王强 黄纪念 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第19期46-51,共6页
以不同颜色花生红衣为研究对象,采用液相色谱-质谱非靶向代谢组学方法,研究花生红衣品种间的差异代谢物及代谢通路。主成分分析结果表明,不同品种的花生红衣存在较大的代谢差异。依据正交偏最小二乘法模型的变量重要性投影值可分离出16... 以不同颜色花生红衣为研究对象,采用液相色谱-质谱非靶向代谢组学方法,研究花生红衣品种间的差异代谢物及代谢通路。主成分分析结果表明,不同品种的花生红衣存在较大的代谢差异。依据正交偏最小二乘法模型的变量重要性投影值可分离出16种差异代谢物,颜色较深的花生红衣山柰酚和表儿茶素-(4α→8)-没食子儿茶素-(4α→8)-儿茶素含量明显较多,且随着红衣颜色的加深,原花青素、杨梅素和槲皮素含量显著升高(P<0.05)。富集差异代谢物的代谢通路共4条,其中最显著的为黄酮和黄酮醇生物合成途径,山柰酚、槲皮素、杨梅素和芦丁等差异代谢物参与此通路,且颜色较深的花生红衣中山柰酚代谢旺盛,颜色较浅的花生红衣中杨梅素和槲皮素代谢旺盛,合成量较多。 展开更多
关键词 花生红衣 颜色 代谢组学 差异代谢 代谢通路
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