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一种由代谢方程构建网络的方法及其实现
1
作者
何胜
吴访升
+3 位作者
潘瑜
徐明亮
杨莉
李炜疆
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期1199-1202,共4页
代谢网络的拓扑结构分析和可视化是系统生物学研究的热点。如何自动合理地由数量众多的代谢方程构建代谢网络是研究者首先面临的问题。基于二部图模型,采用"节点唯一化"和"忽略高度节点"策略,提出一种由代谢方程直...
代谢网络的拓扑结构分析和可视化是系统生物学研究的热点。如何自动合理地由数量众多的代谢方程构建代谢网络是研究者首先面临的问题。基于二部图模型,采用"节点唯一化"和"忽略高度节点"策略,提出一种由代谢方程直接构建代谢网络的方法,并给出MATLAB实现步骤,最后使用生物网络模拟软件可视化生成的代谢网络,结果表明这种方法能用来构建复杂代谢网络,并具有较好展现网络模块和拓扑结构的特点,适用于由大量代谢反应方程自动构建复杂代谢网络的一般应用需求。该方法的MATLAB源码和说明文档可以通过http://bioinf.jiangnan.edu.cn/在线获得。
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关键词
代谢
方程
代谢
网络
可视化
原文传递
人工代谢系统综述
被引量:
2
2
作者
胡扬
桂卫华
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2009年第5期1601-1603,1624,共4页
从生物体新陈代谢规律出发,通过分析催化酶与各类代谢调节模式的关系建立起人工代谢系统模型。该系统能实现模式识别、故障诊断、多目标优化等功能。利用新陈代谢机理建立人工代谢方程。通过对平衡因子、抑制因子等代谢算子的调节来改...
从生物体新陈代谢规律出发,通过分析催化酶与各类代谢调节模式的关系建立起人工代谢系统模型。该系统能实现模式识别、故障诊断、多目标优化等功能。利用新陈代谢机理建立人工代谢方程。通过对平衡因子、抑制因子等代谢算子的调节来改变代谢物浓度,提高代谢率,从而实现新陈代谢网络的物质流量均衡和网络节点通畅,达到有效地实现各类功能优化的目的。对人工代谢系统的基础理论和典型应用进行了阐述,指出了进一步研究的方向。
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关键词
人工智能
人工
代谢
系统
人工酶
人工
代谢
方程
代谢
算子
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职称材料
^(32)P轫致辐射SPECT断层显像技术的临床应用
被引量:
1
3
作者
贾晓民
李向阳
+3 位作者
曹爱红
徐龙宝
张旭光
李毅
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第10期1168-1171,F0004,共5页
目的:探索检测治疗靶区内32P的浓度和代谢的方法。方法:美国GE公司的Millennium VG可变角度双探头SPECT仪,对系列浓度32P-磷酸铬胶体断层显像,测量平均光子数/像数/层厚,建立32P的浓度和平均光子数/像数/层厚的关系方程。C57小鼠Hep-6...
目的:探索检测治疗靶区内32P的浓度和代谢的方法。方法:美国GE公司的Millennium VG可变角度双探头SPECT仪,对系列浓度32P-磷酸铬胶体断层显像,测量平均光子数/像数/层厚,建立32P的浓度和平均光子数/像数/层厚的关系方程。C57小鼠Hep-6肝癌皮下移植瘤模型11只,接受32P玻璃微球瘤内局部注射;肝癌患者12例,肝内病灶和转移灶接受32P玻璃微球瘤内局部注射;SPECT连续检测,测量靶区内平均核素浓度,建立核素浓度代谢方程。结果:直线回归方程为Y=-0.457+0.311X。Y为32P放射性浓度,X为平均放射性计数。大部分动物和临床靶区的核素代谢符合指数单室代谢模式,由此可以推导出有效半减期、生物半排期、初始剂量率和累计剂量。结论:利用SPECT轫致辐射断层显像技术测量32P的浓度和代谢方程是可行的。
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关键词
^32P
SPECT
轫致辐射
核素
代谢
方程
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职称材料
用能量代谢方程求解泥龄研究
4
作者
王涛
全晓泉
+2 位作者
楼少华
杨斌
王海涛
《重庆建筑大学学报》
EI
CSCD
北大核心
2007年第5期126-129,共4页
从本质上说,污水生物处理的过程就是微生物能量代谢的过程,从能量的角度出发,在质量守恒与能量守恒的基础上建立了能量代谢方程,同时通过模型试验求解出其中的参数。该方程从微观的角度解释了活性污泥系统中泥龄选择的理由,可运用该方...
从本质上说,污水生物处理的过程就是微生物能量代谢的过程,从能量的角度出发,在质量守恒与能量守恒的基础上建立了能量代谢方程,同时通过模型试验求解出其中的参数。该方程从微观的角度解释了活性污泥系统中泥龄选择的理由,可运用该方程优化低负荷下活性污泥工艺的系统泥龄,从而优化活性污泥系统的能量配置,达到节能降耗的目的。
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关键词
活性污泥法
泥龄
能量
代谢
方程
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职称材料
谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶对肉鸭能量利用的影响
被引量:
6
5
作者
张旭
黄生敏
+4 位作者
蒋桂韬
林谦
胡艳
李昊帮
戴求仲
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期482-488,共7页
本试验旨在研究14种谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶对肉鸭代谢能和能量代谢率的影响。试验选用56只体重2.0 kg左右的健康成年肉用公麻鸭,随机分为7组,每组8个重复,每个重复1只鸭。采用绝食强饲法进行5期代谢试验,测定14种谷物...
本试验旨在研究14种谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶对肉鸭代谢能和能量代谢率的影响。试验选用56只体重2.0 kg左右的健康成年肉用公麻鸭,随机分为7组,每组8个重复,每个重复1只鸭。采用绝食强饲法进行5期代谢试验,测定14种谷物及其副产品[玉米、玉米糖渣、玉米干酒糟及其可溶物( DDGS)、稻谷、碎米、米糠、米糠粕、小麦、次面粉、次粉、麦麸、大麦、燕麦麸、白酒糟]加酶前后的表观代谢能( AME )、真代谢能( TME )、能量表观代谢率和真代谢率,并根据常规养分含量构建谷物及其副产品代谢能的预测方程。结果表明:14种谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶后均能够提高鸭的AME和TME,麦麸和燕麦麸的TME分别提高了7.78%和12.62%( P >0.05),白酒糟、次粉、玉米 DDGS 和玉米的 TME 分别提高了8.07%、5.67%、3.66%和3.30%(P>0.05),加酶后谷物及其副产品代谢能的有效营养改进值( ENIV)为0.10~0.76 MJ/kg。谷物及其副产品的AME和TME的预测方程分别为:AME=12.406+0.214CP-0.154NDF (R2=0.737);TME =13.477+0.213CP -0.152NDF (R2=0.737)。由此可见,在谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶能够提高肉鸭的AME、TME和能量表观代谢率。
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关键词
谷物及其副产品
非淀粉多糖酶
肉鸭
代谢
能
代谢
能预测
方程
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职称材料
2型糖尿病患者静息代谢率与糖尿病视网膜病变的关系
被引量:
1
6
作者
张伊桐
佟雪巍
+2 位作者
徐宇欣
浦胜丹
高昕媛
《国际内分泌代谢杂志》
2023年第6期464-468,共5页
目的探讨2型糖尿病(T2DM)患者静息代谢率(RMR)与糖尿病视网膜病变(DR)的相关性。方法选取586例T2DM患者,分为无DR(NDR)组、轻度至中度非增殖性DR(NPDR)组和视力威胁性DR(VTDR)组。根据Mifflin-St Jeor公式计算静息代谢率(RMR)。观察不同...
目的探讨2型糖尿病(T2DM)患者静息代谢率(RMR)与糖尿病视网膜病变(DR)的相关性。方法选取586例T2DM患者,分为无DR(NDR)组、轻度至中度非增殖性DR(NPDR)组和视力威胁性DR(VTDR)组。根据Mifflin-St Jeor公式计算静息代谢率(RMR)。观察不同Mifflin-RMR水平患者的临床特点。采用二元和有序logistic回归分析Mifflin-RMR与DR之间的关系。结果VTDR组Mifflin-RMR显著高于轻度至中度NPDR组和NDR组,而轻度至中度NPDR组Mifflin-RMR也显著高于NDR组(P均<0.001)。在控制混杂变量后,与Mifflin-RMR第一分位数患者相比,第四分位数患者发生DR的风险明显增加(OR=17.763,95%CI:8.017~39.356,P<0.001)。此外,Mifflin-RMR升高与DR严重程度相关(OR=13.447,95%CI:6.936~25.971,P<0.001)。结论在T2DM患者中,RMR与DR患病及严重程度相关。
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关键词
2型糖尿病
糖尿病视网膜病变
静息
代谢
率预测
方程
原文传递
题名
一种由代谢方程构建网络的方法及其实现
1
作者
何胜
吴访升
潘瑜
徐明亮
杨莉
李炜疆
机构
江苏技术师范学院计算机科学与工程学院
无锡城市职业技术学院电子信息系
江南大学生物工程学院
出处
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期1199-1202,共4页
基金
江南大学工业生物技术教育部重点实验室开放课题(KLIB-KF200903)
江苏技术师范学院科研启动基金项目(KYY10059)
文摘
代谢网络的拓扑结构分析和可视化是系统生物学研究的热点。如何自动合理地由数量众多的代谢方程构建代谢网络是研究者首先面临的问题。基于二部图模型,采用"节点唯一化"和"忽略高度节点"策略,提出一种由代谢方程直接构建代谢网络的方法,并给出MATLAB实现步骤,最后使用生物网络模拟软件可视化生成的代谢网络,结果表明这种方法能用来构建复杂代谢网络,并具有较好展现网络模块和拓扑结构的特点,适用于由大量代谢反应方程自动构建复杂代谢网络的一般应用需求。该方法的MATLAB源码和说明文档可以通过http://bioinf.jiangnan.edu.cn/在线获得。
关键词
代谢
方程
代谢
网络
可视化
Keywords
metabolic equations, metabolic networks, visualization
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
人工代谢系统综述
被引量:
2
2
作者
胡扬
桂卫华
机构
中南大学信息科学与工程学院
出处
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2009年第5期1601-1603,1624,共4页
基金
国家杰出青年科学基金资助项目(60425310)
国家"973"计划资助项目(2002CB312200)
文摘
从生物体新陈代谢规律出发,通过分析催化酶与各类代谢调节模式的关系建立起人工代谢系统模型。该系统能实现模式识别、故障诊断、多目标优化等功能。利用新陈代谢机理建立人工代谢方程。通过对平衡因子、抑制因子等代谢算子的调节来改变代谢物浓度,提高代谢率,从而实现新陈代谢网络的物质流量均衡和网络节点通畅,达到有效地实现各类功能优化的目的。对人工代谢系统的基础理论和典型应用进行了阐述,指出了进一步研究的方向。
关键词
人工智能
人工
代谢
系统
人工酶
人工
代谢
方程
代谢
算子
Keywords
artificial intelligence
artificial metabolic system
artificial enzyme
artificial metabolic equation
metabolic operator
分类号
TP182 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
下载PDF
职称材料
题名
^(32)P轫致辐射SPECT断层显像技术的临床应用
被引量:
1
3
作者
贾晓民
李向阳
曹爱红
徐龙宝
张旭光
李毅
机构
徐州医学院第二附属医院肿瘤外科
常州市第二人民医院
出处
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第10期1168-1171,F0004,共5页
基金
江苏省卫生厅医学科学发展基金资助(HS2003063)
常州市科技局2005年科学发展基金资助(CS2005209)
文摘
目的:探索检测治疗靶区内32P的浓度和代谢的方法。方法:美国GE公司的Millennium VG可变角度双探头SPECT仪,对系列浓度32P-磷酸铬胶体断层显像,测量平均光子数/像数/层厚,建立32P的浓度和平均光子数/像数/层厚的关系方程。C57小鼠Hep-6肝癌皮下移植瘤模型11只,接受32P玻璃微球瘤内局部注射;肝癌患者12例,肝内病灶和转移灶接受32P玻璃微球瘤内局部注射;SPECT连续检测,测量靶区内平均核素浓度,建立核素浓度代谢方程。结果:直线回归方程为Y=-0.457+0.311X。Y为32P放射性浓度,X为平均放射性计数。大部分动物和临床靶区的核素代谢符合指数单室代谢模式,由此可以推导出有效半减期、生物半排期、初始剂量率和累计剂量。结论:利用SPECT轫致辐射断层显像技术测量32P的浓度和代谢方程是可行的。
关键词
^32P
SPECT
轫致辐射
核素
代谢
方程
分类号
R445.5 [医药卫生—影像医学与核医学]
下载PDF
职称材料
题名
用能量代谢方程求解泥龄研究
4
作者
王涛
全晓泉
楼少华
杨斌
王海涛
机构
重庆大学城市建设与环境工程学院
出处
《重庆建筑大学学报》
EI
CSCD
北大核心
2007年第5期126-129,共4页
基金
教育部博士基金资助(20020611025)
文摘
从本质上说,污水生物处理的过程就是微生物能量代谢的过程,从能量的角度出发,在质量守恒与能量守恒的基础上建立了能量代谢方程,同时通过模型试验求解出其中的参数。该方程从微观的角度解释了活性污泥系统中泥龄选择的理由,可运用该方程优化低负荷下活性污泥工艺的系统泥龄,从而优化活性污泥系统的能量配置,达到节能降耗的目的。
关键词
活性污泥法
泥龄
能量
代谢
方程
Keywords
activated sludge process , SRT , energy metabolism equation
分类号
X051 [环境科学与工程]
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职称材料
题名
谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶对肉鸭能量利用的影响
被引量:
6
5
作者
张旭
黄生敏
蒋桂韬
林谦
胡艳
李昊帮
戴求仲
机构
湖南省畜牧兽医研究所动物营养与饲养技术研究室
岳阳市第四中学
湖南农业大学动物科学技术学院
出处
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第2期482-488,共7页
基金
国家水禽产业技术体系建设专项资金资助(CARS-43)
文摘
本试验旨在研究14种谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶对肉鸭代谢能和能量代谢率的影响。试验选用56只体重2.0 kg左右的健康成年肉用公麻鸭,随机分为7组,每组8个重复,每个重复1只鸭。采用绝食强饲法进行5期代谢试验,测定14种谷物及其副产品[玉米、玉米糖渣、玉米干酒糟及其可溶物( DDGS)、稻谷、碎米、米糠、米糠粕、小麦、次面粉、次粉、麦麸、大麦、燕麦麸、白酒糟]加酶前后的表观代谢能( AME )、真代谢能( TME )、能量表观代谢率和真代谢率,并根据常规养分含量构建谷物及其副产品代谢能的预测方程。结果表明:14种谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶后均能够提高鸭的AME和TME,麦麸和燕麦麸的TME分别提高了7.78%和12.62%( P >0.05),白酒糟、次粉、玉米 DDGS 和玉米的 TME 分别提高了8.07%、5.67%、3.66%和3.30%(P>0.05),加酶后谷物及其副产品代谢能的有效营养改进值( ENIV)为0.10~0.76 MJ/kg。谷物及其副产品的AME和TME的预测方程分别为:AME=12.406+0.214CP-0.154NDF (R2=0.737);TME =13.477+0.213CP -0.152NDF (R2=0.737)。由此可见,在谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶能够提高肉鸭的AME、TME和能量表观代谢率。
关键词
谷物及其副产品
非淀粉多糖酶
肉鸭
代谢
能
代谢
能预测
方程
Keywords
ENIV
cereal and its by-products
non-starch polysaccharides enzyme
meat duck
metabolizable ener-gy
ENIV
metabolizable energy prediction equation
分类号
S816 [农业科学—饲料科学]
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职称材料
题名
2型糖尿病患者静息代谢率与糖尿病视网膜病变的关系
被引量:
1
6
作者
张伊桐
佟雪巍
徐宇欣
浦胜丹
高昕媛
机构
哈尔滨医科大学附属第一医院内分泌科
出处
《国际内分泌代谢杂志》
2023年第6期464-468,共5页
基金
黑龙江省自然科学基金项目(LH2023H024)。
文摘
目的探讨2型糖尿病(T2DM)患者静息代谢率(RMR)与糖尿病视网膜病变(DR)的相关性。方法选取586例T2DM患者,分为无DR(NDR)组、轻度至中度非增殖性DR(NPDR)组和视力威胁性DR(VTDR)组。根据Mifflin-St Jeor公式计算静息代谢率(RMR)。观察不同Mifflin-RMR水平患者的临床特点。采用二元和有序logistic回归分析Mifflin-RMR与DR之间的关系。结果VTDR组Mifflin-RMR显著高于轻度至中度NPDR组和NDR组,而轻度至中度NPDR组Mifflin-RMR也显著高于NDR组(P均<0.001)。在控制混杂变量后,与Mifflin-RMR第一分位数患者相比,第四分位数患者发生DR的风险明显增加(OR=17.763,95%CI:8.017~39.356,P<0.001)。此外,Mifflin-RMR升高与DR严重程度相关(OR=13.447,95%CI:6.936~25.971,P<0.001)。结论在T2DM患者中,RMR与DR患病及严重程度相关。
关键词
2型糖尿病
糖尿病视网膜病变
静息
代谢
率预测
方程
Keywords
Type 2 diabetes mellitus
Diabetes retinopathy
Resting metabolic rate prediction equation
分类号
R587.2 [医药卫生—内分泌]
R774.1 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一种由代谢方程构建网络的方法及其实现
何胜
吴访升
潘瑜
徐明亮
杨莉
李炜疆
《计算机与应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2011
0
原文传递
2
人工代谢系统综述
胡扬
桂卫华
《计算机应用研究》
CSCD
北大核心
2009
2
下载PDF
职称材料
3
^(32)P轫致辐射SPECT断层显像技术的临床应用
贾晓民
李向阳
曹爱红
徐龙宝
张旭光
李毅
《南京医科大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2007
1
下载PDF
职称材料
4
用能量代谢方程求解泥龄研究
王涛
全晓泉
楼少华
杨斌
王海涛
《重庆建筑大学学报》
EI
CSCD
北大核心
2007
0
下载PDF
职称材料
5
谷物及其副产品中添加非淀粉多糖酶对肉鸭能量利用的影响
张旭
黄生敏
蒋桂韬
林谦
胡艳
李昊帮
戴求仲
《动物营养学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
6
下载PDF
职称材料
6
2型糖尿病患者静息代谢率与糖尿病视网膜病变的关系
张伊桐
佟雪巍
徐宇欣
浦胜丹
高昕媛
《国际内分泌代谢杂志》
2023
1
原文传递
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