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肠道菌群的昼夜节律性及其与宿主间代谢互作的研究进展 被引量：2
1
作者 张谨莹 唐陆琦 +1 位作者 胡良宇 王梦芝 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第8期3577-3583,共7页
肠道菌群具有24 h昼夜节律并与宿主生物钟之间存在复杂的相互作用。当肠道菌群昼夜节律紊乱,会造成体内产生一系列生理和病理的改变;而当宿主的昼夜节律破坏,还会引起肠道菌群节律发生变化。本文主要综述肠道菌群的节律特征、影响因素... 肠道菌群具有24 h昼夜节律并与宿主生物钟之间存在复杂的相互作用。当肠道菌群昼夜节律紊乱,会造成体内产生一系列生理和病理的改变;而当宿主的昼夜节律破坏,还会引起肠道菌群节律发生变化。本文主要综述肠道菌群的节律特征、影响因素、肠道菌群节律与宿主生物钟的双向作用及其相互关系,以期为研究肠道菌群节律及其与宿主生物钟相互作用的代谢机理提供参考。 展开更多
关键词 肠道菌群 昼夜节律 宿主 代谢互作
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基于基因组的假小链双歧杆菌与卷曲乳杆菌代谢互作分析 被引量：1
2
作者 姜天翌 吴欢 +1 位作者 陈峰 张晨虹 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期3044-3054,共11页
肠道菌群是一个复杂的微生态系统。肠道内的不同微生物之间相互作用,以功能群(guild)的形式响应环境的扰动,但其互作关系仍不明确。一名小胖威利综合征(prader-willi syndrome,PWS)儿童在接受了一种高膳食纤维食谱的营养干预后,肥胖表... 肠道菌群是一个复杂的微生态系统。肠道内的不同微生物之间相互作用,以功能群(guild)的形式响应环境的扰动,但其互作关系仍不明确。一名小胖威利综合征(prader-willi syndrome,PWS)儿童在接受了一种高膳食纤维食谱的营养干预后,肥胖表型改善,肠道内假小链双歧杆菌和卷曲乳杆菌被富集,两类菌丰度变化呈现正相关关系。针对这一现象,我们对假小链双歧杆菌和卷曲乳杆菌之间的互作关系进行了探究。假小链双歧杆菌C95分离自该名PWS儿童干预后的粪便样品,该菌基因组上拥有丰富的碳水化合物利用基因、胆汁酸抗性及粘附性功能因子相关基因和编码产生胞外多糖的基因簇。本研究中,我们从相同样本中分离到一株卷曲乳杆菌B4,该菌基因组上拥有丰富的碳水化合物利用基因、S层蛋白基因、细菌素分泌基因和乙酸合成的关键基因。然后,我们利用Netcooperate对C95菌株与B4菌株之间的代谢互补关系进行预测。结果表明,C95菌株能够为B4菌株提供57%的代谢底物,拓宽B4菌株的碳水化合物和核苷酸代谢通路。本研究利用菌株全基因组信息,寻找到假小链双歧杆菌C95与卷曲乳杆菌B4之间的代谢互作证据,为这种数学模型找到的微生物共变化关系赋予实际的生物学意义。 展开更多
关键词 肠道菌群 功能群 代谢互作 双歧杆菌 乳杆菌
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地下水脱卤过程中的微生物种间代谢互作:提高原位氯代烯烃厌氧脱氯效能的有效途径 被引量：2
3
作者 王泽懿 吕梦冉 +3 位作者 于洋 张悦妍 温丽莲 李昂 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1576-1590,共15页
有机卤呼吸细菌(organohalide-respiring bacteria,OHRB)在氯代烯烃污染地下水的原位生物修复中扮演着关键性的角色,提高其丰度及活性对氯代烯烃的完全去除具有重要意义。在实际环境中,有机卤呼吸细菌往往与多种微生物共存,微生物种间... 有机卤呼吸细菌(organohalide-respiring bacteria,OHRB)在氯代烯烃污染地下水的原位生物修复中扮演着关键性的角色,提高其丰度及活性对氯代烯烃的完全去除具有重要意义。在实际环境中,有机卤呼吸细菌往往与多种微生物共存,微生物种间代谢互作现象十分普遍,有机污染物的完全无害化往往需要通过微生物菌群的协同代谢作用来实现。因此,本文围绕微生物种间代谢互作进行综述,对目前获得的脱氯微生物菌种资源及脱氯机理进行了回顾,重点阐述了专性OHRB、非专性OHRB和非OHRB的种间代谢互作行为及机制,并提出以种间代谢互作为指导进行合成微生物群落的构建来有效提高氯代烯烃厌氧生物降解效率,为实现环境氯代烯烃类有机污染物的快速、彻底无害化提供理论指导。 展开更多
关键词 微生物种间代谢互作 有机卤呼吸细菌 合成微生物群落 氯代烯烃 厌氧脱氯
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蛋白质互作组学技术及其在植物研究中的应用进展 被引量：1
4
作者 张文洋 张胜 +1 位作者 易干军 晏石娟 《广东农业科学》 CAS 2022年第11期86-95,共10页
蛋白质互作组学技术是一门鉴定和量化蛋白质与其他代谢物或蛋白质等分子相互作用的前沿技术,已成为研究植物系统生物学和多组学研究的重要组成部分。近年来,基于质谱的组学技术迅速发展,也促进蛋白质-代谢物相互作用(Protein-metabolite... 蛋白质互作组学技术是一门鉴定和量化蛋白质与其他代谢物或蛋白质等分子相互作用的前沿技术,已成为研究植物系统生物学和多组学研究的重要组成部分。近年来,基于质谱的组学技术迅速发展,也促进蛋白质-代谢物相互作用(Protein-metabolite interaction,PMI)、蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)的发现和验证方法取得巨大进步,这些蛋白质互作组学技术在功能基因组和功能代谢组研究中逐渐展示出巨大的应用潜力。系统总结了过去10年不同蛋白质互作组学技术(主要包括PMI和PPI)的分析策略,并详细分析了它们各自的优缺点和适用的相互作用类型,综述了蛋白质互作组学技术在植物研究领域的应用进展,对植物蛋白质互作组学技术的应用策略和需要攻克的关键技术瓶颈进行了总结。蛋白质互作组学技术的不断发展将进一步推动植物胞内信号转导及代谢调控通路的解析,而精准解析信号网络中关键相互作用将为植物自身生长发育以及适应外界环境等机制研究提供重要的信息。 展开更多
关键词 蛋白质互作组学技术 蛋白质-代谢物互作 蛋白质-蛋白质互作 蛋白质组学 功能代谢组学
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