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题名人NOD2蛋白的生物信息学分析
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作者
刘颖
李萌萌
白莉
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机构
南京医科大学康达学院病原生物学与免疫学教研室
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出处
《生物技术》
CAS
2023年第3期301-304,共4页
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基金
南京医科大学康达学院科研发展基金项目(KD2021KYJJZD108)。
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文摘
[目的]对人NOD2蛋白进行生物信息学分析,预测其结构和功能,为儿童癫痫与肠道菌群之间的关系提供试验基础。[方法]利用生物信息学工具对人NOD2蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区域、空间结构、亚细胞定位、信号肽、磷酸化位点进行预测。[结果]人NOD2蛋白由1013个氨基酸残基组成,相对分子质量112530.04 Da,等电点为6.59,分子式为C_(5033)H_(7960)N_(1402)O_(1428)S_(49),带负电荷的残基总数(天冬氨酸+谷氨酸)103个,带正电荷的残基总数(精氨酸+赖氨酸)96个,蛋白不稳定系数为48.75,脂肪系数为101.46,总平均亲水性系数为0.008。二级结构由54.59%的α-螺旋、10.07%的延伸链、5.73%的β-转角、29.62%的无规卷曲构成。亚细胞被确认为定位在细胞膜、细胞质和线粒体中。[结论]人NOD2蛋白是一种不含信号肽和跨膜区的疏水性蛋白,具有激酶活性。该研究为探讨儿童癫痫与肠道菌群及炎症之间的关系提供了依据。
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关键词
人nod2蛋白
儿童癫痫
肠道菌群
炎症
生物信息学分析
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Keywords
human nod2
epilepsy in children
intestinal flora
inflammation
bioinformatic analysis
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分类号
R34
[医药卫生—基础医学]
Q39
[生物学—遗传学]
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