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人恶性T细胞扩增序列1在肾透明细胞癌预后中作用及其与免疫浸润关系
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作者 杨萌 钱城 朱建国 《社区医学杂志》 CAS 2023年第16期822-829,共8页
目的探讨肾透明细胞癌组织中的人恶性T细胞扩增序列1(MCTS1/MCT1)表达情况及其与肾透明细胞癌临床病理参数之间的关系,通过各种生物信息学工具预测MCTS1靶基因及进行相关功能分析,为进一步研究MCTS1为靶点的基因治疗提供理论依据。方法... 目的探讨肾透明细胞癌组织中的人恶性T细胞扩增序列1(MCTS1/MCT1)表达情况及其与肾透明细胞癌临床病理参数之间的关系,通过各种生物信息学工具预测MCTS1靶基因及进行相关功能分析,为进一步研究MCTS1为靶点的基因治疗提供理论依据。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取肾透明细胞癌患者的表达谱和临床信息。应用Wilcoxon秩和检验,比较肾透明细胞癌组织和正常肾组织中MCTS1的表达水平。为挖掘潜在的信号通路和生物学功能进行了功能富集分析。免疫细胞浸润采用单样本基因集富集分析。应用UALCAN和MethSURV数据库分析MCTS1的甲基化状态。采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析确定MCTS1的预后价值。构建诺模图预测肾透明细胞癌1、3和5年的总生存率(OS)。采用Log-rank检验对P值进行检验。结果基于HPA数据库分析肾透明细胞癌中MCTS1的组织表达水平,MCTS1在肾透明细胞癌组织中的表达水平高于邻近组织,差异有统计学意义,P<0.001;在不同的亚组中,用Kaplan-Meier方法评估MCTS1表达在肾透明细胞癌患者中的预后价值,结果显示,MCTS1的组织表达水平与M病理分期、组织学类型和年龄增长密切相关,差异有统计学意义,P<0.001;当MCTS1的过度表达时OS显著下降,差异有统计学意义,P<0.001;多因素Cox分析确定MCTS1是OS的独立阴性预后标志,合成了符合指数为0.841的OS诺模图,差异有统计学意义,OR=2.574,95%CI为1.446~4.683,P=0.005。UALCAN和MethSURV数据库分析MCTS1的甲基化状态,MCTS1的低甲基化状态与不良预后相关,肾透明细胞肿瘤组织在启动子处的DNA甲基化水平明显低于正常肾脏组织,差异有统计学意义,P<0.001。单样本基因集富集分析结果显示,MCTS1的过度表达与自然杀伤细胞、辅助性T细胞17、肥大细胞和浆细胞样树突状细胞的免疫细胞浸润水平呈负相关,差异有统计学意义,P<0.001。结论MCTS1高表达是肾� 展开更多
关键词 人恶性t细胞扩增序列1 肾透明细胞癌 甲基化 免疫浸润 生物信息学
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