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2017～2018年河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染病例中人副流感病毒3型基因特征分析 被引量：15
1
作者 周杉杉 毛乃颖 +4 位作者 姬奕昕 张燕 崔爱利 许文波 扈瑞平 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期730-740,共11页
严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起... 严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)是引起婴幼儿就诊和住院的常见原因,也是该年龄段人群发病的主要原因,而病毒感染占呼吸道感染病例的60%以上,其中人副流感病毒(Human parainfluenza viruses,HPIVs)是引起呼吸道感染的常见病原。为分析河南省漯河市儿童严重急性呼吸道感染(SARI)病例中人副流感病毒3型(HPIV-3)检出状况及血凝素-神经氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase,HN)基因特征,采用实时荧光定量聚合酶链反应(Polymerase chain reaction,PCR)方法对河南省漯河市中心医院于2017年10月10日至2018年12月27日送检的627份SARI病例咽拭子进行核酸检测,筛查HPIV-3阳性标本,对HPIV-3阳性标本用反转录聚合酶链反应(Reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增其HN基因,并对扩增产物进行序列测定,与GenBank数据库中的国内外HPIV-3 HN基因进行对比分析,绘制系统进化树,并分析基因特征。627份咽拭子标本中,HPIV-3阳性有27份,检出率为4.3%。59%的HPIV-3阳性病例分布于春夏季,发病人群中,6岁以下儿童占96.3%。通过RT-PCR方法共获得18株HPIV-3的HN基因,经过序列测定及对比分析可划分为两个基因亚型:C3a和C3b。C3a亚型有10株,C3b亚型有8株。18株HPIV-3的HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.1%~100.0%和98.8%~100%。与原型株Wash/47885/57相比,本次扩增18株HPIV-3 HN基因序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.5%~95.0%和97.0%~97.7%。与GenBank中国内外的HPIV-3 HN基因的代表株比较,其核苷酸及氨基酸同源性分别为94.1%~98.5%和96.8%~97.0%。本研究提示HPIV-3是河南省漯河市儿童SARI病例中检出的病原之一,2017年10月至2018年12月期间,至少有C3a、C3b两个基因亚型的HPIV-3毒株在漯河市共流行。 展开更多
关键词 人副流感病毒(hpivs) 血凝素-神经氨酸酶蛋白(HN)基因 基因特征 同源性分析
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