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PCR-CTPP:一种基于错配技术的SNP分型方法的改良
被引量：
16
1
作者
王柯
章金涛
+6 位作者
运玉霞
吴晓冰
陈阿群
王鹏
王凯娟
张建营
代丽萍
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期182-188,共7页
为探讨两对交叉引物PCR(PCR-CTPP)技术的原理并提高SNP分型的准确性,以人类MTHFR基因1298位点突变为例,通过设计合理的引物、优化引物终浓度及复性温度等重建PCR-CTPP检测系统,对比常规PCR-CTPP和改良的PCR-CTPP检测系统的可靠性。结果...
为探讨两对交叉引物PCR(PCR-CTPP)技术的原理并提高SNP分型的准确性,以人类MTHFR基因1298位点突变为例,通过设计合理的引物、优化引物终浓度及复性温度等重建PCR-CTPP检测系统,对比常规PCR-CTPP和改良的PCR-CTPP检测系统的可靠性。结果表明,改良的PCR-CTPP检测系统更加准确,支持了常规方法存在理论缺陷的观点;批量鉴定结果进一步验证了改良方法的可靠性。该技术有望在医学和分子生物学等领域广泛应用。
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关键词
两对交叉引物PCR
四引物扩增受阻突变体系PCR
SNP分型
人为
错配
亚甲基四氢叶酸还原酶
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职称材料
基于荧光定量PCR扩增反应的SNP测定法
被引量：
5
2
作者
单志新
谭虹虹
+1 位作者
余细勇
林秋雄
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第6期827-830,共4页
建立一种利用荧光定量PCR扩增反应进行单核苷酸多态性(SNP)快速测定的方法.以人β肾上腺素受体2基因中的Arg16Gly为研究对象,利用荧光染料SYBRGreenⅠ标记定量PCR产物,通过PCR生长曲线和融解曲线分析结果进行SNP分型.为提高SNP测定的特...
建立一种利用荧光定量PCR扩增反应进行单核苷酸多态性(SNP)快速测定的方法.以人β肾上腺素受体2基因中的Arg16Gly为研究对象,利用荧光染料SYBRGreenⅠ标记定量PCR产物,通过PCR生长曲线和融解曲线分析结果进行SNP分型.为提高SNP测定的特异性,分别在野生型和突变型等位基因的特异性引物3′端倒数第3个碱基位置,引入了一个人为错配碱基,使引物的错误延伸率显著降低,大大提高了SNP分析的准确性.通过DNA测序验证荧光定量PCR对β肾上腺素受体2基因中Arg16Gly分型结果的准确率.实验结果表明,所建立的方法操作简便,结果准确,适合进行大规模样品的SNP检测工作.
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关键词
单核苷酸多态性
实时聚合酶链反应
等位基因特异性延伸反应
人为
错配
碱基
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职称材料
题名
PCR-CTPP:一种基于错配技术的SNP分型方法的改良
被引量：
16
1
作者
王柯
章金涛
运玉霞
吴晓冰
陈阿群
王鹏
王凯娟
张建营
代丽萍
机构
河南省肿瘤流行病学重点实验室
郑州大学生物工程系
郑州大学实验动物中心
郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期182-188,共7页
基金
国家自然科学基金项目(编号:30872181
81072360)
+1 种基金
河南省高校科技创新人才支持计划(编号:2010HASTIT027)
河南医学科技攻关项目(编号:200903009)资助
文摘
为探讨两对交叉引物PCR(PCR-CTPP)技术的原理并提高SNP分型的准确性,以人类MTHFR基因1298位点突变为例,通过设计合理的引物、优化引物终浓度及复性温度等重建PCR-CTPP检测系统,对比常规PCR-CTPP和改良的PCR-CTPP检测系统的可靠性。结果表明,改良的PCR-CTPP检测系统更加准确,支持了常规方法存在理论缺陷的观点;批量鉴定结果进一步验证了改良方法的可靠性。该技术有望在医学和分子生物学等领域广泛应用。
关键词
两对交叉引物PCR
四引物扩增受阻突变体系PCR
SNP分型
人为
错配
亚甲基四氢叶酸还原酶
Keywords
PCR-CTPP
Tetra-primer ARMS PCR
SNP genotyping
artificial/deliberate mismatch
MTHFR
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
基于荧光定量PCR扩增反应的SNP测定法
被引量：
5
2
作者
单志新
谭虹虹
余细勇
林秋雄
机构
广东省人民医院医学研究中心
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第6期827-830,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.30300421)~~
文摘
建立一种利用荧光定量PCR扩增反应进行单核苷酸多态性(SNP)快速测定的方法.以人β肾上腺素受体2基因中的Arg16Gly为研究对象,利用荧光染料SYBRGreenⅠ标记定量PCR产物,通过PCR生长曲线和融解曲线分析结果进行SNP分型.为提高SNP测定的特异性,分别在野生型和突变型等位基因的特异性引物3′端倒数第3个碱基位置,引入了一个人为错配碱基,使引物的错误延伸率显著降低,大大提高了SNP分析的准确性.通过DNA测序验证荧光定量PCR对β肾上腺素受体2基因中Arg16Gly分型结果的准确率.实验结果表明,所建立的方法操作简便,结果准确,适合进行大规模样品的SNP检测工作.
关键词
单核苷酸多态性
实时聚合酶链反应
等位基因特异性延伸反应
人为
错配
碱基
Keywords
single nucleotide polymorphism （SNP）, real-time polymerase chain reaction, allele-specific amplification, artificial mismatch base
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
PCR-CTPP:一种基于错配技术的SNP分型方法的改良
王柯
章金涛
运玉霞
吴晓冰
陈阿群
王鹏
王凯娟
张建营
代丽萍
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2011
16
下载PDF
职称材料
2
基于荧光定量PCR扩增反应的SNP测定法
单志新
谭虹虹
余细勇
林秋雄
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005
5
下载PDF
职称材料
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