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北部湾红树林沉积物中微生物群落结构的时空变化分析
被引量:
5
1
作者
赵华显
阎冰
+5 位作者
徐悦
莫淑名
聂世清
欧倩
武波
蒋承建
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期2161-2169,共9页
微生物群落结构对海洋红树林湿地生态系统中的物质循环非常关键。本研究从中国亚热带北部湾典型海洋红树林湿地生态系统中采集沉积物样品,利用宏基因组学技术手段,完成了沉积物样品16S rDNA基因的扩增子的高通量测序,分析了不同时空条...
微生物群落结构对海洋红树林湿地生态系统中的物质循环非常关键。本研究从中国亚热带北部湾典型海洋红树林湿地生态系统中采集沉积物样品,利用宏基因组学技术手段,完成了沉积物样品16S rDNA基因的扩增子的高通量测序,分析了不同时空条件下红树林沉积物的微生物群落结构分布和变化规律。研究结果表明,不管在干季还是湿季,在门分类水平上变形菌门(Proteobacteria)是最丰富的类别。此外,变形菌门(Proteobacteria)与绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)和放线菌门(Actinobacteria)一共占据总丰度的80%左右。干季时期的微生物α多样性显著高于湿季,主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)显示干、湿两季的微生物群落结构具有明显差异。干季时期的细菌的相对丰度显著高于湿季,而古菌则相反。不同时空期(干季和湿季)的变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度没有显著差异。冗余分析(redundancy analysis,RDA)和相关性分析表明温度和盐度对微生物群落结构具有显著影响。本研究对揭示亚热带海洋红树林湿地生态系统沉积物中的微生物多样性及其群落结构演替规律具有重要的实践意义。
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关键词
亚
热带海洋
红树林
时空变化
微生物群落结构
16S
rDNA
原文传递
题名
北部湾红树林沉积物中微生物群落结构的时空变化分析
被引量:
5
1
作者
赵华显
阎冰
徐悦
莫淑名
聂世清
欧倩
武波
蒋承建
机构
广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室
广西红树林研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第5期2161-2169,共9页
基金
国家重点研发计划科技基础资源调查专项(2017FY100704)
广西红树林保护与利用重点实验室开放基金(课题编号:GKLMC-201702)
广西“红树林和海草系统保育与生态监测”特聘专家岗基金资助。
文摘
微生物群落结构对海洋红树林湿地生态系统中的物质循环非常关键。本研究从中国亚热带北部湾典型海洋红树林湿地生态系统中采集沉积物样品,利用宏基因组学技术手段,完成了沉积物样品16S rDNA基因的扩增子的高通量测序,分析了不同时空条件下红树林沉积物的微生物群落结构分布和变化规律。研究结果表明,不管在干季还是湿季,在门分类水平上变形菌门(Proteobacteria)是最丰富的类别。此外,变形菌门(Proteobacteria)与绿弯菌门(Chloroflexi)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae)和放线菌门(Actinobacteria)一共占据总丰度的80%左右。干季时期的微生物α多样性显著高于湿季,主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCoA)显示干、湿两季的微生物群落结构具有明显差异。干季时期的细菌的相对丰度显著高于湿季,而古菌则相反。不同时空期(干季和湿季)的变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度没有显著差异。冗余分析(redundancy analysis,RDA)和相关性分析表明温度和盐度对微生物群落结构具有显著影响。本研究对揭示亚热带海洋红树林湿地生态系统沉积物中的微生物多样性及其群落结构演替规律具有重要的实践意义。
关键词
亚
热带海洋
红树林
时空变化
微生物群落结构
16S
rDNA
Keywords
Subtropical marine mangrove
Spatio-temporal variability
Microbial community structure
16S rDNA
分类号
Q938.1 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
北部湾红树林沉积物中微生物群落结构的时空变化分析
赵华显
阎冰
徐悦
莫淑名
聂世清
欧倩
武波
蒋承建
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
5
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