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稻瘟病菌群体的分子遗传学研究——广东省与云南省稻瘟病菌群体遗传及致病型结构的比较分析 被引量:32
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作者 吴伟怀 王玲 +2 位作者 程贯忠 朱有勇 潘庆华 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期675-680,共6页
通过基于SRAP标记的分子指纹分析法对由广东省和云南省各40个菌株构成的试验群体进行了遗传结构分析。在相似性系数取0.83时,80个供试菌株被分为25个宗谱;其中广东群体9个宗谱,宗谱频率为22.5%;云南群体16个宗谱,宗谱频率为40.0%,由此说... 通过基于SRAP标记的分子指纹分析法对由广东省和云南省各40个菌株构成的试验群体进行了遗传结构分析。在相似性系数取0.83时,80个供试菌株被分为25个宗谱;其中广东群体9个宗谱,宗谱频率为22.5%;云南群体16个宗谱,宗谱频率为40.0%,由此说明,后者比前者的遗传多样性高。有趣的是,在25个宗谱中并不存在两个群体共有的宗谱,由此推测它们之间存在明显的遗传特异性或异质性。另一方面,利用中国、日本和IRRI的3套鉴别品种分别对80个供试菌株进行了致病型结构分析。结果表明,在上述3套鉴别品种中,广东群体分别被划分为16、30和20个致病型;而云南群体则分别被划分为12、31和16个致病型。由此说明,两个群体之间遗传多样性方面的差异并没有反映于致病型多样性上。但是,通过对两个群体致病型结构的比较分析表明,两个群体之间存在高度的致病型特异性,这一特性则充分地反映于两者的遗传特异性上。研究结果表明,从多样性和特异性这两方面来进行病原菌群体遗传宗谱和致病型结构分析可能更加合理和全面一些。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 分子遗传学 致病型结构 比较研究 广东 云南 群体遗传学 稻瘟病
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猪流行性腹泻病毒云南流行毒株N基因序列分析 被引量:5
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作者 宋聪 刘宁 +5 位作者 李美荃 石於友 李华春 高林 杨荣丽 姚俊 《动物医学进展》 北大核心 2016年第5期15-19,共5页
为了解近年来云南省PEDV流行毒株的变异情况,选取了采集自昆明西翥、富源、厂口、玉溪红塔等地方猪场的不同时间的6份PEDV阳性水样腹泻粪便样品,进行N基因的RT—PCR扩增、测序及序列分析。结果表明,来自同一猪场不同流行时间的TY1、... 为了解近年来云南省PEDV流行毒株的变异情况,选取了采集自昆明西翥、富源、厂口、玉溪红塔等地方猪场的不同时间的6份PEDV阳性水样腹泻粪便样品,进行N基因的RT—PCR扩增、测序及序列分析。结果表明,来自同一猪场不同流行时间的TY1、TY2、TY3毒株之间,TY1与TY2毒株N基因核苷酸序列完全相同,仅TY3毒株在第80和第1238位置处的碱基发生了变异(A—C、C—T),TY3与TY1、TY2的毒株N基因核苷酸序列的同源性达99.8%。云南6个流行毒株TY1、TY2、TY3、YXHT、FYDH及Changkou的核苷酸序列的同源性为99.2%~100%。云南6个流行毒株与2014年德国毒株GER—L00721—2014(Accession:LM645057.1)、法国毒株KR011756-FR001—2014(Accession:KR011756.1)及我国2010年河北毒株JF700126.1-HB—HS-2010(Accession:LM645057.1)的核苷酸序列同源性为98.6%~100%,并同属于一个进化分支。云南6个流行毒株与CV777经典疫苗毒株之间的同源性仅为95.2%~95.5%,存在一定的变异,这或许是云南省猪群经PEDV疫苗免疫后保护率较低的原因之一。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 N基因 序列分析 云南
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基于线粒体细胞色素b基因的细颈囊尾蚴种群遗传多样性研究 被引量:3
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作者 郝桂英 杨光友 +3 位作者 古小彬 阳爱国 杨应东 王淑贤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期119-125,共7页
为探讨我国细颈囊尾蚴种群之间的遗传相似性及与其他带科带属绦虫的亲缘关系,用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因全序列研究了分离自我国四川和云南2省7地区猪、山羊和绵羊共33个细颈囊尾蚴的遗传变异,并用MEGA 4.0程序NJ法和PAUP 4.0程序MP... 为探讨我国细颈囊尾蚴种群之间的遗传相似性及与其他带科带属绦虫的亲缘关系,用线粒体细胞色素b(Cyt b)基因全序列研究了分离自我国四川和云南2省7地区猪、山羊和绵羊共33个细颈囊尾蚴的遗传变异,并用MEGA 4.0程序NJ法和PAUP 4.0程序MP法绘制种系发育树。本研究结果显示:细颈囊尾蚴分离株的Cyt b基因全长为1 068bp,共检测到22个单倍型,单倍型间核苷酸相似性较高(97.3%~99.9%),其与带科带属其他5种绦虫的相似性均在82%以下。系统发育树显示,7个不同地域的细颈囊尾蚴聚为一支,分为3个亚群,且与地理区域、宿主没有直接的相关性,呈现混杂的分布格局,未形成明显的地理分支或宿主分支。研究结果表明:细颈囊尾蚴Cyt b基因存在一定的遗传差异,但种内相对保守,与其他带科绦虫种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,并为细颈囊尾蚴的种群遗传学研究及其与其他带科绦虫病的鉴别诊断的建立奠定基础。 展开更多
关键词 细颈囊尾蚴 线粒体细胞色素B基因 遗传多样性 四川 云南
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副猪嗜血杆菌云南本地株的分离及鉴定
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作者 纪文清 胡永贵 杨贵树 《云南畜牧兽医》 2011年第1期15-17,共3页
副猪嗜血杆菌病是由副猪嗜血杆菌引起的主要危害猪的一种急性、热性传染病。本试验对疑似副猪嗜血杆菌感染病例病料进行细菌分离培养,对分离菌株进行生化试验鉴定,结果可见菌落有卫星现象,革兰氏阴性的细小杆菌,分离菌株能发酵葡萄糖、... 副猪嗜血杆菌病是由副猪嗜血杆菌引起的主要危害猪的一种急性、热性传染病。本试验对疑似副猪嗜血杆菌感染病例病料进行细菌分离培养,对分离菌株进行生化试验鉴定,结果可见菌落有卫星现象,革兰氏阴性的细小杆菌,分离菌株能发酵葡萄糖、乳糖,产酸不产气,不发酵蔗糖、木糖、甘露醇,不产生靛基质,不分解尿素,不分解精氨酸,过氧化氢酶阳性,氧化酶阴性。证明分离菌株为副猪嗜血杆菌。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 云南本地
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