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二阶HMM算法改进及在miRNA靶基因预测中的应用
被引量:
5
1
作者
高松
秦殿刚
+2 位作者
冯铁男
马成荣
王翼飞
《应用科学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期307-312,共6页
隐马氏模型在语音识别和生物信息学中有重要的应用.本文研究二阶隐马氏模型(HMM2)的基本算法,利用归一化和递推原理,改进模型的前向-后向算法及Baum-Welch训练算法并给予证明,使得该算法更容易理解和机器实现,并保证数值稳定性.将HMM2...
隐马氏模型在语音识别和生物信息学中有重要的应用.本文研究二阶隐马氏模型(HMM2)的基本算法,利用归一化和递推原理,改进模型的前向-后向算法及Baum-Welch训练算法并给予证明,使得该算法更容易理解和机器实现,并保证数值稳定性.将HMM2应用到miRNA靶基因预测的后期过滤处理中取得了较好的结果.
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关键词
二阶
隐
马氏
模型
前向-后向算法
Baum-Welch算法
miRNA靶基因
下载PDF
职称材料
题名
二阶HMM算法改进及在miRNA靶基因预测中的应用
被引量:
5
1
作者
高松
秦殿刚
冯铁男
马成荣
王翼飞
机构
上海大学数学系
出处
《应用科学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期307-312,共6页
基金
国家自然科学基金(No.30871341)
上海市重点学科基金(No.S30104)
+1 种基金
上海市教委重点学科建设项目基金(No.J50101)
科技部重大科技专项基金(No.2008ZX10002-017,No.2008ZX10002-020,No.2009ZX09103-686)资助
文摘
隐马氏模型在语音识别和生物信息学中有重要的应用.本文研究二阶隐马氏模型(HMM2)的基本算法,利用归一化和递推原理,改进模型的前向-后向算法及Baum-Welch训练算法并给予证明,使得该算法更容易理解和机器实现,并保证数值稳定性.将HMM2应用到miRNA靶基因预测的后期过滤处理中取得了较好的结果.
关键词
二阶
隐
马氏
模型
前向-后向算法
Baum-Welch算法
miRNA靶基因
Keywords
second-order hidden Markov model(HMM2)
forward-backward algorithm
Baum-Welch algorithm
miRNA target gene
分类号
TP13 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
二阶HMM算法改进及在miRNA靶基因预测中的应用
高松
秦殿刚
冯铁男
马成荣
王翼飞
《应用科学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
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