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基因芯片表达在乳腺癌转移过程中的聚类分析
被引量:
1
1
作者
董骝焕
袁媛
+4 位作者
沈世镒
孙保存
冯玉梅
尼春生
李晓青
《生物数学学报》
CSCD
北大核心
2007年第3期527-532,共6页
利用基因芯片可以得到不同基因在不同生命过程中的表达,因此在医学诊断与病变分析中受到重视,并开始大量应用.经测定发现,不同基因在病变过程的不同阶段中的表达是不相同的,由此可以得到在病变过程的不同基因的表达特征.在本文中,我们...
利用基因芯片可以得到不同基因在不同生命过程中的表达,因此在医学诊断与病变分析中受到重视,并开始大量应用.经测定发现,不同基因在病变过程的不同阶段中的表达是不相同的,由此可以得到在病变过程的不同基因的表达特征.在本文中,我们给出了乳腺癌在转移过程中的基因表达特征的聚类分析法分析,并改进了k-means聚类算法,使之具有自动搜索聚类数的功能,并且有助于改善k-means算法的聚类结果陷入局部最小值的状况.通过对平均聚类误差指标的比较,kr-means要优于k-means算法.本文所得到的结果可供乳腺癌诊断与病变分析参考,同时可以应用于小型基因检测芯片的制备,也可以用于构建基因网络调控图.
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关键词
聚类分析
乳腺癌
基因
转移
基因
芯片数据表达
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职称材料
题名
基因芯片表达在乳腺癌转移过程中的聚类分析
被引量:
1
1
作者
董骝焕
袁媛
沈世镒
孙保存
冯玉梅
尼春生
李晓青
机构
中科院上海生科院计算生物学研究所
嘉兴学院统计系
南开大学数学科学学院
天津医科大学肿瘤研究所
出处
《生物数学学报》
CSCD
北大核心
2007年第3期527-532,共6页
基金
国家自然科学基金(10271061
90208022)
+2 种基金
天南大联合研究项目
刘徽应用数学研究中心资助
中国博士后科学基金资助(200604000683)
文摘
利用基因芯片可以得到不同基因在不同生命过程中的表达,因此在医学诊断与病变分析中受到重视,并开始大量应用.经测定发现,不同基因在病变过程的不同阶段中的表达是不相同的,由此可以得到在病变过程的不同基因的表达特征.在本文中,我们给出了乳腺癌在转移过程中的基因表达特征的聚类分析法分析,并改进了k-means聚类算法,使之具有自动搜索聚类数的功能,并且有助于改善k-means算法的聚类结果陷入局部最小值的状况.通过对平均聚类误差指标的比较,kr-means要优于k-means算法.本文所得到的结果可供乳腺癌诊断与病变分析参考,同时可以应用于小型基因检测芯片的制备,也可以用于构建基因网络调控图.
关键词
聚类分析
乳腺癌
基因
转移
基因
芯片数据表达
Keywords
Clustering analysis
Gene chip expression data analysis
Metastasis in breast tumor
分类号
O212.2 [理学—概率论与数理统计]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基因芯片表达在乳腺癌转移过程中的聚类分析
董骝焕
袁媛
沈世镒
孙保存
冯玉梅
尼春生
李晓青
《生物数学学报》
CSCD
北大核心
2007
1
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参考文献
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