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乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭患者lncRNA表达谱分析
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作者 李小梅 李荣华 +2 位作者 符小玉 李颖 傅蕾 《生命科学研究》 CAS CSCD 2021年第3期249-258,共10页
为了分析乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭(hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure,HBVACLF)患者与乙肝携带者(asymptomatic carrier,ASC)间差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),探究lncRNA在HBV-ACLF... 为了分析乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭(hepatitis B virus-related acute-on-chronic liver failure,HBVACLF)患者与乙肝携带者(asymptomatic carrier,ASC)间差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),探究lncRNA在HBV-ACLF中的功能,选取5例HBV-ACLF患者和5例ASC患者,应用高通量测序检测其外周血中lncRNA及信使RNA(messenger RNA,mRNA)的表达谱,筛选出在两组间差异表达的lncRNA及mRNA,并进一步对差异表达的lncRNA进行生物信息学分析。结果显示,与ASC组相比,HBV-ACLF组中共发现了131个异常表达的lncRNA,表达上调的lncRNA有114个,表达下调的lncRNA有17个,其中lncRNA PIGC上调最显著。GO分析表明,差异表达的lncRNA主要参与病毒复制、固有免疫、小分子物质代谢等生物学过程;KEGG分析发现,差异表达的lncRNA主要参与核黄素代谢、类固醇激素生物合成、果糖和甘露糖代谢、卟啉和叶绿素代谢、叶酸生物合成、氨基酸和核苷酸代谢等信号通路。Cis预测提示,lncRNA PIGC能调控mRNA ENST00000484368的表达。本研究筛选出了在HBV-ACLF患者中差异表达的lncRNA谱,并发现lncRNA很可能通过调节肝细胞的小分子代谢及肝脏免疫反应在HBV-ACLF中发挥作用。 展开更多
关键词 长链非编码RNA(lncRNA) 信使RNA(mRNA) 表达谱 乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭(hbv-aclf) 高通量测序
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