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基于生物信息学方法的坤泰胶囊分子网络及生物功能初步探析 被引量：8
1
作者 王李俊 杨琴 +1 位作者 王飞 朱盼 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2601-2605,共5页
目的基于和颜?坤泰胶囊(以下简称坤泰胶囊)各组分对应靶点信息集,运用生物信息学方法探析其发挥疗效的潜在分子网络及生物功能。方法将坤泰胶囊6味组方药材逐一在中药系统药理学研究数据库(TCMSP)、TCM-mesh中检索获得每一种药材所对应... 目的基于和颜?坤泰胶囊(以下简称坤泰胶囊)各组分对应靶点信息集,运用生物信息学方法探析其发挥疗效的潜在分子网络及生物功能。方法将坤泰胶囊6味组方药材逐一在中药系统药理学研究数据库(TCMSP)、TCM-mesh中检索获得每一种药材所对应的化学成分,并与经液相色谱-电喷雾质谱联用技术(LC-ESI-MS/MS)检测得到的坤泰胶囊活性成分进行比对,剔除重复成分,获得坤泰胶囊含有的活性成分,再将这些成分逐一在数据库中检索获得其对应的靶点信息,形成化合物-靶点信息集。利用DAVID、KEGG、COSMIC等数据库,对化合物-靶点信息集进行功能富集分析、靶标的组织特异性表达分析,以及蛋白-蛋白相互关系网络分析。结果结合数据库与LC-ESI-MS/MS检测,共获得29个成分,获得对应的靶基因186个。这些靶基因显著富集在神经中枢、乳腺、卵巢等组织中。经DAVID的基因本体(gene ontology,GO)分析结果显示,这些靶标显著集中于细胞质、线粒体、细胞外基质等细胞器,主要发挥脂肪酶、激酶以及氧化还原酶等活性,参与代谢、能量通路、凋亡等生物过程。KEGG通路富集分析表明这些靶标显著参与PI3K-Akt、m TOR、胰岛素等信号通路。结论通过坤泰胶囊活性成分-靶标信息集的建立,利用各生物信息数据库与分析手段,从分子水平为坤泰胶囊的临床疗效提供佐证,也为进一步拓展其临床应用提供依据。 展开更多
关键词 和颜 坤泰胶囊 中药系统药理学研究数据库 生物信息学 基因本体 信号通路 蛋白-蛋白相互作用
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