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甲基营养菌代谢过程新进展与代谢工程改造 被引量:3
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作者 周狄霏 冯晨曦 +2 位作者 宋书真 杨松 马增新 《南京工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2022年第5期511-522,共12页
甲基营养菌是一类能够利用有机碳一(C1)作为唯一碳源和能源进行生长的微生物,其中心代谢具有特殊性、复杂性和多样性的特点,是研究C1同化、异化和合成代谢的重要对象。近年来,随着甲基营养菌的系统组学研究技术日趋成熟,分子遗传改造工... 甲基营养菌是一类能够利用有机碳一(C1)作为唯一碳源和能源进行生长的微生物,其中心代谢具有特殊性、复杂性和多样性的特点,是研究C1同化、异化和合成代谢的重要对象。近年来,随着甲基营养菌的系统组学研究技术日趋成熟,分子遗传改造工具和分子元器件的不断开发和完善,研究者们对甲基营养菌中心代谢过程和调控机制的认识逐步深化。基于此,系统阐述了甲基营养菌依赖于稀土元素的代谢调控机制,以及甲烷氧化菌中心代谢的新认知和甲醇利用菌途径工程的新策略,为进一步对甲基营养菌的代谢改造和高值产品开发提供一定的参考。 展开更多
关键词 甲基营养菌 中心代谢 甲烷氧化菌 甲醇利用菌 稀土元素 代谢工程
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斯氏假单胞菌A1501物质代谢及能量生成相关基因的分析 被引量:1
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作者 刘伟 燕永亮 +6 位作者 杨剑 平淑珍 陈立宏 陆伟 张维 陈明 林敏 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第4期175-180,共6页
斯氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501是一株分离自中国南方水稻根际土壤的联合固氮菌。该菌在无氨和微好氧条件下可将空气中的氮气转化为植物可以直接利用的铵。A1501基因组测定工作已经完成,根据A1501菌基因组的功能注释对该菌的... 斯氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)A1501是一株分离自中国南方水稻根际土壤的联合固氮菌。该菌在无氨和微好氧条件下可将空气中的氮气转化为植物可以直接利用的铵。A1501基因组测定工作已经完成,根据A1501菌基因组的功能注释对该菌的中心代谢、能量合成及环境适应性等方面进行了生物信息学分析。结果发现,A1501菌的物质代谢途径具有多样性,除不能利用EMP途径代谢己糖外,该基因组含有几乎所有编码Entner-Doudorff途径(ED)、磷酸戊糖途径(HMP)、糖酵解途径(EMP)、三羧酸循环(TCA)以及乙醛酸途径中关键酶类的基因。此外,基因组分析鉴定了252个与能量产生相关以及3套编码电子传递复合体(1个Nqr和2个Rnf复合体)的基因簇。为进一步研究A1501菌的碳代谢调控及C-N偶联机制提供了重要的理论依据。 展开更多
关键词 斯氏假单胞菌A1501 生物固氮 中心代谢 能量生成
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分枝杆菌转化甾醇过程的中心代谢关键基因转录差异分析
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作者 熊亮斌 孙吉 +4 位作者 刘显舟 屈占国 计雨情 徐一新 王风清 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期120-127,共8页
为探究新金色分枝杆菌代谢甾醇积累甾体药物中间体过程的中心代谢调节机制,采用转录组测序结合qRT-PCR技术,对比分析甾药中间体生产菌株中心代谢的关键基因转录水平,测定转化过程的葡萄糖消耗速率。结果显示,糖酵解途径的pfkB、pyk转录... 为探究新金色分枝杆菌代谢甾醇积累甾体药物中间体过程的中心代谢调节机制,采用转录组测序结合qRT-PCR技术,对比分析甾药中间体生产菌株中心代谢的关键基因转录水平,测定转化过程的葡萄糖消耗速率。结果显示,糖酵解途径的pfkB、pyk转录下调1.96倍及1.49倍;磷酸戊糖途径的zwf、gntZ转录下调3.57倍及2.43倍;三羧酸循环的citA、icd2和kdg转录分别下调2.5倍、1.78倍及1.92倍。对葡萄糖消耗速率的测定显示,中间体生产菌株的初始代谢速率显著低于野生型菌株。研究结果表明在转化甾醇积累甾药中间体过程中,分枝杆菌的中心代谢途径受到一定程度的抑制性调节。 展开更多
关键词 新金色分枝杆菌 甾体药物中间体 中心代谢 9-OHAD 葡萄糖
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不同贮藏温度对宰后猪里脊肉乳酸代谢通量的影响 被引量:7
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作者 张成云 何兴兴 +3 位作者 庞广昌 张德权 张春晖 关文强 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第3期192-197,共6页
为探讨不同温度处理对宰后猪里脊肉乳酸代谢通量的影响,本实验以猪里脊肉为材料,分别在4℃和-1℃下贮藏0.5、2、6、12、24、72、120、168 h,测定葡萄糖、乳酸和NADH含量的变化速率,并通过猪肉宰后僵直变化规律及乳酸代谢途径,建立中心... 为探讨不同温度处理对宰后猪里脊肉乳酸代谢通量的影响,本实验以猪里脊肉为材料,分别在4℃和-1℃下贮藏0.5、2、6、12、24、72、120、168 h,测定葡萄糖、乳酸和NADH含量的变化速率,并通过猪肉宰后僵直变化规律及乳酸代谢途径,建立中心代谢网络模型,进行乳酸代谢通量的分析。结果表明:在不同温度和贮藏时间下乳酸代谢通量均有明显差异,其中,-1℃贮藏时的葡萄糖进入磷酸戊糖途径的通量高于4℃,而在0.5~12 h贮藏期间-1℃贮藏时的乳酸代谢通量低于4℃,且在24~168 h贮藏期间-1℃贮藏时的乳酸代谢通量下降速率要慢于4℃。这表明贮藏温度越低分解代谢速率越慢,-1℃贮藏条件能够延缓乳酸的积累和下降速率,有利于鲜肉的保鲜。本研究从代谢的角度为鲜肉的保鲜提供了参考及理论依据。 展开更多
关键词 猪里脊肉 乳酸代谢通量 中心代谢网络 糖酵解
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高渗胁迫对光滑球拟酵母转录组的影响 被引量:2
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作者 徐沙 刘立明 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1284-1293,共10页
采用表达谱芯片技术,研究了光滑球拟酵母细胞在不同渗透压条件下(860、1 765、2 603m Os mol/kg和3 324 m Os mol/kg)的转录水平变化情况。结果表明,在高渗透压条件下,表达量大幅度提高的基因主要包括一些与细胞壁、细胞膜合成相关的基... 采用表达谱芯片技术,研究了光滑球拟酵母细胞在不同渗透压条件下(860、1 765、2 603m Os mol/kg和3 324 m Os mol/kg)的转录水平变化情况。结果表明,在高渗透压条件下,表达量大幅度提高的基因主要包括一些与细胞壁、细胞膜合成相关的基因,以及细胞膜上的信息素蛋白质基因。中心代谢途径(即糖酵解途径、三羧酸循环和氧化磷酸化途径)整体表现为显著上调,特别是参与ATP和NADH合成的相关基因。此外,对可能作为相容性溶质的氨基酸,如谷氨酸、脯氨酸、精氨酸的合成代谢途径的分析表明,脯氨酸和谷氨酸合成途径中的酶转录水平均有一定程度的提高,但是幅度不大;而精氨酸分解途径中的尿素羧化酶转录水平发生显著下调,其转录水平下降至1/100以下。 展开更多
关键词 光滑球拟酵母 渗透压胁迫 转录组 中心代谢途径 氨基酸代谢途径
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透明颤菌vgb基因在脱氮假单胞菌中的表达及对维生素B_(12)合成的碳中心代谢流分析 被引量:3
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作者 施慧琳 王泽建 +3 位作者 吴杰群 郭美锦 储炬 庄英萍 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期21-30,共10页
在为维生素B_(12)生产菌株脱氮假单胞菌确立合适的接合转移操作条件的基础上,通过单交换的方式,将vgb基因整合到脱氮假单胞菌染色体上,获得了vgb重组菌株Pvgb-16,并通过^(13)C同位素标记实验,探索VHb蛋白对脱氮假单胞菌碳中心代谢流变... 在为维生素B_(12)生产菌株脱氮假单胞菌确立合适的接合转移操作条件的基础上,通过单交换的方式,将vgb基因整合到脱氮假单胞菌染色体上,获得了vgb重组菌株Pvgb-16,并通过^(13)C同位素标记实验,探索VHb蛋白对脱氮假单胞菌碳中心代谢流变化和维生素B_(12)合成的影响。研究结果表明,在相同的供氧条件下,vgb重组菌株Pvgb-16拥有更高的比生长速率和比产物合成速率,与出发菌株相比分别提升了22%和52%。碳代谢通量分布分析表明,vgb重组菌株Pvgb-16的PP途径改善,提升了NADPH合成通量;甘氨酸由甜菜碱合成的通量上升,促进了前体物质氨基乙酰丙酸的合成,进一步加速维生素B_(12)的合成。总体来看,含vgb基因的重组菌株与出发菌株相比在促进菌体的生长、维生素B_(12)的合成速率及得率上都有显著效果,对进一步的发酵生产应用研究具有重要意义。 展开更多
关键词 脱氮假单胞菌 维生素B12 中心代谢流分析 VGB基因
原文传递
基于中心碳代谢分析技术的肝胆系统疾病靶向代谢组学研究
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作者 徐圣弢 吴琼 +3 位作者 刘佃花 王琳召 谭蔚锋 陈俊 《药学实践与服务》 CAS 2023年第12期753-759,共7页
目的 采用超高效液相色谱三重四级杆质谱技术(UPLC-QQQ-MS)对肝胆疾病患者血浆样本内源性中心碳代谢相关化学成分进行分析,寻找肝胆系统病变的可能特征代谢物及显著改变的代谢通路。方法 招募健康志愿者32人、胆管囊肿患者23人、胆道结... 目的 采用超高效液相色谱三重四级杆质谱技术(UPLC-QQQ-MS)对肝胆疾病患者血浆样本内源性中心碳代谢相关化学成分进行分析,寻找肝胆系统病变的可能特征代谢物及显著改变的代谢通路。方法 招募健康志愿者32人、胆管囊肿患者23人、胆道结石患者19人、肝癌患者45人及肝门部胆管癌患者50人,采集血浆样本,进行UPLC-QQQ-MS分析,采用MPP软件进行统计分析,结合模式识别分析各组间代谢组差异,研究肝胆疾病显著改变代谢通路及可能致病机制。结果 代谢组学分析得到胆管囊肿患者15个、胆道结石患者7个、肝癌患者7个和肝门部胆管癌患者3个与健康人血浆中存在显著性差异的可能生物标志物,并分别富集胆管囊肿患者8条、胆道结石患者4条、肝癌4条和肝门部胆管癌患者1条在体内显著改变的代谢通路。结论 根据上述鉴别的差异代谢物和富集的代谢通路结果,表明肝脏病变主要影响了机体的能量代谢及氨基酸的代谢与运输,而磷酸肌醇代谢在胆管囊肿、胆道结石、肝癌和肝门部胆管癌中均显著改变。 展开更多
关键词 中心代谢 代谢靶标分析 胆管囊肿 肝癌 肝门部胆管癌
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中心体相关调节蛋白及其异常与肿瘤发生的研究进展 被引量:2
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作者 张彤雯 牛昀 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 2007年第12期956-959,共4页
中心体是动物细胞的重要细胞器,作为动物细胞中首要的微管组织中心(microtu-bule-organizing center,MTOC),在细胞的生命活动中起着重要的作用。各种不同形式的中心体异常会造成细胞中微管分布的紊乱,进而引起细胞骨架的异常和染色体分... 中心体是动物细胞的重要细胞器,作为动物细胞中首要的微管组织中心(microtu-bule-organizing center,MTOC),在细胞的生命活动中起着重要的作用。各种不同形式的中心体异常会造成细胞中微管分布的紊乱,进而引起细胞骨架的异常和染色体分离障碍。许多位于中心体处的蛋白对于中心体微管组织中心功能实现发挥着重要的作用,它们的异常同很多疾病的发生息息相关。更为重要的是越来越多的证据表明,不同来源肿瘤细胞中存在有各种中心体的异常,并且这些异常对于肿瘤的发生、发展和预后都有着紧密的联系。因而研究中心体微管组织中心功能和研究实现这些功能的相关调节蛋白,对于肿瘤的早期诊断和抗肿瘤药物的开发提供了重要的依据。 展开更多
关键词 中心体/病理学 肿瘤 微管组织中心/代谢 调节蛋白
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基于氧化还原酶活性时变研究巴利阿里假单胞菌中心碳代谢 被引量:1
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作者 温卫卫 周小芬 +1 位作者 王世珍 方柏山 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期145-148,共4页
以分离自中国北部湾沉积物的海洋菌株巴利阿里假单胞菌(Pseudomonas balearica)为例,在考察其生长动力学的同时,监测了其中心碳代谢(CCM)中6种关键氧化还原酶,葡萄糖-6-磷酸脱氢酶、丙酮酸脱氢酶、2-酮戊二酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶、苹... 以分离自中国北部湾沉积物的海洋菌株巴利阿里假单胞菌(Pseudomonas balearica)为例,在考察其生长动力学的同时,监测了其中心碳代谢(CCM)中6种关键氧化还原酶,葡萄糖-6-磷酸脱氢酶、丙酮酸脱氢酶、2-酮戊二酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶、苹果酸酶及异柠檬酸脱氢酶的酶活性时变,从酶蛋白表达水平揭示了海洋生长条件下巴利阿里假单胞菌CCM中关键氧化还原酶的酶活性变化的规律,为研究微生物CCM和发掘海洋微生物新型酶制剂提供一种新思路. 展开更多
关键词 海洋微生物 中心代谢 氧化还原酶 动力学
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