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密码对的使用与基因组进化 被引量：9
1
作者 王芳平 李宏 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期176-184,共9页
以5种真核、20种细菌、10种古菌生物的基因组为样本,分析了编码序列中密码对和基因间序列中三联体对的相对模式数随频数的分布,验证了这种分布符合Γ(α,β)分布。发现分布形状参数!值与生物基因组进化存在明显的相关性;编码序列与基因... 以5种真核、20种细菌、10种古菌生物的基因组为样本,分析了编码序列中密码对和基因间序列中三联体对的相对模式数随频数的分布,验证了这种分布符合Γ(α,β)分布。发现分布形状参数!值与生物基因组进化存在明显的相关性;编码序列与基因间序列的进化方式截然不同。随着进化,编码序列的分布形状逐渐向随机分布靠近(α值逐渐增大)。而对基因间序列,古菌与真核生物的分布形状接近,与细菌的分布相差明显。 展开更多
关键词 基因组进化 密码对 三联体对 r(邶)分布
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几种模式生物密码对的使用和基因组进化 被引量：4
2
作者 王芳平 李宏 《内蒙古大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期166-172,共7页
以闪烁古生球菌、枯草杆菌、大肠杆菌、酿酒酵母、拟南芥和线虫基因组为样本,分别分析了编码序列中密码对、基因间序列中三联体对的相对模式数目随频数的分布,验证这种分布是Γ(α,β)分布.发现分布参数与基因组进化相关;另外,比较了密... 以闪烁古生球菌、枯草杆菌、大肠杆菌、酿酒酵母、拟南芥和线虫基因组为样本,分别分析了编码序列中密码对、基因间序列中三联体对的相对模式数目随频数的分布,验证这种分布是Γ(α,β)分布.发现分布参数与基因组进化相关;另外,比较了密码对的观测值与期望值之差的分布,发现密码对的使用普遍具有偏好性,且不同的物种所偏好的密码对是不同的. 展开更多
关键词 基因组进化 密码对 三联体对 Г(α β)分布
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