基于近邻量测认知信息的多传感器融合估计 被引量：7

1

作者 张鹏 张建业 +1 位作者 王占磊 谢文俊 《计算机工程》 CAS CSCD 2012年第8期1-3,共3页

在构建传感器模糊量测认知偏差的基础上,提出一种新的多传感器融合估计方法。运用相邻量测样本均值和协方差度量传感器可靠性,确保融合权重分配的客观性和灵敏性。实验结果表明,与基于均值融合算法和支持度融合算法相比,使用该方法得到... 在构建传感器模糊量测认知偏差的基础上,提出一种新的多传感器融合估计方法。运用相邻量测样本均值和协方差度量传感器可靠性,确保融合权重分配的客观性和灵敏性。实验结果表明,与基于均值融合算法和支持度融合算法相比,使用该方法得到的融合权值分配方式更加合理,可进一步提高估计精度。 展开更多

关键词 多传感器融合 一致性序列 量测认知偏差 近邻信息 可靠性度量 权重分配

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人类P53下游基因一致性序列研究 被引量：1

2

作者 白明泽 谭军 舒坤贤 《重庆邮电学院学报（自然科学版）》 2006年第4期544-547,共4页

人类P53蛋白是一种通用转录因子,通过调控一系列下游基因的转录来影响许多细胞功能。p53下游基因含有P53蛋白结合序列,收集已报道的63条人类P53蛋白结合序列并与El-Deiry等定义的一致性序列进行比较,发现这些P53蛋白结合序列与一致性序... 人类P53蛋白是一种通用转录因子,通过调控一系列下游基因的转录来影响许多细胞功能。p53下游基因含有P53蛋白结合序列,收集已报道的63条人类P53蛋白结合序列并与El-Deiry等定义的一致性序列进行比较,发现这些P53蛋白结合序列与一致性序列特征并不严格一致,对这些偏差规律的分析有利于建立p53下游基因预测模型,进而利用计算机方法预测p53下游基因,研究其基因互作网络。 展开更多

关键词 P53基因 p53下游基因 一致性序列

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基于深度学习的第三代基因测序一致性序列生成 被引量：1

3

作者 王水介 周倩 刘贤明 《智能计算机与应用》 2020年第8期118-123,共6页

继人类基因组计划开展以来,基因测序已经广泛影响了生命科学的研究方式。基因组组装是从大量随机测序获得的短片段中重建出基因组长序列的过程,其最终目标是生成完整、准确的一致性序列,为后续多种研究提供可靠的参考基因组。第三代基... 继人类基因组计划开展以来,基因测序已经广泛影响了生命科学的研究方式。基因组组装是从大量随机测序获得的短片段中重建出基因组长序列的过程,其最终目标是生成完整、准确的一致性序列,为后续多种研究提供可靠的参考基因组。第三代基因测序技术可以产生读长达几十kb的片段,其应用极大提高了基因组组装的完整性,但测序的高错误率却限制了最终一致性序列的准确性。本研究提出基于深度学习的一致性序列生成模型,利用人工神经网络提取基因多序列比对结果的结构特征,生成准确率更高的一致性序列。实验表明,该模型针对第三代测序数据可以生成质量较高的一致性序列,并且无需读取测序时的质量值,也不用一次读取超长序列,可以更加灵活地处理小数据块。 展开更多

关键词 第三代基因测序 一致性序列 深度学习 人工神经网络

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测序仪性能评价用脱氧核糖核酸国家参考品的建立

4

作者 曲守方 黄传峰 +2 位作者 孙楠 于婷 黄杰 《中国医药生物技术》 2021年第4期297-301,共5页

目的建立测序仪性能评价用脱氧核糖核酸国家参考品。方法分别将扩增培养后的永生化的人细胞系、培养达到10^(8)数量级的转染HPV11质粒的细菌、大肠杆菌和欧陆森氏菌高GC菌株收集后提取基因组DNA,然后进行DNA浓度测定。接着将人基因组DNA... 目的建立测序仪性能评价用脱氧核糖核酸国家参考品。方法分别将扩增培养后的永生化的人细胞系、培养达到10^(8)数量级的转染HPV11质粒的细菌、大肠杆菌和欧陆森氏菌高GC菌株收集后提取基因组DNA,然后进行DNA浓度测定。接着将人基因组DNA、HPV病毒基因组DNA、大肠杆菌基因组DNA和高GC菌株基因组DNA分别按照20、5、50、50 ng/μl终浓度要求,进行分装,制备国家参考品。在不同的基因测序仪进行上机测序,包括BGISEQ-500、NextSeq CN500、NovaSeq 6000和BioelectronSeq 4000等。构建人全基因组变异标准集和一致性序列。采用不同测序平台进行协作标定,评价变异标准集和一致性序列的适用性。结果制备的国家参考品经不同平台测序后构建了人全基因组变异标准集和一致性序列。经过不同测序平台标定,结果符合人全基因组变异标准集和一致性序列的要求。结论测序仪性能评价用脱氧核糖核酸国家参考品可以用于高通量基因测序仪的性能评价,为产品注册检定及上市后监督管理提供依据。 展开更多

关键词 高通量基因测序仪 测序通量 标准集 一致性序列 单核苷酸多态性 插入缺失

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轮状病毒感染与健康儿童肠道菌群结构的比较 被引量：10

5

作者 杜惠敏 陈颖虹 +3 位作者 陈俊仪 张美玲 赵立平 庞晓燕 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第18期1237-1238,1249,共3页

目的比较轮状病毒(RV)感染与健康儿童肠道菌群结构的差异,为临床治疗提供有价值的参考依据。方法采集20例RV感染及6例健康儿童粪便样品,提取粪便样品中细菌的混合DNA,先通过肠道菌重复性基因内一致性序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)结合... 目的比较轮状病毒(RV)感染与健康儿童肠道菌群结构的差异,为临床治疗提供有价值的参考依据。方法采集20例RV感染及6例健康儿童粪便样品,提取粪便样品中细菌的混合DNA,先通过肠道菌重复性基因内一致性序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)结合分子杂交技术分析两组儿童之间肠道微生物组成的相似性;再扩增粪便样品中菌群的16 S rDNA基因V3区,利用PCR-TGGE技术分析肠道菌群的组成情况,研究两组儿童肠道微生物菌群组成的差异。结果肠道菌群的组成有很强的宿主专一性。RV感染与健康儿童相比,肠道菌群中糖皮质激素(GC)水平较低的细菌明显减少。微生态制剂治疗组温度梯度凝胶电泳(TGGE)条带数有一个逐渐增加的过程。结论轮状病毒感染时,可致患儿肠道菌群紊乱,但用抗生素治疗将更致肠道微生态失调,不利于患儿肠道菌群恢复,建议临床医师在轮状病毒感染时,慎用抗生素。 展开更多

关键词 轮状病毒 肠道菌重复性基因一致性序列-聚合酶链式反应 温度梯度凝胶电泳 肠道菌群

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截形苜蓿生物数据分析平台的构建与应用 被引量：2

6

作者 刘云岩 苏震 +3 位作者 董江丽 申小叶 李道丰 王涛 《草地学报》 CAS CSCD 2006年第3期231-235,共5页

为更有效地利用截形苜蓿(M.truncatula)的表达序列标签和其他公共数据,加快对截形苜蓿功能基因的研究步伐,构建了“M.trunca tula Home”生物数据分析平台,并以此为中心,整合了专门为截形苜蓿定制的电子克隆系统。该数据分析平台具有序... 为更有效地利用截形苜蓿(M.truncatula)的表达序列标签和其他公共数据,加快对截形苜蓿功能基因的研究步伐,构建了“M.trunca tula Home”生物数据分析平台,并以此为中心,整合了专门为截形苜蓿定制的电子克隆系统。该数据分析平台具有序列基本信息查询、电子克隆系统、试验一致性序列动态分类查询的功能。进一步利用“M.truncatula Home”生物数据分析平台大规模预测了截形苜蓿盐胁迫相关基因,从截形苜蓿的36878条试验一致性序列中预测出650条与耐盐相关的序列,为进一步克隆截形苜蓿耐盐相关功能基因奠定了基础。 展开更多

关键词 截形苜蓿 生物数据分析平台 电子克隆 表达序列标签 试验一致性序列

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3种基因分型方法在鲍曼不动杆菌中的应用评价 被引量：2

7

作者 姜飞 邓丽华 +3 位作者 康海泉 赵晓杰 马萍 李洪春 《国际检验医学杂志》 CAS 2015年第9期1195-1197,共3页

目的比较3种基因分型方法在鲍曼不动杆菌中的应用。方法采用琼脂稀释法检测重症监护室（ICU）分离的30株鲍曼不动杆菌的最小抑菌浓度（MIC）;分别以肠杆菌科基因间重复一致性序列（ERIC）、基因外回文重复序列（REP）及随机多态性核苷... 目的比较3种基因分型方法在鲍曼不动杆菌中的应用。方法采用琼脂稀释法检测重症监护室（ICU）分离的30株鲍曼不动杆菌的最小抑菌浓度（MIC）;分别以肠杆菌科基因间重复一致性序列（ERIC）、基因外回文重复序列（REP）及随机多态性核苷酸序列（RAPD）为引物进行PCR扩增,利用电泳指纹图谱进行基因分型,并进行聚类分析。结果 30株鲍曼不动杆菌仅对头孢哌酮/舒巴坦有较低的耐药率;ERIC-PCR基因分型法的扩增条带最为丰富,能扩增出4∽7个条带,RAPD和REP-PCR扩增条带较少,分别扩增出1∽5和1∽4个条带;3种方法分别将30株鲍曼不动杆菌分为4、4、3个群。结论头孢哌酮/舒巴坦对于多重耐药鲍曼不动杆菌依然有较好的敏感性;本试验初步证实3种方法均可作为鲍曼不动杆菌基因分型的可选方法,ERIC-PCR较另外两种方法扩增条带更丰富,分辨率更好。 展开更多

关键词 肠杆菌科基因间重复一致性序列 随机多态性核苷酸序列 基因外回文重复序列 鲍曼不动杆菌 基因分型

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基于黄花蒿低覆盖度高精度基因组SSR分子标记开发 被引量：1

8

作者 贺文瑞 廖保生 +6 位作者 沈晓凤 郭帅 廖雪娇 梁毓 孟莹 徐江 陈士林 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第18期6087-6096,共10页

不同产地黄花蒿品质差异较大,因此开发黄花蒿特异性分子标记对于筛选鉴定优质种源具有重大意义。本研究结合形态标记及化学计量学对相同环境下不同种源黄花蒿的特征进行统计分析;再利用Krait软件对黄花蒿不同覆盖度CCS数据及全基因组进... 不同产地黄花蒿品质差异较大,因此开发黄花蒿特异性分子标记对于筛选鉴定优质种源具有重大意义。本研究结合形态标记及化学计量学对相同环境下不同种源黄花蒿的特征进行统计分析;再利用Krait软件对黄花蒿不同覆盖度CCS数据及全基因组进行SSR位点数据挖掘,使用Primer Premier 3.0软件设计引物,筛选出具有多态性的引物并鉴定种源。结果表明,相同培养环境下黄花蒿的形态特征及有效成分含量具有显著性差异;同时,黄花蒿1X CCS数据能够有效反映基因组SSR的特征,二者的6种SSR重复类型的重复次数集中于5~13次,长度大多分布于10~30 bp。以1X CCS数据筛选出的SSR位点为基础,设计筛选得到373187对引物,随机挑选的20对引物用于有效性检测,14对引物扩增出条带,其中引物S1能在材料间扩增出特异性条带,可用于对不同产地黄花蒿进行区分。本研究以1X CCS数据为基础,开发黄花蒿SSR标记,结合形态学标记及有效成分含量,能够有效区分不同种源的黄花蒿,为黄花蒿遗传多样性分析、资源鉴定保护、基因功能研究等方面提供了丰富的分子标记。另外低覆盖度CCS具有测序量小,无需拼接组装,读长长,精确度较高且成本较低等优势,可作为开发SSR标记的基础数据,为具有超大基因组的物种提供了一种新的思路。 展开更多

关键词 黄花蒿(Artemisia annua Linn.) 基因组 环形一致性序列 SSR分子标记 重复基元

原文传递

耐碳青霉烯铜绿假单胞菌耐药机制和传播机制研究 被引量：2

9

作者 郑芬 芮勇宇 《检验医学与临床》 CAS 2013年第10期1201-1202,共2页

目的阐明南方医科大学南方医院耐碳青霉烯铜绿假单胞菌的耐药机制和传播机制。方法采用聚合酶链反应(PCR)-限制性核酸片段长度多态性分析分型和测序技术对临床分离的59株耐碳青霉烯铜绿假单胞菌进行整合子Ⅰ、插入序列共同区(ISCR1)和... 目的阐明南方医科大学南方医院耐碳青霉烯铜绿假单胞菌的耐药机制和传播机制。方法采用聚合酶链反应(PCR)-限制性核酸片段长度多态性分析分型和测序技术对临床分离的59株耐碳青霉烯铜绿假单胞菌进行整合子Ⅰ、插入序列共同区(ISCR1)和常见碳青霉烯酶基因研究,采用肠杆菌科间重复一致性序列(ERIC)-PCR技术研究传播机制。结果 59株菌株中20株(34%)整合子Ⅰ阳性,17株(29%)整合子Ⅰ可变区阳性;9株(15%)ISCR1阳性,5株(8%)ISCR1可变区阳性且均携带qnrA1和ampR耐药基因盒。1株检出复杂性整合子Ⅰ,3株检出VIM-2基因,2株检出IMP-1基因。ERIC-PCR聚类分析在80%相似水平上聚为52个类群。结论整合子Ⅰ、ISCR1和碳青霉烯酶在铜绿假单胞菌介导多重耐药方面有重要作用,ERIC-PCR是进行铜绿假单胞菌同源性分析的有效方法。 展开更多

关键词 铜绿假单胞菌 整合子 插入序列共同区 碳青霉烯酶 肠杆菌科间重复一致性序列-聚合酶链反应

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背景颜色对一致性序列效应的调节 被引量：1

10

作者 赵晓月 唐丹丹 +1 位作者 谭金凤 陈安涛 《心理科学》 CSSCI CSCD 北大核心 2016年第1期50-55,共6页

背景颜色是一个重要的环境因素,大量研究表明背景颜色影响人的认知和行为表现。然而,背景颜色对认知控制的影响,是一个关键但又被忽略的问题。为了探讨清楚这个问题,本研究采用字母flanker任务,考察了灰色、蓝色和红色三种颜色背景条件... 背景颜色是一个重要的环境因素,大量研究表明背景颜色影响人的认知和行为表现。然而,背景颜色对认知控制的影响,是一个关键但又被忽略的问题。为了探讨清楚这个问题,本研究采用字母flanker任务,考察了灰色、蓝色和红色三种颜色背景条件下的一致性序列效应和干扰效应。结果发现,蓝色背景下的一致性序列效应不显著,而灰色和红色背景下均得到了显著的一致性序列效应。三种颜色背景均出现显著的冲突干扰效应,但它们之间没有显差异。这些结果表明,认知控制的在线调整受蓝色背景的干扰,冲突解决不受背景颜色的影响。本研究首次揭示了背景颜色对认知控制在线调整的影响,也进一步加深了我们对一致性序列效应的理解。 展开更多

关键词 认知控制 一致性序列效应 调节 Flanker任务 背景颜色

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9～10岁儿童和成人的一致性序列效应 被引量：1

11

作者 赵鑫 贾丽娜 周爱保 《心理学报》 CSSCI CSCD 北大核心 2019年第8期914-923,共10页

一致性序列效应是指个体根据前一情境中的冲突信息,灵活适应当前环境的能力.研究选取9~10岁的儿童和18~25岁的成人为被试,采用色词Stroop任务和Stroop与Flanker刺激混合的任务,在控制重复启动的影响后,考察一致性序列效应在不同任务中... 一致性序列效应是指个体根据前一情境中的冲突信息,灵活适应当前环境的能力.研究选取9~10岁的儿童和18~25岁的成人为被试,采用色词Stroop任务和Stroop与Flanker刺激混合的任务,在控制重复启动的影响后,考察一致性序列效应在不同任务中的年龄差异.结果发现,在不同的任务中,儿童和成人均表现出显著的一致性序列效应,且一致性序列效应的大小不存在显著差异.研究结果表明,冲突适应过程涉及更高级的加工过程,9~10岁的儿童已具备类似成人的、更一般化的冲突适应能力. 展开更多

关键词 认知适应 一致性序列效应 色词Stroop任务 Flanker任务

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遗传算法在转录因子结合位点识别中的应用

12

作者 马志强 魏雅卓 +3 位作者 崔颖 马雅楠 孙平平 陆林英 《生物信息学》 2009年第1期72-74,77,共4页

遗传算法是模拟生物进化过程的计算模型,是一种全局优化搜索算法。将遗传算法与转录因子结合位点识别问题相结合的新方法,以一致性序列模型作为保守motif的描述模型,通过对motif序列与待测序列的比对问题进行编码,将其转化成搜索空间中... 遗传算法是模拟生物进化过程的计算模型,是一种全局优化搜索算法。将遗传算法与转录因子结合位点识别问题相结合的新方法,以一致性序列模型作为保守motif的描述模型,通过对motif序列与待测序列的比对问题进行编码,将其转化成搜索空间中的优化问题,利用遗传算法来搜索最优解,预测转录因子的结合位点。实验结果表明,这种新的方法是有效的,它在占用少量内存的情况下能够准确地识别出待测转录因子结合位点。 展开更多

关键词 遗传算法(GA) 转录因子结合位点(TFBS) 一致性序列模型

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一种一致性测试方法在专有通信协议测试中的应用研究

13

作者 张晴 《福建电脑》 2012年第9期122-124,共3页

专有通信协议一致性的实现是保证项目系统通信质量的关键。本文采用有限状态机FSM对通信协议进行建模。并依据产生的UIO序列生成相应的一致性测试序列,并对一个实际项目进行协议的一致性测试,发现使用了一致性测试方法的测试比没有使用... 专有通信协议一致性的实现是保证项目系统通信质量的关键。本文采用有限状态机FSM对通信协议进行建模。并依据产生的UIO序列生成相应的一致性测试序列,并对一个实际项目进行协议的一致性测试,发现使用了一致性测试方法的测试比没有使用此方法的测试更有效。 展开更多

关键词 通信协议 有限状态机FSM UIO序列 一致性测试序列

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计算机网络中通信协议一致性测试技术浅探

14

作者 蓝敏 《科教导刊（电子版）》 2014年第32期135-135,共1页

本文介绍通信协议一致性测试的主要方法和相应的测试过程，同时，概括论述了通信协议的一致性测试体系，详细分析其生成测试序列的常用方法，同时指明了它们之间的关系，为通信协议一致性测试的实施提供指导作用。

关键词 通信协议 一致性测试测试序列

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