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冬小麦抗寒相关microRNA生物信息学预测分析与表达特征的验证 被引量：3
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作者 卢秋巍 徐庆华 +8 位作者 钟昊 苍晶 于晶 郑成成 吴冰 朱会杰 冯明芳 梅琳 孙仙泽 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期747-753,共7页
东北农业大学培育的自主知识产权的冬小麦新品种‘东农冬麦1号’(‘dn1’)是强抗寒(可耐–30℃低温)栽培品种。本研究应用BLAST、UNAFOLD等生物信息学软件从冬小麦EST库中分析和预测抗寒相关miRNA及其靶基因,并利用qRT-PCR技术验证表达... 东北农业大学培育的自主知识产权的冬小麦新品种‘东农冬麦1号’(‘dn1’)是强抗寒(可耐–30℃低温)栽培品种。本研究应用BLAST、UNAFOLD等生物信息学软件从冬小麦EST库中分析和预测抗寒相关miRNA及其靶基因,并利用qRT-PCR技术验证表达丰度高、差异显著的miRNA及其靶基因的表达特性。结果显示:生物信息学软件分析和预测到16条抗寒相关miRNAs,隶属于15个家族、对应137个靶基因;其中miR1118、miR1120、miR1128、miR1133和miR1139表达丰度高、差异显著,上述5个miRNA在–10℃时表达量显著下降、在–25℃时表达量显著升高,但是其相应靶基因在–10℃时表达量显著升高,在–25℃时显著下降。可见,上述5个miRNA及其靶基因响应低温胁迫,与‘dn1’的强抗寒性相关。本研究为冬小麦响应低温胁迫下miRNA调控的分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 '东农冬麦1号’('dn1’) 抗寒性 microRNAs(miRNAs) 生物信息学 表达特性
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