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斜带石斑鱼神经坏死病毒基因组RNA1和RNA2序列测定及分析 被引量：8
1
作者 陈晓艳 翁少萍 +3 位作者 吕玲 黄剑南 殷志新 何建国 《中山大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期73-77,共5页
根据GenBank数据库公布的鱼类神经坏死病毒(nervousnecrosisvirus,NNV)同源序列设计了7对特异性引物,采用RT＿PCR方法扩增出目的片断,将PCR产物测序和分析。斜带石斑鱼Epinepheluscoioides神经坏死病毒(orange＿spottedNNV,OGNNV)基因... 根据GenBank数据库公布的鱼类神经坏死病毒(nervousnecrosisvirus,NNV)同源序列设计了7对特异性引物,采用RT＿PCR方法扩增出目的片断,将PCR产物测序和分析。斜带石斑鱼Epinepheluscoioides神经坏死病毒(orange＿spottedNNV,OGNNV)基因组由两个片断(RNA1和RNA2)组成,RNA1由3103个核苷酸组成,含有一个开放阅读框,编码982个氨基酸;RNA2由1433个核苷酸组成,含有一个开放阅读框,编码338个氨基酸。OGNNV基因组与新加坡GGNNV(greasygrouperNNV)的基因组有高度的相似性。分析病毒的RNA2序列发现:OGNNV与DGNNV(dragongrouperNNV)、RGNNV(redspottedNNV)和GGNNV的亲缘关系很近,并且具有相同的中和位点;分析病毒的RNA1序列,发现在OGNNV的RNA1序列中同样可以找到依赖RNA的RNA聚合酶的6个模序(motif)。根据同源性比较和系统进化分析,OGNNV属于RGNNV血清型的成员。 展开更多
关键词 斜带石斑鱼Epinephelus coioides神经坏死病毒 基因组序列测定与分析 β诺达病毒
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牙鲆(Paralichthys olivaceus)β诺达病毒衣壳蛋白重组表达及复性条件优化 被引量：1
2
作者 蒋嫣冉 张亦陈 +2 位作者 刘逸尘 耿绪云 孙金生 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期370-375,共6页
β诺达病毒利用其缺乏校正功能的聚合酶进行基因组复制,易导致突变,因而具有广泛的宿主感染性,而且可引发致死率极高的病毒性神经坏死症,需要有针对性地研究检测及防御方法。本研究以感染牙鲆(Paralichthys olivaceus)的β诺达病毒为对... β诺达病毒利用其缺乏校正功能的聚合酶进行基因组复制,易导致突变,因而具有广泛的宿主感染性,而且可引发致死率极高的病毒性神经坏死症,需要有针对性地研究检测及防御方法。本研究以感染牙鲆(Paralichthys olivaceus)的β诺达病毒为对象,利用引物设计,将His标签编码序列连接到完整病毒衣壳蛋白C端,构建原核表达载体;采用SDS-PAGE及质谱对表达产物进行分离和鉴定;重组衣壳蛋白经镍离子亲和柱纯化后进行复性条件的正交优化。结果表明4个肽段经质谱鉴定与预期一致;纯化产物产量可达36mg/L;4°C条件下,复性缓冲液中尿素和PBS的最适浓度为0.8mol/L和0.05mol/L。本研究建立的制备方案可为研制相关疫苗以及开发针对该病毒的快速检测产品等提供有价值的参考。 展开更多
关键词 牙鲆 β诺达病毒 重组表达 复性优化
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牙鲆β诺达病毒环介导等温扩增检测方法的建立
3
作者 顾中华 张亦陈 +1 位作者 耿绪云 孙金生 《天津水产》 2012年第1期10-14,共5页
β诺达病毒属于诺达病毒科的β诺达病毒属,可感染数十种养殖鱼类的幼鱼,导致死亡率极高的病毒性神经坏死症,尚无有效防治方法,快速准确诊断是控制该病的关键。本研究建立了基于环介导等温扩增原理的检测方法,并分析了其对多种检测样本... β诺达病毒属于诺达病毒科的β诺达病毒属,可感染数十种养殖鱼类的幼鱼,导致死亡率极高的病毒性神经坏死症,尚无有效防治方法,快速准确诊断是控制该病的关键。本研究建立了基于环介导等温扩增原理的检测方法,并分析了其对多种检测样本的适应性。结果表明,本方法检出限高于灵敏的荧光定量PCR,可达101拷贝;通过将逆转录与等温扩增偶联,实现了在一只检测管中一次加样的快速检测,避免了多次加样引入的干扰;组织粗提液及RNA抽提液样本分别经过102-105和104-107倍稀释后可直接用于病毒检测。 展开更多
关键词 β诺达病毒 病毒性神经坏死症 等温扩增 牙鲆
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