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α类蛋白的构建模式及拓扑结构预测
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作者 李晓琴 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1999年第3期325-328,共4页
给出了α类蛋白的构建规则,指出了螺旋片段的长短是决定相邻两个片段取向的重要原因.讨论了4螺旋束的构建及理论模式,对α类蛋白的分类进行了补充。
关键词 α类蛋白 拓扑结构 二级结构序列 蛋白质 分类
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可溶性凝集素样氧化型低密度脂蛋白受体1和锌指蛋白A20与冠心病的关系 被引量:6
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作者 陈红伟 邢永生 +4 位作者 王志方 杨树涵 刘艳宾 苏淑红 金卫东 《中华老年心脑血管病杂志》 北大核心 2021年第5期475-478,共4页
目的分析血清可溶性凝集素样氧化型低密度脂蛋白受体1(sLOX-1)、锌指蛋白A20水平与冠心病严重程度的关系。方法选取我院2018年2月~2019年12月收治的126例冠心病患者作为冠心病组,选取同期健康体检者50例作为对照组;采集2组研究对象的外... 目的分析血清可溶性凝集素样氧化型低密度脂蛋白受体1(sLOX-1)、锌指蛋白A20水平与冠心病严重程度的关系。方法选取我院2018年2月~2019年12月收治的126例冠心病患者作为冠心病组,选取同期健康体检者50例作为对照组;采集2组研究对象的外周血,酶联免疫吸附法测定血清sLOX-1、锌指蛋白A20水平。结果冠心病组血清sLOX-1、锌指蛋白A20信使核糖核酸(mRNA)表达水平均高于对照组[(1652.63±246.82)ng/L vs(652.48±114.05)ng/L,0.20±0.03 vs 0.06±0.02,P<0.01]。与单支病变比较,双支病变、多支病变患者血清sLOX-1、锌指蛋白A20 mRNA表达水平均显著增高,多支病变高于双支病变,差异有统计学意义(P<0.01);ACS患者血清sLOX-1、锌指蛋白A20 mRNA表达水平高于稳定性心绞痛患者(P<0.01)。logistic回归分析显示,血清sLOX-1、锌指蛋白A20水平与冠心病严重程度呈正相关(OR=2.368,95%CI:1.002~5.439,P=0.024;OR=2.126,95%CI:0.985~4.813,P=0.036)。结论血清sLOX-1、锌指蛋白A20水平与冠心病患者冠状动脉病变程度密切相关,可能参与了冠状动脉粥样硬化斑块的发生、发展。 展开更多
关键词 清道夫受体 E类 肿瘤坏死因子α诱导蛋白3 冠心病 酶联免疫吸附测定 动脉粥样硬化 RNA 信使
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α/β类蛋白的构建模式及拓扑结构预测 被引量:3
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作者 李晓琴 罗辽复 杨笛 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1998年第3期349-353,共5页
讨论了α/β类蛋白的构建模式及拓扑分类;根据二级结构序列给出了α/β类蛋白拓扑结构预测的简明规则,预测成功率在80%以上.
关键词 α/β类蛋白 二级结构序列 拓扑结构 蛋白质
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新型多功能蛋白家族DABB类蛋白研究进展 被引量:1
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作者 麦麦提艾力·阿卜杜纳斯尔 马纪 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期5460-5472,共13页
DABB类蛋白含有1~2个二聚化α+β桶状结构域(dimeric α+β barreldomain,DABB)。DABB结构域最早在嗜氢菌的果糖1,6二磷酸醛缩酶的C端和盐胁迫下胡杨的热休克蛋白(Hsp90)、羟脯氨酸糖蛋白(HRGP)中发现。目前报道的该类蛋白主要存在于植... DABB类蛋白含有1~2个二聚化α+β桶状结构域(dimeric α+β barreldomain,DABB)。DABB结构域最早在嗜氢菌的果糖1,6二磷酸醛缩酶的C端和盐胁迫下胡杨的热休克蛋白(Hsp90)、羟脯氨酸糖蛋白(HRGP)中发现。目前报道的该类蛋白主要存在于植物、细菌和真菌中,在动物中尚无报道。在植物中,DABB类蛋白与植物抵御多种病原真菌入侵和非生物胁迫相关。在微生物中,DABB类蛋白主要参与氧化还原相关的代谢过程。目前,关于DABB结构域的具体功能仍不清楚,尚无关于DABB类蛋白的综述文献,本综述从含有此结构域的DABB类蛋白的物种来源、DABB结构域的特点及其保守氨基酸、DABB类蛋白的系统进化等方面,对植物和细菌DABB类蛋白的研究现状进行了总结,并对该类蛋白的研究与应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 DABB类蛋白 α+β桶状结构域 单加氧酶 胁迫响应 抗真菌
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基本螺旋-环-螺旋家族成员a15通过Ⅺ型胶原蛋白α1链基因调控胰腺癌细胞增殖、侵袭与转移
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作者 孙莹 李扬 +2 位作者 刘志强 李永峰 勾善淼 《中华实验外科杂志》 CAS 北大核心 2022年第8期1527-1530,共4页
目的探讨Ⅺ型胶原蛋白α1链(COL11A1)基因是否为基本螺旋-环-螺旋家族成员a15(MIST1)调控胰腺癌细胞增殖、侵袭与转移的关键靶基因。方法采用Chip-seq(染色质免疫沉淀-测序)筛选MIST1在胰腺癌中的候选靶基因得到COL11A1基因;采用反转录... 目的探讨Ⅺ型胶原蛋白α1链(COL11A1)基因是否为基本螺旋-环-螺旋家族成员a15(MIST1)调控胰腺癌细胞增殖、侵袭与转移的关键靶基因。方法采用Chip-seq(染色质免疫沉淀-测序)筛选MIST1在胰腺癌中的候选靶基因得到COL11A1基因;采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)对过表达MIST1的胰腺癌细胞进行验证MIST1对COL11A1基因的调控作用;采用染色质免疫共沉淀技术(ChIP)和双荧光素酶报告基因实验明确MIST1和COL11A1的结合域;Transwell实验(侵袭实验)、细胞划痕实验、四唑盐比色法(MTT)、细胞集落形成实验和动物实验研究COL11A1的表达对胰腺癌细胞生物学行为的影响;收集胰腺癌和癌旁组织样本, 通过RT-qPCR和Western blot研究其COL11A1的mRNA和蛋白表达水平;用癌症基因组图谱(TCGA)来评估COL11A1的表达对胰腺癌患者预后的影响。组间比较采用t检验或方差分析。结果对TCGA胰腺癌数据根据COL11A1表达水平分组后生存分析显示高COL11A1表达与胰腺癌预后不良呈正相关[风险比(HR)=2.30, P<0.05];MIST1的-N端与COL11A1启动子相互作用并抑制其转录, MIST1-N端突变后诱发的荧光酶活性(1.08±0.22)与对照组(1.00±0.00)比较, 差异无统计学意义(t=0.608, P>0.05);Transwell实验显示COL11A1敲低组在PANC-1、BxPC-3和SW1990细胞系中细胞穿膜数为(98.33±9.56)、(95.00±8.67)、(104.00±11.73)个/视野, 均低于对照组[(562.00±37.33)、(793.67±67.29)、(504.00±37.39)个/视野, t=20.841、17.836、17.680, P<0.01];细胞划痕实验显示COL11A1敲低组划痕愈合率为(63.39±5.71)%、(49.66±4.22)%、(53.33±8.92)%, 低于对照组[(89.42±4.25)%、(78.39±7.73)%、(82.98±7.09)%, t=6.334、5.847、4.507, P<0.01];MTT测定和集落形成实验结果显示COL11A1敲低组集落形成个数为(19.00±4.55)、(41.00±7.33)、(21.33±4.07)/个, 低于对照组[(43.33±9.27)、(87.67±10.39)、(69.00±9.85)/个, t=4.080、6.357、7.747, P<0.05] 展开更多
关键词 Ⅺ型胶原蛋白α1链 A类碱性螺旋-环-螺旋蛋白15 上皮-间充质转化 胰腺癌
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