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Tumor gene mutations and messenger RNA expression: correlation with clinical response to icotinib hydrochloride in non-small cell lung cancer 被引量:30
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作者 REN Guan-jun ZHAO Yuan-yua +4 位作者 ZHU Yu-jia XIAO Yi XU Jia-sen SHAN Bin ZHANG Li 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2011年第1期19-25,共7页
Background Molecular targeted drugs is now widely used in non-small cell lung cancer (NSCLC) clinical treatment. Icotinib hydrochloride is a new type of oral epidermal growth factor receptor (EGFR) tyrosine kinase... Background Molecular targeted drugs is now widely used in non-small cell lung cancer (NSCLC) clinical treatment. Icotinib hydrochloride is a new type of oral epidermal growth factor receptor (EGFR) tyrosine kinase inhibitors (EGFR-TKIs). In this study, we examined the role of EGFR, K-RAS, B-RAF somatic mutations and EGFR mRNA expression in tumor specimens from advanced NSCLC patients as predicators of the efficacy of icotinib hydrochloride. Methods We analyzed tumor paraffin-embedded specimens, which were obtained from 14 of 40 patients with advanced NSCLC who enrolled in the stage I clinical trial of icotinib hydrochloride. Somatic mutations were evaluated by mutant-enriched liquidchip (MEL) technology, and EGFR mRNA expression was measured by branched DNA liquidchip (MBL) technology. Results In the 14 specimens, seven patients showed EGFR mutations, exon 19 deletion (3/7) and exon 21 point mutation (4/7); and two patients showed K-RAS mutation. No mutations in EGFR exon 20. or B-RAF were detected. In patients with EGFR mutation, one patient developed progress disease (PD), three patients had stable disease (SD), two patients had partial responses (PR) and one patient had a complete response (CR). In patients with wild-type EGFR, four patients had PD, three patients acquired SD, and none had PR/CR (P=-0.0407). EGFR mutations were associated with better progress-free survival (PFS) (141 days vs. 61 days) but without a statistically significant difference (P=0.8597), and median overall survival (OS) (-〉449 days vs. 140 days). EGFR mRNA expression levels were evaluated (three high, eight moderate, one low, and two that can not be measured due to insufficient tumor tissue) and no statistically significant relationships was observed with response, PFS or OS. Conclusions The EGFR mutation rate was consistent with that reported in the Asian population, so the MEL technology is reliable for measuring EGFR mutation with high throughput and rapidity 展开更多
关键词 non-small cell lung cancer icotinib hydrochloride epidermal growth factor receptor somatic mutation messenger rna
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Stem cell-derived exosomes as a therapeutic tool for cardiovascular disease 被引量:20
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作者 Etsu Suzuki Daishi Fujita +2 位作者 Masao Takahashi Shigeyoshi Oba Hiroaki Nishimatsu 《World Journal of Stem Cells》 SCIE CAS 2016年第9期297-305,共9页
Mesenchymal stem cells(MSCs) have been used to treat patients suffering from acute myocardial infarction(AMI) and subsequent heart failure. Although it was originally assumed that MSCs differentiated into heart cells ... Mesenchymal stem cells(MSCs) have been used to treat patients suffering from acute myocardial infarction(AMI) and subsequent heart failure. Although it was originally assumed that MSCs differentiated into heart cells such as cardiomyocytes, recent evidence suggests that the differentiation capacity of MSCs is minimal and that injected MSCs restore cardiac function via the secretion of paracrine factors. MSCs secrete paracrine factors in not only naked forms but also membrane vesicles including exosomes containing bioactive substances such as proteins, messenger RNAs, and microR NAs. Although the details remain unclear, these bioactive molecules are selectively sorted in exosomes that are then released from donor cells in a regulated manner. Furthermore, exosomes are specifically internalized by recipient cells via ligand-receptor interactions. Thus, exosomes are promising natural vehicles that stably and specifically transport bioactive molecules to recipient cells. Indeed, stem cell-derived exosomes have been successfully used to treat cardiovascular disease(CVD), such as AMI, stroke, and pulmonary hypertension, in animal models, and their efficacy has been demonstrated. Therefore, exosome administration may be a promising strategy for the treatment of CVD. Furthermore, modifications of exosomal contents may enhance their therapeutic effects. Future clinical studies are required to confirm the efficacy of exosome treatment for CVD. 展开更多
关键词 EXOSOMES messenger rna Cardiovascular disease MESENCHYMAL STEM CELLS STEM CELLS Microrna
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应用信使核糖核酸差异显示研究中医肝阳上亢、肝阳化风证的基因表达 被引量:11
3
作者 王光平 金益强 鄢东红 《湖南中医学院学报》 2001年第1期6-8,共3页
为探讨肝阳上亢、肝阳化风两证的分子机理,应用信使核糖核酸(mRNA)差异显示技术,研究了两证患者与正常受试者的基因表达情况。结果显示:使用15种不同的引物组合,聚丙烯酰胺凝胶电泳,放射自显影后,有28条区带呈现不同的... 为探讨肝阳上亢、肝阳化风两证的分子机理,应用信使核糖核酸(mRNA)差异显示技术,研究了两证患者与正常受试者的基因表达情况。结果显示:使用15种不同的引物组合,聚丙烯酰胺凝胶电泳,放射自显影后,有28条区带呈现不同的表达。其中,肝阳上亢患者与正常受试者之间有14条区带表现不同的表达,肝阳化风患者与正常受试者之间有11条区带表达具有差异,而肝阳上亢患者与肝阳化风患者有6条区带表现不同的基因表达。在肝阳上亢患者、肝阳化风患者与正常受试者之间,大部分不同表达的基因其表达为降低。这些结果初步表明,肝阳上亢患者、肝阳化风患者与正常受试者之间存在基因表达的改变;肝阳上亢患者与肝阳化风患者之间也存在基因表达的差别。 展开更多
关键词 肝阳上亢 肝阳化风 信使核糖核酸 差异显示 基因表达
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mRNA的序列、结构以及翻译速率与蛋白质结构的关系 被引量:13
4
作者 柳树群 刘次全 《Zoological Research》 CAS CSCD 1999年第6期457-461,共5页
mRNA所包含的核苷酸序列通过三联体密码子决定了蛋白质的氨基酸序列。但是, 由于对氨基酸同义密码使用频率上的差异, 密码子与反密码子相互作用效率上的不同, 以及密码子上下文关系和mRNA 不同区域二级结构上的差异, 造成了核糖体对mRNA... mRNA所包含的核苷酸序列通过三联体密码子决定了蛋白质的氨基酸序列。但是, 由于对氨基酸同义密码使用频率上的差异, 密码子与反密码子相互作用效率上的不同, 以及密码子上下文关系和mRNA 不同区域二级结构上的差异, 造成了核糖体对mRNA 不同区域翻译速度上的差异, 加之共翻译折叠的作用, 使得mRNA 的序列和结构影响着蛋白质空间结构的形成。 展开更多
关键词 Mrna 翻译速率 共翻译折叠 蛋白质结构 序列
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Use of blood-based biomarkers for early diagnosis and surveillance of colorectal cancer 被引量:11
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作者 Ganepola AP Ganepola Joel Nizin +1 位作者 John R Rutledge David H Chang 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE CAS 2014年第4期83-97,共15页
Early screening for colorectal cancer(CRC) holds the key to combat and control the increasing global burden of CRC morbidity and mortality. However, the current available screening modalities are severely inadequate b... Early screening for colorectal cancer(CRC) holds the key to combat and control the increasing global burden of CRC morbidity and mortality. However, the current available screening modalities are severely inadequate because of their high cost and cumbersome preparatory procedures that ultimately lead to a low participation rate. People simply do not like to have colonoscopies. It would be ideal, therefore, to develop an alternative modality based on blood biomarkers as the first line screening test. This will allow for the differentiation of the general population from high risk individuals. Colonoscopy would then become the secondary test, to further screen the high risk segment of the population. This will encourage participation and therefore help to reach the goal of early detection and thereby reduce the anticipated increasing global CRC incidence rate. A blood-based screening test is anappealing alternative as it is non-invasive and poses minimal risk to patients. It is easy to perform, can be repeated at shorter intervals, and therefore would likely lead to a much higher participation rate. This review surveys various blood-based test strategies currently under investigation, discusses the potency of what is available, and assesses how new technology may contribute to future test design. 展开更多
关键词 Colorectal neoplasms Early detection of cancer Colonoscopy Biological markers BLOOD messenger rna Microrna Long NON-CODING rna DNA methylation Microsatellite instability Loss of HETEROZYGOSITY High-throughput NUCLEOTIDE sequencing Mass spectrometry Real-time polymerase chain reaction Microarray analysis
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急性缺血性中风阴阳类证的血清转录组学特征分析 被引量:11
6
作者 刘文琛 李国铭 +5 位作者 何春华 乔利军 申昕 程骁 蔡业峰 黄燕 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第15期122-130,共9页
目的:筛选急性缺血性中风阴类证、阳类证患者血清的差异表达长链非编码核糖核酸(lncRNA),微小RNA(miRNA),信使RNA(mRNA),获取基因间调控关系,从转录组学层面探讨急性缺血性中风阴类证、阳类证形成的物质基础与生物学机制。方法:使用lncR... 目的:筛选急性缺血性中风阴类证、阳类证患者血清的差异表达长链非编码核糖核酸(lncRNA),微小RNA(miRNA),信使RNA(mRNA),获取基因间调控关系,从转录组学层面探讨急性缺血性中风阴类证、阳类证形成的物质基础与生物学机制。方法:使用lncRNA,mRNA及miRNA芯片微阵列,分别检测急性缺血性中风阴类证、阳类证与非中风受试者(各10例)血清中lncRNA,miRNA与mRNA的表达情况,通过联合分析,筛选出阴类证、阳类证相关的差异表达谱。对获得的差异基因进行反义lncRNA与mRNA共表达分析、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能通路分析,获取基因间调控关系,预测lncRNA的靶基因。对40例(阳类证10例,阴类证30例)样本中部分差异基因进行实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)验证。结果:227个lncRNA,54个mRNA,4个miRNA的表达与阳类证密切相关,394个lncRNA,206个mRNA的表达和阴类证密切相关。阳类证组中反义lncRNA RP11-647P12. 1和RP11-677M14. 2可能通过上调表达水平,分别调控神经元衍生神经营养因子(NDNF)和神经颗粒素(NRGN)的基因表达。通路富集显示,阴类证、阳类证之间转录组表达谱差异主要与血压调节、神经递质受体活性调节、内分泌激素调节、炎症反应、肾素-血管紧张素系统等通路相关。结论:急性缺血性中风阴类证、阳类证的lncRNA,miRNA,mRNA表达谱存在差异,阴、阳类证的表型差异可能由血压调节、肾上腺素能受体调节、肾素-血管紧张素系统以及γ-氨基丁酸(GABA)等多个通路的共同参与。转录组学特征为研究急性缺血性中风阴类证、阳类证的生物学基础提供了一定的科学依据。 展开更多
关键词 急性缺血性中风 阴类证 阳类证 长链非编码rna 微小rna 信使rna 转录组学
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不同强度运动后大鼠心肌细胞热休克蛋白72mRNA的表达 被引量:11
7
作者 陈佩杰 魏勇杨 德洪 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期624-628,共5页
目的 :探讨不同运动强度和持续时间运动对大鼠心肌细胞热休克蛋白 72mRNA表达的影响。方法 :分别使SD大鼠进行低强度 (6 0 %VO2 max)、中等强度 (75 %VO2 max)和高强度 (85 %VO2 max)跑台运动 1天、2天和 3天 ,在末次运动结束后 2 4小时... 目的 :探讨不同运动强度和持续时间运动对大鼠心肌细胞热休克蛋白 72mRNA表达的影响。方法 :分别使SD大鼠进行低强度 (6 0 %VO2 max)、中等强度 (75 %VO2 max)和高强度 (85 %VO2 max)跑台运动 1天、2天和 3天 ,在末次运动结束后 2 4小时以RT -PCR法检测大鼠心肌细胞热休克蛋白 72mRNA的表达。结果 :在安静情况下大鼠心肌细胞存在HSP72mRNA的基础结构性表达 ;低强度运动 1天后心肌细胞HSP72mRNA表达与对照组相比无显著性差异 ,但随着运动时间的延长 ,HSP72mRNA表达逐渐增加 ;中等强度运动后心肌细胞HSP72mRNA表达随运动持续时间的延长显著增加 ,但运动 2天和 3天组表达量无显著性差异 ;大强度运动后心肌细胞HSP72mRNA表达随运动持续时间的延长显著增加。结论 :运动可以造成心肌细胞HSP72mRNA的表达增加 ,不同强度运动诱导心肌细胞HSP 72mRNA表达程度不同 ,且与运动持续时间存在内在关系。 展开更多
关键词 热休克蛋白 运动 心肌细胞 信使核糖核酸
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Biomedical applications of mRNA nanomedicine 被引量:11
8
作者 Qingqing Xiong Gha Young Lee +2 位作者 Jianxun Ding Wenliang Li Jinjun Shi 《Nano Research》 SCIE EI CAS CSCD 2018年第10期5281-5309,共29页
As an attractive alternative to plasmid DNA, messenger RNA (mRNA) has recently emerged as a promising class of nucleic acid therapeutics for biomedical applications. Advances in addressing the inherent shortcomings ... As an attractive alternative to plasmid DNA, messenger RNA (mRNA) has recently emerged as a promising class of nucleic acid therapeutics for biomedical applications. Advances in addressing the inherent shortcomings of mRNA and in the development of nanoparticle-based delivery systems have prompted the development and clinical translation of mRNA-based medicines. In this review, we discuss the chemical modification strategies of mRNA to improve its stability, minimize immune responses, and enhance translational efficacy. We also highlight recent progress in nanoparticle-based mRNA delivery. Considerable attention is given to the increasingly widespread applications of mRNA nanomedicine in the biomedical fields of vaccination, protein-replacement therapy, gene editing, and cellular reprogramming and engineering. 展开更多
关键词 messenger rna chemical modification NANOPARTICLE VACCINATION gene editing protein-replacement cellular reprogramming and engineering
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不同周期运动后大鼠心肌细胞热休克蛋白72 mRNA的表达 被引量:7
9
作者 魏勇 陈佩杰 杨德洪 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期129-132,共4页
目的 :探讨不同周期运动对大鼠心肌细胞热休克蛋白 72mRNA表达的影响。方法 :以不同周期跑台运动为运动模式 ,观察了一周运动、二周运动和三周运动后 2 4h大鼠心肌细胞热休克蛋白 72mRNA的表达。结果 :安静对照组大鼠心肌细胞存在HSP72m... 目的 :探讨不同周期运动对大鼠心肌细胞热休克蛋白 72mRNA表达的影响。方法 :以不同周期跑台运动为运动模式 ,观察了一周运动、二周运动和三周运动后 2 4h大鼠心肌细胞热休克蛋白 72mRNA的表达。结果 :安静对照组大鼠心肌细胞存在HSP72mRNA的基础结构性表达 ;一周运动后大鼠心肌细胞HSP72mRNA表达明显增多 ,两周运动后HSP72mRNA表达较一周运动稍减少 ,但无统计学意义 ;三周运动后大鼠心肌细胞HSP72mRNA表达较运动一、二周减少 ,且存在显著性差异。结论 :运动可以造成心肌细胞HSP72mRNA的表达增加 ,长时间规律运动可以使HSP72mRNA表达在细胞中累积 。 展开更多
关键词 心肌细胞 热休克蛋白 运动 信使核糖核酸 动物实验
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Expression signatures of long non-coding RNA and mRNA in human traumatic brain injury 被引量:8
10
作者 Li-Xiang Yang Li-Kun Yang +3 位作者 Jie Zhu Jun-Hui Chen Yu-Hai Wang Kun Xiong 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期632-641,共10页
Long non-coding RNAs(lncRNAs) play a key role in craniocerebral disease, although their expression profiles in human traumatic brain injury are still unclear. In this regard, in this study, we examined brain injury ti... Long non-coding RNAs(lncRNAs) play a key role in craniocerebral disease, although their expression profiles in human traumatic brain injury are still unclear. In this regard, in this study, we examined brain injury tissue from three patients of the 101 st Hospital of the People's Liberation Army, China(specifically, a 36-year-old male, a 52-year-old female, and a 49-year-old female), who were diagnosed with traumatic brain injury and underwent brain contusion removal surgery. Tissue surrounding the brain contusion in the three patients was used as control tissue to observe expression characteristics of lncRNAs and mRNAs in human traumatic brain injury tissue. Volcano plot filtering identified 99 lncRNAs and 63 mRNAs differentially expressed in frontotemporal tissue of the two groups(P < 0.05, fold change > 1.2). Microarray analysis showed that 43 lncRNAs were up-regulated and 56 lncRNAs were down-regulated. Meanwhile, 59 mRNAs were up-regulated and 4 mRNAs were down-regulated. Gene Ontology(GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG) analyses revealed 27 signaling pathways associated with target genes and, in particular, legionellosis and influenza A signaling pathways. Subsequently, a lncRNA-gene network was generated, which showed an absolute correlation coefficient value > 0.99 for 12 lncRNA-mRNA pairs. Finally, quantitative real-time polymerase chain reaction confirmed different expression of the five most up-regulated mRNAs within the two groups, which was consistent with the microarray results. In summary, our results show that expression profiles of mRNAs and lncRNAs are significantly different between human traumatic brain injury tissue and surrounding tissue, providing novel insight regarding lncRNAs' involvement in human traumatic brain injury. All participants provided informed consent. This research was registered in the Chinese Clinical Trial Registry(registration number: ChiCTR-TCC-13004002) and the protocol version number is 1.0. 展开更多
关键词 nerve REGENERATION HUMAN TRAUMATIC brain injuries long noncoding rna messenger rna GO ANALYSIS real-time quantitative POLYMERASE chain reaction biomarkers microarray ANALYSIS biological processes medical informatics neural REGENERATION
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不同运动强度对大鼠骨骼肌中低氧诱导因子-1αmRNA表达的影响 被引量:5
11
作者 张幸 余斌 蔡保塔 《中华创伤骨科杂志》 CAS CSCD 2006年第5期453-457,共5页
目的探讨不同运动强度和持续时间对大鼠腓肠肌中低氧诱导因子-1α(HIF-1α)mRNA表达的影响。方法80只大鼠随机分为对照组、低强度运动组、中强度运动组和高强度运动组,各组又按时间(1、3、7、14d)分为四个亚组,运用透射电镜观察大鼠骨... 目的探讨不同运动强度和持续时间对大鼠腓肠肌中低氧诱导因子-1α(HIF-1α)mRNA表达的影响。方法80只大鼠随机分为对照组、低强度运动组、中强度运动组和高强度运动组,各组又按时间(1、3、7、14d)分为四个亚组,运用透射电镜观察大鼠骨骼肌细胞和RT-PCR法测定大鼠腓肠肌中HIF-1αmR-NA的表达。结果对照组HIF-1αmRNA存在基础性表达。与对照组HIF-1αmRNA的表达相比:低强度运动组第7天差异有显著性意义(P<0.05);中强度运动组和高强度运用组与对照组比较第3天和第7天差异均有显著性意义(P<0.05);但在第3天和第7天各不同强度运动组之间差异无显著性意义(P>0.05);各组第14天后HIF-1αmRNA表达与对照组相比差异均无显著性意义(P>0.05)。电镜结果提示:高强度运动组肌丝排列紊乱,线粒体肿胀明显,部分空泡化。结论运动会在一定时间内造成大鼠骨骼肌HIF-1αmRNA表达增加,是其适应机制之一;但不同运动强度诱导HIF-1αmRNA表达无显著性差异;长时间高强度运动会对骨骼肌细胞造成损害。 展开更多
关键词 低氧诱导因子1Α 运动 骨骼肌 信使核糖核酸
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长链非编码RNA的竞争性内源RNA调控模式在动脉粥样硬化中的研究进展 被引量:6
12
作者 韩爽 陈宇 张伟丽 《中国动脉硬化杂志》 CAS 2021年第3期185-192,共8页
动脉粥样硬化是一种缓慢进行性的血管炎症性病变。越来越多的研究表明长链非编码RNA(lncRNA)作为竞争性内源RNA(ceRNA)与微小RNA(miRNA)结合,通过ceRNA网络调控靶基因信使RNA(mRNA)分子的表达水平和功能,在动脉粥样硬化的病理生理过程... 动脉粥样硬化是一种缓慢进行性的血管炎症性病变。越来越多的研究表明长链非编码RNA(lncRNA)作为竞争性内源RNA(ceRNA)与微小RNA(miRNA)结合,通过ceRNA网络调控靶基因信使RNA(mRNA)分子的表达水平和功能,在动脉粥样硬化的病理生理过程中发挥重要作用。lncRNA、miRNA和mRNA之间的互作调控机制复杂。本文综述了lncRNA-miRNA-mRNA调控网络在动脉粥样硬化发病机制中的调控关系,阐述该调控网络在内皮细胞功能障碍、血管平滑肌细胞表型转化、巨噬细胞激活以及脂质代谢异常等病变中的重要作用,为动脉粥样硬化临床诊疗提供新思路。 展开更多
关键词 长链非编码rna 竞争性内源rna 微小rna 信使rna 动脉粥样硬化
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二氢青蒿素促进IL-2产生及其mRNA表达(英文) 被引量:7
13
作者 杨四旬 谢蜀生 +2 位作者 马大龙 高汉林 龙振洲 《中国药理学报》 CSCD 1994年第6期515-520,共6页
应用细胞培养及分子杂交技术研究了二氢青蒿素(DHA)的免疫调节作用。结果发现,DHA明显促进ConA诱导的脾细胞增殖,增强小鼠脾细胞及T细胞株LBRM产生IL-2及其mRNA表达。而在相同浓度范围内对转化的T细胞及LPS诱导的淋巴细胞增殖无明显影... 应用细胞培养及分子杂交技术研究了二氢青蒿素(DHA)的免疫调节作用。结果发现,DHA明显促进ConA诱导的脾细胞增殖,增强小鼠脾细胞及T细胞株LBRM产生IL-2及其mRNA表达。而在相同浓度范围内对转化的T细胞及LPS诱导的淋巴细胞增殖无明显影响。结果提示,DHA的促IL-2产生及促淋巴细胞增殖作用可能由不同途径介导。 展开更多
关键词 二氢青蒿素 白细胞介素2 Mrna
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十二指肠和小肠肿瘤P27mRNA,PTENmRNA表达及意义 被引量:8
14
作者 刘国利 杨竹林 徐扬 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 2002年第1期18-20,共3页
研究十二指肠和小肠良恶性肿瘤组织中P2 7mRNA ,PTENmRNA表达及临床病理学意义。方法 :标本经 10 %福尔马林固定 ,常规石蜡包埋后连续切片 ,P2 7mRNA和PTENmRNA染色方法为原位杂交染色法。结果 :4 4例腺癌P2 7mRNA和PTENmRNA阳性率 (5 2... 研究十二指肠和小肠良恶性肿瘤组织中P2 7mRNA ,PTENmRNA表达及临床病理学意义。方法 :标本经 10 %福尔马林固定 ,常规石蜡包埋后连续切片 ,P2 7mRNA和PTENmRNA染色方法为原位杂交染色法。结果 :4 4例腺癌P2 7mRNA和PTENmRNA阳性率 (5 2 % ,5 7% )明显地低于 10例腺瘤 (90 % ,90 % ) ,P2 7mRNA和PTENmRNA阴性病例均为同 1例腺上皮呈重度不典型增生腺瘤。组织学分级Ⅰ级、癌细胞未侵袭肌层 +浅肌层、肿块最大径≤ 3cm和淋巴结未转移病例P2 7mRNA、PTENmRNA阳性率明显高于组织学分级Ⅲ级、癌细胞侵袭深肌层 +浆膜层、肿块最大径 >3cm和淋巴结转移病例。P2 7mRNA和PTENmRNA在腺癌中表达无明显相互关系。结论 :P2 7mRNA和PTENmRNA表达与十二指肠和小肠癌发生发展、生物学行为、转移发生及预后有密切关系 ,检测十二指肠和小肠良性病变P2 7mRNA或 /和PTENmRNA表达对预防和早期发现恶性肿瘤可能有重要临床应用意义。 展开更多
关键词 十二指肠肿瘤 小肠肿瘤 肿瘤抑制基因类 信使rna 杂交染色
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应用mRNA差异显示技术克隆新的肝癌相关基因的研究 被引量:8
15
作者 王征旭 曾锦章 +2 位作者 洪毅 吴孟超 王红阳 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期413-415,共3页
目的 研究和克隆新的肝癌相关基因 ,探讨肝癌发生的分子学基础。方法 采用mRNA差异显示技术 (DDPCR)和逆转录聚合酶链式反应、测序等方法 ,分析 2对肝细胞癌和癌旁组织基因表达差异情况 ,并用Northern印迹杂交的方法 ,分析所获得的基... 目的 研究和克隆新的肝癌相关基因 ,探讨肝癌发生的分子学基础。方法 采用mRNA差异显示技术 (DDPCR)和逆转录聚合酶链式反应、测序等方法 ,分析 2对肝细胞癌和癌旁组织基因表达差异情况 ,并用Northern印迹杂交的方法 ,分析所获得的基因片段在 12对肝细胞癌和癌旁组织中的表达。结果 使用 5条上游引物、4条下游引物 ,从 2对肝癌和癌旁组织中获得 6个新的肝癌组织高表达基因片段STW 1、STW 2、STW 3、STW 4、STW 5和STW 6 ,其在肝癌组织中表达的阳性率分别是 :83 .3% (10 /12 )、6 6 .7% (8/12 )、5 0 .0 % (6 /12 )、83 .3 % (10 /12 )、5 8.3% (7/12 )和 6 6 .7%(8/12 ) ,且所分析的 12对肝癌组织都存在 2种以上的新基因片段表达。结论 用DDPCR技术获得6个新的肝癌差异表达基因片段 ,说明肝癌的发生、发展是多基因参与的复杂过程。 展开更多
关键词 肝细胞癌 基因表达 Mrna 克隆 DDPCR
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荧光定量RT-PCR法监测肺癌患者化疗前后外周血淋巴细胞mdr1 mRNA的变化 被引量:7
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作者 王梅 葛明建 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第19期1979-1982,共4页
目的检测肺癌患者化疗前后外周血淋巴细胞(PBL)中多药耐药基因(mdr1)表达水平,探讨其与化疗疗效的相互关系。方法分别于化疗开始前及化疗周期结束后第3周收集肺癌患者(n=32)外周血标本。采集标本的同时行胸片或胸部CT扫描,并计算肿瘤最... 目的检测肺癌患者化疗前后外周血淋巴细胞(PBL)中多药耐药基因(mdr1)表达水平,探讨其与化疗疗效的相互关系。方法分别于化疗开始前及化疗周期结束后第3周收集肺癌患者(n=32)外周血标本。采集标本的同时行胸片或胸部CT扫描,并计算肿瘤最大径及垂直径的乘积。运用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(fqRT-PCR)法检测PBL中mdr1基因的表达。结果与化疗前相比,化疗后PBL中mdr1 mRNA水平上升显著[(3.881 8±0.828 0)与(4.3166±0.923 1),t=-4.207,P=0.000]。化疗前后外周血mdr1 mRNA水平变化与肿瘤大小改变间亦存在负相关关系(r=-0.389,P=0.028)。化疗前小细胞肺癌(SCLC)与非小细胞肺癌(NSCLC)患者PBL中mdr1转录本水平间存在显著性差异,SCLC明显低于NSCLC[(2.831 4±0.398 4)与(4.231 9±0.603 4),t=6.101,P=0.000]。结论NSCLC及SCLC在化疗耐药机制上可能存在差异性。检测患者化疗前后PBL中mdr1 mRNA水平对判定化疗疗效有一定的指导意义,可在一定程度上指导化疗方案的修订。 展开更多
关键词 肺肿瘤 血液 聚合酶链反应 药物耐受性 信使rna 化学疗法
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精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA筛选及核心竞争性内源RNA网络构建
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作者 王艺梦 邰旭光 +3 位作者 李小龙 刘鹏 王越 祁冬冬 《山东医药》 CAS 2024年第33期30-34,共5页
目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研... 目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研究对象的外周血,提取总RNA后构建cDNA文库并进行高通量测序,采用R软件筛选精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA。采用miRanda和qTar数据库共同预测与差异表达miRNA相互作用的circRNA和mRNA,与差异表达的circRNA、mRNA取交集后,采用R软件构建差异表达的ceRNA网络。基于DAVID数据库对精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA进行GO和KEGG富集分析。采用string数据库构建精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA之间的PPI网络,选用cytoscape软件中cytoHubba插件筛选影响精神分裂症发生发展的核心mRNA,选择与核心mRNA存在相互作用关系的miRNA和circRNA构建精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络。结果相比健康对照组,精神分裂症组患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA分别为31、213、2624个。构建了由差异表达的5个circRNA、4个miRNA和57个mRNA组成的ceRNA网络。精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA主要参与化学刺激的感官知觉、多细胞生物生长的负调控等生物过程,涉及泛素-泛素连接酶活性、鸟苷酸结合、酶结合等分子功能,以及细胞质、肌动蛋白细胞骨架、轴突末端等细胞成分,ceRNA网络中mRNA显著富集于NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、泛素介导的蛋白水解等代谢通路。构建的精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA PPI网络共包含23个节点和22条边,筛选获得影响精神分裂症发生发展的2个核心mRNA为BRCA1、GNAS。构建的精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络包含5个节点和4条边。5个节点中包� 展开更多
关键词 精神分裂症 circrna-mirna-mrna网络 竞争性内源rna网络 环状rna 微小rna 信使rna
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磷脂酸磷酸酶2域1A基因在乳腺上皮细胞和乳腺癌细胞中的表达 被引量:7
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作者 赵二趁 崔静 +8 位作者 冯思佳 杨璐 柴婕 杨丹丹 张翠翠 王志慧 郜培琼 李娜 千新来 《新乡医学院学报》 CAS 2016年第5期356-358,361,共4页
目的探讨磷脂酸磷酸酶2域1A(PPAPDC1A)基因在正常乳腺上皮细胞和不同转移能力的乳腺癌细胞中表达的差异。方法以正常乳腺上皮HBL-100细胞、低转移乳腺癌MCF-7细胞、高转移乳腺癌MDA-MB-435s细胞和高转移乳腺癌MDA-MB-231细胞为研究对象... 目的探讨磷脂酸磷酸酶2域1A(PPAPDC1A)基因在正常乳腺上皮细胞和不同转移能力的乳腺癌细胞中表达的差异。方法以正常乳腺上皮HBL-100细胞、低转移乳腺癌MCF-7细胞、高转移乳腺癌MDA-MB-435s细胞和高转移乳腺癌MDA-MB-231细胞为研究对象,通过实时荧光定量聚合酶链反应(q PCR)和Western blot法分别检测PPAPDC1A基因mRNA和蛋白在上述细胞中的表达。结果与正常乳腺上皮HBL-100细胞比较,3种不同转移能力的乳腺癌细胞中的PPAPDC1A mRNA和蛋白表达水平均升高(P<0.01),且高转移乳腺癌MDA-MB-231细胞和高转移乳腺癌MDA-MB-435s细胞中PPAPDC1A mRNA和蛋白表达水平均高于低转移乳腺癌MCF-7细胞(P<0.01),高转移乳腺癌MDA-MB-231细胞中PPAPDC1A mRNA和蛋白水平的表达高于高转移乳腺癌MDA-MB-435s细胞(P<0.01)。PPAPDC1A在4种细胞中表达的顺序为HBL-100细胞<MCF-7细胞<MDA-MB-435s细胞<MDA-MB-231细胞。结论 PPAPDC1A基因可能促进了乳腺癌的发生、转移。 展开更多
关键词 乳腺癌 磷脂酸磷酸酶2域1A基因 信使rna 蛋白
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小鼠正畸牙移动中牙周组织自噬相关基因表达的初步研究 被引量:7
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作者 尹圆圆 马华钰 +4 位作者 李昕怡 徐静晨 柳汀 陈嵩 何姝姝 《国际口腔医学杂志》 CAS CSCD 2020年第6期627-634,共8页
目的研究小鼠正畸牙移动模型中移动牙牙周组织自噬相关基因的表达,探讨自噬在正畸牙移动骨塑建中的作用。方法 30只11周龄雄性C57B/6小鼠随机分为3组,每组10只。A组构建小鼠正畸牙移动模型,安放镍钛拉簧并施加矫治力;B组放置拉簧但不加... 目的研究小鼠正畸牙移动模型中移动牙牙周组织自噬相关基因的表达,探讨自噬在正畸牙移动骨塑建中的作用。方法 30只11周龄雄性C57B/6小鼠随机分为3组,每组10只。A组构建小鼠正畸牙移动模型,安放镍钛拉簧并施加矫治力;B组放置拉簧但不加矫治力;C组空白组。加力装置均安放于上颌左侧第一磨牙与左侧切牙之间,加力至第12 d处死小鼠。取左侧上颌骨标本,制作左侧上颌第一磨牙牙周组织标本切片,采用微计算机断层扫描技术测量牙移动距离,使用苏木精-伊红(HE)染色、抗酒石酸酸性磷酸酶(TRAP)染色和实时荧光定量聚合酶联式反应(RT-qPCR)观察牙移动情况,检测牙周组织中骨塑建相关基因[骨保护因子(OPG)和破骨细胞核因子κB受体活化因子配体(RANKL)]和自噬相关基因(包括Atg5、Atg7和Beclin-1)的表达。结果 A组平均牙移动距离0.09 mm,HE染色显示A组牙根张力侧与压力侧的牙周膜间隙不均等,压力侧细胞受到挤压、张力侧细胞受到拉伸。TRAP染色显示A组第一磨牙牙根近中侧见到阳性破骨细胞且A组压力侧破骨细胞数大于张力侧,差异有统计学意义(P<0.05)。RT-qPCR显示A组牙周组织OPG信使RNA(mRNA)表达显著降低,RANKL、Atg5、Atg7及Beclin-1 mRNA表达显著增加,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 正畸力作用下牙周组织自噬相关基因表达水平升高,自噬可能通过影响牙周组织中破骨水平参与了正畸牙移动骨塑建过程。 展开更多
关键词 C57B/6小鼠 正畸牙移动 自噬 信使rna 骨塑建
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上市核酸药物及其脂质纳米递送载体研究进展 被引量:4
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作者 崔丽莉 张勇 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期826-833,共8页
核酸作为新一代生物技术药物,不但可以从本源上治疗疾病,而且在技术和生产层面均具有显著的平台化特征,因此在医疗领域具有广阔的应用前景。然而,核酸在体内外稳定性差,递送效率低,极大限制了其成药性。近年来,以可离子化脂质为基础的... 核酸作为新一代生物技术药物,不但可以从本源上治疗疾病,而且在技术和生产层面均具有显著的平台化特征,因此在医疗领域具有广阔的应用前景。然而,核酸在体内外稳定性差,递送效率低,极大限制了其成药性。近年来,以可离子化脂质为基础的脂质纳米粒展示出良好的临床应用潜力,并在核酸新冠疫苗中得到了验证。脂质纳米粒能够凭借其独特的结构和理化性质特征,在体内展现出较高的递送效率和较好的安全性,为未来核酸药物的临床应用提供了更多可能。本文围绕核酸药物自身特点及其临床应用面临的屏障,结合已获批上市核酸药物,重点阐述其递送载体脂质纳米粒成功的关键要素,并对领域内尚待解决的问题进行展望。 展开更多
关键词 核酸 小干扰rna 信使rna 可离子化脂质 脂质纳米粒 体内外递送
原文传递
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