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2005-2014年上海市O139群霍乱弧菌的分子特征和耐药性研究 被引量:11
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作者 屠丽红 张曦 +2 位作者 陈洪友 宋元君 陈敏 《疾病监测》 CAS 2015年第3期223-227,共5页
目的分析2005-2014年上海市O139群霍乱弧菌的分子特征和耐药性。方法以聚合酶链反应(PCR)方法检测86株O139群霍乱弧菌的霍乱毒素基因(ctx A)、溶血素基因(hly A)、毒素协调菌毛基因(tcp A)、调控蛋白基因(toxR)和编码霍乱毒素基因的CTX... 目的分析2005-2014年上海市O139群霍乱弧菌的分子特征和耐药性。方法以聚合酶链反应(PCR)方法检测86株O139群霍乱弧菌的霍乱毒素基因(ctx A)、溶血素基因(hly A)、毒素协调菌毛基因(tcp A)、调控蛋白基因(toxR)和编码霍乱毒素基因的CTXφ基因组基因(zot、ace)。采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)方法对O139群霍乱弧菌菌株进行分子分型。采用WHO推荐的改良K-B纸片法,对O139群霍乱弧菌菌株进行11种抗菌药物(头孢曲松、强力霉素、诺氟沙星、环丙沙星、复方新诺明、丁胺卡那霉素、四环素、氯霉素、萘啶酸、氨苄西林、庆大霉素)敏感试验。结果患者来源O139群霍乱弧菌菌株93.2%(41/44)为产毒株,水产来源菌株58.3%(21/36)为产毒株,6株水体来源菌株均为非产毒株。PFGE分析将O139群霍乱弧菌分为35个型别。MLST分析将O139群霍乱弧菌分为9个ST型,其中流行菌型为ST 69型,非产毒株以ST 162型为主。86株O139群霍乱弧菌经药物敏感试验分析显示O139群霍乱弧菌产毒株的耐药情况比非产毒株严重。O139群霍乱弧菌产毒株对强力霉素、复方新诺明、四环素、萘啶酸、氨苄西林、庆大霉素的耐药率高。O139群霍乱弧菌非产毒株对萘啶酸耐药严重。结论上海市患者和水产来源O139群霍乱弧菌构成以产毒株为主。PFGE分型提示水产为霍乱疫情的主要传染源。O139群霍乱弧菌产毒株高度克隆化,流行菌型为ST 69型,耐药情况严重。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 毒力基因 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型 耐药性
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四川阿坝州牦牛源溶血性大肠杆菌血清型鉴定及毒力相关基因检测 被引量:10
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作者 诸明欣 张焕容 +1 位作者 汤承 李嘉英 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期9-13,共5页
为了解牦牛源溶血性大肠杆菌血清型及毒力相关基因,本研究从四川阿坝州采集的牦牛鼻腔棉拭子中分离鉴定溶血性大肠杆菌,并通过玻板凝集结合试管凝集试验鉴定其血清型,采用PCR方法检测大肠杆菌的4个溶血素基因及其它7个毒力相关基因。结... 为了解牦牛源溶血性大肠杆菌血清型及毒力相关基因,本研究从四川阿坝州采集的牦牛鼻腔棉拭子中分离鉴定溶血性大肠杆菌,并通过玻板凝集结合试管凝集试验鉴定其血清型,采用PCR方法检测大肠杆菌的4个溶血素基因及其它7个毒力相关基因。结果显示,从临床健康的牦牛鼻腔中分离鉴定出74株溶血性大肠杆菌,分离率为19.2%(74/386)。O血清型鉴定结果显示,74株牦牛源溶血性大肠杆菌中已确定O血清型的菌株有60株,共24种O血清型,其余14株未能定型。PCR检测与溶血素相关的4个基因携带率分别为96.0%(hly A)、86.5%(hly E)、14.9%(ehly)和2.7%(ehx);有4种溶血素基因组合,分别为hly A^+(96.0%),hly E^+(86.5%),hly A/hly E双阳性(80.9%),ehx/hly E双阳性(2.7%);其它毒力相关基因的检出率分别为93.2%(irp2)、93.2%(fyu A)和2.7%(stx2);LT、STa、STb和K99基因未检出。研究结果表明,溶血性大肠杆菌存在于临床健康牦牛鼻腔内,血清型复杂且无优势血清型,大肠杆菌溶血素相关基因和高致病性毒力岛相关基因携带率高。本研究首次对四川阿坝州牦牛源溶血性大肠杆菌的血清型和毒力相关基因进行了研究,提示在牦牛中存在溶血性大肠杆菌的潜在威胁。 展开更多
关键词 牦牛 溶血性大肠杆菌 血清型 毒力相关基因
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江苏部分地区鸡源与猪源弯曲菌耐药性分析与毒力基因检测 被引量:9
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作者 唐梦君 周倩 +6 位作者 张小燕 张静 唐修君 陆俊贤 周生 蒲俊华 高玉时 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期2284-2292,共9页
旨在了解江苏省部分地区鸡源与猪源弯曲菌的耐药及毒力基因携带情况。从江苏省25个规模养殖场采集250份粪便样品进行弯曲菌的分离鉴定,采用琼脂平板稀释法测定9种抗菌药物的最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentrations,MICs),PCR... 旨在了解江苏省部分地区鸡源与猪源弯曲菌的耐药及毒力基因携带情况。从江苏省25个规模养殖场采集250份粪便样品进行弯曲菌的分离鉴定,采用琼脂平板稀释法测定9种抗菌药物的最小抑菌浓度(minimal inhibitory concentrations,MICs),PCR方法扩增弯曲菌8种与致病力相关的毒力基因。结果显示:共分离得到93株弯曲菌,包括空肠弯曲菌45株,结肠弯曲菌48株;空肠弯曲菌对萘啶酸(80.0%)、四环素(71.1%)和环丙沙星(66.7%)的耐药率较高,而结肠弯曲菌对红霉素(87.5%)、萘啶酸(79.2%)和阿奇霉素(72.9%)产生较强的耐药性,分离株多重耐药现象严重,多重耐药率达67.7%;8个毒力基因在弯曲菌分离株中的携带率不同,cdtB和cadF携带率为100%,htrB为97.8%,clpP为76.3%,csrA为18.3%,wlaN为5.4%,cstⅡ为2.2%,cgtB为0%。结果提示,江苏省畜禽养殖场弯曲菌分离株多重耐药情况严重,毒力相关基因在弯曲菌中分布广泛。 展开更多
关键词 弯曲菌 耐药性 毒力基因 分离鉴定
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广州地区水产品及外环境水体溶藻弧菌污染状况与毒力相关基因分析 被引量:9
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作者 张晶 陈佳璇 +2 位作者 伍业健 陶霞 吴新伟 《中国卫生检验杂志》 CAS 2016年第4期539-541,共3页
目的了解广州地区海产品、淡水产品及外环境水体中溶藻弧菌污染状况,研究其毒力相关基因分布特征,为溶藻弧菌感染防治提供依据。方法采集广州市市售水产品及外环境水体标本,进行溶藻弧菌分离鉴定,对分离到的溶藻弧菌毒力相关基因toxR、C... 目的了解广州地区海产品、淡水产品及外环境水体中溶藻弧菌污染状况,研究其毒力相关基因分布特征,为溶藻弧菌感染防治提供依据。方法采集广州市市售水产品及外环境水体标本,进行溶藻弧菌分离鉴定,对分离到的溶藻弧菌毒力相关基因toxR、Collagenase^(VP)、tox S、trh、tdh、tlh、Collagenase^(VA)、UreR、Fla A、omp W、Asp A、fur等进行实验室检测,对结果进行统计分析。结果共采集320份样品,溶藻弧菌检出率为20.31%,其中海产品的检出率最高,为26.30%,淡水产品检出率为11.67%;65株食源性和环境分离株检测到toxR、Collagenase、tlh、Fla A、omp W、Asp A、fur基因,未检测到tox S、trh、tdh、UreR基因。结论广州地区海产品、淡水产品测到及外环境水体中溶藻弧菌污染严重,其致病因子具有复杂性及独特性,需加强水产品与外环境水体的监测,做好预防控制疾病工作。 展开更多
关键词 溶藻弧菌 水产品 外环境水体 毒力相关基因
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食品中蜡样芽胞杆菌的毒力基因分布研究 被引量:7
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作者 王远洋 刘钟栋 +3 位作者 陈国培 郭正洋 兰全学 刘芳 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期5304-5310,共7页
为了调查食品中蜡样芽胞杆菌的污染状况,以及蜡样芽胞杆菌毒力基因的分布情况,采集了419份食物样本,从样本中分离出32株蜡样芽胞杆菌,检出率为7.6%。应用hblA、hblC、hblD三重基因,nheA、nheB、nheC三重基因,entFM、bceT、ces三重基因... 为了调查食品中蜡样芽胞杆菌的污染状况,以及蜡样芽胞杆菌毒力基因的分布情况,采集了419份食物样本,从样本中分离出32株蜡样芽胞杆菌,检出率为7.6%。应用hblA、hblC、hblD三重基因,nheA、nheB、nheC三重基因,entFM、bceT、ces三重基因的实时荧光PCR体系对阳性样本进行毒力基因分布的研究。结果表明,hblA、hblC、hblD基因检出率均为53.1%;nheA、nheB、nheC基因检出率分别为65.6%、90.6%、87.5%;entFM和bceT基因检出率分别为96.9%和53.1%,携带ces基因的仅有一株。除ces基因外,携带上述八种基因的菌株占阳性菌株的34.4%。 展开更多
关键词 蜡样芽胞杆菌 污染 毒力基因 多重实时荧光PCR
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绵羊肺炎支原体研究进展
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作者 魏婕 张妤 +2 位作者 米晓云 魏玉荣 郑文新 《草食家畜》 2024年第1期19-24,共6页
【现状】绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae)是引起绵羊和山羊呼吸系统疾病的主要病原之一,病羊以咳嗽、气喘、流鼻液、消瘦等为主要临床症状。【问题】由于该病原具有广泛的寄主范围,病程长,体外培养困难,对抗菌药物的敏感性难... 【现状】绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae)是引起绵羊和山羊呼吸系统疾病的主要病原之一,病羊以咳嗽、气喘、流鼻液、消瘦等为主要临床症状。【问题】由于该病原具有广泛的寄主范围,病程长,体外培养困难,对抗菌药物的敏感性难以测定,致使临床选药困难,用药依从性差。因此,目前该病防控缺乏便捷且行之有效的措施,具有较高的病死率,一旦发病对羊产业造成巨大经济损失。【对策】目前有效防控措施为疫苗免疫,但缺乏针对性强的商业化市售疫苗。根据目前抗病育种研究,可以针对绵羊肺炎支原体培育新抗病绵羊品种。【结论】疫苗防控是快速有效的防控措施之一,但由于流行病原无交叉保护性,且成本较高,无法满足新疆羊产业发展需要,因此,培育抗绵羊肺炎支原体的绵羊新品种十分必要且意义深远。 展开更多
关键词 绵羊肺炎支原体 流行病学 毒力 抗病育种
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茶树炭疽菌N425全基因组测序与基因功能注释 被引量:1
7
作者 张承康 周子文 +3 位作者 郭田龙 彭成彬 陈美霞 刘伟 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1437-1444,共8页
【目的】对茶树炭疽菌N425进行全基因组测序和基因功能注释并从中初筛出致病相关基因。【方法】通过Illumina HiSeq2500 PE150平台对N425菌株进行全基因组测序和组装,并利用NR、KEGG、KOG等功能基因数据库进行基因预测和功能注释。【结... 【目的】对茶树炭疽菌N425进行全基因组测序和基因功能注释并从中初筛出致病相关基因。【方法】通过Illumina HiSeq2500 PE150平台对N425菌株进行全基因组测序和组装,并利用NR、KEGG、KOG等功能基因数据库进行基因预测和功能注释。【结果】茶树炭疽菌N425基因组全长约56.3 Mbp,G+C含量为53.2%,共预测出10 157个蛋白编码基因和若干各类非蛋白编码序列。其中,1 356个基因在病原与宿主互作数据库(PHI)中得到注释,包括140个注释为致病力丧失的基因;720个基因在碳水化合物酶数据库(CAZy)中得到注释;302个基因被预测为次生代谢物相关基因。这些基因中有涉及cAMP-PKA、MAPK等信号通路以及降解宿主细胞壁等致病相关过程,是潜在的致病相关基因。【结论】本研究成功获得茶树炭疽菌N425全基因组序列和基因功能注释,并从中挖掘出潜在致病相关基因,为后续展开对茶树炭疽菌侵染茶树的致病分子机制研究奠定基础。 展开更多
关键词 茶树炭疽病 基因组测序 基因注释 致病相关基因
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四川部分地区禽源空肠弯曲菌ERIC-PCR分型及毒力相关基因分析 被引量:5
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作者 王寒 张博 +5 位作者 莫亚霞 罗正中 姜思讯 孙成亮 曹随忠 姚学萍 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第9期1465-1473,共9页
为了解四川地区禽源空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)的遗传多样性和毒力相关基因的携带情况,对从四川成都、雅安及眉山市采集的鸡源、鸭源和鹌鹑源的盲肠及肛拭子样品进行C.jejuni的分离鉴定、ERICPCR分型和17种毒力相关基因的检测分... 为了解四川地区禽源空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)的遗传多样性和毒力相关基因的携带情况,对从四川成都、雅安及眉山市采集的鸡源、鸭源和鹌鹑源的盲肠及肛拭子样品进行C.jejuni的分离鉴定、ERICPCR分型和17种毒力相关基因的检测分析。结果显示,总体分离率为10.23%(48/469),其中鸡源分离率显著高于鹌鹑源(P<0.05)。ERIC-PCR聚类分析显示48株C.jejuni可分为6簇、16类共31种基因型,不同场分离株多在某一类或某一簇内聚集分布,而部分菌株在不同地区、不同场之间呈交叉分布。毒力基因检测结果显示,15种毒力相关基因的携带率在50%以上,其中鹌鹑源分离株的毒力基因携带率高于其他动物的携带率。由此表明四川地区禽源C.jejuni毒力基因的携带率高并且具有较高的遗传多样性。 展开更多
关键词 家禽 空肠弯曲菌 ERIC-PCR分型 毒力相关基因
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广州地区创伤弧菌分子生物学特征分析
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作者 张晶 陈惠玲 +4 位作者 和鹏 侯水平 白志军 陶霞 吴新伟 《中国食品卫生杂志》 CSCD 北大核心 2023年第12期1710-1714,共5页
目的了解广州地区创伤弧菌的分子生物学特征。方法对采集自广州地区的38株创伤弧菌进行全基因组测序,结合从NCBI公共数据库下载的50株序列数据,利用fineSTRUCTURE软件解析创伤弧菌的种群结构,并利用CARD、ResFinder和VFDB数据库对其毒... 目的了解广州地区创伤弧菌的分子生物学特征。方法对采集自广州地区的38株创伤弧菌进行全基因组测序,结合从NCBI公共数据库下载的50株序列数据,利用fineSTRUCTURE软件解析创伤弧菌的种群结构,并利用CARD、ResFinder和VFDB数据库对其毒力基因和耐药基因进行鉴定。结果创伤弧菌分为4个系统发育谱系(L1~L4),广州地区分离株全部聚集于L1(占47%)和L2(占53%)谱系,ST分型主要为ST357、ST157、ST136、ST139、ST345、ST303等,呈现一定的区域聚集性。创伤弧菌多个基因组鉴定发现acrF、CRP、catB9、rpoC、ugd等11种耐药基因,并首次在创伤弧菌中发现与多黏菌素耐药相关的MCR基因。该物种还携带5类23种毒力基因,编码鞭毛蛋白、Ⅱ型分泌系统蛋白、荚膜多糖、RtxA毒素、铁超载等毒力相关基因。结论广州地区创伤弧菌高度同源重组,并且携带多种耐药、毒力相关基因,应加强对其监测管理。 展开更多
关键词 创伤弧菌 全基因组测序 种群结构 多位点序列分型 耐药基因 毒力基因
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一株大黄鱼致病性溶藻弧菌的分离鉴定与毒力相关基因分析 被引量:4
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作者 陈洪清 《渔业研究》 2019年第6期487-493,共7页
2018年,宁德蕉城大湾渔排大黄鱼出现体表和鳍条溃疡、出血,鳃缺损等症状。为鉴定该菌株并评估其致病性,本研究从患病大黄鱼鳃部分离得到一株优势菌株,生理生化特征显示,该菌株可在TCBS培养基上生长,菌落颜色为黄色,为革兰阴性短杆菌,具... 2018年,宁德蕉城大湾渔排大黄鱼出现体表和鳍条溃疡、出血,鳃缺损等症状。为鉴定该菌株并评估其致病性,本研究从患病大黄鱼鳃部分离得到一株优势菌株,生理生化特征显示,该菌株可在TCBS培养基上生长,菌落颜色为黄色,为革兰阴性短杆菌,具有嗜盐性,生理生化指标与标准株17700一致。结合生理生化指标与16S rDNA分析,确定该菌为溶藻弧菌,命名为Val180620。攻毒结果显示,Val180620菌株对大黄鱼具有较强的致病力,在水温25℃腹腔注射感染时,对规格(20±2)g大黄鱼的LD 50为2.38×10^6 CFU。毒力相关基因分析结果表明,Val180620菌株携带有CollagenaseVA、ToxR、FlaA和TRH等毒力相关基因。此外,本研究未从菌株Val180620中检测出UreR基因,但菌株Val180620仍表现出较强的致病性,说明UreR不是决定溶藻弧菌毒力的主要因子。 展开更多
关键词 大黄鱼 溶藻弧菌 16S RDNA 致病性 毒力基因
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广藿香青枯病菌致病相关基因的筛选及分析 被引量:2
11
作者 张泳 贺红 +1 位作者 李巧 王邦伟 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期249-254,共6页
目的对广藿香青枯病菌致病相关基因进行筛选及分析。方法以广藿香青枯病菌菌株PRS-84的Tn5转座子插入突变株为材料,通过伤根浸泡法分别接种于广藿香植株,筛选致病性减弱的突变株;对筛选获得的突变株进行生长速率、泳动性和生物膜形成等... 目的对广藿香青枯病菌致病相关基因进行筛选及分析。方法以广藿香青枯病菌菌株PRS-84的Tn5转座子插入突变株为材料,通过伤根浸泡法分别接种于广藿香植株,筛选致病性减弱的突变株;对筛选获得的突变株进行生长速率、泳动性和生物膜形成等表型分析;再利用反向PCR扩增致病性减弱突变株Tn5转座子插入位点的侧翼序列并进行序列测定与生物信息学分析。结果筛选得到了2个致病性减弱的突变株(PRS-84-11-33、PRS-84-11-123),它们对广藿香植株的致病性均明显低于野生株PRS-84。与野生株相比,致病性减弱突变株的菌落形态无明显变化,突变株PRS-84-11-123在培养后期生长速率有所升高。突变株PRS-84-11-33及PRS-84-11-123的泳动能力及生物膜形成能力均低于野生株。突变株Tn5转座子插入位点侧翼序列的生物信息学分析表明,这2个致病性减弱突变株的Tn5转座子插入位点基因分别为lptE基因和lon基因。结论该研究筛选获得了与广藿香青枯病菌致病性相关的基因,为了解青枯病菌的致病机制、寻找有效防治广藿香青枯病的方法提供了基础信息。 展开更多
关键词 广藿香 青枯病菌 Tn5转座子插入突变株 致病相关基因
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光唇鱼源无乳链球菌的分离鉴定及遗传特征 被引量:3
12
作者 蔺凌云 潘晓艺 +4 位作者 姚嘉赟 尹文林 曹铮 刘忆瀚 沈锦玉 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期3159-3172,共14页
【目的】为查明浙江养殖光唇鱼大量死亡的病原,了解病原的遗传特征。【方法】本工作对患病光唇鱼进行病原分离,结合形态特征、生理生化特性和16S rRNA基因序列同源性,对分离菌株进行鉴定;采用人工回感试验确定其病原性,并对分离株的血... 【目的】为查明浙江养殖光唇鱼大量死亡的病原,了解病原的遗传特征。【方法】本工作对患病光唇鱼进行病原分离,结合形态特征、生理生化特性和16S rRNA基因序列同源性,对分离菌株进行鉴定;采用人工回感试验确定其病原性,并对分离株的血清型、多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、毒力基因型和表面蛋白抗原基因型等遗传特征进行分析;此外,还测试了菌株的药敏特性。【结果】从患病光唇鱼体中分离得到优势菌株ACRO-0708,为革兰氏阳性球菌,不溶血,分子与生化鉴定为无乳链球菌(Streptococcus agalactiae);人工感染试验证实其对光唇鱼有较强的致病性,LD_(50)为6.47×10^(3)CFU/g,属于血清型Ⅰb和MLST型ST261,毒力基因型为sip+bibA+cfb+hylB+iagA+fbsA+fbsB+bac–bca–cylE–scpB–lmb–,不携带所检测的6种表面蛋白基因。药敏试验结果显示,对青霉素、氨苄西林等8种药物较敏感,对氯霉素、复方新诺明等7种药物耐药。【结论】引起浙江养殖光唇鱼死亡的病原菌为无乳链球菌,其分子特征与水产动物主要流行的无乳链球菌株具有显著差异,生产中可选用氨苄西林、氟苯尼考等药物进行防治。 展开更多
关键词 光唇鱼 无乳链球菌 分子血清型 MLST 毒力基因
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产吲哚金黄杆菌YM5毒性相关基因及其急性经口毒性 被引量:2
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作者 唐丹 丁彦强 +5 位作者 黄玉红 方扬 靳艳玲 何开泽 易卓林 赵海 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期289-293,共5页
产吲哚金黄杆菌(Chryseobacterium indologenes)YM5是本实验室分离所得的一株具有高效羽毛角蛋白降解能力的革兰氏阴性菌,具有潜在的工业应用价值,但部分产吲哚金黄杆菌的相关株系被报道可能为医院条件致病菌.本研究通过测定YM5全基因... 产吲哚金黄杆菌(Chryseobacterium indologenes)YM5是本实验室分离所得的一株具有高效羽毛角蛋白降解能力的革兰氏阴性菌,具有潜在的工业应用价值,但部分产吲哚金黄杆菌的相关株系被报道可能为医院条件致病菌.本研究通过测定YM5全基因组序列,分析其基因组中毒性相关功能基因,结合小鼠急性经口毒性试验,来评价YM5的生物安全性.结果显示,YM5基因组内不含毒性相关基因.YM5菌液及其羽毛发酵液对小鼠半数致死量(LD50)大于20 g/kg BW,属实际无毒级;处理14 d后,小鼠血清中谷丙转氨酶(AST)、谷草转氨酶(ALT)、尿素(BUN)、肌酐(Cre)、血糖(GLU)、总胆固醇(TC)和甘油三酯(TG)与对照组均无显著性差异(P>0.05).本研究表明YM5菌液及其羽毛发酵液对哺乳动物安全无毒副作用,可应用于工业生产. 展开更多
关键词 产吲哚金黄杆菌YM5 羽毛发酵 毒性相关基因 急性毒性
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Screening and identification of Shigella flexneri 2a virulence-related genes induced after invasion of epithelial cells
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作者 SHI Zhaoxing WANG Hengliang +6 位作者 HU Kun FENG Erling YAO Xiao HUANG Liuyu SU Guofu HUNAG Peitang HUANG Cuifen 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2004年第6期494-502,共10页
An in vivo expression technology (IVET) was applied to screen s.flexneri 2a genes induced after invasion of epithelial cells, and virulence-related genes were further identified by mutational analysis. Thirteen intrac... An in vivo expression technology (IVET) was applied to screen s.flexneri 2a genes induced after invasion of epithelial cells, and virulence-related genes were further identified by mutational analysis. Thirteen intracellular induced genes were identified with a HeLa cell infection model. Of these, two were identified as alkylation-related genes; one was related to metabolism; one encoded a transcriptional regulator; three were identified as insertion elements; three ap- peared to be antisense to genes involved in the transmethylation,biosyntheseis, and phos- photransferase system;and three were predicted to encode polypeptides with unknown functions. Intracellular survival assavs showed that the mutants of alkA,citC and wcaJ genes had lower capability of intracellular replication or survival than the the wild-type strain.The results indicated that alkA, citC and wcaJ genes could take part in the intracellular survival or replication of S. flexneri 2a and the capability of intracellular survival or replication could be one of the major virulence elements. However, the yaiC mutant was able to survive in the murine infection assay but almost not in HeLa cell infection assay. Very possibly, yaiC gene was involved in the other mechanism of S. flexneri virulence. This study might lead to a better understanding of the intra- cellular survival or proliferation process of S. flexneri 2a and perhaps provide insights into the pathogenicity of this pathogen. 展开更多
关键词 Shigella flexneri 2a intracellular induced expression virulence-related genes in vivo expression technology.
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猪源肠球菌明胶液化表型与5种毒力基因的检测分析 被引量:1
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作者 李岱霞 朱娜 +2 位作者 蒋逸凡 任杰 黎满香 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期361-365,共5页
为探究明胶液化的表型与其5种毒力基因在不同来源和不同种属猪肠球菌中的分布差异,本研究采用PCR方法以及明胶液化试验对湖南分离的375株肠球菌携带的明胶酶基因(gelE)、调控gelE表达的毒力基因反应调节子基因(fsrA)、前肽加工蛋白基因(... 为探究明胶液化的表型与其5种毒力基因在不同来源和不同种属猪肠球菌中的分布差异,本研究采用PCR方法以及明胶液化试验对湖南分离的375株肠球菌携带的明胶酶基因(gelE)、调控gelE表达的毒力基因反应调节子基因(fsrA)、前肽加工蛋白基因(fsrB)、组氨酸激酶基因(fsrC)、丝氨酸蛋白酶基因(sprE)共5种毒力基因的分布情况以及液化明胶现象进行检测。结果显示,共263株肠球菌检测到了毒力基因,检出率分别为41.3%(gelE)、45.9%(fsrA)、50.9%(fsrB)、48.8%(fsrC)、48.8%(sprE)。能够同时检测到5种毒力基因的菌株共有110株,其中粪肠球菌106株,且该5种毒力基因在106株粪肠球菌中的检出率均为最高,另外4株为其它肠球菌。在明胶液化试验中,共有155株肠球菌检测到gelE基因,但只有106株能够发生明胶液化现象,且这些菌株正是能够同时检测到5种毒力基因的106株粪肠球菌,而另外4株能够同时检测到5种毒力基因的其它肠球菌却不能发生明胶液化现象。结果表明,粪肠球菌是肠球菌中主要携带毒力基因的菌属,与屎肠球菌以及其它肠球菌相比,更容易出现液化明胶的表型,这可能与粪肠球菌中某些明胶液化的机制有关,且除gelE外,参与gelE表达的几种毒力基因对该表型的出现也具有一定的影响。 展开更多
关键词 肠球菌 粪肠球菌 群体感应系统 毒力基因 明胶分解
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2005年-2010年武汉市霍乱弧菌监测分析 被引量:1
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作者 熊燕 江元山 +3 位作者 陈智 王芳 龙一兵 周军波 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2012年第4期847-849,共3页
目的:对2005年-2010年霍乱弧菌监测中分离的25株疑似菌株进行系统鉴定。方法:分离培养、血清学试验、系统生化鉴定(VITEK32)、PCR检测其分型及毒素基因、药敏试验。结果:25株菌鉴定为霍乱弧菌的有21株,与霍乱弧菌发生交叉凝集4株;病例... 目的:对2005年-2010年霍乱弧菌监测中分离的25株疑似菌株进行系统鉴定。方法:分离培养、血清学试验、系统生化鉴定(VITEK32)、PCR检测其分型及毒素基因、药敏试验。结果:25株菌鉴定为霍乱弧菌的有21株,与霍乱弧菌发生交叉凝集4株;病例监测主要为O139霍乱弧菌、外环境监测主要为O1群霍乱弧菌;病例监测菌株携带霍乱弧菌毒素基因(ctxAB)、其他菌株均不携带霍乱弧菌毒素基因(ctxAB)。药敏实验结果对诺氟沙星和环丙沙星敏感,对其他抗生素有不同程度的耐药。结论:武汉市霍乱弧菌在病例监测中主要为O139群霍乱弧菌产毒株、外环境监测中主要为O1群霍乱弧菌非产毒株,不同型别菌株存在不同程度耐药性。 展开更多
关键词 霍乱弧菌 分离鉴定 霍乱弧菌毒素基因 药物敏感性
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鸭瘟病毒ZJ2016强毒株部分基因序列的测定与分析 被引量:1
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作者 张红丽 黄靖 +4 位作者 刘霞 吴赟竑 冯肖肖 吴雪军 徐辉 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第2期226-233,共8页
2016年,浙江省一鸭场发生疑似鸭瘟病例,经鉴定,病鸭感染鸭瘟病毒,命名为ZJ2016病毒株。实验应用二代基因测序方法对该病毒核酸进行全基因测序,鉴定分析鸭瘟病毒ZJ2016株抗原与毒力相关基因序列特征。对测序病毒主要囊膜糖蛋白基因gB、gC... 2016年,浙江省一鸭场发生疑似鸭瘟病例,经鉴定,病鸭感染鸭瘟病毒,命名为ZJ2016病毒株。实验应用二代基因测序方法对该病毒核酸进行全基因测序,鉴定分析鸭瘟病毒ZJ2016株抗原与毒力相关基因序列特征。对测序病毒主要囊膜糖蛋白基因gB、gC、gG、gH、gI、gK、gL、gM、gN与致病力基因LORF11、UL2、UL12、UL41、UL47、US10进行核酸与氨基酸序列分析,并与已发表毒株序列及疫苗株(VAC株、clone-03株)序列比较。结果显示,与疫苗免疫保护抗原相关的ZJ2016株囊膜糖蛋白序列与疫苗毒株序列相比未发生明显的变异,而ZJ2016株的LORF11、UL2、UL12、UL41、UL47、US10基因结构及同源性与疫苗株氨基酸序列差异明显,且与中国其他分离强毒株LH2011株、CHv株、CV株同源性较高,表明该毒株具有强毒株的基因型特征。 展开更多
关键词 鸭瘟 抗原 毒力基因 强毒株 疫苗株
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副猪嗜血杆菌血清4型不同菌株间毒力相关基因验证及LpxC基因生物信息学分析 被引量:1
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作者 周媛媛 张学谅 +6 位作者 王静 陈欣 李睿 尹荣兰 王超 黄晨 尹荣焕 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期550-558,共9页
为探究副猪嗜血杆菌同一血清型不同菌株间毒力相关基因的差异以及LpxC基因的遗传特性,本试验设计35种毒力相关基因的特异性引物,对副猪嗜血杆菌血清型4型的两种菌株进行PCR验证,并将两株菌株的LpxC基因连接到T5载体上,转化到大肠杆菌感... 为探究副猪嗜血杆菌同一血清型不同菌株间毒力相关基因的差异以及LpxC基因的遗传特性,本试验设计35种毒力相关基因的特异性引物,对副猪嗜血杆菌血清型4型的两种菌株进行PCR验证,并将两株菌株的LpxC基因连接到T5载体上,转化到大肠杆菌感受态细胞中进行克隆及测序,得到921bp目的片段。在NCBI上进行比对分析,运用DNA star软件对LpxC基因进行核苷酸同源性比对,同时对LpxC基因编码的蛋白质进行生物信息学分析。结果表明:35种毒力相关基因中除SapA基因,其余34种在两个菌株中共同存在,两株HPS的LpxC基因序列与各参考菌株之间的同源性均在97%~100%之间,说明LpxC基因在副猪嗜血杆菌中保守存在。系统进化树结果显示XM1602菌株LpxC基因与SH0165菌株处于同一分支,FS0035菌株LpxC基因与ZJ0906菌株处于同一分支。同时,菌株FS0035和XM1602的LpxC基因编码的蛋白质等电点分别为5.59和5.45;该蛋白质为亲水性蛋白,无跨膜结构;二级结构包括α螺旋、伸展链、β转角和无规卷曲。结果证实,同一血清4型,两株不同的副猪嗜血杆菌菌株在毒力相关基因上存在一定的差异;LpxC基因在两个菌株中保守性较高,变异性较低。 展开更多
关键词 副猪嗜血杆菌 毒力相关基因 LpxC 序列分析 生物信息学分析
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Polymorphism analysis of virulence-related genes among Candida tropicalis isolates 被引量:1
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作者 Li-Juan Zhang Shuan-Bao Yu +3 位作者 Wen-Ge Li Wen-Zhu Zhang Yuan WU Jin-Xing Lu 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期446-453,共8页
Background: Adhesion, biofilm formation, yeast-hyphal transition, secretion of enzymes, and hemolytic activity are all considered important factors in Candida tropicalis infection. However, DNA sequence data for this ... Background: Adhesion, biofilm formation, yeast-hyphal transition, secretion of enzymes, and hemolytic activity are all considered important factors in Candida tropicalis infection. However, DNA sequence data for this pathogen are limited. In this study, the polymorphism and heterogeneity of genes agglutinin-like sequences (ALS)2, Lipase (LIP)1, LIP4, and secretory aspartyl proteinase tropicalis (SAPT)1-4 as well as the relationship between phenotype and genotype were analyzed. Methods: This study started in August 2013, and ended in July 2017. The complete length of ALS2, LIP1, LIP4, and SAPT1-4 of 68 clinical C. tropicalis isolates was sequenced. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) as well as insertions and deletions (indels) were identified within these genes. In addition, phenotypic characteristics of the virulent factors, including adhesion and the secretion of aspartyl proteinases and phospholipases, were determined. Results: There were 73, 24, 17, 16, 13, and 180 SNPs in the genes LIP1, LIP4, SAPT1, SAPT2, SAPT3, and SAPT4, respectively. Furthermore, 209 SNPs were identified in total for the gene ALS2. Interestingly, large fragment deletions and insertions were also found in ALS2. Isolate FXCT 01 obtained from blood had deletions on all 4 sites and showed the lowest adhesion ability on the polymethylpentene surface. In addition, isolates with deletions in the regions 1697 to 1925 and 2073 to 2272 bp displayed relatively low abilities for adhesion and biofilm formation, and this phenotype correlated with the deletions found in ALS2. LIP1, SAPT4, and ALS2 displayed great heterogeneity among the isolates. Large deletions found in gene ALS2 appeared to be associated with the low ability of adhesion and biofilm formation of C. tropicalis. Conclusion: This study might be useful for deeper explorations of gene function and studying the virulent mechanisms of C. tropicalis. 展开更多
关键词 CANDIDA TROPICALIS virulence-related genes PHYLOGENETIC analysis GENE ALS GENE LIP GENE SAP
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利用相似致病菌中保守的致病菌特有基因预测新的毒力相关基因
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作者 魏波 王波 +8 位作者 牛超 周围 廖翔 高原 王月兰 李北平 呼和巴特尔 岳俊杰 梁龙1 《生物技术通讯》 CAS 2011年第3期370-374,共5页
目的:在致病机制相似的致病菌中寻找保守的致病菌特有基因,预测新的毒力相关基因。方法:首先选取致病机制相似的致病菌EHEC与EPEC,利用本实验室构建的包含115 152条致病菌特有基因片段的数据库进行本地Blast,得到致病菌特有基因,对致病... 目的:在致病机制相似的致病菌中寻找保守的致病菌特有基因,预测新的毒力相关基因。方法:首先选取致病机制相似的致病菌EHEC与EPEC,利用本实验室构建的包含115 152条致病菌特有基因片段的数据库进行本地Blast,得到致病菌特有基因,对致病菌特有基因在相似致病菌中的保守性进行分析,得到新的可能的毒力相关基因。结果:在6株EHEC菌中找到95条保守的致病菌特有基因,其中大部分为已知的毒力相关基因,还有许多可能的毒力相关基因;在9株相似致病菌(EHEC、EPEC)中找到10条保守的致病菌特有的蛋白基因,其中9条为已知的致病相关基因,1条为可能的致病相关基因。结论:应用本方法可以发现新的毒力基因,为后续对致病菌致病机制的实验研究奠定了基础。 展开更多
关键词 致病菌特有基因 毒力相关基因 预测
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