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新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因进化和变异分析
被引量：
5
1
作者
资海荣
李伟
+4 位作者
周丹
李婕
宣杨
郭艳
卫平民
《东南大学学报（医学版）》
CAS
2014年第4期416-421,共6页
目的：对新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因的进化和变异进行分析，为进一步研究致病性禽流感的致病机制和毒力因子奠定基础。方法：从IRD数据库中下载2013年2月19日至2013年10月31日的H7N9流感病毒PBl基因序列63条，运用MEGA5．2．1...
目的：对新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因的进化和变异进行分析，为进一步研究致病性禽流感的致病机制和毒力因子奠定基础。方法：从IRD数据库中下载2013年2月19日至2013年10月31日的H7N9流感病毒PBl基因序列63条，运用MEGA5．2．1软件进行序列分析，用邻接法构建基因进化树；通过氨基酸序列分析PB1基因95～367片段的PB1-F2蛋白氨基酸位点变化；应用Excel表格对氨基酸构成进行计算；运用Predictive Analytics Software（PASW）18．0软件对氨基酸构成改变进行统计分析。结果：63株甲型H7N9毒株中有17株毒株的PB1-F2蛋白在其氨基酸序列第25位后发生断裂。新型甲型H7N9的进化主要分为两个系别，系别I主要由完整型PB1-F2蛋白毒株构成，系别Ⅱ主要由52aa截短型PB1-F2蛋白毒株构成。完整型PB1-F2蛋白与截短型PB1-F2蛋白各类氨基酸构成存在差异。结论：H7N9流感毒株中存在着截短型PB1-F2蛋白毒株，并且H7N9流感病毒毒株PB1-F2蛋白断裂位点均在25位氨基酸后，这将成为H7N9流感毒株进化过程中重要的特征。完整型PB1-F2蛋白与截短型PB1-F2蛋白氨基酸构成的差异对于甲型H7N9流感病毒致病性的影响有待进一步研究。
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关键词
甲型H7N9流感病毒
截短型
pb
1
-
f
2
pb
1
-
f
2蛋白的变异
氨基酸构成
下载PDF
职称材料
甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与宿主蛋白的相互作用的初步研究
被引量：
1
2
作者
冯发深
何霞
+4 位作者
王铸
徐霖
张定梅
关琳琳
曹开源
《热带医学杂志》
CAS
2012年第6期657-660,F0004,共5页
目的利用酵母双杂交技术研究甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与人类宿主蛋白的相互作用,为该病毒蛋白的功能研究和致病机制提供理论依据。方法以本实验室分离和鉴定的甲型H3N2流感病毒A/Guangdong/7028/2010为模版,构建pGBKT7-PB1-F2...
目的利用酵母双杂交技术研究甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与人类宿主蛋白的相互作用,为该病毒蛋白的功能研究和致病机制提供理论依据。方法以本实验室分离和鉴定的甲型H3N2流感病毒A/Guangdong/7028/2010为模版,构建pGBKT7-PB1-F2重组载体,利用Y2HGold酵母双杂交系统,从人类通用cDNA文库中筛选与其相互作用的蛋白。结果成功构建含诱饵蛋白基因的pGBKT7-PB1-F2重组载体,转化酵母自激活和毒性实验显示为阴性;酵母双杂交实验显示Y2HGold和Y187酵母的结合率为5.22%,符合实验要求;经筛选和验证后,得到3个与截短型PB1-F2蛋白有相互作用的阳性克隆,分别为钾/钠ATP酶β1亚基、热休克蛋白40和白介素-2受体γ亚基。结论初步推断截短型H3N2流感病毒PB1-F2蛋白可能影响流感病毒在宿主细胞中的复制功能和凋亡调控。
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关键词
甲型H3N
2
流感病毒
截短型
pb
1
-
f
2蛋白
酵母双杂交
相互作用
原文传递
题名
新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因进化和变异分析
被引量：
5
1
作者
资海荣
李伟
周丹
李婕
宣杨
郭艳
卫平民
机构
东南大学公共卫生学院
出处
《东南大学学报（医学版）》
CAS
2014年第4期416-421,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(81273143)
文摘
目的：对新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因的进化和变异进行分析，为进一步研究致病性禽流感的致病机制和毒力因子奠定基础。方法：从IRD数据库中下载2013年2月19日至2013年10月31日的H7N9流感病毒PBl基因序列63条，运用MEGA5．2．1软件进行序列分析，用邻接法构建基因进化树；通过氨基酸序列分析PB1基因95～367片段的PB1-F2蛋白氨基酸位点变化；应用Excel表格对氨基酸构成进行计算；运用Predictive Analytics Software（PASW）18．0软件对氨基酸构成改变进行统计分析。结果：63株甲型H7N9毒株中有17株毒株的PB1-F2蛋白在其氨基酸序列第25位后发生断裂。新型甲型H7N9的进化主要分为两个系别，系别I主要由完整型PB1-F2蛋白毒株构成，系别Ⅱ主要由52aa截短型PB1-F2蛋白毒株构成。完整型PB1-F2蛋白与截短型PB1-F2蛋白各类氨基酸构成存在差异。结论：H7N9流感毒株中存在着截短型PB1-F2蛋白毒株，并且H7N9流感病毒毒株PB1-F2蛋白断裂位点均在25位氨基酸后，这将成为H7N9流感毒株进化过程中重要的特征。完整型PB1-F2蛋白与截短型PB1-F2蛋白氨基酸构成的差异对于甲型H7N9流感病毒致病性的影响有待进一步研究。
关键词
甲型H7N9流感病毒
截短型
pb
1
-
f
2
pb
1
-
f
2蛋白的变异
氨基酸构成
Keywords
A/H7N9
truncated
pb
1-
f
2
protein
pb
1-
f
2
mutation
amino
acid
composition
分类号
R183.3 [医药卫生—流行病学]
下载PDF
职称材料
题名
甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与宿主蛋白的相互作用的初步研究
被引量：
1
2
作者
冯发深
何霞
王铸
徐霖
张定梅
关琳琳
曹开源
机构
中山大学临床检验标准化研究中心
中山大学中山医学院微生物教研室
广东省重大传染病预防和控制技术研究中心
中山大学热带病防治研究教育部重点实验室
出处
《热带医学杂志》
CAS
2012年第6期657-660,F0004,共5页
基金
国家重大传染病防治科技重大专项(2009ZX10004-213)
广东省重大传染病专项
文摘
目的利用酵母双杂交技术研究甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与人类宿主蛋白的相互作用,为该病毒蛋白的功能研究和致病机制提供理论依据。方法以本实验室分离和鉴定的甲型H3N2流感病毒A/Guangdong/7028/2010为模版,构建pGBKT7-PB1-F2重组载体,利用Y2HGold酵母双杂交系统,从人类通用cDNA文库中筛选与其相互作用的蛋白。结果成功构建含诱饵蛋白基因的pGBKT7-PB1-F2重组载体,转化酵母自激活和毒性实验显示为阴性;酵母双杂交实验显示Y2HGold和Y187酵母的结合率为5.22%,符合实验要求;经筛选和验证后,得到3个与截短型PB1-F2蛋白有相互作用的阳性克隆,分别为钾/钠ATP酶β1亚基、热休克蛋白40和白介素-2受体γ亚基。结论初步推断截短型H3N2流感病毒PB1-F2蛋白可能影响流感病毒在宿主细胞中的复制功能和凋亡调控。
关键词
甲型H3N
2
流感病毒
截短型
pb
1
-
f
2蛋白
酵母双杂交
相互作用
Keywords
in
f
luenza
A
H3N
2
truncated
pb
1-
f
2
protein
yeast
two-hybrid
system
protein
interaction
分类号
R511 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
新型甲型H7N9流感病毒PB1-F2蛋白基因进化和变异分析
资海荣
李伟
周丹
李婕
宣杨
郭艳
卫平民
《东南大学学报（医学版）》
CAS
2014
5
下载PDF
职称材料
2
甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与宿主蛋白的相互作用的初步研究
冯发深
何霞
王铸
徐霖
张定梅
关琳琳
曹开源
《热带医学杂志》
CAS
2012
1
原文传递
已选择
0
条
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引证文献
统计分析
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