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蔗糖合酶基因启动子克隆及其转基因水稻植物中特异性表达 被引量:13
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作者 李永春 张宪银 薛庆中 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期586-590,共5页
以水稻品种“明恢 6 3”基因组 DNA为模板 ,用 PCR方法克隆出水稻蔗糖合酶基因起始密码子以前 (包括第一内含子 )的上游序列 RSP1及其不包括第一内含子的上游调控序列 RSP2。测序结果显示 ,在重要的功能区段上 ,克隆的序列与 Wang(1992 ... 以水稻品种“明恢 6 3”基因组 DNA为模板 ,用 PCR方法克隆出水稻蔗糖合酶基因起始密码子以前 (包括第一内含子 )的上游序列 RSP1及其不包括第一内含子的上游调控序列 RSP2。测序结果显示 ,在重要的功能区段上 ,克隆的序列与 Wang(1992 )等的报道基本一致。构建了由 RSP1和 RSP2驱动报告基因 Gus的植物表达载体 ,并用于农杆菌介导法水稻遗传转化。对水稻品种“秀水 11”转基因植株各部位的 GUS组织化学分析表明 :RSP1和 RSP2都可以驱动Gus基因在根、茎、叶及颖壳中高效特异表达 ,但在胚和胚乳中不表达。作者认为 。 展开更多
关键词 蔗糖合酶基因 启动子 克隆 转基因 水稻 植物 特异性表达
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泥蚶同工酶谱在不同组织的差异研究 被引量:20
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作者 李太武 吕振明 +2 位作者 林志华 苏秀榕 柴雪良 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期125-132,共8页
用聚丙烯酰胺电泳法对泥蚶5种组织中的19种同工酶进行检测分析,发现除其中4种酶未显示任何有活性的区带,两种酶只显示极微弱且不稳定的区带外,其他种酶类在各个组织中都显示出清晰稳定的图谱,且这些酶在分布和活性上均表现出高度的组织... 用聚丙烯酰胺电泳法对泥蚶5种组织中的19种同工酶进行检测分析,发现除其中4种酶未显示任何有活性的区带,两种酶只显示极微弱且不稳定的区带外,其他种酶类在各个组织中都显示出清晰稳定的图谱,且这些酶在分布和活性上均表现出高度的组织特异性,说明泥蚶组织中已存在相当丰富和完整的酶系统,基本具备了与高等动物相类似的机体代谢方式,而且这些酶基因的表达存在着组织分布上的自我调控机制.同时与其他贝类和高等动物相比,泥蚶的同工酶基因的表达既表现出了与其分类地位相一致的特征,又反应出在分类阶元上的特殊性. 展开更多
关键词 泥蚶 同工酶 组织特异性表达 聚丙烯酰胺电泳法
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毛竹捕光叶绿素a/b结合蛋白基因cab-PhE1的克隆与表达分析 被引量:15
3
作者 高志民 刘成 +1 位作者 刘颖丽 彭镇华 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第3期145-149,共5页
The light harvesting chlorophyll a/b-binding protein is one of key proteins in the transformation from light energy to chemical energy. An open reading frame coding precursor protein of cab gene was cloned from the fi... The light harvesting chlorophyll a/b-binding protein is one of key proteins in the transformation from light energy to chemical energy. An open reading frame coding precursor protein of cab gene was cloned from the first strand of bamboo cDNA through RT-PCR methods,and named as cab-PhE1 (cab gene 1 from Phyllostachys edulis EF207229). The sequence analysis showed that the deduced polypeptide was highly homologous to some other CAB proteins from monocotyledon,and the gene belonged to lhcb2 family. Tissue specific expression showed that cab-PhE1 expressed higher in leaf than sheath and stem. The prokaryotic expression vector of cab-PhE1 gene encoding the mature protein was constructed by subcloning the fragment into pET-23 a and was expressed in Escherichia coli induced by IPTG. The molecular weight of the induced protein was about 28 ku,approximate to that of the mature protein. This work is a key to the further research on in vitro reconstitution of light-harvesting Chl a/b complexes. 展开更多
关键词 毛竹 捕光叶绿素a/b结合蛋白基因 组织特异性表达 原核表达
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毛竹苯丙氨酸解氨酶基因的克隆及组织特异性表达分析 被引量:15
4
作者 高志民 彭镇华 +2 位作者 李雪平 牟少华 马艳军 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2009年第3期449-453,共5页
As a critical enzyme in secondary metabolism of plant,Phenylanlanine ammonialyase(PAL) has significant meaning to its development and strong tolerance ability against hard.A full-length cDNA of PAL gene was isolated f... As a critical enzyme in secondary metabolism of plant,Phenylanlanine ammonialyase(PAL) has significant meaning to its development and strong tolerance ability against hard.A full-length cDNA of PAL gene was isolated from Phyllostachys edulis through RT-PCR and RACE methods,and named as PePAL1(GenBank accession number:FJ195650).PePAL1 is 2 436 bp,which contains an open reading frame encoding 701 amino acids.The results of amino acid sequence analysis showed that PePAL1 had high identities with other gramineous PAL in Oryza sativa,Zea mays,Saccharum officinarum,Bambusa ventricosa,Bambusa oldhamii and Triticum aestivum,especially with PAL from O.sativa up to 93.0%.Phylogenetic analysis showed that PePAL1 and LLB1 were on different branch sites.Tissue specific expression showed that PePAL1 expressed in leaf,sheath,stem and root,much higher in stem. 展开更多
关键词 毛竹 苯丙氨酸解氨酶 克隆 组织特异性表达
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拟南芥芥子酶基因TGG6是花特异表达的假基因 被引量:6
5
作者 汪萌 伍祚斌 +2 位作者 李定琴 孙雪飘 张家明 《生命科学研究》 CAS CSCD 2007年第4期316-322,共7页
芥子酶是一类催化硫代葡萄糖苷水解的同工酶.TGG6是在拟南芥中新发现的芥子酶基因.从拟南芥几个不同生态型中克隆了TGG6基因的全长核基因和cDNA片段.序列分析结果表明,所有供试的生态型的TGG6基因都与拟南芥第3个芥子酶基因TGG3类似,在... 芥子酶是一类催化硫代葡萄糖苷水解的同工酶.TGG6是在拟南芥中新发现的芥子酶基因.从拟南芥几个不同生态型中克隆了TGG6基因的全长核基因和cDNA片段.序列分析结果表明,所有供试的生态型的TGG6基因都与拟南芥第3个芥子酶基因TGG3类似,在编码区存在1个以上移码突变,不能编码完整多肽.生态型Col-0第10个内含子的剪切边界还发生了缺失,导致内含子不能被切除.初步确定TGG6是一个假基因.然而,RT-PCR结果却表明TGG6在花器中特异性表达,说明TGG6在进化的某个阶段可能是有功能的基因,由于某种原因,该基因在进化过程中被失活. 展开更多
关键词 拟南芥 芥子酶 TGG6 组织特异表达 花特异表达 假基因
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人雄激素芳香化酶基因(CYP19)结构及其表达调控研究进展 被引量:4
6
作者 何海琼 王金发 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1998年第6期492-496,共5页
人雄激素芳香化酶与乳腺癌的发生和发展密切相关.综述了编码该酶的CYP19基因的结构、独特的组织特异性表达和调控CYP19基因表达的各种因素及其有关的调控机制.
关键词 雄激素芳香化酶 组织特异性表达 CYP19
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绿竹BoSUT2基因的分子特征与亚细胞定位 被引量:8
7
作者 高志民 杨学文 +3 位作者 彭镇华 李雪平 牟少华 马艳军 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第2期45-50,共6页
植物蔗糖转运蛋白(sucrose transporter,SUT)作为一种功能性蛋白,在蔗糖运输以及蔗糖特异信号感应过程中发挥着重要的生理功能。采用RT-PCR方法从绿竹中分离1个新的编码蔗糖转运蛋白基因,cDNA长1668bp,编码555个氨基酸,命名为BoSUT2(注... 植物蔗糖转运蛋白(sucrose transporter,SUT)作为一种功能性蛋白,在蔗糖运输以及蔗糖特异信号感应过程中发挥着重要的生理功能。采用RT-PCR方法从绿竹中分离1个新的编码蔗糖转运蛋白基因,cDNA长1668bp,编码555个氨基酸,命名为BoSUT2(注册号:EU247931)。序列分析表明,BoSUT2与其他单子叶植物的蔗糖转运蛋白有着较高的一致性,其中与绿竹BoSUT1一致性最高,达92.3%。编码蛋白二级结构预测分析显示,BoSUT2具有糖运转子保守域和跨膜结构域,属于膜蛋白。组织特异性表达检测表明,BoSUT2在叶片和叶鞘中的表达丰度较高且比较接近,在根中有微弱表达。将BoSUT2置于35S启动子之下,构建了含GFP的融合表达载体,并转化烟草悬浮细胞,观察结果表明,BoSUT2主要定位到细胞质膜上。 展开更多
关键词 绿竹 蔗糖转运蛋白基因 组织特异性表达 亚细胞定位
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茉莉花MVD基因及其启动子的克隆与表达 被引量:8
8
作者 陈笛 王鹏杰 +4 位作者 郑玉成 林浥 郑知临 陈桂信 叶乃兴 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2019年第3期309-315,共7页
根据茉莉花转录组数据,采用RT-PCR技术,克隆了茉莉花甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(MVD)基因,命名为JsMVD(GenBank登录号为MH311041.1).采用染色体步移技术分离JsMVD基因5′端上游调控序列,通过实时荧光定量PCR技术检测JsMVD基因在茉莉花植株不... 根据茉莉花转录组数据,采用RT-PCR技术,克隆了茉莉花甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(MVD)基因,命名为JsMVD(GenBank登录号为MH311041.1).采用染色体步移技术分离JsMVD基因5′端上游调控序列,通过实时荧光定量PCR技术检测JsMVD基因在茉莉花植株不同组织及不同激素处理下的表达水平.测序结果表明,JsMVD基因全长cDNA序列的长度为1 500 bp,包含长度为1 269 bp的开放阅读框(ORF),共编码422个氨基酸,亚细胞定位预测该蛋白可能位于细胞质上.JsMVD蛋白含有GHMP激酶N-端和C-端保守结构域,具有多个保守氨基酸残基及ATP结合位点,与野生油橄榄的相似性最高,相似系数达到88%,且进化树显示两者的亲缘关系最近.JsMVD基因5′端启动子序列长度为893 bp,该调控序列包含多种植物激素响应元件和光响应元件.实时荧光定量PCR技术检测结果表明,JsMVD基因在成熟花中的表达量最高,从高到低依次为成熟花、花蕾、茎、叶、根,且受GA、IAA和ABA不同程度的诱导. 展开更多
关键词 茉莉花 甲羟戊酸焦磷酸脱羧酶(MVD) 启动子 组织特异性表达
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绿竹锌指蛋白基因BoBZF克隆及功能初步分析 被引量:7
9
作者 高志民 刘青 +2 位作者 牟少华 李雪平 胡陶 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第10期49-54,共6页
锌指蛋白在原核生物与真核生物基因转录调控中发挥着重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从绿竹叶片中分离到1个锌指蛋白基因,命名为BoBZF(GenBank登记号:EU606025)。BoBZF cDNA全长1076bp,编码256个氨基酸。蛋白结构分析表明,其编码的蛋... 锌指蛋白在原核生物与真核生物基因转录调控中发挥着重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从绿竹叶片中分离到1个锌指蛋白基因,命名为BoBZF(GenBank登记号:EU606025)。BoBZF cDNA全长1076bp,编码256个氨基酸。蛋白结构分析表明,其编码的蛋白具有2个B-Box结构域,属于B-Box型锌指蛋白。组织特异性表达显示BoBZF在叶片、叶鞘、幼茎和根中均有表达,其中在叶片的表达丰度较高。将BoBZF置于CaMV35S启动子控制下,构建到载体pBI121的多克隆位点,并转化拟南芥。RT-PCR分析表明,BoBZF已在拟南芥中表达。转基因植株耐旱性明显提高,意味着BoBZF与竹子的耐旱能力有关。 展开更多
关键词 绿竹 锌指蛋白基因 组织特异性表达 异位表达 耐旱
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麻竹同源异型盒基因DlKNOX1的克隆及功能初步分析 被引量:7
10
作者 刘青 汪玉凤 +2 位作者 赵韩生 陈颖 高志民 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第2期56-62,共7页
同源异型盒基因在决定植物的形态建成中发挥着重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从麻竹中分离到1个同源异型盒基因,其cDNA全长1 452 bp,编码1个330个氨基酸的蛋白,包含1个KNOX1区、1个KNOX2区、1个ELK区和1个Homeobox区,属于KNOX蛋白,该... 同源异型盒基因在决定植物的形态建成中发挥着重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从麻竹中分离到1个同源异型盒基因,其cDNA全长1 452 bp,编码1个330个氨基酸的蛋白,包含1个KNOX1区、1个KNOX2区、1个ELK区和1个Homeobox区,属于KNOX蛋白,该基因命名为DlKNOX1(GenBank No.KF709955)。组织表达特异性分析表明,DlKNOX1在节中的表达量最高,茎和鞘中次之,而在叶片中最低。将DlKNOX1置于35S启动子控制下,构建到载体pPZP的多克隆位点并转化拟南芥。RT-PCR分析表明,DlKNOX1已在转基因植株中表达。转基因植株表型变化明显,花期比野生型延迟,果荚着生部位明显发生变化,这意味着DlKNOX1基因可能参与麻竹形态建成的调控。 展开更多
关键词 麻竹 同源异型盒基因 组织特异性表达 异位表达 形态建成
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长牡蛎(Crassostrea gigas)两个Dmrt家族基因的时空表达 被引量:7
11
作者 张娜 黄雯 +3 位作者 许飞 李莉 张国范 郭希明 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期717-724,共8页
本文以长牡蛎27个幼虫发育阶段个体以及成体的5个组织织作为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术对其Dmrt家族中的2个基因(CgDsx和CgDmrtA2)的表达模式以及在性别决定中的作用进行了研究。结果表明,长牡蛎CgDsx基因在胚胎发育初期有大量表... 本文以长牡蛎27个幼虫发育阶段个体以及成体的5个组织织作为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术对其Dmrt家族中的2个基因(CgDsx和CgDmrtA2)的表达模式以及在性别决定中的作用进行了研究。结果表明,长牡蛎CgDsx基因在胚胎发育初期有大量表达,从囊胚期到担轮幼虫初期表达量最高,之后表达量开始降低,在D形幼虫后一直维持在极低的表达水平,此后仅在成体的雄性性腺中具有高度表达。由此可见,CgDsx可能也对早期胚胎发育起一定调控作用,同时参与了性别决定。CgDmrtA2在长牡蛎所有组织中均有表达,各组织间表达差异不显著,在D形幼虫至壳顶后期表达量较高,说明它参与了胚胎中后期的发育过程,可能与神经的形成相关,但是其具体功能还需要进一步研究。 展开更多
关键词 长牡蛎 Dmrt家族 幼虫发育 组织表达差异 性别决定
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岱衢族大黄鱼不同组织的同工酶谱 被引量:7
12
作者 管丹冬 李明云 叶帅东 《宁波大学学报(理工版)》 CAS 2008年第1期34-38,共5页
于2006年11月,在象山港采集30尾网养岱衢族大黄鱼,采用聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳方法,研究分析了岱衢族大黄鱼眼睛、肌肉、肝脏、肾脏、脾脏、心脏、胸鳍、鳃和脑9种组织中16种同工酶(LDH、ADH、MDH、ME、SOD、POD、EST、GAD、ALP、ATP、... 于2006年11月,在象山港采集30尾网养岱衢族大黄鱼,采用聚丙烯酰胺凝胶垂直电泳方法,研究分析了岱衢族大黄鱼眼睛、肌肉、肝脏、肾脏、脾脏、心脏、胸鳍、鳃和脑9种组织中16种同工酶(LDH、ADH、MDH、ME、SOD、POD、EST、GAD、ALP、ATP、FDH、SCD、IDH、GDH、ACP、GcDH)的表达情况,发现除IDH、GDH、ACP、GcDH 4种酶只显示微弱且不稳定的区带外,其他酶类在各组织中都显示出清晰稳定的酶谱,且这些酶在表型、分布和活性上均表现出高度的组织特异性,与各组织的生理功能相一致. 展开更多
关键词 岱衢族大黄鱼 同工酶 组织特异性表达
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薄壳山核桃 SnRK2 基因家族鉴定及表达分析 被引量:3
13
作者 马文娟 朱凯凯 +3 位作者 谌梦云 赵娟 谭鹏鹏 彭方仁 《植物资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期18-28,46,共12页
通过生物信息学方法从薄壳山核桃〔Carya illinoinensis(Wangenh.)K.Koch〕全基因组中鉴定出SnRK2基因家族成员,并对该基因家族成员编码蛋白的理化性质及基因的结构、保守基序、共线性关系、顺式作用元件和表达模式进行了分析。结果表明... 通过生物信息学方法从薄壳山核桃〔Carya illinoinensis(Wangenh.)K.Koch〕全基因组中鉴定出SnRK2基因家族成员,并对该基因家族成员编码蛋白的理化性质及基因的结构、保守基序、共线性关系、顺式作用元件和表达模式进行了分析。结果表明:从薄壳山核桃全基因组中鉴定出13个SnRK2基因,命名为CiSnRK2.1至CiSnRK2.13,编码氨基酸残基数为336~366,理论等电点均小于pI 7,且所有编码蛋白为亲水蛋白。13个CiSnRK2与10个拟南芥〔Arabidopsis thaliana(Linn.)Heynh.〕SnRK2的氨基酸序列高度保守,包含相同的结构域,如脱落酸(ABA)诱导调节结构域。13个CiSnRK2分为3组,薄壳山核桃与山核桃(C.cathayensis Sarg.)的SnRK2亲缘关系较近;每组中的CiSnRK2具有相似的保守基序和基因结构。13个CiSnRK2基因存在12对共线关系,Ka/Ks分析结果表明CiSnRK2基因进化过程主要受到正选择。CiSnRK2基因的启动子包含丰富的环境胁迫类及激素类响应元件,其中激素类响应元件以ABA响应元件最多。多数CiSnRK2基因在薄壳山核桃不同组织中有不同程度表达,其中CiSnRK2.5、CiSnRK2.8、CiSnRK2.9和CiSnRK2.12的表达水平较低,CiSnRK2.2、CiSnRK2.3和CiSnRK2.13的表达水平较高。经100μmol·L-1 ABA处理24 h后,除CiSnRK2.2、CiSnRK2.3、CiSnRK2.6外,其余10个基因表达水平均上调。综合分析表明:薄壳山核桃SnRK2基因家族成员具有SnRK2基因家族的基本特征;该基因家族成员在不同组织中的表达特性存在差异,部分CiSnRK2基因的表达呈现组织特异性;ABA处理后部分CiSnRK2基因的表达水平显著上调,由此推断这些基因可能参与薄壳山核桃的ABA诱导响应过程。 展开更多
关键词 薄壳山核桃 SnRK2基因 生物信息学分析 组织特异性表达 ABA诱导
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光唇鱼不同组织的同工酶谱 被引量:6
14
作者 周健博 李明云 《水产科学》 CAS 北大核心 2010年第4期229-231,共3页
采用垂直聚丙烯酰胺平板电泳,研究了光唇鱼的肝脏、脾脏、心脏、肾脏、脑、鳃耙、眼睛、背鳍和肌肉9种组织器官中10种同工酶,分析了其酶谱表型。结果表明,除了过氧化氢酶和酸性磷酸酶只显示微弱且不稳定的区带外,乳酸脱氢酶、苹果酸脱... 采用垂直聚丙烯酰胺平板电泳,研究了光唇鱼的肝脏、脾脏、心脏、肾脏、脑、鳃耙、眼睛、背鳍和肌肉9种组织器官中10种同工酶,分析了其酶谱表型。结果表明,除了过氧化氢酶和酸性磷酸酶只显示微弱且不稳定的区带外,乳酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶、超氧化物歧化酶、苹果酸酶、醇脱氢酶、过氧化物酶、酯酶和淀粉酶均显示出清晰稳定的酶谱。这些酶的表型、分布和活性上均有高度的组织特异性,与各组织的生理功能相一致。 展开更多
关键词 光唇鱼 同工酶 组织特异性表达
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尾巨桉HMGR基因的克隆及表达分析 被引量:6
15
作者 蒋春 张华玲 彭江 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期113-117,共5页
基于RACE技术克隆得到尾巨桉3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶(EuHMGR)基因全长为1955bp,包含1560bp的开放阅读框(ORF),编码519个氨基酸。生物信息学分析表明EuHMGR包含两个HMG-CoA结合基序和两个NADP(H)结合基序;同源建模得到EuHMGR三维... 基于RACE技术克隆得到尾巨桉3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶(EuHMGR)基因全长为1955bp,包含1560bp的开放阅读框(ORF),编码519个氨基酸。生物信息学分析表明EuHMGR包含两个HMG-CoA结合基序和两个NADP(H)结合基序;同源建模得到EuHMGR三维构象呈"V"型,包含N-结构域、S-结构域和L-结构域。将EuHMGR组DNA与cDNA序列进行比对表明EuHMGR存在一个319bp的内含子。通过实时定量PCR进行组织特异性表达分析表明EuHMGR在茎中的表达量最高,叶次之,在根中基本无表达。该研究为后续尾巨桉EuHMGR的功能验证以及遗传转化奠定基础。 展开更多
关键词 尾巨桉 HMGR 生物信息学 内含子 组织特异性表达
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禹白芷苯丙氨酸解氨酶基因AdPAL1的克隆与表达分析 被引量:1
16
作者 张晓东 刘勇江 +3 位作者 沙漠 赵晶晶 李会平 张喜 《广东农业科学》 CAS 2023年第5期1-10,共10页
【目的】探究禹白芷中欧前胡素含量与苯丙氨酸解氨酶基因AdPAL1表达的相关性,并对AdPAL1进行克隆和原核表达。【方法】使用高效液相色谱法测定禹白芷快速生长期和收获期根和叶中欧前胡素的含量,并使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法测定A... 【目的】探究禹白芷中欧前胡素含量与苯丙氨酸解氨酶基因AdPAL1表达的相关性,并对AdPAL1进行克隆和原核表达。【方法】使用高效液相色谱法测定禹白芷快速生长期和收获期根和叶中欧前胡素的含量,并使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法测定AdPAL1基因在同时期根和叶中的表达情况,以观察欧前胡素含量与AdPAL1基因表达是否具有相关性。此外,以禹白芷转录组为基础,采用逆转录PCR(RT-PCR)技术从禹白芷根中克隆AdPAL1基因,并在大肠杆菌中进行表达。【结果】禹白芷快速生长期根中的欧前胡素含量远高于叶,而AdPAL1基因在根中的表达量也远高于叶。与快速生长期相比,收获期根中欧前胡素含量略有下降,AdPAL1基因在根中的表达量也同时下降。这些结果表明AdPAL1基因表达与欧前胡素含量具有相关性。此外,生物信息学分析显示,禹白芷AdPAL1基因(GenBank登录号:OQ822236)开放阅读框长1764 bp,编码557个氨基酸,其蛋白相对分子质量为61.10 kD,等电点为5.92,且具有苯丙氨酸解氨酶保守结构域(IPR005922,1~547),属于PAL蛋白家族成员。AdPAL1蛋白定位于细胞质,主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,与石防风属植物KpPAL2蛋白亲缘关系最近,序列相似性高达99.28%。AdPAL1基因在大肠杆菌中表达的重组蛋白相对分子质量约为84.00 kD,与预期蛋白大小一致。【结论】初步确定禹白芷根和叶中欧前胡素含量与AdPAL1基因表达相关,并成功克隆AdPAL1基因,在大肠杆菌中成功表达。上述结果为进一步研究AdPAL1基因在欧前胡素生物合成中的作用机制提供参考。 展开更多
关键词 禹白芷 欧前胡素 苯丙氨酸解氨酶 组织特异性表达 基因克隆 生物信息学分析 原核表达
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谷子PLATZ转录因子基因家族的鉴定和分析 被引量:1
17
作者 孙蓉 杨宇琭 +2 位作者 李亚军 张会 李旭凯 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期548-559,共12页
PLATZ转录因子家族是一类植物特异性锌依赖DNA结合蛋白,在植物生长发育和抗逆过程中发挥不可或缺的作用。然而,对于谷子(Setaria italica)PLATZ家族基因尚未进行系统研究。在谷子基因组中鉴定出17个PLATZ基因并对其进行系统命名。通过... PLATZ转录因子家族是一类植物特异性锌依赖DNA结合蛋白,在植物生长发育和抗逆过程中发挥不可或缺的作用。然而,对于谷子(Setaria italica)PLATZ家族基因尚未进行系统研究。在谷子基因组中鉴定出17个PLATZ基因并对其进行系统命名。通过系统发育分析将SiPLATZ基因划分为5个亚家族,同一亚家族成员具有相似的基因结构和保守基序。顺式作用元件分析表明,SiPLATZ基因可能在籽粒胚乳发育和多种抗逆反应中发挥作用。Ka/Ks分析表明,重复基因受到纯化选择。SiPLATZ基因在不同组织和发育阶段的表达存在显著差异,主要包括在根、叶和茎中高表达,以及在穗和籽粒中高表达两类,这体现出SiPLATZ基因生理功能的复杂性,其可能参与调节籽粒生长和多种抗逆反应。此外,结合WGCNA分析构建的共表达网络,发现SiPLATZ6、SiPLATZ8、SiPLATZ9和SiPLATZ11可能是谷子产量遗传改良和功能基因研究的候选基因。研究结果为深入揭示PLATZ转录因子在谷子生长发育中的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 PLATZ 谷子 全基因组鉴定 组织特异性表达 WGCNA
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中国水仙NtMADS3基因全长的克隆与表达分析 被引量:4
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作者 高志民 陈段芬 彭镇华 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期96-101,共6页
MADS-box基因在植物花发育中具有重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从中国水仙幼嫩花蕾中分离到了一个MADS-box同源基因,命名为NtMADS3(GenBank登记号:EU081900)。该基因cDNA全长980 bp;编码区编码241个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基... MADS-box基因在植物花发育中具有重要作用。采用RT-PCR和RACE技术,从中国水仙幼嫩花蕾中分离到了一个MADS-box同源基因,命名为NtMADS3(GenBank登记号:EU081900)。该基因cDNA全长980 bp;编码区编码241个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基因结构。序列分析表明,NtMADS3编码的蛋白与其他植物的MADS-box蛋白有着较高的一致性,其中与石刁柏的AOM3一致性高达89.2%,与拟南芥的AGL6一致性为60.0%。系统进化树分析表明NtMADS3基因属于E类功能基因。组织表达模式分析显示,NtMADS3基因在中国水仙的开花期各器官及花的各部位均有表达。将该基因置于CaMV 35S启动子控制下,构建到载体pBI121的多克隆位点,在拟南芥中异位表达,转基因植株花期提前,但花型无显著变化。 展开更多
关键词 中国水仙 MADS-BOX基因 克隆 组织特异性表达 异位表达
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ERF转录因子调控杨树叶片形态构建的功能分析
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作者 王升级 周猎鼎 +4 位作者 胡佳 金霞 党慧 赵凯 韩有志 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1157-1168,共12页
ERF转录因子在植物生长发育及逆境胁迫应答过程中发挥着重要的调控功能,但关于ERF转录因子调控杨树叶片大小发育的功能及作用机制尚不清楚。本研究通过生物信息学筛选获得杨树ERF_II亚族转录因子15个,根据其氨基酸序列特征进一步分为A和... ERF转录因子在植物生长发育及逆境胁迫应答过程中发挥着重要的调控功能,但关于ERF转录因子调控杨树叶片大小发育的功能及作用机制尚不清楚。本研究通过生物信息学筛选获得杨树ERF_II亚族转录因子15个,根据其氨基酸序列特征进一步分为A和B两组, A组成员第77位为丙氨酸-A,含有Motif 4、Motif 6元件及2个UTR区域;而B组成员第77位为苏氨酸-T或者异亮氨酸-I并含有特异的Motif 5。基因片段重复分析表明杨树ERF_II亚族存在7对基因片段重复;基因共线性分析结果显示8个ERF_II亚族转录因子与11个拟南芥基因存在21对片段重复,说明ERF_II亚族转录因子之间存在基因功能冗余。基因组织特异性表达模式分析表明Potri.002G085600、Potri.005G176000、Potri.006G138700、Potri.018G047300和Potri.006G138800等5个基因在根中表达量最高;Potri.018G038100 (ERF194)在叶中表达量最高;Potri.014-G025200和Potri.002G124000在茎中表达量最低。表达相关性分析结果显示Potri.006G138700、Potri.006G138800、Potri.006G218200和Potri.018G047300等4个基因以Potri.006G138700为中枢存在显著相关性, Potri.002G085600与Potri.005G176000表达存在相关性。基因功能注释分析显示15个ERF_II亚族转录因子基因均在细胞组成中发挥着作用,说明其具有组织特异性。叶片大小及生理指标分析结果显示OX株系叶片明显小于非转基因对照, OX叶片鲜重和干重亦小于WT,但并未达到显著差异,而OX比叶重大于WT,说明OX的叶片厚度的增加弥补了面积减小对其重量的影响;OX株系叶片颜色更深,叶绿素含量明显大于WT;而RNAi与WT差异不明显。说明ERF194的抑制表达对于杨树片叶的发育并无明显影响,其功能可能与ERF_II亚族其他转录因子存在冗余或互补。本研究揭示了ERF_II亚族转录因子成员之间存在基因功能冗余,并且在调控杨树叶片大小生长过程中发挥着重要的作用。尤其是ERF194的过� 展开更多
关键词 ERF转录因子 杨树 叶片发育 组织特异性表达 ERF194
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北沙参异戊烯基转移酶GlIPT1基因的克隆及生物信息学分析 被引量:4
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作者 陈泓宇 任宏伟 +3 位作者 张玉喜 王卫青 谭玲玲 高婷 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2020年第4期1176-1184,共9页
目的挖掘参与北沙参(Glehniae Radix)香豆素合成的关键酶异戊烯基转移酶(Isoprenyltransferase,IPT)基因,进一步分析该基因的序列特征及表达量模式。方法本研究摸索了一种北沙参基原植物珊瑚菜(Glehnia littoralis Fr.Schmidt ex Miq.)... 目的挖掘参与北沙参(Glehniae Radix)香豆素合成的关键酶异戊烯基转移酶(Isoprenyltransferase,IPT)基因,进一步分析该基因的序列特征及表达量模式。方法本研究摸索了一种北沙参基原植物珊瑚菜(Glehnia littoralis Fr.Schmidt ex Miq.)无菌苗制备方法,并且在珊瑚菜转录组测序数据的基础上,使用茉莉酸甲酯(MeJA)处理筛选出表达量上调的候选基因序列;利用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术对GlIPT1基因cDNA序列进行全长克隆;根据所得的氨基酸序列进行蛋白质理化性质、二级结构、三级结构分析;利用Clustalx及MEGA 6.0构建NJ系统进化树;利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)方法检测该基因的组织特异性表达。结果GlIPT1基因cDNA序列全长为1296 bp,编码306个氨基酸残基,蛋白相对分子质量为34409.30 Da,等电点为5.93,属于P-loop_NTPase超家族,为亲水性蛋白。系统进化分析表明,GlIPT1与伞形科植物胡萝卜Daucus carota subsp.sativus IPT蛋白亲缘关系较近。荧光定量PCR结果显示:GlIPT1基因在珊瑚菜的花中表达量最高,其次是根,在叶中表达量较低。结论本实验为进一步研究北沙参的分子育种和利用生物技术提高香豆素产量奠定了基础,具有重要的理论价值和良好的应用前景。 展开更多
关键词 北沙参 异戊烯基转移酶基因 RACE 生物信息学分析 组织特异性表达
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