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贵州疣螈D-loop区和tRNA^(Phe)序列变异及群体遗传多样性
被引量:
3
1
作者
肖羽
陈光照
谷晓明
《动物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期21-29,共9页
贵州疣螈(Tylototriton kweichowensis)是我国特有的国家Ⅱ级保护动物,分布面积极为狭窄。为了解其遗传多样性现状,作者采获了几乎覆盖其分布范围的12群体的58个体的材料,测定了线粒体D-loop区(mtDNA控制区)及tRNAPhe基因全序列共808bp...
贵州疣螈(Tylototriton kweichowensis)是我国特有的国家Ⅱ级保护动物,分布面积极为狭窄。为了解其遗传多样性现状,作者采获了几乎覆盖其分布范围的12群体的58个体的材料,测定了线粒体D-loop区(mtDNA控制区)及tRNAPhe基因全序列共808bp,发现16个变异位点,定义了26个单元型。遗传多样性检测显示,贵州疣螈种群具有高的单元型多样性和低的核苷酸多样性。Tajima’s D和Fuand Li’s D值检测结果均表明,贵州疣螈种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离。系统发育及网络进化分析没有显示出单元型和地理位置的对应关系,各群体的单元型都相互散布在不同的分布群中,呈现一种混杂的分布格局。水城群体与其他任一群体间基因流Nm<1,有分化的迹象。总的来说,贵州疣螈各群体之间没有发生极显著的遗传分化,因此建议将贵州疣螈所有群体作为一个整体管理单元加以保护。
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关键词
贵州疣螈
D-LOOP区
trnaphe
基因
遗传多样性
基因流
原文传递
鲤鱼线粒体tRNA^(phe)基因结构的特异性
被引量:
2
2
作者
米志勇
刘兰香
+1 位作者
王钢锋
吴乃虎
《实验生物学报》
CSCD
1996年第3期269-272,共4页
鲤鱼线粒体tRNA^(phe)基因的核酸序列已被测定。在鲸、人、爪蟾、牛、小鼠、鸡和鲤鱼中对此基因序列比较发现在D茎存在一个奇怪的保守结构,然而D茎在其余种类的已经测定的脊椎动物线粒体tRNA基因和细胞质tRNA基因中是极不保守的。这一...
鲤鱼线粒体tRNA^(phe)基因的核酸序列已被测定。在鲸、人、爪蟾、牛、小鼠、鸡和鲤鱼中对此基因序列比较发现在D茎存在一个奇怪的保守结构,然而D茎在其余种类的已经测定的脊椎动物线粒体tRNA基因和细胞质tRNA基因中是极不保守的。这一保守结构包含有13bp碱基,我们将此保守区前7个碱基与真核生物RNA PolⅢ识别的A区相比较,发现在此不同物种的两种序列存在部分的同源性。考虑到tRNA^(phe)基因在线粒体基因组上位于置换环区和线粒体rRNA基因编码区之间这一特殊区域内,我们推测这一奇怪的保守结构可能存在其它更为有意义的功能。
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关键词
鲤鱼
线粒体
trnaphe
基因
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题名
贵州疣螈D-loop区和tRNA^(Phe)序列变异及群体遗传多样性
被引量:
3
1
作者
肖羽
陈光照
谷晓明
机构
贵州师范大学生命科学学院
出处
《动物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第3期21-29,共9页
基金
贵州省教育厅自然科学研究项目(No.黔教科(2007)017)
贵州省国际科技合作重点项目(No.黔科合外G字(2008)700116)
文摘
贵州疣螈(Tylototriton kweichowensis)是我国特有的国家Ⅱ级保护动物,分布面积极为狭窄。为了解其遗传多样性现状,作者采获了几乎覆盖其分布范围的12群体的58个体的材料,测定了线粒体D-loop区(mtDNA控制区)及tRNAPhe基因全序列共808bp,发现16个变异位点,定义了26个单元型。遗传多样性检测显示,贵州疣螈种群具有高的单元型多样性和低的核苷酸多样性。Tajima’s D和Fuand Li’s D值检测结果均表明,贵州疣螈种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离。系统发育及网络进化分析没有显示出单元型和地理位置的对应关系,各群体的单元型都相互散布在不同的分布群中,呈现一种混杂的分布格局。水城群体与其他任一群体间基因流Nm<1,有分化的迹象。总的来说,贵州疣螈各群体之间没有发生极显著的遗传分化,因此建议将贵州疣螈所有群体作为一个整体管理单元加以保护。
关键词
贵州疣螈
D-LOOP区
trnaphe
基因
遗传多样性
基因流
Keywords
Tylototriton
kweichowensis
mtDNA
D-loop
trnaphe
gene
gene
tic
diversity
gene
flow
分类号
Q953 [生物学—动物学]
原文传递
题名
鲤鱼线粒体tRNA^(phe)基因结构的特异性
被引量:
2
2
作者
米志勇
刘兰香
王钢锋
吴乃虎
机构
中国科学院发育生物学研究所
出处
《实验生物学报》
CSCD
1996年第3期269-272,共4页
基金
国家自然科学基金
文摘
鲤鱼线粒体tRNA^(phe)基因的核酸序列已被测定。在鲸、人、爪蟾、牛、小鼠、鸡和鲤鱼中对此基因序列比较发现在D茎存在一个奇怪的保守结构,然而D茎在其余种类的已经测定的脊椎动物线粒体tRNA基因和细胞质tRNA基因中是极不保守的。这一保守结构包含有13bp碱基,我们将此保守区前7个碱基与真核生物RNA PolⅢ识别的A区相比较,发现在此不同物种的两种序列存在部分的同源性。考虑到tRNA^(phe)基因在线粒体基因组上位于置换环区和线粒体rRNA基因编码区之间这一特殊区域内,我们推测这一奇怪的保守结构可能存在其它更为有意义的功能。
关键词
鲤鱼
线粒体
trnaphe
基因
Keywords
Carp
mitochondria.
tRNA^(phe)
gene
.
分类号
Q959.468 [生物学—动物学]
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题名
作者
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1
贵州疣螈D-loop区和tRNA^(Phe)序列变异及群体遗传多样性
肖羽
陈光照
谷晓明
《动物学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
3
原文传递
2
鲤鱼线粒体tRNA^(phe)基因结构的特异性
米志勇
刘兰香
王钢锋
吴乃虎
《实验生物学报》
CSCD
1996
2
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参考文献
引证文献
统计分析
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