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生存曲线中Meta分析适宜数据的提取与转换 被引量:59
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作者 周支瑞 张天嵩 +3 位作者 李博 毛智 曾宪涛 刘士新 《中国循证心血管医学杂志》 2014年第3期243-247,共5页
生存分析是处理生存数据重要的统计学方法,生存数据的Meta分析在预后研究的系统评价中应用广泛,但生存资料原始数据通常较难获得。本文通过实例演示的形式介绍如何通过文献中的生存曲线提取生存资料数据并通过提取的生存率数据计算Meta... 生存分析是处理生存数据重要的统计学方法,生存数据的Meta分析在预后研究的系统评价中应用广泛,但生存资料原始数据通常较难获得。本文通过实例演示的形式介绍如何通过文献中的生存曲线提取生存资料数据并通过提取的生存率数据计算Meta合并所需要的数据。 展开更多
关键词 生存数据 生存分析 生存曲线 预后 META分析 系统评价
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RevMan、Stata和R软件在生存资料Meta分析的应用 被引量:10
2
作者 陈新林 胡月 +4 位作者 郎建英 陈丽霞 徐谦 莫传伟 武哲丽 《中国循证医学杂志》 CSCD 2016年第6期736-740,共5页
生存资料的Meta分析越来越多。从原始文献计算出风险比(HR)及其95%可信区间,实际频数和理论频数的差值(O-E)及其标准差后,可以使用Review Manager(RevMan)、Stata和R等软件计算合并HR。RevMan软件简单易学,但存在一定的局限;Stata和R软... 生存资料的Meta分析越来越多。从原始文献计算出风险比(HR)及其95%可信区间,实际频数和理论频数的差值(O-E)及其标准差后,可以使用Review Manager(RevMan)、Stata和R等软件计算合并HR。RevMan软件简单易学,但存在一定的局限;Stata和R软件功能强大,灵活多样,能够绘制多种图形,但需要进行适当的编程。 展开更多
关键词 生存数据 META分析 REV MAN STATA R软件
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联合模型介绍及在医学研究中的应用 被引量:9
3
作者 翟映红 陈琪 +4 位作者 韩贺东 赵欣欣 高永晴 周详 贺佳 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1456-1460,共5页
医学随访研究中,纵向数据和生存数据往往伴随出现,并且通常相关联,对纵向数据和生存数据单独分析可能会导致有偏倚的结果.联合模型同时处理纵向数据及生存数据,能够纠正偏差,提高参数估计的效率并提供有效的推论,是目前医学研究中一个... 医学随访研究中,纵向数据和生存数据往往伴随出现,并且通常相关联,对纵向数据和生存数据单独分析可能会导致有偏倚的结果.联合模型同时处理纵向数据及生存数据,能够纠正偏差,提高参数估计的效率并提供有效的推论,是目前医学研究中一个比较热门的方法.联合模型已取得较多进展,国内介绍及应用联合模型的文章较少.本文将从主要思想、基本框架、参数估计方法等方面对联合模型中的随机效应模型进行介绍,并基于R软件中程序包JM对艾滋病数据集分析,旨在阐明联合模型在处理医学随访数据中的优势,促进联合模型在临床研究中的应用. 展开更多
关键词 联合模型 纵向数据 生存数据
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不同删失比例下生存数据模拟生成的方法 被引量:4
4
作者 钱俊 刘国庆 周业明 《数理医药学杂志》 2013年第6期644-646,共3页
生存分布、删失分布、删失比例等因素是生存数据模拟需考虑的重要因素。按含删失的生存数据产生的一般步骤,分别探讨了生存时间生成,删失时间生成,以及删失比例大小设置为不同数值时,生存数据模拟生成的方法,并辅以SAS程序说明。
关键词 删失比例 生存分布 生存时间 生存数据
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如何利用WinBUGS软件开展生存数据网状Meta分析 被引量:5
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作者 李伦 葛龙 +3 位作者 刘爱萍 张俊华 张珺 田金徽 《中国药物评价》 2016年第5期402-405,411,共5页
本文主要介绍如何利用WinBUGS软件开展风险比的网状Meta分析、生存曲线的网状Meta分析以及合并二分类变量结果与风险比结果的网状Meta分析,期望为生存数据网状Meta分析撰写者提供帮助。
关键词 网状Meta分析 生存数据
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生存分析资料进行Meta分析时所需主要结局指标的换算方法 被引量:5
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作者 陈新林 文艺 +6 位作者 胡月 江梅 武哲丽 李先涛 周倩仪 徐谦 莫传伟 《循证医学》 CSCD 2016年第4期244-246,252,共4页
生存资料的Meta分析越来越多,但是大部分原始文献并没有全面报告实际死亡数(O)、理论死亡数(E)、风险比(HR)及其方差(V),本文总结了O-E、HR和V等指标的多种转换公式。希望研究者能够灵活应用这些公式计算生存资料Meta分析的必备指标,并... 生存资料的Meta分析越来越多,但是大部分原始文献并没有全面报告实际死亡数(O)、理论死亡数(E)、风险比(HR)及其方差(V),本文总结了O-E、HR和V等指标的多种转换公式。希望研究者能够灵活应用这些公式计算生存资料Meta分析的必备指标,并采用HR进行生存资料的Meta分析。 展开更多
关键词 生存数据 META分析 实际死亡数 理论死亡数 风险比
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生存资料回归模型分析——生存资料及其统计分析方法概述 被引量:3
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作者 刘媛媛 李长平 胡良平 《四川精神卫生》 2020年第1期21-26,共6页
本文目的是全面介绍生存资料的特点及其常用统计分析方法。生存资料具有以下四个特点:①同时具有生存结局和生存时间;②生存时间可能含有删失数据或截尾数据;③生存时间的分布通常不服从正态分布,常呈指数分布、Weibull分布、对数正态分... 本文目的是全面介绍生存资料的特点及其常用统计分析方法。生存资料具有以下四个特点:①同时具有生存结局和生存时间;②生存时间可能含有删失数据或截尾数据;③生存时间的分布通常不服从正态分布,常呈指数分布、Weibull分布、对数正态分布;④影响生存时间的因素较复杂且不易控制。生存资料统计分析方法涉及统计描述、差异性分析和回归分析三大类,其中,统计描述主要有Kaplan-Meier(卡普兰-迈耶)估计法和Life table(寿命表)估计法;差异性分析主要有对数秩检验(log-rank test)和威尔考克森检验(Wilcoxon test);而回归分析主要有Cox比例和非比例风险回归模型、参数回归模型。在对生存资料进行统计分析时,需要合理选择统计分析方法,方可全面而又深入地揭示生存资料的内在变化规律。 展开更多
关键词 生存资料 删失数据 生存分析 生存函数 风险函数 回归分析
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生存资料的二次研究系列之一:应用R软件实现生存曲线中数据提取与生存曲线的合并 被引量:4
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作者 孟详喻 靳英辉 +3 位作者 程小柯 张永刚 曹越 曾宪涛 《中国循证心血管医学杂志》 2016年第1期2-6,共5页
涉及生存资料的Meta分析最常用的方法是对两组比较的风险比(hazard ratio,HR)进行合并,其数据基础是原始研究的HR及其95%可信区间(95%CI)。然而,原始研究中HR及其95%CI未报道或不完整报道的情况并不少见,这限制了基于HR的Meta分析的开... 涉及生存资料的Meta分析最常用的方法是对两组比较的风险比(hazard ratio,HR)进行合并,其数据基础是原始研究的HR及其95%可信区间(95%CI)。然而,原始研究中HR及其95%CI未报道或不完整报道的情况并不少见,这限制了基于HR的Meta分析的开展。绝大多数涉及生存结局的原始研究均提供了生存曲线,通过对生存曲线进行合并能对人群的生存结局进行全面评估。本文介绍利用R软件实现生存曲线数据提取并对其进行合并以生成汇总生存曲线的方法。 展开更多
关键词 生存资料 生存曲线 R软件
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基于共享随机效应模型的纵向认知标志物对轻度认知障碍逆转的预测性能比较
9
作者 秦瑶 韩红娟 +6 位作者 刘龙 陈杜荣 马艺菲 崔靖 白文琳 张荣 余红梅 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2024年第3期370-375,共6页
目的将共享随机效应模型(shared random-effect model,SREM)应用于轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)向认知正常(normal cognition,NC)逆转的研究,比较不同纵向认知标志物对MCI逆转的预测性能,并评价影响因素的协变量效应。... 目的将共享随机效应模型(shared random-effect model,SREM)应用于轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)向认知正常(normal cognition,NC)逆转的研究,比较不同纵向认知标志物对MCI逆转的预测性能,并评价影响因素的协变量效应。方法SREM模型包括两个子模型,其中纵向子模型采用线性混合效应模型对纵向认知标志物的变化轨迹建模,生存子模型采用比例风险模型对生存过程建模。基于对数似然函数值和信息准则进行模型拟合优度检验,采用ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)评价不同纵向认知标志物(MMSE、CDRSB、FAQ、ADAS11、ADAS13和ADASQ4)对MCI逆转的预测性能;同时进行纵向子模型和生存子模型的影响因素分析。结果843名MCI患者中72名(8.54%)在随访结束后逆转为NC。以spline-PH-GH参数分布为基准风险函数的SREM模型对数似然函数值最大,AIC和BIC最小;以CDRSB为纵向认知标志物建立的SREM模型拟合最好,在不同时间的AUC值均表现良好,范围为0.797~0.852,且预测误差最小,范围为0.0427~0.0429;年龄、性别、受教育程度、婚姻状况和APOEε4基因均会影响MCI患者的认知功能和日常活动功能,六种纵向认知标志物均会影响MCI患者的逆转。结论CDR评分对MCI患者的认知功能和逆转预测性能最佳;认知功能和日常活动功能可作为MCI逆转的动态监测指标。 展开更多
关键词 共享随机效应模型 联合模型 纵向数据 生存数据 轻度认知障碍 逆转
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基于一种距离相关的超高维生存数据Model-Free特征筛选
10
作者 潘莹丽 王昊宇 +1 位作者 喻佳丽 刘展 《湖北大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第1期122-132,共11页
随着大数据时代的来临,数据维度爆炸式增长,超高维数据的降维问题逐渐成为众多研究领域的热点话题。由于响应变量通常存在右删失,处理超高维完全数据的降维方法在右删失数据中将不再适用。本研究提出一种新的基于距离相关能有效处理超... 随着大数据时代的来临,数据维度爆炸式增长,超高维数据的降维问题逐渐成为众多研究领域的热点话题。由于响应变量通常存在右删失,处理超高维完全数据的降维方法在右删失数据中将不再适用。本研究提出一种新的基于距离相关能有效处理超高维右删失数据的特征筛选方法。首先利用距离相关系数计算每个协变量对响应变量的边际效应,建立与该系数有关的筛选指标,然后再根据事先确立的筛选准则进行特征筛选。提出的特征筛选方法不依赖任何模型结构假定,因此可以有效避免模型指定错误带来的不良后果。此外,该方法采用的距离协方差估计量是总体距离协方差的一个无偏估计,统计准确性和计算精度高。模拟和实证研究表明,提出的方法能在保留所有重要变量的前提下快速剔除与响应变量相关程度较弱的协变量,从而达到降低参数维数的目的。 展开更多
关键词 超高维数据 生存数据 距离相关 Model-Free特征筛选
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网络Meta分析研究进展系列(十三):生存数据的网络Meta分析 被引量:4
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作者 张天嵩 董圣杰 +3 位作者 杨智荣 武珊珊 田金徽 孙凤 《中国循证心血管医学杂志》 2021年第6期649-652,共4页
本文系统梳理了生存数据的基本类型和重建、效应量计算、转换、统计模型及实现软件等,以期提高NMA制定者和使用者规范实施和解读生存数据NMA的能力。
关键词 网络Meta分析 生存数据 至事件时间数据 统计模型 统计软件
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A Class of Weighted Estimators for Additive Hazards Model in Case-cohort Studies 被引量:3
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作者 Cai-lin DONG Jie ZHOU Liu-quan SUN 《Acta Mathematicae Applicatae Sinica》 SCIE CSCD 2014年第4期1153-1168,共16页
Case-cohort sampling is a commonly used and efficient method for studying large cohorts. In many situations, some covariates are easily measured on all cohort subjects, and surrogate measurements of the expensive cova... Case-cohort sampling is a commonly used and efficient method for studying large cohorts. In many situations, some covariates are easily measured on all cohort subjects, and surrogate measurements of the expensive covariates also may be observed. In this paper, to make full use of the covariate data collected outside the case-cohort sample, we propose'a class of weighted estimators with general time-varying weights for the additive hazards model, and the estimators are shown to be consistent and asymptotically normal. We also identify the estimator within this class that maximizes efficiency, and simulation studies show that the efficiency gains of the proposed estimator over the existing ones can be substantial in practical situations. A real example is provided. 展开更多
关键词 additive hazards case-cohort study stratified sampling survival data two-phase design
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匹配调整间接比较用于生存数据分析:在R语言中的实现
13
作者 胡宏飞 马越 +2 位作者 裘怡津 李宇昕 周挺 《中国循证医学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期105-111,共7页
随着单臂临床试验日益增多,缺乏头对头临床研究,未调整的间接比较和网状Meta分析应用局限性日益突出。当个体数据数量有限时,匹配调整间接比较能够充分地利用单项研究个体数据并通过倾向得分匹配其他研究的汇总数据,有效地平衡不同试验... 随着单臂临床试验日益增多,缺乏头对头临床研究,未调整的间接比较和网状Meta分析应用局限性日益突出。当个体数据数量有限时,匹配调整间接比较能够充分地利用单项研究个体数据并通过倾向得分匹配其他研究的汇总数据,有效地平衡不同试验中人群差异带来的潜在偏倚,并完成目标干预措施间的疗效比较。本研究一方面围绕匹配调整间接比较有关概念和原理进行介绍,另一方面,基于当前肿瘤药物评价的广泛应用,系统展示如何基于R语言使用锚定匹配调整间接比较法针对生存数据进行分析,以期为科学循证决策提供参考。 展开更多
关键词 R语言 匹配调整间接比较 生存数据
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基于投影相关的超高维生存数据的特征筛选新方法
14
作者 潘莹丽 葛翔宇 周艳丽 《中国科学:数学》 CSCD 北大核心 2024年第2期211-230,共20页
本文对超高维右删失生存数据的特征筛选提出一种基于投影相关且具有确定独立筛选(projection correlation sure independent screening, PC-SIS)的新方法.一方面, PC-SIS方法并不需要指定任何模型,也不需要对生存函数进行非参数估计,且... 本文对超高维右删失生存数据的特征筛选提出一种基于投影相关且具有确定独立筛选(projection correlation sure independent screening, PC-SIS)的新方法.一方面, PC-SIS方法并不需要指定任何模型,也不需要对生存函数进行非参数估计,且对矩条件和次指数条件不敏感,适用于对异常值或厚尾数据的分析.另一方面,在一定的正则化条件下, PC-SIS方法具有确定筛选性和秩相合性.模拟和实证研究表明, PC-SIS方法能在保留所有重要特征的前提下剔除与响应变量相关程度较弱的特征,以实现降维的目的. 展开更多
关键词 投影相关 秩相合性 确定筛选 生存数据 超高维
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基于纵向数据与生存时间数据联合建模的变量选择 被引量:3
15
作者 胡亚南 王春雨 田茂再 《数理统计与管理》 CSSCI 北大核心 2019年第3期483-494,共12页
纵向数据和生存时间数据联合建模能减少由单独建模所引起的偏差,本文研究了基于纵向数据和生存时间联合建模的变量选择问题。对于生存时间数据,把生存时间做离散化处理,引入离散风险函数的Probit模型;对于纵向数据,利用线性混合效应模... 纵向数据和生存时间数据联合建模能减少由单独建模所引起的偏差,本文研究了基于纵向数据和生存时间联合建模的变量选择问题。对于生存时间数据,把生存时间做离散化处理,引入离散风险函数的Probit模型;对于纵向数据,利用线性混合效应模型建模。采用共享随机效应的方法对纵向数据和生存时间进行联合建模,通过利用多元高斯隐截断分布,构造出联合模型的精确似然。然后对似然函数加惩罚,重新构造目标函数,得到回归系数的稀疏估计量。理论证明以及数值模拟研究展示了稀疏估计量的良好性质。 展开更多
关键词 纵向数据 生存数据 变量选择 联合建模
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老年人脉压变化与全因死亡关联的贝叶斯联合模型应用研究 被引量:3
16
作者 谢纬华 余小金 +5 位作者 戴品远 孙金芳 王莉娜 覃玉 武鸣 赵健 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期72-77,共6页
目的以老年人脉压变化与全因死亡的关联研究为背景,探讨贝叶斯联合模型拟合相互关联的纵向结局与生存结局时的应用策略和统计性能,为类似特征资料的分析提供方法学指导。方法本研究以自然三次样条函数拟合纵向测量脉压的非线性混合效应... 目的以老年人脉压变化与全因死亡的关联研究为背景,探讨贝叶斯联合模型拟合相互关联的纵向结局与生存结局时的应用策略和统计性能,为类似特征资料的分析提供方法学指导。方法本研究以自然三次样条函数拟合纵向测量脉压的非线性混合效应模型,并采用B样条法构建全死因生存结局的基线风险函数,通过共享的随机效应关联两个过程建立贝叶斯联合模型,运用Gibbs抽样进行模型参数计算,并将贝叶斯联合模型结果与经典两步法联合模型进行比较。结果贝叶斯联合模型结果显示基线脉压越高(α1=0.72, 95%CI:0.43~1.13),第0~3年、3~6年、6~9年脉压升高越快(α21=0.34, 95%CI:0.20~0.45;α22=0.45, 95%CI:0.10~0.75;α23=0.42, 95%CI:0.24~0.62),老年人全因死亡风险越高。贝叶斯法和两步法联合模型在参数点估计方向上具有一致性,贝叶斯法的区间宽度大于两步法。结论当纵向与生存数据存在关联时,贝叶斯联合模型是对纵向与生存数据联合分析合理有效的统计方法。研究显示,老年人基线脉压过高和脉压升高过快均会造成更高的死亡风险。 展开更多
关键词 纵向数据 生存数据 老年人脉压 全因死亡 贝叶斯联合模型 两步法联合模型
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疾病预后研究的中介分析方法评价 被引量:3
17
作者 施倩雯 魏永越 +3 位作者 李清雅 段巍巍 赵杨 陈峰 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2017年第3期390-396,共7页
目的对用于癌症预后研究的五种中介分析方法(VanderWeele法、Baron-Kenny法、Imai法、Sobel法和InverseWeight法)进行评价,为实例分析的方法选择提供依据。方法基于模拟试验,产生不同参数设置下的模拟数据,并评价五种方法的第一类错误... 目的对用于癌症预后研究的五种中介分析方法(VanderWeele法、Baron-Kenny法、Imai法、Sobel法和InverseWeight法)进行评价,为实例分析的方法选择提供依据。方法基于模拟试验,产生不同参数设置下的模拟数据,并评价五种方法的第一类错误、检验效能和分析时间。结果除InverseWeight法在相关系数较大时第一类错误有所膨胀外,其余四种方法的第一类错误在不同参数情况下均在0.05附近。五种方法的检验效能趋势一致,均随着样本量、中介比、总效应的增大而增大,随着删失比的增大而减小。在样本量较小(N=100)且中介比不大于30%的情况下,InverseWeight法的检验效能低于另四种方法。InverseWeight法、Baron-Kenny法和Imai法的分析效率远低于VanderWeele法和Sobel法。结论综合考虑一类错误控制、检验效能及分析效率,推荐VanderWeele法进行预后研究的中介分析。 展开更多
关键词 生存资料 中介分析 VanderWeele法
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福州市胃癌患者生存数据的Weibull模型 被引量:1
18
作者 吴彬 田俊 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2003年第4期220-221,共2页
目的 了解福州市胃癌患者的生存分布模式。方法 采用Weibull模型分别对 1992~ 1995年和 1996~1999年福州市胃癌患者的生存数据进行拟合。结果 两个时期胃癌患者的生存数据均服从Weibull分布 ,模型的形状参数分别为 0 7790 944 5 3... 目的 了解福州市胃癌患者的生存分布模式。方法 采用Weibull模型分别对 1992~ 1995年和 1996~1999年福州市胃癌患者的生存数据进行拟合。结果 两个时期胃癌患者的生存数据均服从Weibull分布 ,模型的形状参数分别为 0 7790 944 5 3和 0 5 7714 3 93 5。结论 福州市胃癌患者的生存分布属减速死亡模型 ,1996~ 1999年胃癌患者的死亡速率小于 1992~ 1995年的死亡速率。 展开更多
关键词 胃癌 生存数据 Weibull模型 生存时间 福州市
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Stata和R软件在生存资料Meta分析中的正确使用 被引量:3
19
作者 张天嵩 《中国循证医学杂志》 CSCD 2017年第10期1237-1240,共4页
在系统评价或Meta分析中,风险比(Hazard ratio,HR)常作为效应量用于时间-事件结局分析,但在实践中,常因忽视数据的对数转换从而导致错误结果。本文以实例说明如何正确使用Stata和R软件对获得HR及其95%可信区间的生存资料进行Meta分析。
关键词 生存数据 系统评价 META分析 STATA软件 R软件
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基于纵向生存数据联合模型的肝硬化数据应用研究 被引量:2
20
作者 王一茸 韦程东 +1 位作者 岑泰林 张晓东 《广西师范学院学报(自然科学版)》 2018年第2期31-36,共6页
纵向生存数据基本的联合模型都包含一个纵向结果和一个生存结果,该文基于混合效应模型和Cox比例风险模型构建纵向生存数据的标准联合模型和广义联合模型,并利用原发性胆汁性肝硬化(PBC)数据进行建模对比分析,结果表明联合建模结果优于... 纵向生存数据基本的联合模型都包含一个纵向结果和一个生存结果,该文基于混合效应模型和Cox比例风险模型构建纵向生存数据的标准联合模型和广义联合模型,并利用原发性胆汁性肝硬化(PBC)数据进行建模对比分析,结果表明联合建模结果优于单独生存建模或纵向建模结果,广义联合模型优于标准联合模型. 展开更多
关键词 纵向数据 生存数据 联合模型 PBC数据
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