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HIV-1整合酶核心区的同源模建及优化研究
被引量:
1
1
作者
梁立
刘嵬
+2 位作者
何红秋
苟小军
胡建平
《湖北农业科学》
2015年第13期3283-3288,3293,共7页
以原型泡沫病毒(PFV)整合酶(Integrase,IN)-雷特格韦(Raltegravir,RLV)复合物晶体结构为模板,同源模建了HIV-1 IN–RLV复合物模型。恰当的Ramachandran plot分布和Profile-3D数值结果验证了复合物模型的合理性。用分子动力学(Molecular ...
以原型泡沫病毒(PFV)整合酶(Integrase,IN)-雷特格韦(Raltegravir,RLV)复合物晶体结构为模板,同源模建了HIV-1 IN–RLV复合物模型。恰当的Ramachandran plot分布和Profile-3D数值结果验证了复合物模型的合理性。用分子动力学(Molecular dynamics,MD)模拟优化了模建复合物,分子整体结构发生微幅调整,其中活性口袋区关键残基D116-Mg1-Mg2-E152有一定关联柔性摆动,这对于IN结合柔性较大的RLV分子较为有利。运动性分析表明,RLV分子围绕中心羟基嘧啶,两侧恶二唑和氟苯略微靠近。通过与晶体结构及对接结果对比发现,D116和N155可能是识别RLV抑制剂最为关键的两个残基。
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关键词
HIV-1整合酶
雷特格韦
同源模建
结构优化
分子动力学模拟
运动模式
分子识别
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职称材料
LaPbMnSbO_6化合物的结构精修和磁性表征
2
作者
韩琳
刘孝娟
+3 位作者
孟君玲
姚传刚
武晓杰
孟健
《应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期350-355,共6页
采用半化学两步法合成了双钙钛矿氧化物LaPbMnSbO6,研究了其晶体结构和磁学性质。通过对XRD谱图进行Rietveld结构精修可以得到,该化合物为单斜晶系的P21/n(No.14)空间群,B位Mn O6和Sb O6八面体为岩盐有序结构。由于A位Pb2+离子的存在而...
采用半化学两步法合成了双钙钛矿氧化物LaPbMnSbO6,研究了其晶体结构和磁学性质。通过对XRD谱图进行Rietveld结构精修可以得到,该化合物为单斜晶系的P21/n(No.14)空间群,B位Mn O6和Sb O6八面体为岩盐有序结构。由于A位Pb2+离子的存在而产生二级Jahn-Teller效应,使得B位八面体内部晶格畸变具有各向异性。磁性测试表明该样品呈典型的反铁磁有序特征,反铁磁转变温度TN=9 K。
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关键词
双钙钛矿氧化物
半化学两步法
结构精修
磁性
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职称材料
铝合金晶粒细化的研究进展与发展趋势
被引量:
14
3
作者
孙小平
石路
+2 位作者
管仁国
王顺成
戚文军
《有色矿冶》
2010年第5期32-35,共4页
阐述了铝合金晶粒细化技术的研究和应用现状,铝合金获得细晶的几种凝固技术,晶粒细化剂和变质剂的变质细化作用及晶粒细化机理。并叙述了铝合金晶粒细化的发展趋势以及新型Al-Ti-C-Re、Al-Ti-B-Re合金的细化效果及应用。
关键词
晶粒细化
凝固细晶
变质细化
细化机理
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职称材料
Rietveld法研究K^+,Al^(3+)对Zn-Co-O体系结构的影响
4
作者
朱波
陈敏
+3 位作者
袁贤鑫
金松寿
吕光烈
吴红丽
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
1995年第2期135-141,共7页
为了研究K+、Al3+时Zn-Co-O尖晶石催化性能的影响,用Rietveld分析法测定了由共沉淀法制备的Zn-Co-O体系的结构,并考察添加K+、Al3+对该体系结构的影响.结果表明,该体系均由(CoZn)O固溶体ZnCo2O4尖晶石二相以及部分非晶态...
为了研究K+、Al3+时Zn-Co-O尖晶石催化性能的影响,用Rietveld分析法测定了由共沉淀法制备的Zn-Co-O体系的结构,并考察添加K+、Al3+对该体系结构的影响.结果表明,该体系均由(CoZn)O固溶体ZnCo2O4尖晶石二相以及部分非晶态组成,添加K+、Al3+能使尖晶石相含量增加,对氧参数的影响呈相反趋势,氧参数大小规律与氧的活动性大小相对应.
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关键词
RIETVELD
结构修正
尖晶石结构
催化性能
氧参数
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职称材料
峨眉山玄武岩晶洞中硅铁灰石的晶体结构
被引量:
1
5
作者
阮青锋
邱志惠
+3 位作者
陆琦
张良钜
肖平
于吉顺
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2011年第2期177-184,共8页
硅铁灰石产于云南昭通莲峰二叠纪峨眉山玄武岩的晶洞中,晶体以(100)发育的板状、薄板状、厚板状、板柱状为主,根据电子探针成分数据,按阴离子数O15计算出所研究硅铁灰石的矿物分子式:Ca2.037(Fe20.+709Mn02.+187Mg20.+063)0.959Fe31.+18...
硅铁灰石产于云南昭通莲峰二叠纪峨眉山玄武岩的晶洞中,晶体以(100)发育的板状、薄板状、厚板状、板柱状为主,根据电子探针成分数据,按阴离子数O15计算出所研究硅铁灰石的矿物分子式:Ca2.037(Fe20.+709Mn02.+187Mg20.+063)0.959Fe31.+182[(Si4.997Al0.003)5.0O14.768(OH)0.232]。采用侧槽装样法制备晶体结构解析用样片,使用X′Pert PRO型X射线粉晶衍射仪收集衍射数据,通过模型法和Rietveld结构精修方法精修了硅铁灰石的晶体结构,并收敛到Rp=0.035 1,Rwp=0.045 4,Rexp=0.028 86,χ2=2.475。精修后硅铁灰石的空间群为P1,a=0.746 6(1)nm,b=1.163 1(2)nm,c=0.668 4(1)nm,α=91.554(4)°,β=93.889(3)°,γ=104.193(3)°。硅铁灰石晶体单胞由铁氧八面体与钙氧十二面体连接沿[110]方向延伸的两条硅氧四面体单链组成,其中,铁氧八面体和钙氧十二面体都存在不同程度的畸变。
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关键词
硅铁灰石
X射线粉末衍射
Rietveld晶体结构精修
峨眉山玄武岩
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职称材料
题名
HIV-1整合酶核心区的同源模建及优化研究
被引量:
1
1
作者
梁立
刘嵬
何红秋
苟小军
胡建平
机构
成都大学药食同源植物资源开发重点实验室
重庆市科学技术研究院重庆生物医药与器械研究中心
乐山师范学院化学学院
出处
《湖北农业科学》
2015年第13期3283-3288,3293,共7页
基金
国家自然科学基金项目(11247018
11147175
+3 种基金
81202438)
四川省科技厅应用基础项目(2011JYZ007)
四川省教育厅重点项目(12ZA066)
乐山市科技计划项目(14GZD022)
文摘
以原型泡沫病毒(PFV)整合酶(Integrase,IN)-雷特格韦(Raltegravir,RLV)复合物晶体结构为模板,同源模建了HIV-1 IN–RLV复合物模型。恰当的Ramachandran plot分布和Profile-3D数值结果验证了复合物模型的合理性。用分子动力学(Molecular dynamics,MD)模拟优化了模建复合物,分子整体结构发生微幅调整,其中活性口袋区关键残基D116-Mg1-Mg2-E152有一定关联柔性摆动,这对于IN结合柔性较大的RLV分子较为有利。运动性分析表明,RLV分子围绕中心羟基嘧啶,两侧恶二唑和氟苯略微靠近。通过与晶体结构及对接结果对比发现,D116和N155可能是识别RLV抑制剂最为关键的两个残基。
关键词
HIV-1整合酶
雷特格韦
同源模建
结构优化
分子动力学模拟
运动模式
分子识别
Keywords
HIV-lintegrase
rahegravir
homology
modeling
structure
refine
molecular
dynamics
simulation
motion
mode
molecular
recognition
分类号
Q615 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
LaPbMnSbO_6化合物的结构精修和磁性表征
2
作者
韩琳
刘孝娟
孟君玲
姚传刚
武晓杰
孟健
机构
中国科学院长春应用化学研究所稀土资源利用国家重点实验室
中国科学院大学
出处
《应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期350-355,共6页
基金
国家自然科学基金(21221061
21071141
+1 种基金
51372244)
吉林省自然科学基金(201115126)资助项目~~
文摘
采用半化学两步法合成了双钙钛矿氧化物LaPbMnSbO6,研究了其晶体结构和磁学性质。通过对XRD谱图进行Rietveld结构精修可以得到,该化合物为单斜晶系的P21/n(No.14)空间群,B位Mn O6和Sb O6八面体为岩盐有序结构。由于A位Pb2+离子的存在而产生二级Jahn-Teller效应,使得B位八面体内部晶格畸变具有各向异性。磁性测试表明该样品呈典型的反铁磁有序特征,反铁磁转变温度TN=9 K。
关键词
双钙钛矿氧化物
半化学两步法
结构精修
磁性
Keywords
double
perovskites
two-step
semi-chemical
structure
refine
ments
magnetic
properties
分类号
O611.2 [理学—无机化学]
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职称材料
题名
铝合金晶粒细化的研究进展与发展趋势
被引量:
14
3
作者
孙小平
石路
管仁国
王顺成
戚文军
机构
东北大学材料与冶金学院
广州有色金属研究院
出处
《有色矿冶》
2010年第5期32-35,共4页
基金
广东省重大科技专项(2009A080205004)
国家自然科学基金(50974038)
中央高校基本科研业务费(N090502003)
文摘
阐述了铝合金晶粒细化技术的研究和应用现状,铝合金获得细晶的几种凝固技术,晶粒细化剂和变质剂的变质细化作用及晶粒细化机理。并叙述了铝合金晶粒细化的发展趋势以及新型Al-Ti-C-Re、Al-Ti-B-Re合金的细化效果及应用。
关键词
晶粒细化
凝固细晶
变质细化
细化机理
Keywords
grain
refine
ment
solidification
structure
refin
ning
modification
refine
ment
refine
ment
mechanisms
分类号
TG146.2 [一般工业技术—材料科学与工程]
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职称材料
题名
Rietveld法研究K^+,Al^(3+)对Zn-Co-O体系结构的影响
4
作者
朱波
陈敏
袁贤鑫
金松寿
吕光烈
吴红丽
机构
杭州大学化学系
杭州大学中心实验室
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
1995年第2期135-141,共7页
文摘
为了研究K+、Al3+时Zn-Co-O尖晶石催化性能的影响,用Rietveld分析法测定了由共沉淀法制备的Zn-Co-O体系的结构,并考察添加K+、Al3+对该体系结构的影响.结果表明,该体系均由(CoZn)O固溶体ZnCo2O4尖晶石二相以及部分非晶态组成,添加K+、Al3+能使尖晶石相含量增加,对氧参数的影响呈相反趋势,氧参数大小规律与氧的活动性大小相对应.
关键词
RIETVELD
结构修正
尖晶石结构
催化性能
氧参数
Keywords
Rietveld
structure
refin
ment,
structure
of
spinel,
Oxygenous
activity
分类号
O643.36 [理学—物理化学]
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职称材料
题名
峨眉山玄武岩晶洞中硅铁灰石的晶体结构
被引量:
1
5
作者
阮青锋
邱志惠
陆琦
张良钜
肖平
于吉顺
机构
桂林理工大学广西地质工程中心重点实验室
桂林理工大学地球科学学院
广西师范大学化学化工学院
中国地质大学(武汉)地质过程与矿产资源国家重点实验室
出处
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2011年第2期177-184,共8页
基金
国家自然科学基金项目(40572026)
广西教育厅科研项目(201010LX182)
文摘
硅铁灰石产于云南昭通莲峰二叠纪峨眉山玄武岩的晶洞中,晶体以(100)发育的板状、薄板状、厚板状、板柱状为主,根据电子探针成分数据,按阴离子数O15计算出所研究硅铁灰石的矿物分子式:Ca2.037(Fe20.+709Mn02.+187Mg20.+063)0.959Fe31.+182[(Si4.997Al0.003)5.0O14.768(OH)0.232]。采用侧槽装样法制备晶体结构解析用样片,使用X′Pert PRO型X射线粉晶衍射仪收集衍射数据,通过模型法和Rietveld结构精修方法精修了硅铁灰石的晶体结构,并收敛到Rp=0.035 1,Rwp=0.045 4,Rexp=0.028 86,χ2=2.475。精修后硅铁灰石的空间群为P1,a=0.746 6(1)nm,b=1.163 1(2)nm,c=0.668 4(1)nm,α=91.554(4)°,β=93.889(3)°,γ=104.193(3)°。硅铁灰石晶体单胞由铁氧八面体与钙氧十二面体连接沿[110]方向延伸的两条硅氧四面体单链组成,其中,铁氧八面体和钙氧十二面体都存在不同程度的畸变。
关键词
硅铁灰石
X射线粉末衍射
Rietveld晶体结构精修
峨眉山玄武岩
Keywords
babingtonite
X-ray
powder
diffraction
method
crystal
structure
refine
d
by
Rietveld
method
Emeishan
basalt
分类号
P578.954 [天文地球—矿物学]
O76 [天文地球—地质学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HIV-1整合酶核心区的同源模建及优化研究
梁立
刘嵬
何红秋
苟小军
胡建平
《湖北农业科学》
2015
1
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职称材料
2
LaPbMnSbO_6化合物的结构精修和磁性表征
韩琳
刘孝娟
孟君玲
姚传刚
武晓杰
孟健
《应用化学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
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职称材料
3
铝合金晶粒细化的研究进展与发展趋势
孙小平
石路
管仁国
王顺成
戚文军
《有色矿冶》
2010
14
下载PDF
职称材料
4
Rietveld法研究K^+,Al^(3+)对Zn-Co-O体系结构的影响
朱波
陈敏
袁贤鑫
金松寿
吕光烈
吴红丽
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
1995
0
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职称材料
5
峨眉山玄武岩晶洞中硅铁灰石的晶体结构
阮青锋
邱志惠
陆琦
张良钜
肖平
于吉顺
《桂林理工大学学报》
CAS
北大核心
2011
1
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职称材料
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