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冈比亚按蚊嗅觉结合蛋白候选基因cDNA的克隆、鉴定及其表达型分析 被引量:15
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作者 李正西 Jing-Jiang Zhou 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期417-423,共7页
疟蚊主要依靠嗅觉发现寄主。非洲疟蚊冈比亚按蚊Anophelesgambiae是一种嗜吸人血的疟疾传播媒介昆虫。该文作者基于其全基因组序列 ,采用RT PCR和标准分子克隆技术获得 2个嗅觉结合蛋白候选基因agLZ3788和agLZ9988。测序分析结果表明 ,... 疟蚊主要依靠嗅觉发现寄主。非洲疟蚊冈比亚按蚊Anophelesgambiae是一种嗜吸人血的疟疾传播媒介昆虫。该文作者基于其全基因组序列 ,采用RT PCR和标准分子克隆技术获得 2个嗅觉结合蛋白候选基因agLZ3788和agLZ9988。测序分析结果表明 ,它们具有嗅觉结合蛋白的标志性结构域。进一步采用半定量RT PCR技术研究了它们的空间表达型 ,结果发现它们不但在雌蚊触角中表达 ,也在其他部位 (尤其是蚊虫足部 )有强的表达。这一发现说明疟蚊嗅觉结合蛋白可能具有更广的功能 。 展开更多
关键词 疟蚊 冈比亚按蚊 嗅觉结合蛋白 半定量RT-PCR 空间表达型
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植物生长发育关键转录因子—FUSCA3
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作者 杨杉杉 刘长菊 +1 位作者 石忠森 刘石娟 《曲阜师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第2期99-105,共7页
文章综述了FUS3基因的时空表达模式,FUS3转录因子的功能机制和响应非生物胁迫等方面的研究进展,此外还提出了潜在的研究方向,例如在种子发育成熟期,FUS3与B3家族其他转录因子互作提高贮藏物质积累的具体机制等,以期对FUS3转录因子的调... 文章综述了FUS3基因的时空表达模式,FUS3转录因子的功能机制和响应非生物胁迫等方面的研究进展,此外还提出了潜在的研究方向,例如在种子发育成熟期,FUS3与B3家族其他转录因子互作提高贮藏物质积累的具体机制等,以期对FUS3转录因子的调控网络有一定了解,同时为植物中FUS3的功能机制研究提供新的启示. 展开更多
关键词 FUSCA3转录因子 时空表达模式 功能机制 非生物胁迫
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美国白蛾丝氨酸蛋白酶基因HcSP1的克隆、时空表达及对取食不同寄主植物的表达响应 被引量:5
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作者 赵旭东 孙宇航 +3 位作者 陈昌宇 田朔 陶蓉 郝德君 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期160-169,共10页
【目的】为探究美国白蛾Hyphantria cunea在寄主转换过程中的消化生理机制奠定基础。【方法】通过筛选美国白蛾cDNA文库,克隆美国白蛾丝氨酸蛋白酶基因。荧光定量PCR检测该基因在美国白蛾不同发育阶段的表达特性;半定量RT-PCR和荧光定量... 【目的】为探究美国白蛾Hyphantria cunea在寄主转换过程中的消化生理机制奠定基础。【方法】通过筛选美国白蛾cDNA文库,克隆美国白蛾丝氨酸蛋白酶基因。荧光定量PCR检测该基因在美国白蛾不同发育阶段的表达特性;半定量RT-PCR和荧光定量PCR分别检测该基因在美国白蛾5龄幼虫体内不同组织中的分布及表达特性;荧光定量PCR检测取食不同寄主植物(美洲黑杨Populus deltoides,日本晚樱Cerasus serrulata var.lannesiana,山樱花Cerasus serrulata,喜树Camptotheca acuminata和法国梧桐Platanus orientalis)叶片后美国白蛾4龄幼虫中该基因的表达量。【结果】克隆获得美国白蛾丝氨酸蛋白酶基因HcSP1(GenBank登录号:MH663425),开放阅读框长882 bp,编码293个氨基酸,预测分子量为30.5 kD,理论等电点预测为9.86。编码蛋白N末端疏水区包含15个氨基酸组成的信号肽;具有丝氨酸蛋白酶的典型特征,即氨基酸序列中具有组氨酸(His)、天门冬氨酸(Asp)以及丝氨酸(Ser)残基组成的酶活性催化中心三元件;具有明显的胰蛋白酶前体的特征,即具有信号肽、激活肽以及胰蛋白酶N末端保守的起始氨基酸序列(IVGG)。NCBI BLAST比对结果表明美国白蛾HcSP1与其他鳞翅目昆虫丝氨酸蛋白酶的氨基酸序列一致性在50%~70%之间。荧光定量PCR结果显示,HcSP1在美国白蛾幼虫不同发育阶段的相对表达量呈现动态的变化,并随着幼虫虫龄的增长呈现上升趋势。半定量RT-PCR及荧光定量PCR结果显示,HcSP1在美国白蛾5龄幼虫头部、唾液腺、中肠、脂肪体、表皮、马氏管和血淋巴等组织中均有表达且在幼虫中肠中表达量极高。与取食其他寄主植物叶片相比,美国白蛾取食喜树叶片后HcSP1的相对表达量明显升高,并显著高于取食其他寄主植物。【结论】本研究克隆获得美国白蛾丝氨酸蛋白酶基因HcSP1,检测了其在美国白蛾不同发育阶段、不同组织以及取 展开更多
关键词 美国白蛾 丝氨酸蛋白酶 胰蛋白酶 序列分析 时空表达 寄主植物
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镉污染土壤中甘薯镉元素的时空积累规律 被引量:4
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作者 张道微 董芳 +2 位作者 张亚 黄艳岚 张超凡 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2020年第S01期289-298,共10页
为进一步明确甘薯镉元素的时空积累规律,探索甘薯薯肉低镉积累特性形成的原因,利用原子吸收光谱仪检测了在镉中度污染土壤和镉重度污染土壤生长条件下湘薯20号各组织器官镉分配与积累的时空差异,并用荧光定量PCR检测分析了与之对应的甘... 为进一步明确甘薯镉元素的时空积累规律,探索甘薯薯肉低镉积累特性形成的原因,利用原子吸收光谱仪检测了在镉中度污染土壤和镉重度污染土壤生长条件下湘薯20号各组织器官镉分配与积累的时空差异,并用荧光定量PCR检测分析了与之对应的甘薯镉积累相关同源基因的表达差异。研究发现,镉污染土壤中甘薯的镉积累符合根>茎>叶的特性,当土壤镉浓度增加至0.6 mg/kg或2.0 mg/kg时,相对于阴性对照,各部位镉含量增加的倍数分别为3.05~8.75和6.25~26.89;各组织器官随生长时间延长植株镉积累量逐渐增加,地上部茎叶镉积累速率高于薯肉镉积累速率,且叶片中积累的镉不易发生二次转移,因而新叶中镉含量低于老叶。植物镉积累和转运相关的基因在甘薯基因组存在同源基因,且多数存在多个同源拷贝,虽然这些基因在一定程度上随着镉积累量的增加而被诱导表达,但是各拷贝之间的时空表达模式存在差异。相对于镉积累调控相关基因的表达,胁迫响应相关基因受镉胁迫诱导表达的趋势更为明显。镉污染土壤中甘薯的镉积累随着土壤镉浓度增加而增加,随着生长时间延长而增加。甘薯薯肉的镉积累规律较为特殊,薯肉镉积累量低于薯皮、茎、叶等部位,且随着生长时间的增加,薯肉镉积累速率也远低于地上部茎叶。植物镉积累和转运相关的基因在甘薯基因组存在同源基因,且多数存在多个同源拷贝,各拷贝之间的时空表达模式存在差异,推测这种表达差异与甘薯的镉积累特性有关。 展开更多
关键词 甘薯 镉的积累 同源基因 时空表达模式
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美国白蛾丝素蛋白基因的鉴定、时空表达及取食不同寄主植物后的表达响应 被引量:2
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作者 赵旭东 韩芷琪 +3 位作者 耿薏舒 胡天义 李文萱 郝德君 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期1348-1358,共11页
美国白蛾Hyphantria cunea Drury被列为我国林业检疫性害虫,其l~4龄幼虫具有吐丝结网幕的习性。为探究丝素蛋白基因的表达特性,本研究利用PCR技术克隆了美国白蛾的HcP25(Genbank登录号:OL625670)、HcFib-H(Genbank登录号:OL625672)、HcF... 美国白蛾Hyphantria cunea Drury被列为我国林业检疫性害虫,其l~4龄幼虫具有吐丝结网幕的习性。为探究丝素蛋白基因的表达特性,本研究利用PCR技术克隆了美国白蛾的HcP25(Genbank登录号:OL625670)、HcFib-H(Genbank登录号:OL625672)、HcFib-L(Genbank登录号:OL625671)3条丝素蛋白基因,并进行生物信息学分析;利用RT-qPCR技术检测美国白蛾3条丝素蛋白基因的表达特性。结果表明:3条丝素蛋白基因序列比对均与车前灯蛾Arctia plantaginis丝素蛋白一致性最高,系统进化分析显示丝素蛋白HcP25、HcFib-H、HcFib-L在鳞翅目不同科之间在出现较大的分化。RT-qPCR试验结果显示HcP25、HcFib-H、HcFib-L 3基因相对表达量与网幕产生高峰期(1龄、2龄)相一致。3种丝素蛋白均在丝腺中特异性高水平表达,在头部及脂肪体中有少量表达。美国白蛾幼虫取食不同寄主植物后,3种丝素蛋白基因呈现不同的表达规律;取食杨树Populus L.处理组中HcP25与HcFib-H基因相对表达量极显著高于取食其它寄主处理,而取食山樱花Cerasus serrulata var.lannesiana和日本晚樱Cerasus serrulata处理组中HcFib-L基因表达量最高。研究结果为进一步探究丝素蛋白介导的美国白蛾对不同寄主的适应机制及其扩散机制奠定基础,也为开发美国白蛾防治新方法提供了潜在的基因靶标。 展开更多
关键词 美国白蛾 寄主植物 丝素蛋白 时空表达特性
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条纹斑竹鲨鱼DNA结合抑制因子cDNA的克隆、序列特征及其在肝再生过程中的表达分析 被引量:1
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作者 路群 刘磊 +2 位作者 王颖 王丹丹 叶波平 《药物生物技术》 CAS CSCD 2012年第1期16-21,共6页
DNA结合抑制因子(Inhibitor of DNA binding,Id)又称分化抑制因子(Inhibitors of Differentiation,Id),属于负调控因子HLH家族的成员,其功能是与DNA结合并抑制细胞的分化和促进细胞的增殖。为揭示Id蛋白在鲨鱼肝脏再生过程中的作用,作... DNA结合抑制因子(Inhibitor of DNA binding,Id)又称分化抑制因子(Inhibitors of Differentiation,Id),属于负调控因子HLH家族的成员,其功能是与DNA结合并抑制细胞的分化和促进细胞的增殖。为揭示Id蛋白在鲨鱼肝脏再生过程中的作用,作者从前期构建的条纹斑竹鲨鱼肝脏cDNA文库中克隆到编码Id蛋白的cDNA全序列并预测了其编码产物(CpId)的结构,探讨了该基因在鲨鱼体内的时空表达方式,结果表明:CpId cDNA全长为1 074 bp,编码一个由135个氨基酸残基组成的无跨膜区的胞内蛋白,理论分子质量(Mr)为14 857.2,理论等电点(pI)为5.35。CpId蛋白序列与其他生物来源的Id蛋白的同源性介于42%~62%之间,其N端第31~87 aa组成一个相对保守的Myc型helix-loop-helix结构域。CpId基因在鲨鱼各种组织中均有表达,但以在肝脏、脑和生殖腺中的表达最高;肝部分切除后,CpId基因的表达迅速上调,在切除1 h后到达最高值(为正常肝组织的18倍左右),其后逐渐下降,并在24 h时恢复至正常肝组织中的水平;CpId基因的表达在肝部分切除后的第48 h出现第2个相对较高的表达峰。上述结果表明CpId基因参与了肝脏再生调控的过程,其作用可能与促进肝细胞的增殖再生过程有关。 展开更多
关键词 条纹斑竹鲨鱼 DNA结合抑制因子 时空表达 肝再生 肝细胞增殖
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大豆GmABI4基因克隆及表达分析 被引量:2
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作者 江如 周文冠 +3 位作者 赵思华 尹晗 杨文钰 舒凯 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1010-1016,共7页
该研究基于大豆基因组数据库,根据拟南芥ABI4蛋白的氨基酸序列,经比对分析,获得了大豆中的2个GmABI4基因,分别命名为GmABI4-1(GenBank登录号为XM_014766551.1)和GmABI4-2(GenBank登录号为NM_001249003)。TMHMM软件和系统进化转录分析表... 该研究基于大豆基因组数据库,根据拟南芥ABI4蛋白的氨基酸序列,经比对分析,获得了大豆中的2个GmABI4基因,分别命名为GmABI4-1(GenBank登录号为XM_014766551.1)和GmABI4-2(GenBank登录号为NM_001249003)。TMHMM软件和系统进化转录分析表明,这2个基因编码的蛋白均不具有信号肽,二级结构主要以无规则卷曲和延伸链为主;进化树分析表明,大豆GmABI4和野生大豆亲缘关系较近。荧光定量PCR分析表明,GmABI4-1与GmABI4-2基因在大豆种子与豆荚中的表达量均高于根、茎、叶、花等其他组织,推测可能与调控大豆种子生命活动相关。 展开更多
关键词 大豆 GmABI4 生物信息学分析 时空表达模式
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秦川牛Snail2基因扩增、序列特征及表达特性分析 被引量:2
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作者 田媛 龙凤 +4 位作者 李安奇 陈嘉玥 杨森 昝林森 成功 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第9期3147-3157,共11页
试验旨在扩增秦川牛Snail2基因,构建Snail2基因在其各组织不同发育阶段及脂肪细胞不同分化时期的时空表达规律,为进一步研究Snail2基因在牛脂肪沉积中的功能及调控作用奠定基础。以秦川牛为研究对象,经PCR扩增得到Snail2基因CDS区序列,... 试验旨在扩增秦川牛Snail2基因,构建Snail2基因在其各组织不同发育阶段及脂肪细胞不同分化时期的时空表达规律,为进一步研究Snail2基因在牛脂肪沉积中的功能及调控作用奠定基础。以秦川牛为研究对象,经PCR扩增得到Snail2基因CDS区序列,运用生物信息学软件对其功能结构进行预测,同时采用实时荧光定量PCR检测Snail2基因在新生牛和成年牛各组织及脂肪细胞成脂分化过程中的时空表达谱。结果显示,秦川牛Snail2基因编码序列全长为952 bp。不同物种系统进化树结果表明,牛Snail2蛋白在家牛、水牛、山羊、绵羊中高度保守。磷酸化位点分析发现,存在41个潜在磷酸化位点,其中周期蛋白依赖性激酶1(cyclin dependent kinase 1,CDK1)、CDK5、CKⅡ、CKⅠ等多个细胞周期相关激酶参与了Snail2蛋白的磷酸化修饰。蛋白结构域预测发现,牛、人和鼠等8个物种中有8个相似Motif。Snail2蛋白二级结构主要由不规则卷曲构成,二、三级结构预测结果一致。Snail2基因启动子区序列分析发现1个CpG岛及E2F、C/EBPα(CCAAT/enhancer binding proteins alpha)、AP2和Sp1等与脂肪生成相关的转录因子结合位点。实时荧光定量PCR结果显示,Snail2基因在牛脂肪组织中呈现较高表达水平,且随着脂肪细胞成脂分化和牛生长发育过程均呈现上升趋势,表明Snail2基因在牛脂肪沉积过程中发挥重要作用。研究结果为进一步揭示Snail2基因通过影响脂肪细胞增殖和分化进而影响肉牛脂肪沉积作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 秦川牛 Snail2基因 生物信息学 时空表达谱
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大豆GmTAA1-1基因的生物信息及时空表达分析 被引量:1
9
作者 赵思华 尹晗 +3 位作者 吕昊哲 周文冠 杨文钰 舒凯 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第21期6946-6952,共7页
拟南芥TAA1基因是生长素合成途径上的一个重要组分,其在调控植物荫蔽胁迫响应过程中具有重要的功能。基于大豆基因组数据库,根据拟南芥TAA1蛋白的氨基酸序列,经比对分析,发现大豆中共有5个TAA1同源基因。本研究选取序列相似度最高的一... 拟南芥TAA1基因是生长素合成途径上的一个重要组分,其在调控植物荫蔽胁迫响应过程中具有重要的功能。基于大豆基因组数据库,根据拟南芥TAA1蛋白的氨基酸序列,经比对分析,发现大豆中共有5个TAA1同源基因。本研究选取序列相似度最高的一个基因为对象,将其命名为GmTAA1-1 (GenBank登录号:XP003519828.1)。TMHMM软件和系统进化转录分析表明,GmTAA1-1基因编码的蛋白不具有信号肽,二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主;进化树分析表明,大豆GmTAA1-1和野生大豆亲缘关系较近。通过荧光定量PCR技术(qCPR),分析了GmTAA1-1在种子、根、茎、叶、花、豆荚等不同组织中的表达情况。结果表明,Gm TAA1-1在种子与豆荚中的表达量高于其他组织,具有一定的时空表达特异性,推测其可能与调控种子生命活动相关。本研究为进一步研究豆类作物的荫蔽反应提供了依据,有利于耐荫大豆的选择与培育,便于玉米大豆间套作种植模式的进一步推广。 展开更多
关键词 大豆 GmTAA1-1 生物信息学分析 时空表达模式
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