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浙江两地产索氏桃花水母核糖体小亚基rRNA基因序列分析 被引量:13
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作者 胡义波 姜乃澄 《浙江大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期559-566,共8页
采用PCR和DNA测序技术,对杭州与绍兴产桃花水母标本的核糖体小亚基rRNA基因进行了扩增与测序.经序列比对分析,杭州与绍兴产桃花水母的核糖体小亚基rRNA基因序列与已知索氏桃花水母的序列极为相似,相似度分别为99.61%和99.45%;与索氏桃... 采用PCR和DNA测序技术,对杭州与绍兴产桃花水母标本的核糖体小亚基rRNA基因进行了扩增与测序.经序列比对分析,杭州与绍兴产桃花水母的核糖体小亚基rRNA基因序列与已知索氏桃花水母的序列极为相似,相似度分别为99.61%和99.45%;与索氏桃花水母的遗传距离均为0.001;经分子系统树分析,杭州与绍兴产桃花水母与索氏桃花水母的分支置信度高达100%.综上分析,杭州与绍兴产桃花水母均为索氏桃花水母(Craspe-dacusta sowerbyi),该结论与其形态学分类相一致. 展开更多
关键词 索氏桃花水母 RRNA基因 核糖体小亚基 分类学
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隐孢子虫牛源分离株的分离和鉴定 被引量:17
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作者 刘海鹏 曹建平 +8 位作者 沈玉娟 陈有贵 李小红 卢潍媛 徐馀信 刘宜升 刘述先 周晓农 汤林华 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期81-86,共6页
目的分离和鉴定采自徐州自然感染奶牛粪便中的隐孢子虫卵囊。方法在徐州某奶牛场采集经改良抗酸染色镜检确认为隐孢子虫感染的奶牛粪便,用不连续Sheather’s蔗糖密度梯度离心法纯化卵囊。采用Chelex-100方法提取卵囊基因组DNA,设计引物... 目的分离和鉴定采自徐州自然感染奶牛粪便中的隐孢子虫卵囊。方法在徐州某奶牛场采集经改良抗酸染色镜检确认为隐孢子虫感染的奶牛粪便,用不连续Sheather’s蔗糖密度梯度离心法纯化卵囊。采用Chelex-100方法提取卵囊基因组DNA,设计引物扩增小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因和卵囊囊壁蛋白(COWP)基因,分别克隆到pGEM-T和pGEM-T Easy载体,测定核苷酸序列,运用BLAST和MEGA软件进行序列同源性和种系发生分析。结果分离的隐孢子虫卵囊个体大小为(7.4±0.32)μm×(5.4±0.21)μm,长宽比为1.3±0.07(n=20)。徐州牛源隐孢子虫与Gen- Bank公布的安氏隐孢子虫比较,SSU rRNA和COWP基因序列同源性分别为100%和99%。种系发生分析显示该株隐孢子虫与安氏隐孢子虫处于同一分支。结论由徐州自然感染奶牛粪便中分离获得的隐孢子虫是安氏隐孢子虫。 展开更多
关键词 安氏隐孢子虫 小亚基核糖体RNA 卵囊囊壁蛋白 种系发生分析
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巢式PCR技术在输入性卵形疟诊断中的应用研究 被引量:12
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作者 黄炳成 徐超 +9 位作者 李瑾 肖婷 尹昆 刘功振 王卫艳 赵桂华 魏艳彬 王用斌 赵长磊 魏庆宽 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期49-51,57,共4页
目的应用巢式PCR扩增小亚单位核糖体核糖核酸(18S r RNA)基因确诊卵形疟原虫感染。方法采集2012-2013年山东省疟疾患者全血和滤纸血样,吉氏染色镜检观察血膜疟原虫形态并鉴定虫种。提取血样中DNA,根据疟原虫18S r RNA基因以属和种特异... 目的应用巢式PCR扩增小亚单位核糖体核糖核酸(18S r RNA)基因确诊卵形疟原虫感染。方法采集2012-2013年山东省疟疾患者全血和滤纸血样,吉氏染色镜检观察血膜疟原虫形态并鉴定虫种。提取血样中DNA,根据疟原虫18S r RNA基因以属和种特异性引物进行巢式PCR扩增,筛查卵形疟阳性标本并进行测序验证。结果2012和2013年山东省共筛查到7例输入性卵形疟原虫感染病例。巢式PCR扩增7份血样均在800 bp处出现卵形疟原虫特异性单一条带,Blast比对表明产物序列与Gen Bank卵形疟参考序列一致。结论经巢式PCR方法确诊了2012和2013年山东省7例输入性卵形疟病例。 展开更多
关键词 卵形疟原虫 小亚单位核糖体核糖核酸 巢式PCR 输入性疟疾
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下毛目分子系统进化研究和鬃棘尾虫再描述(纤毛动物门:下毛目:尖毛虫科) 被引量:5
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作者 朱飞云 余育和 沈韫芬 《动物分类学报》 CSCD 北大核心 2002年第1期24-32,共9页
作者自武汉东湖采集的样本中分离出鬃棘尾虫Stylonychiapustulata ,利用活体观察与蛋白银染色技术进行了形态学研究 ,并测定了核糖体小亚基RNA基因全序列 ;以邻接法 (Neighbor Joining ,NJ)和最大简约性法 (MaximumParsimonyMethod ,MP... 作者自武汉东湖采集的样本中分离出鬃棘尾虫Stylonychiapustulata ,利用活体观察与蛋白银染色技术进行了形态学研究 ,并测定了核糖体小亚基RNA基因全序列 ;以邻接法 (Neighbor Joining ,NJ)和最大简约性法 (MaximumParsimonyMethod ,MP)对该物种与GenBank中所有其它下毛目物种进行了分子系统发育分析。结果显示 :所研究下毛目种类皆聚为一支 ,支持下毛目为单系观点 ;尖毛虫属和棘尾虫属物种聚类相互交错 ,因此结合形态学上分类标志的分析 ,对这两个属存在的合理性提出异议。根据本文对同种不同种群的小腔游仆虫Euplotesaedicalatus、尖毛虫Oxytrichagranulifera以及鬃棘尾虫Stylonychiapustulata分子进化分析 。 展开更多
关键词 下毛目 鬃棘尾虫 核糖体小亚基RNA基因 形态学 系统进化 分子系统发育
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